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Conceptos Bsicos de Biologa Celular

Componentes qumicos de las clulas -tomos, molculas y enlaces qumicos -Introduccin a las biomolculas

Las Bases qumicas de la vida


En los organismos vivos todo obedece a las leyes de la qumica y de la fsica. Este tipo de qumica se basa en:
Los compuestos de carbono (qumica orgnica) Depende casi exclusivamente de Rx qumicas que tienen lugar en soluciones acuosas Es enormemente compleja: la qumica de la clula mas
simple es incluso mucho mas compleja que cualquier sistema qumico conocido.
Alberts

La materia esta compuesta combinacin de elementos

por

una

El tomo es la partcula mas pequea de un elemento que mantiene sus propiedades qumicas. Los tomos y la forma en que estos se unen entre si para formar molculas, darn las caractersticas de los elementos.

Alberts

Estructura de un tomo

El nmero de protones determina el nmero atmico La carga elctrica de un protn es exactamente igual y opuesta a la carga de un electrn

Para comprender las actividades que ocurren cuando una clula se divide es necesario conocer los aspectos de las interacciones entre las molculas Por ejemplo Interaccin entre molculas proteicas y ADN para la condensacin de cromosomas

Gerald Karp

Enlaces qumicos
Los electrones mas externos determinan como interactan los tomos. En el ncleo, los protones y los neutrones estn fuertemente unidos. Los electrones estn en constante movimiento, pero los electrones solo pueden existir en determinadas regiones de movimiento aisladas (en orbitas separadas).

Un tomo cuyo orbital mas externo esta completamente ocupado por electrones es muy estable, por lo tanto qumicamente no reactivo. La reactividad qumica de un elemento depende de su orbital externo esta completo o incompleto.

Alberts

Los tomos incompletos tienen una tendencia a interactuar entre si, para ganar o perder electrones y as completar su orbital externo. Este intercambio de electrones puede producirse de dos maneras :
Enlace ionico Intercambio de electrones Enlace covalente Cuando un tomo cede electrones Cuando dos tomos comparten un par de electrones

Enlaces covalentes
Compartir, por lo tanto: El nmero de enlaces que un tomo puede formar guarda relacin con nmero de electrones necesarios para completar la capa externa.

Gerald Karp

Enlaces simples: cada tomo cede un electrn y dos tomos comparten dos electrones. Permite la rotacin de una parte de la molcula en relacin con la otra alrededor del eje de unin. Enlaces dobles: se comparte mas de un par de electrones. Impide esta rotacin lo que genera una disposicin mas rgida y menos flexible de los tomos. Son mas cortos y mas fuertes, tienen un efecto caracterstico sobre la geometra 3D de las molculas

Molculas polares y no polares


Se les llama molculas polares cuando existe una distribucin asimtrica de la carga elctrica. (O, N, S y P) Cuando las molculas no poseen tomos electronegativos y enlaces polarizados (C e H), son no polares.

Gerald Karp

Enlaces no covalentes
Ceder y aceptar, Dependen de las fuerzas de atraccin entre los tomos de cargas opuestas. De manera individual estos enlaces son dbiles, cuando actan en conjunto, las fuerzas de atraccin son fuertes. Tipos de enlaces esenciales para la clula:
-Enlaces inicos -Puentes de Hidrggeno -Fuerza de Van der Waals
Gerald Karp

Enlaces inicos
Por lo general estos enlaces estn formados por tomos que tienen uno o dos electrones en su orbital externo incompleto. O a los que les falta adquirir uno o dos electrones para completar su orbital.

Puentes de Hidrgeno
Tiene una dbil interaccin por atraccin entre un tomo de H unido de forma covalente a un tomo electronegativo (con una carga parcial positiva) y un segundo tomo electronegativo.

Fuerzas de Van der Waals


Las fuerzas de Van der Waals incluyen atracciones entre tomos, molculas, y superficies. Difieren del enlace covalente y del enlace inico en que estn causados por correlaciones en las polarizaciones fluctuantes de partculas cercanas. Asimetras transitorias en la distribucin de electrones, si se encuentran dos o mas con estas caractersticas forman este tipo de uniones.

