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UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID

TESIS DOCTORAL
Tcnicas matemticas para la e a reconstruccin de imgenes de o a uorescencia con aplicaciones en biomedicina

Autor: Pal Leonardo Medina Vsquez u a

Director: Miguel Moscoso

DEPARTAMENTO DE CIENCIA E INGENIER DE IA MATERIALES E INGENIER QU IA IMICA Abril de 2009

UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID

Tcnicas matemticas para la e a reconstruccin de imgenes de o a uorescencia con aplicaciones en biomedicina


Memoria que se presenta para optar al t tulo de Doctor por la Universidad Carlos III de Madrid por el Programa en Ingenier a Matemtica a

Autor: Pal Leonardo Medina Vsquez u a Director: Miguel Moscoso


DEPARTAMENTO DE CIENCIA E INGENIER DE MATERIALES IA E INGENIER QU IA IMICA

Grupo de Modelizacin, Simulacin Numrica y o o e Matemtica Industrial a Abril de 2009

TESIS DOCTORAL Tcnicas matemticas para la e a reconstruccin de imgenes de o a uorescencia con aplicaciones en biomedicina
Autor: Pal Leonardo Medina Vsquez u a Director: Miguel Moscoso Firma del Tribunal Calicador:
Nombre y apellidos Presidente: Vocal: Vocal: Vocal: Secretario: Calicacin: o Legans, e de
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Firma

de 2009

Indice general
1. Introduccin o 1.1. Motivacin . . . . . . . . . . . . . . . . . o 1.2. Imgenes mdicas . . . . . . . . . . . . . a e 1.2.1. Tcnicas convencionales . . . . . e 1.2.2. Mtodos pticos . . . . . . . . . . e o 1.3. Propiedades pticas . . . . . . . . . . . . o 1.3.1. Absorcin . . . . . . . . . . . . . o 1.3.2. Dispersin . . . . . . . . . . . . . o 1.3.3. Indice de refraccin . . . . . . . . o 1.3.4. Profundidad ptica . . . . . . . . o 1.4. Interaccin luz-materia . . . . . . . . . . o 1.4.1. Fluorescencia . . . . . . . . . . . 1.4.2. Fluorforos . . . . . . . . . . . . o 1.4.3. Tiempo de vida uorescente . . 1.5. Fluorescence lifetime imaging microscopy 9 9 11 11 16 18 19 19 23 24 25 26 28 30 32 33 34 35 38 41 43 44 44 52 57 58

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . FLIM

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2. Modelos para la propagacin de luz o 2.1. Formulacin anal o tica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.1.1. Ecuacin de transporte radiativo . . . . . . . . . . . o 2.1.2. Ecuacin de Difusin . . . . . . . . . . . . . . . . . . o o 2.1.3. L mites para la Ecuacin de Difusin . . . . . . . . . o o 2.1.4. Ecuacin de Fokker-Planck . . . . . . . . . . . . . . . o 2.2. Esquemas numricos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . e 2.2.1. Aproximacin numrica a la ecuacin de transporte rao e o diativo y a la ecuacin de Fokker-Planck . . . . . . . o 2.2.2. Aproximacin numrica a la ecuacin de difusin . . o e o o 2.3. Resultados . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3.1. Fuente circular en el centro del tejido . . . . . . . . . 2.3.2. Lser que incide perperdicularmente sobre una de las a fronteras . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6

. 61

3. Estimacin de la distribucin y el tiempo de vida de uoro o o foros 3.1. Introduccin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . o 3.2. Conceptos generales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2.1. Problema inverso . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2.2. Level sets . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2.3. Deformacin de las formas a partir del clculo de variao a ciones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.3. Modelo para la propagacin de luz . . . . . . . . . . . . . . . o 3.4. Reconstruccin de la fuente uorescente . . . . . . . . . . . . o 3.5. Mtodo numrico . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . e e 3.6. Experimentos numricos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . e 3.6.1. Primer experimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.6.2. Segundo experimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.6.3. Tercer experimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.7. Conclusin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . o 4. Conclusiones 5. Apndice I e 6. Apndice II e Bibliograf a

65 65 67 68 70 75 75 78 88 90 90 94 95 96 97 99

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Cap tulo 1 Introduccin o


1.1. Motivacin o

El uso de la luz en medicina data de tiempos muy antiguos. La primera mencin de una forma de fototerapia se considera alrededor de los 3000 A.C. o cuando en India, Egipto y China se utilizaban extractos de plantas, que conten psoralenos1 , para oscurecer reas de la piel en pacientes que sufr an a an 2 leucoderma o vitiligo mediante la aplicacin del extracto, en las zonas afeco tadas, y su posterior exposicin a la luz solar ( vase [37]). Un uso similar se o e describe alrededor de 1400 A.C. en el libro sagrado Athara Veda utilizando la planta Bavachee (psoralen corylifolia), para devolver el color a la piel de las zonas no pigmentadas (vase [142]). Bright en 1831 observ que la luz e o solar, o la proporcionada por una vela, era capaz de brillar en la cabeza de pacientes que sufr hidroceflia 3 . Actualmente esta tcnica de diagnstico an a e o se conoce como transiluminacin4 . Curling en 1843 utliz esta mismo mtodo o o e para diagnosticar enfermedades en el escroto y Cutler en 1929 la utiliz para o diagnosticar lesiones mamarias (vase [88]). e En los ultimos 40 a os, debido al desarrollo de nuevas tecnolog el uso n as, de tcnicas pticas en medicina ha crecido extensamente. En particular, el e o desarrollo del LASER (Light Amplication by Stimulated Emission of Radiation), el cual proporciona un haz de luz con propiedades espectrales bien
Substancia vegetal que es sensible a la luz (o que se puede activar con luz). Enfermedad de la piel en la cual se observan parches de piel blancos debido a la prdida e de la pigmentacin. o 3 Trmino que dene la acumulacin de l e o quido cerebroespinal en los ventr culos (espacios) del cerebro. 4 El paso de una luz a travs de una parte del cuerpo o de rganos para facilitar la e o inspeccin mdica. o e
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denidas, a generado un crecimiento notable en el n mero de aplicaciones u cl nicas. Es as que la adquisicin, manipulacin y aplicacin de la informa o o o cin biomdica obtenida a empezado a dominar el siglo XXI. En particular, o e la microscop ptica se est convirtiendo en una poderoza herramienta para a o a el estudio del funcionamiento de las clulas y los tejidos y, por otra parte, la e adquisicin de imgenes pticas (optical imaging 5) In vivo se ha convertido o a o en un importante mtodo para el diagnstico y control de enfermedades. Dene o tro de este campo caben destacar las imgenes por uorescencia (uorescence a imaging). Las imgenes por uorescencia son especialmente interesantes, pues el uso a de etiquetas uorescentes pueden producir una alta especicidad6 y porque un anlisis apropiado de la se al uorescente puede proporcionar informacin a n o sobre el medio que rodea al marcador as como su ubicacin. Actualmente o existen dos tcnicas para la obtencin de imgenes por uorescencia, que e o a denominaremos como Bioimgenes de uorescencia por contraste (Fluoresa cence contrast in bioimaging) e Imgenes de uorescencia por el tiempo de a vida (Fluorescence lifetime imaging FLIM). Es de esta ultima, precisamente, de la que tratar el presente trabajo. a Las imgenes basadas en el tiempo de vida uorescente implican la recona struccin de la distribucin espacial de las tasas del decaimiento uorescente o o en muestras de tejido. Utiliza el tiempo de vida de la molcula uorescente, e en lugar de su intensidad, para crear las imgenes. Debido a su relativa a simplicidad, las tcnicas ms comunes se basan en la excitacin con ondas e a o continuas (CW) [67, 74] y en la excitacin con frecuencia modulada (FD) o [43, 96]. Sin embargo, las investigaciones actuales tambin se centran en la e excitacin por pulsos en el dominio temporal (TD). La aproximacin por el o o dominio temporal requiere de una tecnolog ms sosticada (peque os pula a n sos de lser para la excitacin y detectores capaces de registrar la se al), pero a o n ofrece varias ventajas sobre las aproximaciones realizadas con ondas continuas (CW) y las realizadas con frecuencia modulada [77]. La deteccin en el o dominio temporal a ade una nueva dimensin a los datos de uorescencia y n o la posibilidad de analizar perles de decaimiento ms complejos a partir de a clulas individuales en muestras gruesas de tejido biolgico. e o

Es una tcnica para la obtencin de imgenes que implica la inferencia de la deexin e o a o de la luz emitida desde una fuente laser o infrarojo sobre el tejido celular Tambin se e conoce con el nombre de molecular imaging. 6 Conjunto de propiedades o caracter sticas de una persona o una cosa que permiten distinguirla de otras.

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1.2.

Imgenes mdicas a e

Una imagen mdica, en general, se puede denir como la representacin e o de la distribucin espacial de una o ms propiedades f o a sicas o qu micas dentro del cuerpo humano. Dos parmetros son de fundamental importancia: el a contraste (es lo que se ve en la imagen) y la resolucin (grado de detalle, o espacial o temporal). La obtencin de una imagen mdica se consigue al irradiar una muestra o e (o paciente) con una cantidad determinada de energ La naturaleza de la a. energ determinar la modalidad o tcnica para la adquisicin de la imagen. a a e o A contiuacin describiremos algunas de las tcnicas para la obtencin o e o de imgenes mdicas. Dividiremos esta descripcin en dos partes: tcnicas a e o e convencionales y mtodos pticos. e o

1.2.1.

Tcnicas convencionales e

Las tcnicas que describiremos se pueden clasicar en dos: e Las que utilizan radiaciones ionizantes7 (rayos X, TC, PET y SPECT). Las que no utilizan radiaciones ionizantes (RM y ecograf a). Rayos X Son un tipo de radiacin electromagntica de gran energ capaz de ao e a travesar cuerpos oscuros. Entrega imgenes anatmicas. La ms simple es la a o a radiograf (y mamograf la cual es una proyeccin en 2D de los rayos que a a), o atraviesan un objeto. Cuando el cuerpo se somete a los rayos X, diferentes partes del cuerpo permiten que pasen cantidades variables de rayos X a travs e de ellas. Los tejidos blandos del cuerpo (como la sangre, la piel, la grasa y el m sculo) permiten que la mayor de los rayos X los atraviesen y aparecen u a en gris oscuro en la placa o medios digitales. Un hueso o tumor, que es ms a denso que los tejidos blandos, permite que pasen menos rayos X a travs de e
Las radiaciones ionizantes son las que tienen suciente energ para romper enlaces a qu micos y producir pares inicos (ionizacin) durante su interaccin con la materia o su o o o paso por ella. Se dividen en dos grupos: Radiaciones corpusculares que tienen masa y carga [protones, electrones, neutrones, radiacin () y radiacin ()]. o o Radiaciones electromagnticas que son energ pura y tienen caracter e a sticas similares a la luz visible y a las ondas de radio [radiacin () y rayos X]. o
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l y aparece en color blanco en la placa. La gura 1.1 muestra una imagen e de esta tcnica. e

Figura 1.1: Rayos.

Tomograf computarizada TC a Entrega imgenes en 3D (cortes). La imagen en 3D es reconstruida mea diante un computador a partir de m ltiples proyecciones de rayos X realiu zadas desde diferentes ngulos alrededor del paciente. Las proyecciones se a adquieren por la rotacin en 360o de un conjunto de tubo-detectores. La too mograf computarizada tiene una menor resolucin que la radiograf aunque a o a un mejor contraste (permite ver los tejidos blandos). La gura 1.2 muestra una imagen de esta tcnica. e

Figura 1.2: Tomograf computarizada. a

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Tomograf por emisin de positrones TEP (PET en ingls) a o e Es una tcnica de diagnstico no invasiva que permite realizar imgenes e o a que muestran el metabolismo y el funcionamiento de tejidos y rganos. La o imgenes generadas tienen menor resolucin que una tomograf computaa o a rizada pero presentan una mayor sensibilidad. La tomograf por emisin de a o positrones se basa en detectar y analizar la distribucin que adopta en el o interior del cuerpo un radioistopo (emisor de positrones ()) administrado o a travs de una inyeccin. El radioistopo, tambin llamado radiotrazador, e o o e se acumula en los tejidos y emite radioactividad que es captada por detectores. La tomograf por emisin de positrones permite localizar los focos a o de crecimiento celular anormal en todo el organismo, pues sta no eval a e u la morfolog de los tejidos sino su metabolismo. La gura 1.3 muestra una a imagen de esta tcnica. e

Figura 1.3: Tomograf por emisin de positrones. a o

Tomograf computarizada por emisin de fotn unico (SPECT en a o o ingls) e Es un tcnica de diagnstico que permite visualizar la distribucin en e o o 3D de un contraste radiactivo (radiotrazador) localizado en un rgano de o inters. El radiotrazador se caracterizar por producir la emisin de un slo e a o o fotn (radiacin ). La tomograf computarizada por emisin de fotn unico o o a o o obtiene imgenes desde diferentes ngulos alrededor del paciente, por lo cual, a a se pueden realizar cortes o secciones en cualquier plano espacial. Las imgenes a adquiridas, generalmente, representarn la actividad metablica. La gura a o 1.4 muestra una imagen de esta tcnica. e 13

Figura 1.4: Tomograf computarizada por emisin de fotn unico a o o Resonancia magntica RM e La resonancia magntica es un fenmeno f e o sico basado en las propiedades mecnico-cunticas de los n cleos atmicos. Las imgenes por resonancia a a u o a magntica se obtienen cuando se somete al paciente a un campo electroe magntico con un imn de 1.5 teslas8 (15 mil veces el campo magntico de la e a e tierra). Este poderoso imn atrae a los protones que estn contenidos en los a a tomos de hidrgeno que conforman los tejidos humanos, los cuales al ser esa o timulados por las ondas de radio frecuencia salen de su alineamiento normal. Cuando el est mulo se suspende, los protones regresan a su posicin original o liberando energ que se transforma en se ales de radio para ser captadas a n por una computadora que las transforma en imgenes. La imgenes generaa a das suelen describir la forma y funcionamiento de los rganos. La gura 1.5 o muestra una imagen de esta tcnica. e

Figura 1.5: Resonancia magntica. e


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Actualmente se utilizan imanes con intensidades de campo de entre 0.15 y 7 teslas.

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Ecograf a Tambin conocida como ultrasonido. Los equipos de ultrasonido producen e ondas sonoras de alta frecuencia que se transmiten hacia el area del cuerpo bajo estudio. Las estructuras que son atravesadas por estas ondas oponen resistencia al paso del sonido (impedancia snica), provocando la produccin o o de ecos. Estos ecos son detectados, registrados y analizados por computadoras, para la obtencin de imgenes. El medio idneo de propagacin de o a o o las ondas es cualquier estructura con alto contenido de agua. La gura 1.6 muestra una imagen de esta tcnica. e

Figura 1.6: Ecograf a.

Desventajas Las tcnicas descritas anteriormente presenta las siguientes desventajas: e Las que utilizan radiaciones ionizantes tienen el inconveniente de que la excesiva exposicin a las mismas pueden producir efectos nocivos en o el cuerpo humano. Las que no utilizan radiaciones ionizantes no causan da o en el cuerpo n humano, pero su implementancin es costoda (resonancia magntica) o e o su resolucin es baja (ecograf o a). Los desventajas mencionadas han motivado la investigacin y el uso cada o vez mayor de mtodos pticos, es decir, mtodos que utilizan un rango de luz e o e que va desde el ultravioleta (100nm) al infrarrojo (1mm) (vase [32]). Los e mtodos pticos han demostrado ser una herramienta util para obtener ine o formacin e imgenes a travs de las propiedades pticas del tejido biolgico. o a e o o Con los mtodos pticos se evita la exposicin a radiaciones ionizantes y se e o o busca implementaciones menos costosas. 15

1.2.2.

Mtodos pticos e o

Cuando hablemos de mtodos pticos (optical imaging o molecular image o ing) nos referiremos a tcnicas para obtener imgenes a travs de la inferencia e a e de la desviacin de la luz emitida por una fuente, laser o infrarrojo, sobre el o tejido biolgico. A los mtodos pticos tambin se los puede denir como la o e o e representacin, caracterizacin y cuanticacin visual de procesos biolgicos o o o o en los niveles celulares y subcelulares de organismos vivos (vase [85]). e Los mtodos pticos se puden dividir en dos: mtodos pticos de imagen e o e o difusa (Diuse optical imaging) [40] y mtodos pticos de imagen bal e o stica (Ballistic optical imaging) [35]. Mtodos pticos de imagen difusa e o Estos mtodos buscan construir imgenes a partir de las mediciones ree a alizadas al tejido biolgico luego de que este haya sido irradiado por luz o visible o cercana al infrarrojo. Las imgenes obtenidas pueden mostrar las a propiedades de absorcin y dispersin de los tejidos, o parmetros siolgicos o o a o como el volumen y oxigenacin de la sangre. o Los mtodos pticos de imagen difusa pueden utilizar alguna de las siguie o entes tcnicas para la obtencin de imgenes. e o a Ondas continuas Se basan en medir la intensidad de la luz transmitida entre dos puntos de la supercie del tejido irradiando luz de forma continua o modulada en una baja frecuencia ( kHz). La gura 1.7 muestra una esquema.

Figura 1.7: Ondas continuas. Dominio temporal Se basan en medir la distribucin temporal de los fotones que han o 16

atravesado el tejido biolgico luego de que hayan sido emitidos por un o pulso de luz ( picosegundos). La gura 1.8 muestra una esquema.

Figura 1.8: Dominio temporal.

Dominio frecuencia Se basan en medir la disminucin de la amplitud y el cambio de fase o de la se al transmitida luego de esta haya sido emitida en una alta n frecuencia ( 100 MHz) y con una amplitud modulada. La gura 1.9 muestra una esquema.

Figura 1.9: Dominio frecuencia.

Mtodos pticos de imagen bal e o stica La creacin de lseres ultrarpidos, y detectores pticos capaces de guardar o a a o las se ales producidas, han hecho posible el surgimiento de esta nueva rea de n a investigacin donde la obtencin y resolucin de de imgenes de alta calidad, o o o a 17

de tejidos biolgicos, slo est limitada por la difraccin9 . o o a o La idea fundamental de estos mtodos es la obtencin de imgenes punto e o a por punto, por el rpido env de rfagas de energ (pulsos de laser) y la a o a a deteccin de los fotones que han atravesado el medio y que no han sufrido o dispersin o los que han sido reejados. A los fotones que no han sufrido o dispersin se los denomina bal o sticos. Para ms detalles sobre estos mtodos a e (vase [35], [147] ) e Comparaciones El cuadro 1.1 muestra una comparacin entre algunas de la tcnicas cono e vencionales y las tcnicas de los mtodos pticos (vase [141]). e e o e Caracter sticas Contraste (tejido-blando) Resolucin espacial o Imgenes en profundidad a Funcin (aplicaciones) o Radiacin no-ionizante o Adquisicin de datos o Coste RX Bajo Excelente Excelente Ninguna No Rpida a Bajo Ecograf a RM Bueno Excelente Buena Buena Buena Excelente Buena Excelente Si Si Rpida a Lenta Bajo Alto MO Excelente Mixta Buena Excelente Si Rpida a Bajo

Cuadro 1.1: Comparacin entre diversas tcnicas para la obtencin de o e o imgenes mdicas. a e Alta con relacin a imgenes bal o a sticas y baja en comparacin con tcnicas o e de ptica difusa o

1.3.

Propiedades pticas o

Cuando la luz viaja a travs del tejido biolgico experimenta, princie o palmente, dos tipos de interacciones, la absorcin y la dispersin. Estas o o propiedades determinan el n mero de fotones que viajan entre dos puntos u del tejido biolgico. o Describiremos, a continuacin, los conceptos que denen la absorcin, la o o dispersin y otras propiedades pticas que se derivan de stas. Una descripo o e cin detallada de los conceptos se puede encontrar en [9] y [58]. o
La difraccin es un fenmeno caracter o o stico de las ondas que consiste en la dispersin o y curvado aparente de las ondas cuando encuentran un obstculo. a
9

18

1.3.1.

Absorcin o

Es la transferencia de energ de una una radiacin incidente a las molcua o e las del tejido circundante. La gura 1.10 esquematiza esta propiedad.

Figura 1.10: Atenuacin de la luz a travs de un medio no dispersivo o e

El parmetro que se utiliza para describir la ecacia de la absorcin se a o conoce como coeciente de absorcin y a partir de ste se dene el llamado o e camino libre medio de absorcin. o Coeciente de absorcin a , se dene como la probabilidad de que un o fotn sea absorbido en un medio (n mero de eventos de absorcin) por o u o 1 1 unidad de longitud (mm o cm ). Camino libre medio de absorcin 1/a , es la distancia media requerida o para que un fotn sea absorbido. o A partir del coeciente de absorcin podemos denir la intensidad de un o haz de luz despus de que ste se haya propagado sobre una determinada e e longitud x, de la siguiente manera I(x) = Io exp(a x). (1.1)

Esta expresin es conocida como la Ley de Beer y es independiente del camino o que haya seguido el fotn. o

1.3.2.

Dispersin o

Es el fenmeno que hace que la direccin de la radiacin dentro de un o o o medio cambie. La gura 1.11 esquematiza esta propiedad. 19

Figura 1.11: Atenuacin de la luz a travs de un medio dispersivo o e

El parmetro que se utiliza para describir la ecacia de la dispersin se a o conoce como coeciente de dispersin y a partir de este se dene el llamado o camino libre medio. Coeciente de dispersin s , se dene como la probabilidad de que un o fotn sea dispersado en un medio (n mero de eventos de dispersin) o u o por unidad de longitud (mm1 o cm1 ). Camino libre medio lt , que se dene como la distancia media que un fotn recorre entre dos eventos consecutivos de dispersin y es igual a o o lt = donde t = a + s . A partir del coeciente de dispersin podemos denir la intensidad de la o componente bal stica de un haz de luz despus de que ste haya viajado una e e longitud x, de la siguiente manera I(x) = Io exp(s x). (1.3) 1 , t (1.2)

En tejidos biolgicos la dispersin de luz (fotones) ocurre cuando esta o o 10 interactua con sus ultraestructuras . Si el tama o de la estructuras molecun lares, tambin conocidas como scatterers, coincide con la longitud de onda e del fotn, estos sufren mayor dispersin. La gura 1.12 muestra un esquema o o del tama o de las ultraestructuras del tejido biolgico que afectan a la luz n o visible y a la infrarroja. 20

10 m

Clulas e N cleo u

1 m Dispersin Mie o 0.1 m Dispersin Rayleigh o 0.01 m

Mitocondr a Lysosomes, ves culas Estriaciones en bras de colgeno a Agregados Macromoleculares

Membranas

Figura 1.12: Representacin del tama o y rango de las ultraestructuras del o n tejido biolgico. o La dispersin de la luz causa por estructuras moleculares cuyo tama o o n coincide con la longitud de onda del fotn es descrita por la teor Mie. La o a dispersin de la luz causa por estructuras moleculares cuyo tama o es mucho o n menor que la longitud de onda del fotn es descrita por la teor Rayleigh. o a Cuando la luz es dispersada, por la interaccin con las scatterers, esta o puede adquirir cualquier direccin. Entonces, si deseamos describir correctao mente el comportamiento de la luz en los tejidos biolgicos debemos consio derar la probabilidad de que un fotn dispersado en una direccin s adquiera o o la direccin s por la interaccin con los scatterers. o o Funcin fase de dispersin o o Denotada como p( s ), describe la probabilidad de que un fotn con una s o direccin inicial s adquiera la direccin s despus de un evento de dispersin. o o e o p( s ) es un funcin de densidad de probabilidad y est normalizada por s o a tanto a la unidad. p( s )ds = 1, s (1.4)
Sn1

donde n = 2, 3. La gura 1.13 esquematiza esta propiedad. Por otra parte, si suponemos que la funcin fase se puede expresar slo o o en funcin del ngulo entre la luz incidente y la luz dispersada, es decir, es o a
Estructuras biolgicas cuyo rango va desde 0,01m (la membrana celular) a 10m (la o clula). e
10

21

p( s ) s

Figura 1.13: Representacin de la funcin de fase p( s ). o o s independiente de la orientacin inicial de s, podemos expresar a sta como o e el producto escalar de los vectores unitarios que indican la direccin inicial o s y nal s , de la siguiente manera: p( s ) = p(cos()). s Anisotrop g a La anisotropia se dene como el coseno medio del ngulo de dispersin, a o es decir, g=
Sn1

(1.5)

p( s )( s )d s s s

(1.6)

o g=

p(cos())(cos())d(cos()).
1

(1.7)

Sus valores var entre 1 < g < 1. Cuando g = 0 la dispersin es uniforme an o en todas las direcciones (isotrpica). Cuando g > 0 domina la dispersin o o hacia adelante y cuando g < 0 domina la dispersin hacia atrs. Para los o a tejidos biolgicos 0,7 g < 1 (vase [19]). o e Funcin de dispersin de Henyey-Greenstein o o La funcin de dispersin Henyey-Greenstein imita la dependencia angular o o de la dispersin de la luz cuando esta interactua con pequeas part o n culas (nubes o polvo interestelar) (vase [54]). e Por otra parte, esta funcin ha demostrado ser util para aproximar la o dependencia angular de un proceso de dispersin en los tejidos biolgicos. o o 22

Para las aplicaciones en optical imaging la funcin de dispersin de Henyeyo o Greenstein en 3D es p(cos()) = y en 2D (vase [53]) es e 1 g2 1 p( ) = . 2 (1 + g 2 2g cos( ))

1 1 g2 4 (1 + g 2 2g cos())3/2

(1.8)

(1.9)

Reg menes altamente difusivos Cuando la luz se propaga por rgimes altamente difusivos, es decir, donde e a s , los coeecientes que nos ayudan a describir el comportamiento de los fotones son los siguientes: Coeciente de dispersin reducido s , se dene como la probabilidad de o que un fotn sea dispersado en un medio de forma isotrpica (difusin o o o 1 1 de fotones en forma aleatria) por unidad de longitud (mm o cm ). o Su valor es (1.10) s = s (1 g).
Camino libre medio reducido lt se dene como la distancia media que un fotn recorre para que sufra dispersin isotrpica y es igual a o o o lt =

1 , t

(1.11)

donde t = a + s .

1.3.3.

Indice de refraccin o

El ndice de refraccin es el cociente entre la velocidad de la luz en el o vac c y la velodicdad de la luz en el medio cuyo o ndice se calcula v. c nr = . v (1.12)

La refraccin normalmente ocurre cuando la luz incide en la frontera de dos o medios con diferente ndice de refraccin (vase la gura 1.14) y es governada o e por la ley de Snell, la cual establece que v1 sin(1 ) = v2 sin(2 ) 23 (1.13)

Figura 1.14: Refraccin de la luz entre dos medios con diferente o ndice de refraccin (nr1 < nr2 ) o

donde 1 es el ngulo de incidencia, 2 es el ngulo de refraccin, v1 y v2 son a a o las velocidades de la luz en cada medio. Dado que los tejidos biolgicos son o medios heterogeneos en su composicin se necesita conocer el valor del indice o de refraccin para varios medios o un valor promedio para el tejido biolgico o o en general. Para la mayor de tejidos biolgicos, el a o ndice de refraccin se o considera alrededor de 1.4 (vase [32]) e

1.3.4.

Profundidad ptica o

La profundidad ptica se dene como la razn entre la distancia recorrida o o en un medio y el camino libre medio del fotn, es decir, o d = ds = t dx, lt (1.14)

donde t = s + a . Por ejemplo, si en un medio vamos de 0 a x, entonces


s

=
0

t (x )dx .

(1.15)

Medios pticamente gruesos y pticamente delgados o o Cuando en un medio vamos de x0 a x1 tal que,
x1

=
x0

t dx 1,

(1.16)

los fotones han viajado lo suciente para ser absorbidos o dispersados. Entonces, si 24

1, el medio es pticamente grueso. El fotn es absorbido o diso o persado muchas veces antes de recorrer la distancia x1 x0 . Caso contrario, si 1, el medio es pticamente delgado. No hay absorcin o dispersin o o o en la distancia x1 x0 .

1.4.

Interaccin luz-materia o

La interaccin de la luz (radicin electromagntica) con la materia ino o e volucra la absorcin de un fotn o quantum de luz por un tomo o molcula. o o a e Si el fotn tiene la energ requerida, el tomo o molcula ser elevado desde o a a e a su estado fundamental (baja energ a un estado excitado (mayor energ a) a). Una vez que se encuentra en el estado excitado (inestable), puede chocar y dar lugar a una reaccin, o bien desactivarse cediendo energ a travs de o a e alguno de los siguientes procesos: Relajacin, proceso no radiante en el que, por choques , la molcula o e 12 pierde energ rpidamente (1ps = 10 s). a a Conversin interna, proceso no radiante en el que la molcula pasa o e de un nivel energtico de vibracin a otro de menor energ y de ah a e o a su estado fundamental (1011 1013 s). Cruce intersistemas, proceso en que la molcula pasa del estado de e excitacin a un estado menor energ (triplete11 ). o a Fluorescencia, proceso radiactivo en el que se emite radiacin de o 9 menor frecuencia que la absorbida durante la excitacin 10 s. o Desactivacin molecular o Quenching, proceso no radiactivo, en o el que la molcula excitada choca con otra molcula, que se encuentra e e es su estado fundamental, y le transere su energ dejndola excitada. a a Fosforecencia, proceso radiactivo en el que la desactivacin ocurre o 3 desde un estado triplete al estado fundamental 10 s. La gura 1.15 (diagrama de Perrin-Jablonski ) describe los procesos mencionados (vase [133], [134]). e

11

Hace referencia al estado energtico de multiplicidad 3 (vase [23]) e e

25

Estado excitado Conversin interna o Relajacin o no-radiativa A Absorcin o Niveles energticos de vibracin e o Cruce intersistema Estado triplete F Fluorescencia F o Fosforecencia A R Raman Estado virtual

Estado fundamental Figura 1.15: Diagrama de Perrin-Jablonski A continuacin explicaremos con mayor detalle el proceso de uorescencia o y sus principales caracter sticas, pues esta propoiedad es de principal inters e en el presente trabajo.

1.4.1.

Fluorescencia

La uorescencia es un proceso de emisin en el cual las molculas son o e excitadas por la absorcin de radiacin electromagntica. Las molculas exo o e e citadas se relajan al estado fundamental, liberando su exceso de energ en a forma de fotones. Los fotones emitidos por uorescencia tienen menos energ que los absorbidos, es decir, poseen una menor frecuencia y emiten a una a mayor longitud de onda. La gura ?? muestra un esquema de lo descrito. Caracter sticas de la uorescencia Rendimiento cuntico de la uorescencia a Es la relacin entre el n mero de fotones emitidos, IF , y el n mero o u u total de fotones absorbidos, Iab , = 26 IF IAb (1.17)

El rendimiento cuntico tambin se puede expresar como la relacin a e o entre las constantes cinticas de los procesos implicados: preceso de e uorescencia (kF ) y procesos no uorescentes (kN F ) = kF kF + kN F (1.18)

Una molcula ser uorescente o no, dependiendo de los valores relatie a vos de las constantes cinticas de los procesos implicados. La constantes e pueden variar su valor dependiendo del entorno en el cual se encuentre la molcula. La temperatura es un factor muy importante. e Desactivacin de la uorescencia (Quenching) o Es un proceso de desexcitacin no radiativa provocado por una molcuo e la ajena a la molcula uorescente. A la molcular ajena se la suele e e llamar desactivador o quencher. Existen dos tipos de desactivacin: o desactivacin dinmica y desactivacin esttica. o a o a Desactivacin dinmica o a Se produce por la colisin entre la molcula quencher y la molcula o e e uorescente. Si la molcula uorescente se encuentra en el estado e excitado, pasa al fundamental sin emitir radiacin al disiparse la o energ en forma de energ cintica. Caso contrar la molcula a a e o, e uorescente disminuye su intensidad. Desactivacin esttica o a Se produce cuando la molcula quencher forma un complejo con e la molcula uorescente (complejo no uorescente). El tiempo de e emisin no cambia, slo baja la intensidad uorescente. o o La gura 1.16 muestra una esquema de la desactivacin de la uoreso cencia (quenching) dinmica y esttica. a a

Figura 1.16: Esquema de la desactivacin esttica y dinmica. o a a

27

1.4.2.

Fluorforos o

Las molculas que emiten la uorescencia se denominan uorforos 12 y e o se consideran dos tipos: endgenos y exgenos. o o Endgenos o Todos los tejidos biolgicos emiten uorescencia cuando son excitao dos con luz UV o visible. Esta uorescencia ocurre de manera natural y frecuentemente se la llama autouorescencia. Las molculas rese ponsables de la autouorescencia en el tejido han sido estudiadas por Richards-Kortum y Sevick-Muraca [110] y los correspondientes espectros de emisin y excitacin han sido publicados por Wagni`res et al. o o e [138]. En la gura 1.17 se muestra el espectro de absorcin y en la gura o 1.18 se muestra el espectro de emisin. o

Figura 1.17: Espectros de absorcin de algunos uorforos endgenos [138]. o o o

En citogentica molecular y biolog molecular tambin se conoce como ((colorante e a e uorescente)) (uorescent dye) o ((marcador uorescente)) (uorescent label, uorescent tag).

12

28

Figura 1.18: Espectros de emisin de algunos uorforos endgenos [138]. o o o Los uorforos endgenos se pueden clasicar en cuatro grupos: poro o rinas13 , los aminocidos y proteinas, la aviana14 y los nucletidos15 a o [41]. Exgenos o Son molculas articiales que se unen qu e micamente a otras molcue las no uorescentes para generar nuevas molculas uorescentes que e son muy sensibles a su entorno; por ejemplo, cambios en el pH. La mayor de uorforos exgenos se derivan de la uoresce 16 . La nuea o o na va generacin de uorforos como el Alexa, Dylight Fluor y BODIPY o o son generalmente ms fotoestables, brillantes y menos sensibles al pH a que otros marcadores estndar [26]. La gura 1.19 muestra el compora tamiento de uorforos espec o cos en el marcado celular.
Grupo de compuestos qu micos que se producen en los glbulos rojos. o Flavina (del lat avus, amarillo) es el nombre com n de un grupo de compuestos n u orgnicos basados en pteridina. a 15 Molculas complejas que incorporan a la misma el cido fosfrico y un az car. Son e a o u fundamentales para la formacin del ADN. o 16 Substanc colorante hidrosoluble de color amarillo que produce un color uorescente a
14 13

29

Figura 1.19: N cleo de un linfocito marcado con diversos ourforos. DAPI u o (azul ti e el ADN) FISH (verde y rojo secuencias espec n cas de dos pares de cromosomas).