Molculas Biolgicas

La masa total de un organismo es agua. La masa seca consta de molculas que contienen tomos de C

Por que el Carbono?


La qumica de la vida se centr en la qumica de este tomo; porque? -Pueden formar muchos tipos de molculas -Su ltimo orbital tiene 4 posibilidades de unin a otros tomos -Pueden formar cadenas (esqueletos) de C (lineal, cclicas, ramificado) ej. colesterol

Tipos de Molculas Biolgicas


4 tipos principales (Macromculas):
Carbohidratos Lpidos Protenas cidos Nucleicos

Carbohidratos
Son sustancias naturales compuestas de carbono, hidrgeno y oxgeno. Son biopolmeros de monosacridos. Los monosacridos se unen covalentemente entre s, a travs de un enlace glucosdico formando: disacridos, oligosacridos y polisacridos. Sus funciones celulares principales son energticas, estructurales y de reconocimiento molecular

Por su nmero de Carbonos

Por su grupo funcional

Alberts

Los C, H y O se pueden unir de distintas maneras y crear estructuras de diversas formas:


Cambiando solo las orientacin de grupos OH

Dando lugar a una gran variedad de azcares


Alberts

Unin de azcares
Se une uno con otro por enlaces glucosdicos (covalente). Se forman por una reaccin de hidrolisis entre el tomo de carbono C1 de un azcar y el grupo hidroxilo del otro azcar.
Gerald Karp

El resultado de las uniones


Monosacarido Ej. Glucosa

Disacarido

Ej. Lactosa (galactosa y glucosa)

Oligosacarido

Ej. Inulina Cadenas de fructosa

Polisacarido Ej. Almidn, Glucgeno (Cadenas y ramificaciones de glucosa)

Monosacridos
La glucosa es el carbohidrato ms abundante en la naturaleza Los animales obtienen glucosa al ser ingerida (plantas o alimentos). Las plantas obtienen glucosa por un proceso fotosntesis Los valores normales de glucosa en sangre se consideran normales hasta 100 mg/dL en ayunas. Si hay alteraciones puede dar como resultado:
Hipoglicemia Hiperglicemia- diabetes

Disacridos
Unin de dos monosacridos Sirven como almacenes de energa disponible. La lactosa presente en la leche de la mayora de los mamferos, participa para el desarrollo del recin nacido. La lactosa de hidroliza (se rompe) por una enzima (lactasa) en la MP de las clulas del intestino. Muchas personas pierden esta enzima despus de la infancia: Intolerantes a la lactosa

Oligo/Polisacridos
10 o mas uniones de azcares Los oligosacridos complejos suelen estar unidos a protenas (glucoprotenas) o lpidos (glucolpidos). Los polisacridos, son cadenas largas y/o ramificadas de azcares. El glucogeno es un polmero de glucosa, sirve como importante almacn de energa (reserva) en la mayora de los animales. Abundante en hgado y msculos estriados (musculo esqueltico tiene 30 min de combustible para una actividad moderada)

Lpidos
Molculas orgnicas compuestas por C e H Poco solubles o insolubles en agua Solubles en solventes orgnicos (ej. Cloroformo, benceno) Compuestos por una parte hidrfila polar y una hidrfoba no polar: ANFIPTICOS.

Clasificacin
cidos grasos Simples Acilgliceridos Saponificables Fosfolpidos

Lpidos

Complejos Glucolpidos Isoprenoides No saponificables Eicosanoides

En la funcin celular
Los mas importantes incluyen a:
Las grasas Esteroides Fosfolpidos La base es: la estructura de los cidos grasos

Gerald Karp

cidos grasos (AG)


Cadenas hidrocarbonadas largas no ramificadas con un solo grupo carboxilo en un extremo. lpidos ms sencillos y precursores de lpidos complejos Un extremo (carboxilo) es hidrofilo y el otro hidrofobo: ANFIPATICOS Los AG difieren entre si en la longitud de sus cadenas y la presencia o ausencia de enlaces dobles

Gerald Karp

Anfiptico

Enlaces simples entre Cs Cuanto mayor sea la cadena (ms carbonos), mayor es la posibilidad de formacin de estas interacciones dbiles. Por ello, a temperatura ambiente, los cidos grasos saturados suelen encontrarse en estado slido

las molculas tienen ms problemas para formar uniones mediante fuerzas de Van der Waals entre ellas. Por ello, a temperatura ambiente, los cidos grasos insaturados suelen encontrarse en estado lquido.