1.4.3.

Tiempo de vida uorescente

Es el tiempo caracter stico durante el cual una molcula permanece en e un estado excitado antes de retornar a su estado fundamental. Usualmente este parmetro no depende de la concentracin de uorforos. En sistemas a o o homogeneos, es decir, en sistemas donde no se produccen reacciones en el estado excitado, el tiempo de vida sigue la ley de decaimiento exponencial, por lo tanto, el tiempo de vida uorescente puede ser denido como el tiempo en el cual la intensidad uorescente inicial de un uorforo decae un 1/e o (aproximadamente 37 %) de la intensidad inicial. La gura 1.20 esquematiza el decaimiento del tiempo de vida uorescente.

Figura 1.20: Esquema sobre el tiempo de vida uorescente.


verde intenso en soluciones alcalina pH > 5 [26].

30

A continuacin mencionaremos algunas de las razones por la cuales medir o el tiempo de vida uorescente es de utilidad para muchas investigaciones, (vase [140]). e Especicidad Los tiempos de vida uorescentes son caracter sticas comunes de la composicin y estructura molecular. Diferentes molculas suelen mostrar o e diferentes tiempos de vida que pueden ser utilizados selectivamente para el anlisis de mezclas complejas en especies moleculares. a Sensibilidad La deteccin del tiempo de vida uorescente puede efectuarse con slo o o un peque o n mero de molculas uorescentes. Basandose en los difen u e rentes tiempos de vida de especies autouorescentes, la discriminacin o de molculas marcadas es posible. e Cuanticacin o El tiempo de vida uorescente esta relacionado con el rendimiento cuntico del uorforo. a o Sensibilidad del entorno Los tiempos de vida uorescentes son altamente sensibles a los cambios f sicos y qu micos del entorno. En particular, los uorforos exgenos o o son dise ados para ser altamente sensiblea a cambios en su entornno n (pH, viscocidad, etc). Anlisis temporal a Las medidas de los tiempos de vida de uorescencia pueden ser utilizadas para detectar cambios qu micos o moleculares muy rpidos. a Cambios qu micos y biolgicos que ocurren a escalas de tiempo muy o 12 7 peque as 10 s y 10 s pueden ser detectados y medidos. n

31

1.5.

Fluorescence lifetime imaging microscopy FLIM

Es una sosticada tcnica que permite registrar en imgenes el tiempo e a de vida uorescente y la localizacin espacial de los uorforos que se eno o cuentra en una muestra. Los resultados del Fluorescence lifetime imaging microscopy son independientes de la concentracin y del camino recorrido o de los uorforos, pero son sensibles a las reacciones en el estado excitado o (transferencia de energia por resonancia) y al quenching dinmico. Con el Flua orescence lifetime imaging microscopy se pueden investigar espacial y temporalmetne diferentes procesos intracelulares y la sensibilidad de parmetros; a por ejemplo, pH [26]. La gura 1.21 publicada en [140] muestra un ejemplo de Fluorescence lifetime imaging microscopy

Figura 1.21: La gura de la ubicada en el centro superior representa una una muestra en la cual el tiempo de vida es diferente en dos regiones de una clula. La gura ubicada en extremo inferior izquierdo representa la imagen e de la clula basada en la intensidad. La gurea ubicada en el extremo inferior e derecho representa la imagen de la cluda basada en el contraste dado por e los tiempos de vida.

32

Cap tulo 2 Modelos para la propagacin de o luz


El modelo ms general para la propagacin de luz (fotones) se establece a o dentro de la teor de transferencia radiativa (la cual ha sido ampliamente a estudiada en f sica atmosfrica (vase [13], [58])), o en la teor de transporte e e a de neutrones (vase [10]). El modelo se puede entender como la interaccin e o entre las part culas de luz y las inhomogeneidades del medio en que se propaga. Se obtiene considerando cambios en el ujo de energ entrante, saliente, a absorbida y emitida dentro de un volumen innitesimal. Para describir el modelo consideremos un peque o paquete de energ n a (luz), un diferencial de volumen dV centrado en r Rn (n = 2, 3), una direccin de propagacin s Sn1 , un tiempo t R y una velocidad de o o propagacin c R. Ver gura 2.1. o
Fotones Absorbidos

entrante, en la direccin s o

I dV

sale, en la direccin de inters o e

Fotones dispersos desde otra direccin a la direccin de inters o o e

Fotones dispersos en direccin o distinta a la direccin de inters o e

Figura 2.1: Interaccin de la luz (fotones) con el medio en el que se propaga o El cambio de energ radiante I(r, s, t) en la direccin s, es igual a la a o prdida de energ debido a la absorcin y a la dispersin (scattering) en e a o o otras direcciones, ms la ganancia de energ debido a la dispersin de la luz a a o entrante desde otras direcciones s y la energ proveniente desde cualquier a 33

fuente de luz en la posicin r. El balance energtico se representa de la o e siguiente manera. 1 I(r, s, t) + s I(r, s, t) = (s + a )I(r, s, t) + s c t + q(r, s, t). p( s )I(r, s, t)d s s (2.1) La ecuacin (2.1) se conoce como ecuacin de transporte radiativo y es una o o ecuacin integro-diferencial para la intensidad espec o ca I en el punto r, la direccin s y el tiempo t. A I tambin se la conoce como densidad angular de o e fotones. En esta ecuacin c es la velocidad de propagacin en el medio, s es o o el coeciente de dispersin, a es el coeciente de absorcin, p es la funcin o o o de dispersin y q la fuente. El signicado de todos ellos se explicar en ms o a a detalle en la siguiente seccin. Existen soluciones anal o ticas slo para casos o muy simples e idealizados (vase [10], [13], [58], [135]). En el cuadro 2.1 se e hace una descripcin de los trminos de la ERT. o e A partir de la intensidad espec ca I(r, s, t) (densidad angular de fotones) se pueden denir dos cantidades muy utiles para describir el comportamiento de los fotones, estas son: la intensidad (r, t) (densidad de fotones) (r, t) =
S2

Sn1

I(r, s, t)d s

(2.2)

y el ujo de fotones J(r, t) J(r, t) =


S2

I(r, s, t)d. s s

(2.3)

2.1.

Formulacin anal o tica

En esta seccin expondremos los modelos ms usados para describir la o a propagacin de la luz en un medio. En particular, describiremos los modelos o basados en: la ecuacin radiativa de transporte, la ecuacin de difusin y la o o o ecuacin de Fokker-Plank. o En todos los modelos consideraremos un dominio compacto y convexo R3 con frontera diferenciable , un intervalo de tiempo [0, T ] y S2 la esfera unidad. 34

s 1 I(r,,t) c t

+ s I(r, s, t)

Diferencia entre el nmero de fotones que u entran y salen del volumen por unidad de tiempo en la direccin s. o

(s + a )I(r, s, t)

Atenuacin de la luz en la direccin s o o debido a la absorcin y la dispersin. o o

Sn1

p( s )I(r, s, t)d s s

Incremento de la energ en la direccin s a o debido a la dispersin de la luz entrante o desde otras direcciones.

q(r, s, t)

Fuente local (Nmero de fotones por unidad u de tiempo emitidos en la posicin r, con o direccin s y en el tiempo t) o

Cuadro 2.1: Descripcin de los trminos de la ecuacin radiativa de transo e o porte.

2.1.1.

Ecuacin de transporte radiativo o

Como acabamos de decir, la propagacin de fotones en el tejido biolgico o o puede ser modelada con la ecuacin de transporte radiativo (vase [4], [10], o e [28], [58]). El comportamiento de los fotones (luz) que viajan a travs de , en un e 2 tiempo t [0, T ], con una direccin s S y que parten desde un punto o rf , se puede modelar de la siguiente manera. Sea 1 I(r, s, t) + s I(r, s, t) = (s + a )I(r, s, t) + s p( s )I(r, s, t)d s s c t 2 S + q(r, s, t) en S2 [0, T ]. (2.4) con condicin inicial o I(r, s, 0) = 0 35 en S2 (2.5)

y condicin de frontera o I(r, s, t) = 0 donde sobre , (rf ) s > 0 . n (2.6) (2.7)

. = (rf , s, t) S2 [0, T ],

Aqu n(rf ) representa el vector unitario normal exterior a en el punto rf . Los parmetros pticos ms importantes son: a es el coeciente de aba o a sorcin, s es el coeciente de dispersin, t = a + s es el coeciente total o o 1 de atenuacin y t es el camino libre medio de los fotones. Adems, supono a dremos que todos estos coecientes son reales y estrictamente positivos. Para las aplicaciones en optical imaging a 0,1 1,0 cm1 , s 100 200 cm1 y 1 0,005 0,01 cm (vase [4], [141]). e t La funcin de dispersin p( s ) describe la probabilidad de que un fotn o o s o con una direccin inicial s adquiera la direccin s despus de un evento de o o e dispersin. En particular, o p( s )d = 1, s s (2.8)

S2

pues p( s ) es un funcin de densidad de probabilidad. El producto escalar s o s s en el argumento de la funcin de dispersin indica que sta depende o o e slo del coseno del ngulo de dispersin s s = cos() y, en particular, es ino a o dependiente de la localizacin del evento de dispersin. Una de las funciones o o de dispersin ms usadas en la literatura es la funcin de Henyey-Greenstein o a o que fue introducida por Henyey y Greenstein en 1941 (vase [54]) para dee scribir la dispersin de la radiacin en una galaxia y que ha sido aplicada o o en otras muchas situaciones (en particular en tejidos biolgicos). La funcin o o de Henyey-Greenstein describe la distribucin angular de la luz dispersada y o est caracterizada por un slo parmetro que representa el coseno medio del a o a ngulo de dispersin. Este es, a o g=
S2

p( s )( s )d . s s s

(2.9)

La funcin de dispersin de Henyey-Greenstein en 3D es o o 1 1 g2 p( s ) = s . 4 (1 + g 2 2g s )3/2 s

(2.10)

El parmetro g en los tejidos biolgicos var entre 0,7 g < 1 (vase a o a e [19]). Apartir de este parmetro se puede denir el coeciente reducido de a 36

dispersin s = s (1 g) (indica la difusin de fotones en forma aleatria). o o o La condicin inicial, ecuacin (2.5), indica que no existen fotones dentro de o o en t = 0. La condicin de frontera, ecuacin (2.6), indica que los fotones o o que salen del domino no vuelven a entrar. La fuente q(r, s, t), la cual emite los fotones, puede situarse en el interior del dominio o en alg n punto de la u frontera . El ujo de fotones que salen por la frontera est determinado por la a siguiente expresin: o X(r, t) =
4

I(r, s, t) n(r)d, s s

r .

(2.11)

Por otra parte, al utilizar la ecuacin (2.4) para modelar la propagacin o o de fotones en el tejido biolgico debemos considerar los siguientes aspectos: o se ignora la naturaleza ondulatoria de la luz. Por lo tanto, la longitud de onda debe ser mucho menor que las dimensiones del objeto de estudio, los fotones son part culas energticas que sufren colisiones elsticas hase a ta que son absorbidos o escapan del dominio y el ndice de refraccin del medio es constante. Para el caso contrario, es o decir, cuando el ndice de refraccin es variable vase [36], [86], [129]. o e Como se puede observar, la ecuacin de transporte radiativo es una ecuacin o o integro-diferencial, que tiene seis variables independientes (x, y, z, , , t), muy dif de resolver, y que conduce fcilmente a problemas numricos cil a e de un tama o prohibitivo para su resolucin. Por ello, se utilizan diferentes n o aproximaciones. Probablemente, la ms usada es la ecuacin de difusin que a o o es vlida en medios pticamente densos (s L 1 y a s siendo L el a o tama o caracter n stico del medio), siempre que estemos lejos de las fuentes de luz y de las interfases. Por otra parte, Kim y Keller (vase [71]) recomiendan e el uso de la ecuacin de Fokker-Plank modicada como aproximacin a la o o ecuacin de transporte radiativo en casos donde la dispersin es predomio o nante en la direccin de incidencia (forward-biased ), es decir, s s 1. o A la ecuacin de transporte radiativo frecuentemente se la simplica a o travs de una expansin en armnicos esfricos (vase [10]). Cuando se utiliza e o o e e N trminos para la expansin el resultado es un conjunto de (N + 1)2 ecuae o ciones diferenciales parciales acopladas, conocida como aproximacin PN . o Para N impar, el conjunto de ecuaciones diferenciales parciales acopladas puede ser reducido a una ecuacin diferencial ordinaria de orden (N + 1) o (vase [3]). e 37

En particular, la primera aproximacin por armnicos esfricos (P1 ) de o o e la ecuacin de transporte radiativo, es la ecuacin de difusin. o o o

2.1.2.

Ecuacin de Difusin o o

La ecuacin de difusin es una aproximacin, muy conocida, a la ecuacin o o o o de transporte radiativo y existen distintas maneras de derivarla (vase [4], e [10], [58], [63]). Una derivacin detallada en (2D) se muestra en el Apndice o e I. El comportamiento de los fotones que viajan a travs de , durante un e tiempo t [0, T ] y que son emitidos por una fuente q, se puede modelar de la siguiente manera. Sea 1 (r, t) D(r, t) + a (r, t) = q(r, t) c t en [0, T ], (2.12)

la aproximacin P1 a la ecuacin de transporte radiativo, donde o o (r, t) =


S2

I(r, s, t)d. s

(2.13)

La condicin inicial, para la ecuacin (2.12), es o o (r, 0) = 0 y la condicin de frontera es o (r, t) + D(r)(r, t) n = 0 2n sobre [0, T ]. (2.15) en , (2.14)

Aqu n representa el vector unitario normal exterior a y n = (n/2) (n 1)((n 1)/2) (2.16)

es una constante que depende de la dimensin del problema. En particular, o para R3 3 = 1/4 y para R2 2 = 1/, (vase [63]). El coeciente de difusin e o D tambin depende de la dimensin. En tres dimensiones su expresin es e o o D= 1 3(a + s ) 1 . 2(a + s ) 38 (2.17)

y en dos dimensiones su expresin es o D= (2.18)

En estas expresiones s = s (1 g) es el coeciente de dispersin reducido y o = 1 + Ref 1 Ref (2.20) (2.19)

es de ndice de refraccin entre fronteras (vase [64],[114],[141]), donde Ref o e es el coeciente de reexin efectivo y su valor se puede determinar emp o ricamente por la siguiente expresin o Ref 1,4399n2 + 0,7099n1 + 0,6681 + 0,0636nr . r r (2.21)

Aqu nr es el indice de refraccin. Para tejidos biolgicos nr 1,4 (vase o o e [32]). Anlisis de la condicin inicial, condicin de frontera y trmino a o o e fuente Condicin inicial o La condicin inicial, ecuacin (2.14), indica que no existen fotones deno o tro de antes de t = 0. Esta condicin se establece a partir de la o condicin inicial de la ecuacin radiativa de transporte, ecuacin (2.5). o o o Analicemos la condicin o Como la ecuacin de difusin carece de direccionalidad, se busca un o o promedio de la incidencia de los fotones con respecto a todas las direcciones en t = 0; para ello se integra la ecuacin (2.5) con respecto a o s I(r, s, 0)d = s
S2 S2

0d s

(2.22)

=0 y por la denic de la intensidad, ecuacin (2.2), se tiene que on o (r, 0) =


S2

I(r, s, 0)d s

(2.23)

= 0. Condicin de frontera o La condicin de frontera, ecuacin (2.15), indica que el ujo total de o o 39

fotones en la frontera es 0. Esta condicin no se establece a de partir de o la condicin de frontera de la ecuacin radiativa de transporte, ecuacin o o o (2.6). Analicemos la condicin o Por carecer de direccionalidad la ecuacin de difusin no puede sato o isfacer de manera exacta la condicin de frontera de la ecuacin de o o transporte radiativo, ecuacin (2.6), pues esta tiene direccionalidad o en su formulacin n s < 0. Para superar este problema usualmente o se reemplaza la condicin de frontera, ecuacin (2.6), por la siguiente o o aproximacin (vase [58]) o e I(r, s, t) nd = 0, s s r . (2.24)

n<0 s

Esta ecuacin indica que el ujo total de fotones que se dirigen hacia o el interior de es cero. A partir de esta condicin y utilizando la o aproximacin P1 a la ecuacin de transporte radiativo, podemos deducir o o la condicin de frontera para la ecuacin de difusin. Consideremos dos o o o casos Si no existe refraccin entre y el medio que rodea. La condicin o o de frontera ser a (r, t) + 1 D(r)(r, t) n = 0, 2n r . (2.25)

Si existe refraccin entre y el medio que lo rodea. Una parte de o la intensidad espec ca I del interior de incidir sobre la frontera a y se reejar al interior, con lo cual la aproximaxin dada por la a o ecuacin (2.24) se modicar de la siguiente manera o a I(r, s, t) nd = s s Ref (r, s, t) nd, s s r (2.26)

n<0 s

n>0 s

y la condicin de frontera ser o a (r, t) + D(r)(r, t) n = 0, 2n r . (2.27)

Para ms detalles sobre las condiciones de frontera (vase [4], [10], [24], a e [48] [50], [64],[114]). 40

Trmino fuente e La fuente de luz q, que es parte de la ecuacin de difusin, se considera o o que es isotrpica, es decir, es independiente de la direccin s, por lo o o tanto q(r, t) =
S2

q(r, s, t)d. s

(2.28)

Existen dos posibilidades para la ubicacin de la fuente q en . o Fuente interna Si se desea modelar una fuente interna, no se necesita poner restriccin alguna. o Fuente externa Si se desea modelar una fuente externa, por ejemplo la incidencia de un lser en la frontera , dado que la fuente q carece de a direccon, sta debe ubicarse a una profundidad de 1/s (esta es e la distancia media requerida para que un fotn sufra al menos un o evento de dispersin), por debajo del lugar donde se supone incide o la fuente. Finalmente, para determinar el ujo de fotones que salen por la frontera , se utiliza la siguiente expresin o X(r, t) = 2n (r, t), r . (2.29)

donde X indica el ujo de fotones, a travs del rea unidad con normal n, e a por unidad de tiempo (vase [126]). e

2.1.3.

L mites para la Ecuacin de Difusin o o

Aunque la aproximacin por difusin es muy util, la validez de sus resulo o tados se deterioran drsticamente cuando las propiedades pticas del medio a o alcanzan ciertos l mites. Dos condiciones son de gran importancia para la obtencin de buenos resultados. o Que el medio sea altamente dispersivo, es decir, que a s . Esta condicin no se cumple en lugares del cuerpo humano que tienen uidos o de baja dispersin; por ejemplo, el l o quido cefalorraqu deo. 41

Que el medio sea pticamente grueso, es decir, que t L 1, donde L es o la longitud caracter stica del medio. Esta condicin implica que el fotn o o es absorbido o dispersado muchas veces antes de recorrer la distancia L. En particular, cuando la profundidad ptica po [10, 20], la ecuacin o o por difusin puede llegar a modelar reg o menes con un g < 0,9. Para los tejidos biolgicos 0,7 g < 1. o Por otra parte, la aproximacin por difusin tampoco es vlida para modo o a elar tiempos de llegada cortos, es decir, no se pueden modelar reg menes, bal sticos, cuasi-bal sticos y cuasi-difusivos. Para entender esto de mejor manera caracterizaremos cada uno de los reg menes mencionados y adems cara acterizaremos el regimen difusivo. Bal stico. Hace referencia a los fotones que no han sufrido ning n evento u de dispersin. Se caracterizan por que o t 1 . cs (2.30)

Cuasi-bal stico. Hace referencia a los fotones que han sufrido unos pocos eventos de dispresin y que conservan una fuerte memoria de su direco cin original. Se caracterizan por que o 1 1 <t . cs cs (2.31)

Cuasi-difusivo. Hace referencia a los fotones que han sufrido algunos eventos de dispresin y que conservan una dbil memoria de su direccin o e o original. Se caracterizan por que 1 10 <t . cs cs (2.32)

Disfusivo. Hace referencia a los fotones que han sufrido muchos eventos de dispresin y que han perdido toda memoria de su direccin original. o o Se caracterizan por que 10 (2.33) t> . cs Por la caracterizacin realizada podemos observar que la aproximacin o o 10 por difusin ser vlida para tiempos en los cuales t > c , es decir, tiempos o a a s largos. Para ms detalles sobre esta descripcin (vase [58], [141]) a o e 42

2.1.4.

Ecuacin de Fokker-Planck o

La ecuacin de Fokker-Planck, denominada as por Adriann Fokker [38] o y Max Plank [105], describe la evolucin temporal de la funcin de densidad o o de probabilidad que muestra la posicin y la velocidad de una part o cula. El primer uso de la ecuacin de Fokker-Planck fue la descripcin estad o o stica del movimiento browniano de una part cula en el seno de un uido (vase [62]). e La ecuacin de Fokker-Planck puede usarse para modelar la propagacin o o de la luz en el tejido biolgico ([71],[45], [46]). o La progagacin de luz que se realiza a travs de , durante un tiempo o e t [0, T ] y que es emitida desde una fuente q, se puede modelar de la siguiente manera. Sea 1 1 I(r, s, t) + s I(r, s, t) + a I(r, s, t) = s s I(r, s, t) + q(r, s, t), (2.34) c t 2 donde el operador laplaciano s I en trminos de coordenadas polares (, ) e de s, con = cos , es s I = I I (1 2 ) + (1 2 )1 2 . en S2 sobre , (rf ) s > 0 . n (2.35)

La condicin inicial, para la ecuacin (2.34), es o o I(r, s, 0) = 0 y la condicin de frontera es o I(r, s, t) = 0 donde . = (rf , s, t) S2 [0, T ], (2.38) (2.37) (2.36)

Aqu n(rf ) representa el vector unitario normal exterior a en el punto rf . Los parmetros pticos ms importantes son: a es el coeciente de absorcin a o a o y s es el coeciente de dispersin. o La ecuacin de Fokker-Planck es una aproximacin a la ecuacin de rao o o diativo. Esta aproximacin se basa en sustituir el operador integral de la o ecuacin de transporte radiativo por una aproximacin basada en operadores o o diferenciales. La sustitucin hace que la ecuacin de Fokker-Planck sea ms o o a fcil de resolver numricamente que la ecuacin de transporte radiativo y a e o adems permite mantener la direccionalidad que la caracteriza. Esto ultimo a no ocurre con la ecuacin de difusin. o o La ecuacin de Fokker-Plank es una buena aproximacin a la ecuacin de o o o transporte radiativo cuando 43

la dispersin es predominante en la direccin de incidencia, es decir, o o cuando g 1 [71]. Existen tejidos biolgicos; por ejemplo, la materia o blanca1 donde g = 0,96. el medio es opticamente delgado (s L 1) y fuertemente dispersivo a s [71].

2.2.

Esquemas numricos e

En esta seccin revisamos los esquemas numricos que se han empleado o e en la tesis. Para la ecuacin de transporte radiativo y para la ecuacin de o o Fokker-Planck se ha utilizado una discretizacin ordinaria para la variable o angular, una discretizacin en diferencias diamante para la variable espacial o y una discretizacion tipo euler para la variable temporal. Para la ecuacin o de difusin hemos implementado un mtodo impl o e cito basado en el esquema de Crank-Nicholson.

2.2.1.

Aproximacin numrica a la ecuacin de transo e o porte radiativo y a la ecuacin de Fokker-Planck o

Dado que los requerimientos computacionales para resolver numricamene te la ecuacin de transporte radiativo en 3D son muy elevados, considero aremos el modelo en 2D. Para ello escogeremos el plano x y y la funcin de o dispersin en dos dimensiones (vase [53]). Adems, consideraremos una sla o e a o variable angular . Utilizaremos el mismo esquema numrico para resolver e la ecuacin de Fokker-Planck en 2D, cuya principal diferencia estar en el o a operador de dispersin. o Sea I = I(x, y, , t) y q = q(x, y, , t). El modelo para la propagacin de o fotones en un plano est dado por a 1 I I I + cos() + sin() + a I s LI = q, c t x y cuya condicin inicial es o I(x, y, , 0) = 0 sobre [0, 2] y cuya condicin de frontera es o I(x, y, , t) = 0 sobre ,
1

(2.39)

(2.40)

(2.41)

Parte del sistema nervioso central compuesta de bras nerviosas mielinizadas.

44

donde . = {(rf , , t) [0, 2] [0, T ], n(rf ) < 0} . (2.42)

Aqu n(rf ) representa el vector unitario normal exterior a en el punto rf . LI es el operador de dispersin que se denir de la siguiente manera: o a Si se considera la ecuacin de transporte radiativo o
2

LRT I = I + donde p( ) =

p( )I(x, y, , t)d ,

(2.43)

1 1 = + 2

1 g2 1 2 (1 + g 2 2g cos( ))
n=1

(2.44) (2.45)

g n cos[n( )].

Si se considera la ecuacin de Fokker-Plank o LF P I = (1 g) 2 I(x, y, , t) . 2 (2.46)

A continuacin describiremos el mtodo numrico para resolver la ecuacin o e e o (2.39) siguiendo la referencia [46]. Mtodo numrico e e Por la naturaleza de la ecuacin de transporte radiativo, existen varios o mtodos para resolverla numricamente. Por ejemplo, e e para tratar la direccin se pueden utilizar: armnicos esfricos, elemeno o e tos nitos, discretizacin ordinaria. o Para tratar la variable espacial se puede utilizar: diferencias nitas, vol menes nitos, elementos nitos, mtodos espectrales. u e Para tratar la variable temporal se puede utilizar cualquier discretizacion que aproxime el operador diferencial hasta un orden determinado. 45

La combinacin de estos mtodos nos proporcionan distintas posibilidades o e para resolver la ecuacin de transporte radiativo. Distintas combinaciones de o los mtodos mencionados para resolver la ecuacin raditiva de transporte se e o pueden ver en [28], [66], [67], [68], [69], [71], [73]. El mtodo numrico que describiremos a continuacin, constar de cuatro e e o a partes: un mtodo iterativo sobre la fuente2 , una discretizacin ordinaria e o para la variable angular, una discretizacin en diferencias diamante para la o variable espacial y una discretizacion tipo euler para la variable temporal. Mtodo iterativo sobre la fuente e Para resolver la ecuacin (2.39), por el mtodo iterativo sobre la fuente o e (vase [81]), resolveremos numricamente e e 1 I l I l I l + cos() + sin() + a I l = J l1 , c t x y para l = 1, 2, . . . hasta llegar a un valor de convergencia denido por J l J l1 < , (2.48) (2.47)

donde el parmetro estar establecido por el usuario. Aqu el trmino fuente a a , e se dene como J0 = q J l = s LI l + q para l = 0, para l = 1, 2, . . . (2.49) (2.50)

Para cada iteracin, el mtodo numrico se compone de dos partes: calcular o e e la actualizacin del trmino fuente (2.49) y resolver la ecuacin diferencial o e o (2.47). Discretizacin angular o Consideremos, en primer lugar, una malla angular de N puntos denida por n = (n 1), donde = 2/N, para n = 1, . . . , N, y denamos la aproximacin In (x, y, t) I(x, y, n , t). o La solucin de la ecuacin (2.40) depender del operador de dispersin o o a o que consideremos
2

Este mtodo se basa en la solucin de la serie de Von Neumann (vase [128]). e o e

46

Para la ecuacin de transporte radiativo el operador integral se diso cretizar por una regla de cuadratura (vase [27]). Utilizando la regla a e de cuadratura, tendremos que
2 0 N

p(n )I(x, y, , t)d

pnk Ik (x, y, t),


k=1

(2.51)

para n = 1, . . . , N. Los pesos de la cuadratura pnk se denen como


k +/2

pnk =
k /2

p(n )d .

(2.52)

Luego, por las ecuaciones (2.51) y (2.52) el operador de dispersin para o la ecuacin de transporte radiativo, denido por la ecuacin (2.43) ser o o a
N

LN In (x, y, t) RT

= In (x, y, t) +

pnk Ik (x, y, t.)


k=1

(2.53)

y la actualizacin para el trmino fuente de la ecuacin (2.47) se calo e o cular como a Jn = LN In (x, y, t) + q(x, y, n , t). (2.54) RT Para la ecuacin de Fokker-Plank el operador diferencial se discretizar con o a un esquema de diferencias nitas centradas de segundo orden, de la forma 2 I(x, y, n , t) In+1 (x, y, t) 2In (x, y, t) + In1 (x, y, t) = , 2 ()2 (2.55)

para n = 1, . . . , N. Adems, para la malla angular, consideraremos a condiciones de frontera peridicas, es decir, I1 = IN e IN +1 = I1 . Eno tonces, por la ecuacin (2.55) el operador de dispersin para la ecuacin o o o de Fokker-Plank, denido por la ecuacin (2.46) ser o a LNP In (x, y, t) = (1 g) F In+1 (x, y) 2In (x, y) + In1 (x, y) . (2.56) ()2

El termino fuente q siempre se concidera conocido. 47

Discretizacin espacial o Utilizando la discretizacin angular, buscaremos resolver numricamente o e la ecuacin diferencial parcial o 1 In In In + cos(n ) + sin(n ) + a In = Jn , c t x y n = 1, . . . , N. (2.57)

Para resolver esta ecuacin utilizaremos el esquema de diferencias nitas o diamante (vase [81]). Una representacin del esquema se muestra en la gura e o 2.2.

yj+1/2 yj yj1/2

xi1/2

xi

xi+1/2

Flujo conocido en la frontera Flujo calculado en la interface de las celdas Flujo calculado en el interior de la celda Figura 2.2: Esquema del mallado para el mtodo de diferencias nitas diae mante El esquema de diferencias nitas diamante se basa en calcular el promedio de la intensidad espec ca en cada celda y en cada nodo. Para ello se aproxima los operadores diferenciales de la ecuacin (2.57) con un esquema en o diferencias nitas centradas de segundo orden In (xi+1/2 , y, t) In (xi1/2 , y, t) 1 In (x, y, t) + cos(n ) c t x In (x, yj+1/2 , t) In (x, yj1/2 , t) + sin(n ) y +a In (x, y, t) = Jn (x, y, t), 48

(2.58)

donde x = xi+1/2 xi1/2 y y = yj+1/2 yj1/2 . Luego se integra la ecuacin (2.58) para xi1/2 < x < xi+1/2 y para yj1/2 < y < yj+1/2 o 1 c dy
j i

dx

In (x, y, t) + cos(n ) t

dy[In (xi+1/2 , y, t) In (xi1/2 , y, t)] dy


j i

+ sin(n )
i

dx[In (x, yj+1/2 , t) In (x, yj1/2 , t)] + a =


j

dxIn (x, y, t) dxJn (x, y, t),


i

dy

(2.59) donde
i+1/2 j+1/2

dx =
i xi1/2

dx y
j

dy =
yj1/2

dy,

(2.60)

y nalmente, para obtener el promedio de la intensidad espec ca en cada celda y en cada nodo, multiplicamos la ecuacin (2.59) por 1/(xy) o 1 Ii,j,n (t) 1 + cos(n )[Ii+1/2,j,n (t) Ii1/2,j,n (t)] c t x 1 + sin(n )[Ii,j+1/2,n (t) Ii,j1/2,n (t)] + ai,j Ii,j,n (t) y = Ji,j,n (t),

(2.61)

donde el promedio de la intensidad espec ca en cada celda y en cada nodo estar denido, respectivamente, por a Ii,j,n (t) = 1 xy 1 y 1 x dy
j i

dxIn (x, y, t),

(2.62)

Ii1/2,j,n (t) =

dyIn(xi1/2 , y, t),
j

(2.63)

Ii,j1/2,n (t) = y Ji,j,n(t) =

dxIn (x, yj1/2 , t)


i

(2.64)

1 xy

dy
j i

dxJn (x, y, t).

(2.65)

49

Discretizacin temporal o Buscaremos resolver la ecuacin diferencial (2.61). Para ello utilizaremos o el principio del esquema de diferencias nitas diamante, es decir, buscaremos el promedio temporal de la intensidad espec ca. Entonces, empezaremos por aproximar el operador diferencial temporal con un esquema en diferencias nitas centradas de segundo orden 1 Ii,j,n(tk+1/2 ) Ii,j,n(tk1/2 ) 1 + cos(n )[Ii+1/2,j,n (t) Ii1/2,j,n (t)] c t x 1 + sin(n )[Ii,j+1/2,n (t) Ii,j1/2,n (t)] + ai,j Ii,j,n(t) = Ji,j,n(t), y (2.66) donde t = tk+1/2 tk1/2 . Luego integraremos la ecuacin (2.66) para o tk1/2 < t < tk+1/2 1 1 [Ii,j,n (tk+1/2 ) Ii,j,n (tk1/2 )] + cos(n ) dt[Ii+1/2,j,n (t) Ii1/2,j,n (t)] c x t 1 + sin(n ) dt[Ii,j+1/2,n (t) Ii,j1/2,n (t)] + ai,j dtIi,j,n(t) = dtJi,j,n (t) y t t t (2.67) donde dt =
t tk1/2 k+1/2

dt

(2.68)

y nalmente, para obtener el promedio temporal de la intensidad espec ca, multiplicaremos la ecuacin (2.67) por 1/t o 1 k+1/2 1 k1/2 k k [Ii,j,n Ii,j,n ] + cos(n )[Ii+1/2,j,n Ii1/2,j,n ] ct x 1 k k k k sin(n )[Ii,j+1/2,n Ii,j1/2,n ] + ai,j Ii,j,n = Ji,j,n + y donde Ii,j,n Ii,j,n
k Ii,j,n = k+1/2 k1/2

(2.69)

Ii,j,n(tk+1/2 ), Ii,j,n(tk1/2 ),
k+1/2

(2.70) (2.71) (2.72)

1 t

dtIi,j,n (t)
tk1/2

50

y
k Ii,j,n

1 = t

k+1/2

dtIi,j,n(t).
tk1/2

(2.73)

Finalmente, el mtodo numrico mostrado requiere tres relaciones auxie e liares que vinculan el ujo de la celda (interior) con el ujo de los nodos (esquinas), estas son:
k Ii,j,n = k Ii,j,n =

1 k k I + Ii1/2,j,n , 2 i+1/2,j,n 1 k k I + Ii,j1/2,n , 2 i,j+1/2,n 1 k+1/2 k1/2 Ii,j,n + Ii,j,n . 2

(2.74) (2.75) (2.76)

y
k Ii,j,n =

Observacin o La solucin del mtodo mostrado implica el barrido en el sentido en el o e que viajan los fotones. Como resultado de este barrido se producen cuatro iteraciones para cada proceso de dispersin. Estas son: o 1. cos(n ) > 0, sin(n ) > 0 de izquierda a derecha; de abajo hacia arriba. 2. cos(n ) < 0, sin(n ) > 0 de derecha a izquierda; de abajo hacia arriba. 3. cos(n ) > 0, sin(n ) < 0 de izquierda a derecha; de arriba hacia abajo. 4. cos(n ) < 0, sin(n ) < 0 de derecha a izquierda; de arriba hacia abajo. Luego, las relaciones (2.74) y (2.75) son utilizadas de la siguiente manera:
k k k Ii+1/2,j,n = 2Iijn Ii1/2,j,n ,

si si si si

cos(n ) > 0 cos(n ) < 0 sin(n ) > 0 sin(n ) < 0.