Trigliceridos
Los cidos grasos se almacenan como reserva de energa a travs de una unin ster al glicerol que forma trigliceridos. En los humanos, un mecanismo para almacenar caloras no utilizados y sus concentraciones altas en sangre se correlaciona con el consumo de almidn y otros alimentos altos en carbohidratos. Niveles normales: menos de 150mg/dL

Esteroides
Todos los esteroides comparten un esqueleto bsico de 4 anillos Cumplen con funciones reguladoras, estructurales y hormonales. Uno de los mas importantes es el colesterol
Componente de las MC de animales y precursor de sntesis de hormonas como testosteronas, progesterona, etc.

Fosfolpidos
Molculas formadas por cidos grasos y glicerol
El glicerol esta unido a dos cadenas, el tercero a un grupo fosfato y este a un grupo polar. osea: 2 cadenas glicerolfosfatogpo polar

Altamente anfipticos Componentes principales de las membranas celulares por su naturaleza anfipatica (hidrofbicos).

Alberts

cidos Nuclicos
Son macromolculas construidas con largas cadenas (secuencia) de nucletidos. 2 tipos: ADN (cido desoxiribonucleico) ARN (cido ribonucleico) La funcin principal es almacenar y liberar informacin biolgica

Alberts y Gerald Karp

ADN
Casi siempre en forma de doble cadena: dos cadenas de polinucletidos, direccin antiparalela, unidas por enlaces de H entre sus bases. Mas estable Se deposita la informacin gentica.

ARN
Cadena simple de polinucleotidos. Transportador transitorio de instrucciones moleculares

Pero entonces como son los nucletidos


Son molculas orgnicas formadas por:

El Azcar

Ribosa Pentosa

ARN

Desoxiribosa

ADN

Base nitrogenada
Bases

Purinas

Pirimidinas

Guanina (G)
Adenina (A)

Citocina (C) Timina (T) Uracilo (U)

Cada nucletido recibe el nombre de la base que contiene Todas las bases forman el ADN y el ARN, solo que el Uracilo solo se encuentra en el ARN.

Grupo Fosfato

Protenas
Son polmeros de aminocidos unidos covalentemente a travs de un enlace amida denominado enlace peptdico. Se identificaron muchas protenas diferentes y cada una tiene una secuencia de aas caracterstica. Son capaces de una variedad tan amplia de actividades debido a la gran diversidad de estructuras que pueden formar Hay dos aspectos de la estructura de los aminocidos que deben considerarse:
las que son comunes a todos ellos y las que son nicas para cada uno

Aminocidos
Unidades estructurales que forman las protenas Conformados por:

20 Aminocidos

Valina (Val) Leucina (Leu) Treonina (Thr) Lisina (Lys) Triptfano (Trp) Histidina (His) * Fenilalanina (Phe) Isoleucina (Ile) Arginina (Arg) * Metionina (Met)

Alanina (Ala) Prolina (Pro) Glicina (Gly) Serina (Ser) Cistena (Cys) ** Asparagina (Asn) Glutamina (Gln) Tirosina (Tyr) ** cido asprtico (Asp) cido glutmico (Glu)

Los aminocidos que componen una cadena de polipptidos se unen por enlaces peptdicos como resultado de la unin del grupo carboxilo de un aminocido con el grupo amino de su vecino, eliminando una molcula de agua

Clasificacin por cadenas laterales


El grupo R o cadena lateral es muy variable entre los 20 aminocidos de construccin y esta variabilidad confiere a las protenas su versatilidad Dando con esto un tipo de clasificacin: cidas

Bsicas Polares sin carga No polares

Clasificacin por obtencin


Esenciales:
El organismo no puede sintetizar por s mismo

No esenciales:
Aas que sintetiza el cuerpo.

Porque son esenciales? (Ejemplos)


Histidina
Esencial para el crecimiento y la reparacin de los tejidos Es importante para el mantenimiento de las vainas de mielina que protegen las clulas nerviosas. Entre muchas otras!