(2.77) (2.78) (2.79) (2.80)

k Ii1/2,j,n k Ii,j+1/2,n k Ii,j1/2,n

= =

k 2Iijn k 2Iijn k 2Iijn

k Ii+1/2,j,n , k Ii,j1/2,n , k Ii,j+1/2,n ,

La relacin (2.76) se utiliza de la siguiente manera o Ii,j,n


k1/2 k = 2Ii,j,n Ii,j,n . k+1/2

(2.81)

Entonces, para cada cuadrante se selecciona la relacin adecuada y junto o con la ecuacin (2.69) se obtiene la ecuacin en diferencias. Por ejemplo, si o o 51

consideramos el caso cos(n ) > 0 y sin(n ) > 0, la ecuacin en diferencias o ser: a Ii,j,n
k+1/2 k = Ii,j,n

ct ct k k k k cos(n ) Ii,j,n Ii1/2,j,n sin(n ) Ii,j,n Ii,j1/2,n x y ct ct k k a,ij Iijn + J . 2 2 ijn (2.82)

Para mayores detalles sobre el mtodo en diferencias tipo diamante, as coe mo el estudio en otras geometr de la ERT (vase [81]). Para detalles, as e comparaciones y aplicaciones del mtodo descrito anteriormente (vase [45], e e [46]).

2.2.2.

Aproximacin numrica a la ecuacin de difusin o e o o

De manera similar a lo efectuado para la ecuacin de transporte radiativo, o consideraremos el modelo en 2D. Escogeremos el plano x y. Sea 1 (x, y, t) D(x, y)(x, y, t) + a (x, y, t) = q(x, y, t) en [0, T ], c t (2.83) con condicin inicial o (x, y, 0) = 0 y la siguiente condicin de frontera o (x, y, t) + D(x, y)(x, y, t) n = sobre [0, T ], (2.85) en (2.84)

donde n es el vector normal a la supercie , R2 es la supercie de propagacin, S1 es la c o rculo unidad, el cual contiene todas las posibles direcciones de propagacin, [0, T ] es el intervalo de tiempo considerado y q o es la fuente de emisin. Adems, a es el coeciente de absorcin, o a o D= 1 2(a + s (1 g)) (2.86)

es el coeciente de difusin, s es el coeciente de dispersin, g es el parmetro o o a de anisotrop y , y son constantes que dependern de las caracter a a sticas del ujo en la frontera; por ejemplo, del ndice de refraccin. o 52

Esquema de Crank-Nicholson Para resolver numricamente la ecuacin (2.83) consideraremos el esquee o ma de Crank-Nicholson. La aproximacin de Crank-Nicholson a la ecuacin o o de difusin es consistente e incondicionalmente estable. Consecuentemente, o por el teorema de equivalencia de Lax, la aproximacin de Crank-Nicholson o a la ecuacin de difusin es convergente [55]. El esquema, impl o o cito, se basa en la construccin de una aproximacin numrica al valor de la solucin en o o e o (x, y, t + k/2) que es un punto situado entre dos las de la malla. Concretamente, si consideramos k (xi , yj , tk ), para (x, y, t + k/2)/t usamos ij la aproximacin que se obtiene a partir de la frmula de diferencias centradas o o k+1 k (xi , yj , t + k/2) ij ij = + O(dt2 ) (2.87) t dt y para D(x, y)(x, y, t+ k/2) usamos como aproximacin el valor medio o de D(x, y)(x, y, t) y D(x, y)(x, y, t + k) en (xi , yj ). El desarrollo del trmino (D), utilizando diferencias centradas, es e (Dm ) = = D m D m 2 m 2 m + +D +D x x y y x2 y 2

1 (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )m (Di+1,j Di1,j 4Di,j )m i+1,j i1,j 4dx2 1 (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )m (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )m + i,j+1 i,j1 4dy 2 1 1 8 + Di,j m + O(dx2 ) + O(dy 2 ), i,j 2 4dx 4dy 2 (2.88)

donde m = k si D(x, y)(x, y, t) y m = k+1 si D(x, y)(x, y, t+k). Utilizando (2.87) y (2.88), la ecuacin de difusin (2.83) se puede resolver o o por el mtodo de Crank-Nicholson de la siguiente manera e k+1 k i,j i,j k k+1 (Dk )+ai,j k (Dk+1 )+ai,j k+1 = qi,j +qi,j , i,j i,j dt (2.89) k+1 k donde qij q(x, y, t) y qij q(x, y, t + k). Si reordenamos los trminos de la ecuacin (2.89), obtenemos la siguiente e o ecuacin en diferencias. o 2
k+1 k k+1 k+1 (p[k+1]+q[k+1])+rai,j i,j = k +p[k]+q[k]rai,j k +r(qi,j +qi,j ), i,j i,j i,j (2.90)

53

donde p[k + 1] = dt (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )k+1 (Di+1,j Di1,j 4Di,j )k+1 i+1,j i1,j 8dx2 8Di,j k+1 , i,j (2.91) dt (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )k+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )k+1 i,j+1 i,j1 8dy 2 8Di,j k+1 , i,j (2.92)

q[k + 1] =

p[k] =

dt k (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )k i+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )i1,j 8dx2 8Di,j k , i,j (2.93) dt k (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )k i,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )i,j1 8dy 2 8Di,j k . i,j (2.94)

q[k] =

y r = dt/2. Para ms detalles ver el Apndice II. a e Condiciones de frontera La condicin de frontera o (x, y, t) + D(x, y)(x, y, t) n = (2.95)

se discretiza utilizando diferencias nitas de segundo orden para el operador diferencial. Para el trmino en x e i,j + Di,j i+1,j i1,j = . 2dx (2.96)

Despejando la ecuacin (2.96), obtendremos que o i+1,j = i1,j + e i1,j = i+1,j 2dx 2dx i,j Di,j Di,j 2dx 2dx + i,j . Di,j Di,j (2.97) (2.98)

54

Anlogo para el trmino en y a e i,j+1 = i,j1 + e i,j1 = i,j+1 2dy 2dy i,j Di,j Di,j 2dy 2dy + i,j . Di,j Di,j (2.99)

(2.100)

Finalmente, la ecuacin (2.90) junto con las condiciones de frontera (2.97), o (2.98), (2.99) y (2.100) forman el siguiente sistema AI k+1 = BI k + C, donde [Af ] A1 i A = [0] . . . [0] [Bf ] Bi1 B = [0] . . . [0] A+1 f [Ai ] .. .
+1 Bf [Bi ] .. .

(2.101) [0] [0] [0] A+1 i [Af ] [0] [0] [0] Bi+1 [Bf ]

A+1 i .. . A1 i Bi+1 .. . Bi1 [Cf ] [Ci ] . . . .

.. . [Ai ] A1 f .. . [Bi ] 1 Bf

Los matrices internas de la matriz A tienen af a+1 f a1 a a+1 f f f .. .. . . [Af ] = 0 . . . a1 f 0 55

C= [Ci ] [Cf ]

la siguiente estructura 0 0 .. . 0 , af a+1 f a1 af f

af a+1 f a1 ai i .. . [Ai ] = 0 . . . 0 af 0 0 a f .. . Af = 0 . . . 0

a+1 i .. .. . . a1 ai i a1 f 0 .. .. . . 0 a f 0

0 0 0 , a+1 i af 0 0 0 0 a f

donde ser +1 o 1, respectivamente. a a e Los trminos af , a+1 , a1 , ai , a+1 y a1 estn desarrollados en el Apndice e i i f f II. Las matrices internas de la matriz B tienen las mismas caracter sticas que las de la matriz A. Las matrices internas de la matriz C tienen la siguiente estructura cf cf . . [Cf ] = . cf cf y [Ci ] = ci cf 56 cf ci . . . .

a 0 0 f 0 a 0 0 i .. .. .. . . . 0 [A ] = 0 i . . 0 a 0 . i 0 0 a f

Los trminos cf y ci estn desarrollados en el Apndice II. e a e

Finalmente k es una matriz formada por los valores de intensidad, conocidos o previamente calculados e k+1 son los valores de la intensidad por calcular.

2.3.

Resultados

En esta seccin presentaremos los resultados de comparar la ecuacin o o radiativa de transporte, la ecuacin de difusin y la ecuacin de Fookkero o o Plank. La seccin se dividir en dos casos: o a el primer caso simular una fuente circular en el centro del tejido que a emite luz en todas direcciones y el segundo caso simular un lser que incide de forma perpendicular a a sobre una de las fronteras. Los resultados que se presentan a continuacin estn adimensionalizados, o a considerando el siguiene criterio de adimensionalizacin: o Para la longitud se considerar la profundidad ptica , es decir, a o = t L, donde L ser la longitud del tejido biolgico. a o Para el tiempo se considerar la siguiente adimencionalizacin a o t = tr , t (2.103) (2.102)

donde tr es el tiempo real y t es el tiempo que tardan los fotones en a travesar lt = 1/t con una velocidad v = c/nr 3 . Para el coeciente de dispersin consideraremos que o = s s , s (2.104)

donde s es el coeciente de dispersin de un tejido particular y s o es el coeciente de dispersin caracter o stico de los tejidos biolgicos o 1 (100cm ).
v es la velocidad de la luz en el medio y se calcula dividiendo la velocidad de la luz en el vac c para el o ndice de refraccin nr (para los tejidos biolgicos nr 1,4) o o
3

57

Para el coeciente de absorcin consideraremos que o a = , a a

(2.105)

donde a es el coeciente de absoricin de un tejido particular y a es el o coeciente de absorcin caracter o stico de los tejidos biolgicos (1cm1 ). o

2.3.1.

Fuente circular en el centro del tejido

En los resultados que presentamos a continuacin mostramos el comporo tamiento de las aproximaciones, ecuacin de difusin y ecuacin de Fokkero o o Plank, a la ecuacin de transporte radiativo cuando: o se cambia la profuncidad ptica, o se cambia el valor del parmetro g. a La gura 2.3 esquematiza el experimento. Receptor

Figura 2.3: Esquema que muestra un fuente circular en el centro del tejido que emite luz en todas las direcciones y un receptor en la frontera superior. Efectos del cambio en la profundidad ptica o A continuacin mostramos el comportamiento de la ecuacin de transfero o encia radiativa y de sus aproximaciones, ecuacin de difusin y ecuacin de o o o Fokker-Plank, frente a variaciones de la profundidad ptica . Hemos consido erado cuatro casos = 2, 5, 10, 20. El coeciente de dispersin es = 0,99, o s el coeciente de absorcin es a = 0,01 y el parmetro g = 0 para todos los o a casos. 58

x 10

0.2
T D FP

0.15

4 Flujo [u.a] Flujo [u.a]

0.1

0.05

0.05

10 Tiempo

15

20

10 Tiempo

15

20

(a)
x 10 12 10 8 Flujo [u.a] 6 4 2 0 2 Flujo [u.a]
4

(b)
x 10 14 12 10 8 6 4 2 0 2
5

10

20 30 Tiempo

40

50

20

40 60 Tiempo

80

100

(c)

(d)

Figura 2.4: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) para (a) = 2, o o o (b) = 5, (c) = 10 y (d) = 20. Efectos del cambio en el parmetro g a A continuacin mostramos el comportamiento de la ecuacin de transo o ferencia radiativa y de sus aproximaciones, ecuacin de difusin y ecuacin o o o de Fokker-Plank, frente a variaciones del parmetro g. Hemos considerado a cuatro casos g = 0, 0,5, 0,8, 0,9. El coeciente de dispersin es = 0,99, el o s 59

coeciente de absorcin es = 0,01 y la profundidad ptica es = 10 para o o a todos los casos.

x 10 14 12 10 8 6 4 2 0 2

x 10 3
T D FP

2.5 2
Flujo [u.a]

Flujo [u.a]

1.5 1 0.5 0 0.5

20

40 60 Tiempo

80

100

20

40 60 Tiempo

80

100

(a)
x 10 1 0.9 0.8 0.7
Flujo [u.a] Flujo [u.a]
3

(b)
x 10 2 1.8 1.6 1.4 1.2 1 0.8 0.6 0.4 0.2
3

0.6 0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0 20 40 60 Tiempo 80 100

20

40 60 Tiempo

80

100

(c)

(d)

Figura 2.5: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) para (a) g = 0, o o o (b) g = 0,5, (c) g = 0,8 y (d) g = 0,9.

60

2.3.2.

Lser que incide perperdicularmente sobre una a de las fronteras

En los resultados que presentaremos mostramos el comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo y de sus aproximaciones, ecuacin de o o difusin y ecuacin de Fokker-Plank, frente a variaciones del parmetro g, o o a cuando un lser incide perperdicularmente sobre la frontera izquierda. Se han a considerado dos tipos de medidas: el ujo de la intensidad reejada (receptor en la misma frontera que la fuente) y el ujo de la intensidad transmitida (receptor en la frontera opuesta). La gura 2.6 esquematiza el experimento.

Lser a Receptor Receptor

Figura 2.6: Esquema que muestra un fuente lser emitiendo en direccin pera o pendicular a la frontera del tejido. El receptor ubicado en el misma frontera de la fuente mide el ujo reejado y el receptor ubicado en el lado opuesto mide el ujo transmitido. A continuacin mostramos los cuatro casos considerados para el parmetro o a g, donde los parmetros pticos utilizados son: profundidad ptica = 10, a o o coeciente de dispersin = 0,99 y coeciente de absorcin = 0,01. o s o a

61

x 10 3

x 10 15
T D FP

2.5

10 2
Flujo [u.a] Flujo [u.a]

1.5

1 0 0.5

20

40 60 Tiempo

80

100

20

40 60 Tiempo

80

100

(a)

(b)

Figura 2.7: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) con g = 0 para o o o (a) ujo de la intensidad reejada y (b) ujo de la intensidad transmitida.
3 4

x 10 3.5 3 2.5
Flujo [u.a]

x 10 6
T D FP

5 4 3 2 1

2 1.5 1 0.5 0

Flujo [u.a]

0 1 2

20

40 60 Tiempo

80

100

20

40 60 Tiempo

80

100

(a)

(b)

Figura 2.8: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) con g = 0,5 para o o o (a) ujo de la intensidad reejada y (b) ujo de la intensidad transmitida.

62

x 10 20

x 10 20
T D FP

15

15

Flujo [u.a]

Flujo [u.a]

10

10

20

40 60 Tiempo

80

100

20

40 60 Tiempo

80

100

(a)

(b)

Figura 2.9: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) con g = 0,8 para o o o (a) ujo de la intensidad reejada y (b) ujo de la intensidad transmitida.
4 3

x 10 6 5 4 3 2 1 0 1 2

x 10 6
T D FP

5 4
Flujo [u.a]

Flujo [u.a]

3 2 1 0 1

20

40 60 Tiempo

80

100

20

40 60 Tiempo

80

100

(a)

(b)

Figura 2.10: Comportamiento de la ecuacin de transporte radiativo (T ), o ecuacin de difusin (D) y ecuacin de Fokker-Plank (F P ) con g = 0,9 para o o o (a) ujo de la intensidad reejada y (b) ujo de la intensidad transmitida.

63

Tiempos promedios El cuadro 2.2 muestra el tiempo promedio que utilizan los mtodos numrie e cos implementados para resolver la ecuacin de transporte radiativo, la ecuacin o o de Fokker-Plank y la ecuacin de difusin. La profundidad ptica utilizada o o o es = 10 para la cual se ha utilizada una malla de 151 151 para el dominio espacial, 32 ngulos para discretizar la variable angular, un tiempo de tiempo a de dt = 0,5 con un tiempo nal de tf = 100. El equipo utilizado ha sido un portatil Dell con procesador Intel(R)Core(TM)2DuoCPU T9300, 2.50GHz y 4GB de memoria RAM. Ecuacin de transporte radiativo o Ecuacin de Fokker-Plank o Ecuacin de difusin o o 36.76 min 10.88 min 0.77 min

Cuadro 2.2: Tiempos de ejecucin. o

64

Cap tulo 3 Estimacin de la distribucin y o o el tiempo de vida de uorforos o


3.1. Introduccin o

Debido a la fuerte interaccin del la luz con el tejido biolgico in vivo o o las imgenes pticas (optical imaging) se estn presentando como una gran a o a promesa para el estudio de las funciones de clulas y tejidos. Entre las tcnicas e e pticas para las imgenes macroscpicas no invasivas, las tcnicas de uoreso a o e cencia estn adquiriendo un papel reelevante. Esto se debe a la utilizacin a o de marcadores uorescentes que proporcionan mayor especicidad que las tcnicas basadas en la absorcin o dispersin [28, 4, 44]. El objetivo biolgico e o o o es marcado con una molcula uorescente que es excitada por una fuente e de luz externa para aumentar la imagen y la informacin sobre su entorno o (pH local, concentraciones de calcio y sodio, saturacin de ox o geno,...). Una aproximacin es utilizar molculas con espectros uorescentes que dependan o e del entorno local, y analizar la respuesta espectral del medio. Otra forma de obtener informacin es mediante mediciones del tiempo de vida uorescente. o El tiempo de vida uorescente de las molculas excitadas cambia debido a e diferentes mecanismos de desactivacin, tales como coliciones o transfereno cia de energ que desactivan el estado excitado. Vamos a considerar en este a (cap tulo), esta ultima aproximacin: imgenes basadas en el tiempo de vida o a uorescente. Las imgenes basadas en el tiempo de vida uorescente implican la recona struccin de la distribucin espacial de las tasas del decaimiento uorescente o o en muestras de tejido. Utiliza el tiempo de vida de la molcula uorescente, e en lugar de su intensidad, para crear las imgenes. Debido a su relativa a 65

simplicidad, las tcnicas ms comunes se basan en la excitacin con ondas e a o continuas (CW) [67, 74] y en la excitacin con frecuencia modulada (FD) o [43, 96]. Sin embargo, las investigaciones actuales tambin se centran en la e excitacin por pulsos en el dominio temporal (TD). La aproximacin por el o o dominio temporal requiere de una tecnolog ms sosticada (peque os pula a n sos de lser para la excitacin y detectores capaces de registrar la se al), pero a o n ofrece varias ventajas sobre las aproximaciones realizadas con ondas continuas (CW) y las realizadas con frecuencia modulada [77]. La deteccin en el o dominio temporal a ade una nueva dimensin a los datos de uorescencia y n o la posibilidad de analizar perles de decaimiento ms complejos a partir de a clulas individuales en muestras gruesas de tejido biolgico. e o Las dicultades de las imgenes basadas en el tiempo de vida uorescente a en tejidos con varios cent metros de espesor son similares a la que tienen las imgenes por microscop de uorescencia y la imgenes por el tiempo de vida a a a fosforecente. Sin embargo, las imgenes basadas en el tiempo de vida uoresa cente poseen algunos retos (ventajas) sobre estas ultimas. En la microscop a de uorescencia, las muestras del tejido son pticamente muy delgadas. Por o lo tanto, la dispersin es despresiable y el modelado es mucho ms sencillo o a ya que no hay necesidad de dar cuenta de ella. Por otra parte, en imgenes a por el tiempo de vida fosforecente los tiempos para la migracin de fotones o en el tejido (del orden de nanosegundos) son despresiables comparados con los tiempos de vida de las muestras fosforecentes (del orden de decenas de microsegundos) lo cual simplica el problema. Sin embargo, lo caracter stico de los tiempos de vida uorescentes es que son com nmente utilizados para u obtener informacin funcional de las muestras biolgicas cuyo rango va desde o o los picosegundos a los nanosegundos. Dos son los desaf que se plantean las imgenes basadas en el tiempo os a de vida uorescente dentro de medios pticamente gruesos debido a las cueso tiones antes mencionadas: (i) dado que en los tejidos biolgicos la luz sufre o m ltiples procesos de dispersin, la descripcin de fenmenos de propagacin u o o o o de la luz se vuelve mucho ms compleja, y (ii) los tiempos para la migracin a o de fotones son comparables con la razn de la disminucin de uorescencia de o o la muestra uorescente, as la distribucin temporal de la se al uorescente o n resultante es la convolucin del pulso dispersado en el tejido y las tasas de o los decaimientos uorescentes. Puesto que la m ltiple dispersin causa una u o severa prdida de resolucin espacial, no se puede hacer uso de imgenes e o a directas y se debe desarrollar nuevos algoritmos para la reconstruccin de o las imgenes, esto con lleva resolver el problema inverso asociado para mejoa rar nuestra capacidad de visualizacin. De hecho, la aparicin de sosticados o o marcadores uorescentes para objetivos biolgicos espec o cos; por ejemplo, 66

marcacin gentica, a motivado el desarrollo de nuevas tecnolog pticas o e as o para imgenes de uorescencia con el objeto de obtener mayor informacin a o de la molcula uorescente. Debemos tener presente que en las imgenes por e a uorescencia, la molculas uorescentes actuan como una fuente interna, y el e proceso de visualizacin equivale a la solucin de un problema inverso donde o o la fuente son las medidas tomadas sobre la frontera. En este cap tulo proponemos una aproximacin basada en [30, 31, 57] o para reconstruir el decaimiento de la uorescencia como un mapa del tejido biolgico. En lugar del clsico esquema iterativo basado en pixels que o a suele conducir a un excesivo suavizado de las imgenes de las propiedades a pticas del tejido, una estrategia basada en fronteras bien denidas y una eso timacin ms conable de los parmetros pticos de inters. Esto es as por o a a o e , que una estrateg basada en la forma y en la regularizacin impl a o cita reduce la dimensionalidad del problema inverso y, por tanto, ayuda a estabilizar el proceso de reconstruccin. Nuestro algoritmo utiliza la tcnica llamada level o e set para representar las formas de las regiones del tejido con diferente ndice de decaimiento uorescente. La principal ventaja de la tcnica de level set es e que nos libera de las restricciones topolgicas cuando reconstru o mos apriori un n mero arbitrario de uorforos. u o En su forma tradicional, la tcnica de level set permite la separacin y e o fusin automatica de formas durante la reconstruccin estableciendo apriori o o el valor de los parmetros en el interior de la forma. Para buscar la forma y a el tiempo de vida de un conjunto de uorforos se lleva a cabo la solucin o o de un problema de optimizacin con una estrategia basada en el gradiente. o En otras palabras, estimamos simultaneamente la distribucin de uorforos o o utilizando una aproximacin basada en la forma y los tiempos de vida uoo rescentes utilizando un gradiente. Nuestros resultados numricos validan esta e estrategia combinada. Este cap tulo se organizar de la siguiente manera. a

3.2.

Conceptos generales

En esta seccin revisaremos los conceptos bsicos que hemos utilizado o a para la reconstruccin de la fuente uorescente. Partiremos con una breve o exposicin sobre el llamado problema inverso, en la cual mencionaremos sus o deniciones principales, problemas al plantearlos y los mtodos mas comunes e para su regularizacin. Luego expondremos la tcnica de level-set, la cual o e ser de fundamental inters en el desarrollo del cap a e tulo, pues est ser la a a herramienta principal para la reconstruccin de la fuente uorescente, en o 67

esta exposicin mencionaremos el uso de las level-set para la representacin o o de dos o ms regiones. Finalmente, mencionaremos la idea bsica para la a a deformacin de formas, a partir del clculo de variaciones. o a

3.2.1.

Problema inverso

El objetivo de recolectar datos es obtener informacin signicativa aco erca de un sistema f sico o fenmeno de inters. Sin embargo, en muchas o e situaciones las cantidades que queremos determinar son diferentes o se han medido de forma diferente a la que somos capaces de medir. Si los datos medidos depende, en cierto modo, de las cantidades que queremos, entonces los datos contendrn algo de informacin sobre dichas cantidades. A para o tir de los datos que hemos medido, el problema de tratar de reconstruir las cantidades que realmente queremos es llamado un problema inverso. En otras palabras, un problema inverso es aquel en el cual habiendo medido un efecto, queremos determinar su causa [125]. Los problemas inversos surgen en disciplinas tales como geof sica, astronom navegacin, imgenes mdicas. De esta breve e incompleta lista, a, o a e es evidente que el mbito de aplicacin de la teor del problema inverso es a o a extensa y sus aplicaciones pueden encontrarse en diversas campos. En particular, este trabajo se centra en la adquisicin de imgenes mdicas con o a e uorescencia. Deniciones El conjunto de valores que queremos reconstruir se llamar imgen, ina a cluso si esos valores no representan una imagen, sino que son simplemente los parmetros que denen al modelo (por ejemplo, el tiempo de vida ). El a conjunto de todas las imgenes se llamar espacio imgen. Notaremos a a a a la imagen con r y al espacio imagen con I. Por otra parte, en la prctica, nunca somos capaces de hacer mediciones a exactas y los datos que obtenemos medimos son una aproximacin a las o cantidades verdaderas. Al conjunto de todos los posibles datos o medidas le llamaremos espacio datos. Notaremos a los datos con g y al espacio datos con G. Por lo mencionado, podemos denir el problema directo como la aplicacin de la imgen a las cantidades que somos capaces de medir, mientras el o a correspondiente problema inverso consistir en encontrar la imgen origa a inal teniendo en cuenta los datos medidos. Notaremos a la aplicacin con o A. 68

En resumen, el problema directo dene la aplicacin o A : I G x g = Ar, y el problema inverso dene la aplicacin o A1 : G I g r = A1 g. (3.1)

(3.2)

Esta aplicacin involucra la existencia de A1 . Las caracter o sticas de la aplicacin A y por tanto de A1 establecern si un problema inverso est bien o a a propuesto o no. Formalmente I y G deben ser espacis de Hilbert y A un operador lineal o acotado (vase [91]). e Problemas inversos mal propuestos Diremos que un problema inveso est bien propuesto si se satisfacen las a tres condiciones siguientes: Existe solucin exacta. o No hay ms que una solucin a o La solucin depende continuamente de los datos o Estas tres condiciones implican que g est en el rango de A, que A es inyeca tiva y que A1 existe y es continua en los espacios dados. En aplicaciones mdicas (especialmente imgenes) encontramos una gran e a variedad de problemas inversos los cuales, generalmente, no cumplen las tres condiciones (a menudo ninguna de ellas en lo absoluto), lo que signica que estn mal planteados. Adems, cuando se discretiza el problema para rea a solverlo numricamente, el mal planteamiento del problema inverso se reeja e en una matriz mal condicionada. Para resolver un problema inverso mal propuesto necesitamos regularizarlo. Regularizacin o Regularizacin signica reemplazar en problema inverso mal propuesto o por una familia de problemas aproximados bien propuestos, los cuales estarn caracterizados por uno o ms parmetros de regularizacin. Al nal, a a a o 69

se escojer una de la aproximaciones para que represente la solucin del proa o blema inverso mal propuesto. La solucin presentada, al no ser la verdadera o solucin del problema inverso mal propuesto (generalmente no existe), toma o el nombre de cuasi solucin. o Entre los mtodos ms frecuentes para regularizar problemas inversos e a mal propuestos tenemos: el mtodo de m e nimos cuadrado y el mtodo de e Tikhonov. El mtodo de m e nimos cuadrados busca un estimador que minimize r el funcional 2 J = Ar g , (3.3) A A = A g , r donde A es el operador adjunto de A (para detalles vase [34]). e El mtodo de Tikhonov busca un r que minimize el funcional de coste e modicado 2 2 J = Ar g + r , (3.5) y se la unica solucin del sistema o (A A + I)r = A g , (3.6) (3.4)

y que sea la unica solucin del sistema o

donde I es la matriz identidad y > 0 es el parmetro de regularizacin a o (para detalles vase [127]). e En esta tesis hemos utilizado el mtodo de m e nimos cuadrados.

3.2.2.

Level sets

El mtodo de level-set fue originalmente desarrollado por Osher y Sethie an para describir el movimiento de curvas y supercies [97, 98]. Desde entonces, este mtodo ha sido ampliamente utilizado en diferentes reas de e a investigacin. Ejemplos de ello son la aplicacin a la mejora de imgenes, o o a crecimiento de cristales, y otros [115]. En 1996, Santosa propuso el uso de la tcnica level-set para resolver problemas inversos con interfaces [112]. En e este primer trabajo el present como ejemplo la solucin de problemas ino o versos lineales utilizando la tcnica level-set para la representacin de las e o formas. Ms tarde, el mtodo del level-set fue utilizado por Litman [84] para a e problemas inversos no lineales de dispersin. En este trabajo, la evolucin o o 70

de una forma se dene calculando la derivada del funcional de coste con respecto a la forma desconocida, la frontera de la forma se mueve en una direccin descendente al funcional de coste correspondiente. El clcuo de la o a velocidad de interface, es decir, las actualizaciones para la funcin level-set en o cada paso, requieren resolver un problema directo y un problema adjunto. A continuacin explicaremos las ideas principales para la representacin de foro o mas por level-sets he introduciremos una ley de evolucin como herramienta o principal para la reconstruccin de formas. o Representacin de dos regiones por level-sets o En el mtodo level-set la forma de un objeto est representada impl e a citamente por una funcin level-set de dimensin superior. La frontera de la o o forma coincide con el cero de la level-set, y los valores negativos de la funcin o level-set denen el interior de la forma. La gura 3.1 ilustra esta relacin. o
Funcin level-set (S + S) o Funcin level-set (S) o Forma S + S

z y x

z=0

Figura 3.1: La funcin level-set dene impl o citamente la forma S. Una peque a perturbacin modica la forma S a una nueva forma S + S de n o manera impl cita. La gura muestra una posible funcin level-set en algun paso de la o evolucin de la forma (l o nea cont nua), y una posible modicacin de esta o funcin level-set (linea cortada) despus de que una actualizacin haya o e o sido aplicada de acuerdo a alg n criterio (por ejemplo, la disminucin de u o una funcin de coste predenida). Obviamente, la representacin impl o o cita de una funcin level-set no es unica pues, existen innitas funciones level-set o que pueden denir una determinada forma S. 71

Usualmente, el n mero de componentes en el dominio de inters S es u e arbitrario y desconocido. Durante el proceso de recontruccin, normalmente o se necesita modelar cambios topolgicos. Los modelos tradicionales que pao rametrizan la forma S no son adecuados para modelar cambios topolgicos o puesto que ellos requieren una reparametrizacin en cada caso. La ventao ja de utilizar la tcnica de level-set es que los cambios topolgicos ocurren e o automaticamente sin la necesidad de reparametrizacin [30]. o Una funcin level-set (r) dene por partes un coeciente constante (r) o que caracteriza el dominio , donde se localiza la variable r, de la siguiente manera i en S, (r) 0 (r, ) = (3.7) e en \ S, (r) > 0. De esta forma, la distribucin de este parmetro caracter o a stico en el dominio depende de la funcin level-set (r) . Para calcular la evolucin de la o o funcin level-set es de utilidad introducir una banda-ajuste (narrowband) o (r), de una anchura determinada, que coincida con los contornos de (r). A menudo, la funcin level-set se modica slo dentro de la banda-ajuste o o cuando se mueve computacionalmente un paso su frontera. La gura 3.2 esquematiza la denicin del parmetro . o a e > 0

S i 0

banda-ajuste

Figura 3.2: La distribucin del parmetro est denido por la funcin o a a o level-set . Banda-ajuste en la cual se modica la funcin level-set . o Una posible enfoque de optimizacin para el clculo de la evolucin de la o a o funcin level-set (r) consiste en minimizar el funcional de coste por m o nimos 72

cuadrado denido como 1 2 Ar g , (3.8) 2 Formalmente la evolucin de la funcin level-set , en un campo de velocio o dades v(r) esta dada para cada punto del dominio (vase [30]). El objetido e es disminuir el funcional de coste J(S) aplicando un campo de velocidades v(r) en direccin n(r), normal a la frontera de la forma. Por lo general, la o evolucin se lleva a cabo slo en la banda-ajuste (r) que tiene la forma o o en su frontera. Obviamente, la componente tangencial de v(r) no contribuye a la deformacin de la forma. Matematicamente, la expresin general para o o la direccin descendente del funcional de coste contiene un producto escalar o v(r) (r), donde v(r) est calculado apropiadamente. En esta tesis, seguiren a mos un enfoque ligeramente diferente para lo cual deniremos una ley de evolucin o d = f (r; ) (3.9) d para la funcin level-set que describe la interface entre el tejido y los uo orforos. El trmino escalar forzante f (r; ) depende de la posicin r y de la o e o evolucin de un tiempo articial , que est determinado de tal manera que o a el funcional de coste (3.8) decrezca. J(S) = Representacin de mltiples regiones con level-set o u En muchas aplicaciones necesitamos reconstruir la distribucin de parmeto a ros de inters denidos para ms de dos posibles valores; por ejemplo, los e a distintos tiempos de vida uorescente. La literatura de las aproximaciones por level-set dividen este problema es dos grupos: las tcnicas que usan una e sla funcin level-set y las tcnicas que usan dos o ms funciones level-set o o e a dependiendo del n mero de materiales distintos que existan en el dominio. u En las tcnicas del primer grupo, las interfases de los distintos materie ales son representados por la misma funcin level-set, pero usando diferentes o niveles (valores) para la level-set. La gura 3.3 ilustra esto. Esta aproximacin tiene algunas desventajas (vase [84]). En particuo e lar, es posible que no existan suentes funciones level-set que satisfagan las restricciones planteadas (estas tcnicas pueden terner restriccioens topolgie o cas). En la segunda aproximacin, algunas funciones level-set son utilizadas o para representar un domino compuesto por m ltiples regiones (cada funcin u o level-set est asociada con un diferente material), como en [117, 148]. Debea mos tener presente que las funciones level-set pueden solaparse durante el 73

S2

S1

z y x

Figura 3.3: Una unica funcin level-set que representa dos materiales o

proceso de iteracin dado que f o sicamente no estn bien denidos materiales a con m ltiples valores. En este caso, restricciones adicionales pueden ser inu troducidas para minimizar el funcional de coste en las zonas solapadas. La gura 3.4 esquematiza esta aproximacin. o

2 1

1 < 0

S2
2 < 0

S1
z y x

Figura 3.4: Dos funciones level-set que representa dos materiales

Alternativamente, una aproximacin ligeramente distinta utilizando ms o a de una funcin level-set ha sido propuesta en [14, 84, 137] para afrontar este o problema. 74

3.2.3.