Leucina
La leucina interacta con los aminocidos isoleucina y valina para promover la cicatrizacin del tejido muscular, la piel y los huesos. Reduce los niveles de azcar en la sangre y ayuda a aumentar la produccin de la hormona del crecimiento.

Metionina
Antioxidante de gran alcance y una buena fuente de azufre, lo que evita trastornos del cabello, piel y uas, ayuda a la descomposicin de las grasas

Estructura Primaria (Protenas)


Es la secuencia lineal de aminocidos especficos que constituyen la cadena (Primer Nivel) La determina el gen correspondiente, y est sostenida por la formacin de los enlaces peptdicos

La secuencia de los aas es MUY importante, el cambio de un aa por otro puede causar mutaciones y por lo tanto enfermedades serias. Por ejemplo: Anemia Falciforme
Cambio en la secuencia de aminocidos de la hemoglobina En el sitio donde normalmente se encuentra un cido glutmico hay una valina Provoca que a menor presin de oxgeno el eritrocito se deforme y adquiera otra apariencia la nueva forma provoca dificultad para la circulacin de los glbulos rojos, por ello se obstruyen los vasos sanguneos y causan sntomas como dolor en las extremidades El transporte de Oxgeno es decifiente

Estructura Secundaria
El trmino conformacin se refiere al arreglo tridimensional de los tomos de la molcula, o sea, su organizacin espacial. Es el plegado natural de cada cadena peptdica debido a la naturaleza (hidrofbica o hidroflica) de los radicales en la secuencia de aminocidos.

Las conformaciones secundarias tpicas son las hlices (alpha) y lminas (beta)

Estructura Terciaria
La estructura terciaria de las protenas, representa el plegado de las estructuras secundarias, el cul, es singular y especfico para cada protena. Cuando el plegado de las estructuras secundarias es por regiones, se les denomina dominios.

Estructura Cuaternaria
Es la estructura protica conformada por dos ms subunidades peptdicas en su estructura terciaria, para formar una protena funcional. Tal arreglo est sostenido por todo tipo de interacciones No-covalentes.

Tipos de protenas
Globulares
En las que la cadena polipeptidca se pliega en una forma compacta, es decir redondeada. Ej. Enzimas.

Fibrosas
Tienen una estructura 3D alargada relativamente simple. En la clula requieren que se extiendan a gran distancia. Son abundantes en el exterior de la clula, donde forman el gel de la matriz extracelular, que ayuda a la unin clulaclula. Se secretan por las clulas hacia adyacencias donde se ensamblan en laminas o fibras largas. Ej. Colgeno.

Funciones
La actividad de las protenas depende de su capacidad para unirse especficamente a otras molculas. Las protenas tienen una gran cantidad de funciones dependiendo del gen que las codifica, es decir, la secuencia de aas De las funciones mas estudiadas y descritas es la enzimtica (acelerar reacciones)

Enzimas
Determinan todas las formaciones qumicas que se producen en las clulas. Se unen a uno o mas ligandos: sustratos, los convierte en productos modificados qumicamente. Aceleran las reacciones, es decir, catalizadores. Permiten a las clulas generar o romper enlaces covalentes.

Regulacin Proteca
Todas las reacciones estn conectadas en la clula. Actividad regulada, solo genera las molculas que requiere para desarrollarse en forma adecuada. Mediante la coordinacin de cuando y como funcionan las protenas, la clula se asegura de que no se produzca una deplecin de sus reservas energticas por la acumulacin de molculas que no quiere

La regulacin enzimtica tiene lugar a muchos niveles. 1.- la clula controla la expresin del gen. 2.- Limitacin de grupos de enzimas a compartimientos especficos. 3.- El general y mas rpidos esta en la misma enzima:
La actividad cambia en respuesta a las molculas con las que este en contacto.

Inhibicin por Retroalimentacin


Una enzima que acta inicialmente en una va de reaccin es inhibida por uno de los productos finales de esta va. La inhibicin por retroalimentacin en mltiples sitios regula reacciones metablicas conectadas. Esta es una regulacin negativa: impide que una enzima actue.

Tambin esta el lado positivo

Unin de un grupo Fosfato


Unin covalente de un grupo fosfato a una de las cadenas laterales de aas.

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