Deformacin de las formas a partir del clculo o a de variaciones

Las deformaciones de las formas S pueden ser representadas haciendo uso de las funciones level-set. Explicaresmos, brevemente la idea expuesta por Santosa [112]. Si se usa la denicin del funcional de coste por m o nimos cuadrados, y se escribe en la forma de producto interno , G en el espacio de datos se obtiene que J(S) = 1 R(S) 2 2 1 = R(S), R(S) G. 2

(3.10)

El residuo R(S) puede ser desarrollado como R(S + S) = R(S) + R (S)S + O( S


2 G),

(3.11)

donde I es la norma en el espacio de los parmetros I, con una peque a a n perturbacin S I. El operador lineal R (S) es la derivada de Frchet de o e R. Sustiyendo (3.76) en (3.75) obtenemos la siguiente relacin o J(S + S) = J(S) + R (S) R(S), S
I

+ O( S

2 G).

(3.12)

El operador R (S) es el operador adjunto de R (S) con respecto a los espacios G e I, que se relacionan de la siguiente manera: R (S) g, S = g, R(S)S G, para todo S I y g G. (3.13)

De esta forma podemos denir gradS J = R (S) R(S) que es la direccin del gradiente de J con respecto S. o (3.14)

3.3.

Modelo para la propagacin de luz o

Para modelar la uorescencia en el tejido consideraremos las siguientes etapas: (i) la propagacin de la luz de excitacin es desde la supercie del o o tejido hacia su interior, (ii) absorcin por uorforos, (iii) conversin a uo o o orescencia, (iv) emisin de la luz uorescente desde los uorforos, y (v) la o o 75

luz emitida regresa a la supercie del tejido (omitimos la re-emisin de la luz o absorbida). Adems, supondremos que los espectros de absorcin y emisin a o o de las molculas uorescentes no se solapan. Por lo tanto, los procesos de e excitacin y emisin tienen lugar en diferentes longitudes de onda denotadas o o por x y m > x , respectivamente. La ecuacin de difusin ha sido ampliamente utilizada en la tomograf o o a ptica difusa para obtener imgenes en tejidos biolgicos con varios cent o a o metros de espesor (vase [4]) y en particular el problema inverso de una fuente e uorescente en imgenes moleculares pticas (optical molecular imaging) a o [16, 61, 76, 95, 87, 96, 99]. Es una buena aproximacin a la ecuacin de o o transporte radiativo que describe la propagacin de la luz a travs de medios o e que la absorben y la dispersan, cuando el medio es pticamente grueso y o las fuentes uorescentes no estn cerca de los detectores ubicados sobre la a supercie del tejido. Una aproximacin alternativa, en la ptica de tejidos, o o es la aproximacin de Fokker-Plank cuando la dispersin es predominante o o en la direccin de incidencia. Anal o ticamente esta aproximacin reemplaza el o operador integral de la ecuacin de transporte por un operador diferencial o [71, 70, 72]. Las ecuaciones de difusin que modelan la propagacin de la luz excitada o o y emitida son 1 x (r, t) Dx 2 x (r, t) + (x + xm (r))x (r, t) = q(r, t0(3.15) ) a a v t 1 m (r, t) Dm 2 m (r, t) + m m (r, t) = qxm (r, t) (3.16) a v t En estas ecuaciones, x y m son el promedio de las intensidades difusivas correspondientes a la propagacin de luz excitada y emitida a longitudes o de onda x y m , respectivamente, con velocidad v. Ellas dependen de la posicin r Rn (n = 2, 3) y el tiempo t [0, T ]. Consideramos una o geometr en dos dimensiones. En un dominio bidimensional, los coecientes a de difusin en las longitudes de onda de excitacin y emisin son o o o Dx = 1 , 2 [(1 g)x + (x + xm)] s a a Dm = 1 . 2 [(1 g)m + m ] s a (3.17)

En (3.17), x y x , y m y m , representan los coecientes de absorcin o a s a s y emisin para las longitudes de onda de excitacin y emisin, respectivao o o mente. La absorcin dada por los uorforos en (3.15)-(3.17) es dada por o o el coeciente de absorcin del uorforo xm. En (3.17), g es el factor de o o a anisotrop y representa el promedio de avance (g > 0) o retroceso (g < 0) a de la dispersin. o 76

Consideramos que el tejido es iluminado en un tiempo t0 por un peque o n pulso lser sobre un punto rs en la frontera. Esto se modela con la expresin a o del lado derecho de la ecuacin (3.15), la cual es igual a o q(r, t0 ) = (r rs )(t t0 ) (3.18)

y para los experimentos n mericos modelaremos el pulso-laser con una disu tribucin gaussina, de tal forma que o q(r, t0 ) = 1 e 2 (
1 rrs s

s 2

t 2

1 2

tt0 t

(3.19)

donde s 0 y t 0. La luz de emisin generada en la posicin r y en el tiempo t se dene por o o el trmino fuente e qxm (r, t) = xm (r) (r) a
t

e(tt )/ (r) x (r, t ) d t


0

(3.20)

en (3.20), (r) representa la distribucin del tiempo de vida. Es el resultado o de la convolucin en el tiempo de un trmino exponencial que describe el o e decrecimiento de la emisin, y el promedio de la intensidad de excitacin en o o el tiempo t. La emisin estimulada (3.20) es directamente proporcional a la o eciencia cuntica del uorforo, que cuantica la conversin a uorescena o o xm cia, y al coeciente de absorcin del uorforo a (r), pero es inversamente o o proporcional al tiempo de vida (r). Las ecuaciones (3.15)-(3.16) se resuelven con las condiciones iniciales y de frontera apropiadas. Para modelar que el ujo total hacia el interior es cero, utilizamos condiciones de frontera tipo Robin x,m (r, t) + x,m (r, t) Dx,m = 0, 2 n r , (3.21)

donde n es el vector normal exterior a la supercie del tejido . Adems, a supondremos que para t0 no existe energ en el medio, con lo cual, las a condiciones iniciales son x,m (r, 0) = 0 r . (3.22)

Las ecuaciones (3.15)-(3.16) sujetas a (3.21)-(3.22) comprenden una descripcin completa del problema directo para imgenes en ptica difusa. o a o 77

3.4.

Reconstruccin de la fuente uorescente o

Nuestro objetivo es reconstruir la distribucin de uorforos xm(r) y o o a la distribucin del tiempo de vida (r) de una fuente uorescente (3.20) o utilizando los datos medidos f sicamente m Gjl = Dm , n (3.23)

tomados a partir de la supercie del tejido en las posiciones rl , l = 1, . . . , l, para la fuente de excitacin dada en la ecuacin (3.15) con rs = rj , j = o o m representa el promedio de la intensidad correspon1, . . . , j . En (3.23), diente a los parmetros f a sicamente correctos xm y . Representaremos a jl }l=1,...,l , para una fuente ja j, por el vector al conjunto de medidas reales {G Gj . El objetivo de reconstruir la distribucin de una o ms fuentes uoreso a centes (uorforos) requiere la deteccin de fronteras bien denidas entre los o o uorforos y las homogeneidades del medio. Puesto que las tcnicas tradio e cionales de reconstruccin buscan recuperar la intensidad uorescente en cada o pixel/voxel de la imagen, a menudo conducen a la confusin de las distino tas fronteras, por lo cual, proponemos una aproximacin basada en la forma o utilizando las tcnicas de level-set. La reconstruccin basada en la forma e o preserva la nitidez de los bordes y aumenta el contraste de la imagen. En la reconstruccin de formas por la aproximacin level-set, la forma o o desconocida S de la distribucin de uorforos est implicitamente represeno o a tada por una funcin level-set lo sucientemente suave de la siguiente o manera: xm(r) = a
xm a,in 0

dentro de S, fuera de S,

donde (r) 0 , donde (r) > 0 .

(3.24)

Aqu xm representa el coeciente de absorcin del uorforo el cual supon, a,in o o dremos constante dentro del mismo. La frontera del uorforo, S, consiste o de todos los puntos donde (r) = 0, y la distribucin de uorforos es distino o ta a cero en todos los puntos donde (r) 0. Indicaremos la dependencia del parmetro xm sobre la funcin leve-set , por xm[]. La principal vena o a a taja de representar implicitamente una forma desconocida por una funcin o level-set es la capacidad que esta tiene para dividirse o fusionarse automaticamente durante la reconstruccin de la misma. o Con las deniciones realizadas podemos formular el problema de reconstruir una forma usando level-set como sigue. (i) supondremos que las propiedades pticas del tejido y de los uorforos son conocidas, (ii) los datos o o 78

(reales) medidos (3.23) sobre la supercie del tejido estn dados y (iii) busa xm caremos una funcin level-set tal que a [] coincida con los datos, es o decir, G(xm[])jl Gjl , a donde G(xm []) = Dm a m . n (3.26) (3.25)

Para resolver el problema de reconstruir una forma seguiremos una aproximacin que evoluciona en el tiempo [1, 57]. Introducimos, para ello, un tiempo o articial (relacionado con el paso iterativo del proceso de reconstruccin), o y usamos una ley de evolucin o d = f (r; ) d (3.27)

para la funcin level-set desconocida . El proposito de la ley de evolucin o o (3.27) es reducir, y eventualmente minimizar, el funcional de coste de m nimos cuadrados, denido de la siguiente manera J(xm [()]) = a donde R(xm[()]) = Gj (xm[()]) Gj , a a (3.29) 1 R(xm[()]) a 2
2 G

(3.28)

al igual que (3.25), representa la coincidencia entre los datos medidos si camente Gj , y los datos estimados a partir de una fuente ja j. Utilizando (3.26), podemos decir que G(xm [()])j = D a m n (3.30)

donde, para nuestro modelo, hemos utilizando una distribucin paramtrica o e xm dada por a [()]. El trmino forzante desconocido f (r, ) en (3.27) se elije de tal manera e que el funcional de coste (3.28) decrezca para un paso de tiempo lo sucientemente peque o en el algoritmo. Dado que la formulacin del funcional de n o coste de m nimos cuadrados (3.28) depende del tiempo articial , la diferenciacin de J(xm (())) con respecto al tiempo , aplicando la regla de o a 79

la cadena produce dJ J xm d a = d xm d a xm d = grad J, a d =

(3.31)
I

dr grad J(r; ) xm () f (r, ) , a,in

done , I representa el producto interno cannico en el espacio de parmetros o a I. Usando esta ecuacin, podemos seleccionar una direccin descendente para o o el funcional de coste tomando f (r; ) = grad J(r; ) para todo r . (3.32)

Notemos que el hecho de resolver (3.27), nos premite extender f a todo el dominio (estrictamente, f slo se deriva para (3.31) en aquellos puntos donde o (r) = 0, i.e., en la frontera de la forma). El elegir una velocidad extendida f (r; ) tiene la util propiedad que nos permite crear objetos en cualquier punto del domino, para valores positivos muy peque os de la funcin level n o set antes de que sus valores se vuelvan negativos. Recomendamos [30] para ms detalles sobre otras posibles extensiones de f (r; ). a Una eciente manera de calcular la direccin del gradiente de J en xm es o a el uso de la formulacin adjunta. Para ello proponemos el siguiente teorema. o Teorema 3.1. La direccin del gradiente J con respecto a xm[()] en o a cada tiempo articial est dado por a grad J(r; ) = (r)
T t

dt W (r, t)
0 0

dt e(tt )/ (r) x (r, t ) ,

(3.33)

donde x (r, t ) es la solucin (3.15) considerando (3.24), y W (r, t) es la o solucin de la siguiente ecuacin adjunta o o 1 W (r, t) Dm 2 W (r, t) + m W (r, t) = 0 , a v t (3.34)

la cual est sujeta a las siguiente condiciones a W (r, t = T ) = 0 W (r, t) = R(xm [()]) donde r . a 80 (3.35) (3.36)

Demostracin o El objetivo de la presente demostracin es determinar el valor de o dJ dxm[()] a . (3.37)

Para ello, utilizaremos una formulacin variacional en la cual o J = Formulacin dbil. o e Si x (r, t) y m (r, t) son soluciones de (3.15) y (3.16), respectivamente, entonces para cualquier par de funciones Z(r, t) y W (r, t) se cumple que
T

J xm. a xm a

(3.38)

L1 =
0

dt

dr Z(r, t)Mx

(3.39)

=0 y que
T

L2 =
0

dt

dr W (r, t)Mm

(3.40)

=0 donde Mx = y Mm = 1 m (r, t) Dm 2 m (r, t) + m m (r, t) qxm (r, t). a v t (3.42) 1 x (r, t) Dx 2 x (r, t) + (x + xm )x (r, t) q(r, t0 ) (3.41) a a v t

Ahora, para determinar el valor de (3.37) utilizaremos la ayuda de un lagrangiano. Denimos el lagrangiano L como L(xm , x , m ) = J + L1 + L2 . a La derivada de L es L = L L L xm a x m . xm a x m 81 (3.44) (3.43)

Antes de continuar notemos que cuando x (r, t) y m (r, t) son soluciones de (3.15) y (3.16), respectivamente, (3.39) y (3.40) se cumplen, es decir, L1 = L2 = 0 y, por lo tanto, L = J. (3.45) para todo Z(r, t) y W (r, t). En particular, L = J. (3.46)

Por otra parte, si en (3.44) elegimos funciones Z(r, t) y W (r, t) de manera que L x = 0 , x L m = 0 . m tendremos que L = L xm xm a a (3.49) (3.47) (3.48)

y sustituyendo (3.46) en (3.49) obtendremos que J = L xm . a xm a (3.50)

Esto signica que la variacin del funcional de coste J ser igual a la variacin o a o del lagrangiano L con respeto a xm , considerando Z(r, t) y W (r, t) de a manera adecuada. Veamos a continuacin la condiciones que deben cumplir Z(r, t) y W (r, t) o para que (3.47) y (3.48) se cumplan. Consideremos, en primer lugar, (3.47) y escribamos una aproximacin a o primer orden, de la siguiente manera L x = L(xm , x + x , m ) L(xm , x , m ). a a x (3.51)

Luego de las operaciones algebraicas respectivas, sobre el lado derecho de (3.51) y dada la linealidad de los operadores, llegamos a la siguiente igualdad L x = x
T

dt
0

dr Z

1 x Dx 2 x + (x + xm )x a a v t

. (3.52)

82

Integrando por partes, aplicando el teorema de la divergencia, y utilizando (3.21) y (3.22), en el lado derecho de (3.52), obtenemos que 1 x Dx 2 x + (x + xm)x = a a v t 0 T 1 Z dt dr x Dx 2 Z + (x + xm ) Z , a a v t 0 dt dr Z donde hemos impuesto que Z(r, t = T ) = 0 en y , Z(r, t) = 0 sobre . (3.54)
T

(3.53)

Bajo estas condiciones, sustituyendo (3.53) en (3.52), tendremos que L x = x


T

dt
0

dr x {

1 Z Dx 2 Z + (x + xm ) Z} . (3.55) a a v t

Luego, puesto que x = 0, ya que buscamos soluciones distintas a la trivial para (3.47), tendremos que 1 Z Dx 2 Z + (x + xm ) Z = 0 . a a v t (3.56)

Esta es la ecuacin adjunta para x (r, t), la cual estar sujeta a las condio a ciones dadas en (3.54). El signo menos delante de la derivada temporal en (3.56) signiva que el tiempo de integracin es hacia atrs. o a La solucin de la ecuacin (3.56), sujeta a las condiciones iniciales y de o o frontera dadas en (3.54), es Z(r, t) = 0 para todo r , and t [0, T ]. (3.57)

Analicemos, a continuacin, (3.48) siguiendo un esquema similar a lo o efectuado para (3.47). Empecemos por escribir una aproximacin a primer o orden para m de la siguiente manera L m = L(xm , x , m + m ) L(xm , x , m ). a a m (3.58)

Luego de las operaciones algebraicas respectivas, el lado derecho de (3.58) es igual a L m = m


T

dt
0

dr W

1 m Dm 2 m + m m a v t 83

(3.59)

Utilizando la integracin por partes, la segunda identidad de Green, la denio cin del funcional de coste y las condiciones dadas en (3.21) y (3.22), tedremos o que
T

dt
0 T 0

1 m Dm 2 m + m m = a v t 1 W dt dr m Dm 2 W + m W a v t dr W

(3.60)

donde hemos impuesto que W (r, t = T ) = 0 en y , W (r, t) = R(xm) sobre . a (3.61)

Bajo estas condiciones, sustituyendo (3.60) en (3.59), tendremos que L m = m


T

dt
0

dr m

1 W Dm 2 W + m W a v t

(3.62)

Luego, puesto que m = 0, ya que buscamos soluciones distintas a la trivial para (3.48), tendremos que 1 W Dm 2 W + m W = 0 . a v t (3.63)

Esta es la ecuacin adjunta para m (r, t), la cual estar sujeta a las condio a ciones dadas en (3.61). El signo menos delante de la derivada temporal en (3.63) signiva que el tiempo de integracin es hacia atrs. o a En resumen, hemos encontrado funciones Z(r, t) y W (r, t) que satisfacen (3.47) y (3.48), respectivamente, siempre y cuando Z(r, t) sea solucin (3.56), o sujeto a las restricciones dadas por (3.54) y W (r, t) sea la solucin de (3.63), o sujeto a las restricciones dadas por (3.61). Ahora, si seleccionamos Z(r, t) y W (r, t) de la manera descrita anteriormente, tendremos que la derivada de L, ecuacin (3.44), es igual a o L = L xm a xm a = < grad L, xm >I a =

(3.64)

dr grad Lxm . a 84

Entonces, para determinar el grad L debemos determinar el valor de A partir de la denicin de L, ecuacin (3.43), tendremos que o o L J L1 L2 = + xm + xm xm xm a a a a T qxm = dr dt W xm 0 a Utilizando (3.64) y (3.65) podemos concluir que
T

L . xm a

(3.65)

grad L =

dt W
0 T

qxm xm a
t

= (r)

(3.66) dt e
(tt )/ (r)

dt W (r, t)
0 0

x (r, t ) .

Finalmente, dado que se cumplen las condiciones necesarias, considerando Z y W de la manera propuesta, para que se cumpla la igualdad (3.45), es decir, J = L, tendremos que (r)
T t

grad J(r, ) =

dt W (r, t)
0 0

dt e(tt )/ (r) x (r, t ) .

(3.67)

Esto demuestra el teorema propuesto.

Utilizando el teorema demostrado podemos retomar la discucin anteo riormente realizada, es decir, buscar la manera de resolver el problema de reconstruir una forma (uorforo) utilizando una funcin level-set . o o En (3.27) establecimos una ley de evolucin para la funcin level-set , o o la cua establecia que d = f (r; ) (3.68) d y luego en (3.32) discutimos sobre el hecho de que la mejor forma de reducir el funcional de coste, ecuacin (3.28), era seleccionar f (r; ) como el gradiente o de dicho funcional, de la siguiente manera f (r; ) = grad J(r, ). (3.69)

Entonces, por (3.68) y (3.69) podemos establecer una forma para la evolucin o de la funcin level-set , dada por o d = grad J(r, ). d 85 (3.70)

Si ahora discretizamos (3.70) con el mtodo de diferencias nitas para el e tiempo articial y consideremos un paso de tiempo > 0, se obtiene la actualizacin de la funcin level-set o o ( + ) () = grad J(r, ). (3.71)

Interpretando (n+1) = ( +), (n) = () y grad J(r)(n) = grad J(r, ), obtenemos la siguiente regla de iteracin o (n+1) = (n) grad J(r)(n) , (0) = 0 , (3.72)

donde el grad J(r)(n) esta dado por el teorema 3.1. Se debe tener presente que la actualizacin descrita requiere que la funcin o o level-set tenga ciertas propiedades de regularidad; por ejemplo, que sea una funcin continua del tipo Lipschitz. o Observemos que, hasta ahora, hemos supuesto conocido (r) sobre todos los puntos donde xm (r) = 0, pero qu sucede si no es as es decir, sino e ?, a conocemos el valor de (r) o si existe ms de un uorforo y cada uno de a o ellos con un distinto valor de (r). Para responder esta pregunta proponemos la busqueda de (r), simultaneamente a la busqueda de la distribucin de o xm uorforos a (r), con el siguiente esquema de actualizacin o o (n+1) (r) = (n) (r) + (r), (3.73)

donde (r) debe ser lo sucientemente sensible de tal manera que el funcional de coste disminuya. Para utilizar un valor de (r) adecuado, proponemos el siguiente teorema. Teorema 3.2. El parmetro de actualizacin (r) que hace que el funcional a o de coste sea m nimo est dado por a t t (n) e(tt )/ (r) x (r, t ) , (n) (r) 0 0 (3.74) donde x (r, t ) es la solucin (3.15) considerando (3.24), y W (r, t) es la o solucin de (3.34) sujeto a las condiciones (3.35) y (3.36). o dt W (r, t) dt 1 + Demostracin o Para la demostracin supondremos que el funcional de coste depende de o (r). 86
xm a (r) (r) = (n) ( (r))2 T t

La denicin del funcional de coste por m o nimos cuadrados, escrito en forma de producto interno , G en el espacio de datos nos dice que 1 R( ) 2 2 1 = R( ), R( ) G. 2 El residuo R( ) puede ser desarrollado como J( ) = R( + ) = R( ) + R ( ) + O(
2 G),

(3.75)

(3.76)

donde I es la norma en el espacio de los parmetros I, con una peque a a n perturbacin I. Sustiyendo (3.76) en (3.75) obtenemos la siguiente o relacin o J( + ) = J( ) + R ( ) R( ),
I

+ O(

2 G).

(3.77)

El operador R ( ) es el operador adjunto de R ( ) con respecto a los espacios G e I. De esta forma podemos denir grad J( ) = R ( ) R( ) (3.78)

en la direccin del gradiente de J en . o Ahora, dado que la actualizacin slo tiene sentido en aquellos lugares o o xm donde existe , es decir, donde a (r) = 0 parece vlido calcular como a xm la direccin del gradiente de J(a ) en , es decir, o = grad J(xm ). a (3.79) Siguiendo los pasos realizados en la demostracin del teorema 3.1, pero o ahora con respecto a podemos llegar a determinar que
T

grad L = y en particular que

dt W (r, t)
0

qxm

(3.80)

grad L = grad J = . Desarrollando la derivada parcial con respecto a , tendremos que (r) = xm (r) a ( (n) (r))2
T t

(3.81)

dt W (r, t)
0 0

dt

1 +

t t (n) (r)

e(tt )/

(n) (r)

x (r, t ) ,

(3.82)

donde x y W cumplen las condiciones requiridas. 87

Observemos que (i) desde que los soportes de xm y coinciden, las a actualizaciones (3.74) slo son diferentes a cero en los uorforos, y (ii) estas o o actualizaciones casi no tienen coste computacional dado que slo se requiere o conocer x (r, t) y W (r, t) las cuales son parte del clculo para las actualizaa ciones de la funcin level-set . o En caso que la distribucin de uorforos, denida por xm(r), este o o a compuesta de una distribucin arbitraria de subdominios compactos disjuno tos (conectados o desconectados) Sp , p = 1, . . . , p, cada uno con un diferente, pero constante, p en su interior, se puede regularizar aplicando el mtodo e de inversin o p = dr (r) . (3.83)
Sp

3.5.

Mtodo numrico e e

En esta seccin describimos las principales caracter o sticas del algoritmo desarrollado para reconstruir la distribucin de uorforos y el tiempo de o o vida uorescente. Sin prdida de generalidad y por razones de clculo numrico, considerae a e mos un dominio en 2D, espec camente un cuadrado. Este procedimiento puede extenderse a otras geometr y a R3 . Resolvemos las ecuaciones as parablicas de excitacin (3.15) y emisin (3.16) usando un esquema de o o o Crank-Nicholson, utilizando diferencias nitas de segundo orden para los operadores espaciales. Estimamos el valor de la integral (3.83) utilizando la regla del trapecio. Las fuentes en la ecuacin de excitacin (3.15) que repreo o sentan un pulso lser sobre , son simuladas utilizando (3.19). a Un procedimiento similar es utilizado para resolver la ecuacin adjunta o (3.34) Nuestro algoritmo consiste de dos etapas. Etapa 1 Empezamos utilizando la reconstruccin clsica de celda por celda (pixo a el by pixel) basada en el operador adjunto. Consideremos como valores iniciales de los parmetros xm (r) = 0 y (r) = (r)0 > 0. Para una a a fuente y una conguracin de uorforos dada, estimamos los parmeo o a xm tros a y de la siguiente manera: 1. Resolvemos el problema directo (3.15) y (3.16). 88

2. Con los datos reales calculamos el residuo y resolvemos el problema adjunto. 3. Utilizamos las expresiones (3.33) y (3.74) para actualizar los paxm rmetros a a y Activando las fuentes de una manera secuencial, es decir, una despus e de otra realizamos el procedimiento descrito, detenindolo cuando el e funcional de costo acumulado llegue a ser cuasi-estacionario. Al nal de la primera etapa obtenemos un conguracin en 2D para los parmetros o a xm a y . Etapa 2 Empezamos utilizando las ultimas aproximaciones a xm y dadas en a la etapa anterior. En esta etapa haremos uso de la tcnica de level-sets y e supondremos que el uorforo es homogeneo en todo su soporte. Como o funcin level-set inicial utilizaremos directamente la aplicacin obtenida o o en la primera etapa suponiendo que el soporte del uorforo esta en o la zona donde el valor de xm decae 1/e con respecto a su mximo. a a Como valor de asignaremos la media de (r) sobre el soporte. El algoritmo de esta segunda etapa es similar al de la primera, pero ahora no usamos directamente las expresiones (3.33) y (3.74) para obtener las actualizaciones de los parmetros xm y , sino que resolvemos la a a ecuacin de evolucin de la funcin level-set. o o o En esta etapa se siguen los siguientes pasos: 1. Resolvemos el problema directo (3.15) y (3.16). 2. Con los datos reales calculamos el residuo y resolvemos el problema adjunto. 3. Utilizamos las expresiones (3.33) y (3.74) para actualizar los paxm rmetros a a y . 4. Calculamos la velocidad de la funcin level-set utilizando (3.32) o y adicionalmente regularizamos esta cantidad via la ecuacin del o calor. 5. Actualizamos los valores de en el soporte del uorforo. Para o este proposito usamos la expresin (3.73) y tomamos como aco tualizacin de la integral sobre el soporte de xm . Si durante o a la evolucin el n mero de uorforos var asignamos los valores o u o a, modales, respectivos, a cada uno de ellos. 89

6. Los tama os de pso son dependientes de la fuente activada, de n esta forma la variaciones siempre sern similares. a 7. Activamos secuencialmente todas las fuentes. Nos referiremos por iteracin al proceso de reconstruccin cuando todas las fuentes o o hayan sido utilizadas. 8. Revisamos el criterio de parada. Si no se satisface, regresa a la primera iteracin. o

3.6.

Experimentos numricos e

En los experimentos numricos que presentamos a continuacin hemos e o considerado una conguracin tomogrca en 2D. El experimento consiste o a de un tejido cuadrado de 5cm 5cm cuyas propiedades pticas estn o a x m 1 dadas por los parmetros de dispersin s = s = 10cm , absorcin a o o x = m = 0,1cm1 y factor de anisotrop g = 0,8. A adimos uctuaciones a a a n (ruido aleatorio) de 5 % alrededor de los valores de dispersin y absorcin. o o Existen slo cuatro fuentes (una en el centro de cada uno de los lados del doo minio) que iluminan al tejido una despus de otra. Los experimentos fueron e realizados considerando uorforos de distintos tama os y hubicados en diso n tintos lugares. Todos los uorforos considerados tienen el mismo coeciente o de absorcin xm = 0,1cm1 con un rendimiento cuntico = 1, pero diso a a tintos tiempos de vida media. Los tiempos de vida media var entre 0,5ns an y 1ns. Para cada fuente, registramos la distribucin temporal del ujo de o salida en cada una de las fronteras utilizando el modelo directo de difusin. o

3.6.1.

Primer experimento

El primer experimento consiste en una reconstruccin multi-objetivo, eso pec camente consiste en reconstruir tres uorforos separados con distintos o tiempos de vida media : 0,5ns, 0,75ns y 1ns, como se muestra en la gura 3.5

90

(ns) 0.9

0.8 0.7

2 cm

0.6 0.5

0.4 0.3

0.2 0.1

5 0

2 cm

Figura 3.5: Esquema real de tres fuentes uorescentes con distintos tiempos de vida media. La primera etapa de nuestro experimento consiste en reconstruir el tiempo de vida media con un esquema clsico de celda por celda (pixel by pixel). a La reconstruccin del tiempo nal, as como la conguracin obtenida se o o muestra en la gura 3.6.
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.6: Reconstruccin obtenida por el mtodo de celda por celda (pixel o e by pixel). Como podemos observar obtenemos una conguracin espacial aproxio mada a la real, pero no podr amos llegar a estimar el valor de en cada uno de los uorforos, a lo ms podriamos obtener un valor promedio. Con o a esta reconstruccin, empezamos la segunda etapa de nuestro mtodo y evoluo e cionamos el perf del uorforo de busqueda. La gura 3.7 muestra el perf l o l inicial con el que empezamos la segunda etapa de nuestro mtodo. e 91

(ns) 0.9

0.8 0.7

2 cm

0.6 0.5

0.4 0.3

0.2 0.1

5 0

2 cm

Figura 3.7: Reconstrucin inicial para el mtodo de level-set. Perles o e obtenidos a partir del mtodo celda por celda. e Despus de 13 iteraciones obtenemos la conguracin que se muestra en e o la gura 3.8.
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.8: Reconstrucin por el mtodo de level-set despus de 13 iterao e e ciones. En las siguientes iteraciones podemos observar como el objeto se rompe en varias piezas. Cada una de ellas evoluciona cambiando su posicin y el o valor del tiempo de vida media, obteniendo al nal del proceso un buena estimacin del tama o, posicin y tiempo de vida media de los uorforos. o n o o Esto se muestra en la gura 3.9.

92

(ns) 0.9

0.8 0.7

2 cm

0.6 0.5

0.4 0.3

0.2 0.1

5 0

2 cm

Figura 3.9: Reconstrucin nal. Muestra la estimacin nal, con el algoritmo o o desarrollado, del tama o, posicin y tiempo de vida media de los uorforos. n o o La evolucin del coste en las dos etapas: celda por celda (l o nea discont nua) y mtodo de level-set (l e nea cont nua), se muestra en la gura 3.10.
0.01 PP LS 0.008

0.006 cost 0.004 0.002 0 0

20

40 iteration

60

80

Figura 3.10: Reconstrucin nal. Muestra la estimacin nal, con el algoritmo o o desarrollado, del tama o, posicin y tiempo de vida media de los uorforos. n o o Podemos ver como evoluciona de manera decreciente el coste y despus e de un cierto n mero de iteraciones llega a ser cuasi-estacionario. u

93

3.6.2.

Segundo experimento

En nuestro segundo experimento, queremos recuperar las caracter sticas de un unico uorforo con forma de T y con un tiempo de vida media = o 0,75ns. El uorforo objetivo se muestra en la gura 3.11. o
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.11: Fluorforo con forma de T y con un tiempo de vida de 0,75ns. o La reconstruccin al nal de la primera etapa, es decir, usando el mtodo o e celda por celda nos proporciona una posible ubicacin del uorforo y una o o cierta estimacin del valor de , pero no es capaz de denirnos la forma que o tiene el uorforo. Esto se muestra en la gura 3.12. o
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.12: Reconstrucin del uorforo utilizando el mtodo celda por celo o e da. Cuando utilizamos el mtodo de level-sets observamos como si somos e capaces de reconstruir, bastante bien, las caracter sticas de nuestro uorforo o objetivo. Esto se muestra en la gura 3.13. 94

(ns) 0.9

0.8 0.7

2 cm

0.6 0.5

0.4 0.3

0.2 0.1

5 0

2 cm

Figura 3.13: Reconstrucin del uorforo utilizando el mtodo de level-sets. o o e

3.6.3.

Tercer experimento

En el tercer experimento nos proponemos investigar la resolucin espacial o de nuestro mtodo. Para ello consideramos dos uorforos peque os y cere o n canos el uno del otro con un tiempo de vida media = 0,75ns para ambos. Esto se muestra en la gura 3.14.
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.14: Dos uorforos peque os y cercanos el uno del otro, ambos con o n el mismo tiempo de vida = 0,75ns. La reconstruccin al nal de la primera etapa, es decir, usando el mtodo o e celda por celda no nos permite detectar la presencia de los dos uorforos. o Podemos observar que esta reconstrucin nos proporciona como resultado un o slo uorforo. Adems, el valor de no es correcto. Esto se muestra en la o o a gura 3.15. 95

(ns) 0.9

0.8 0.7

2 cm

0.6 0.5

0.4 0.3

0.2 0.1

5 0

2 cm

Figura 3.15: Reconstrucin utilizando el mtodo de celda por celda. o e Cuando utilizamos el mtodo de level-sets observamos como nuestra tcnie e ca es capaz de diferenciar la presencia de dos uorforos y de recuperar el o valor de . Esto se muestra en la gura 3.16.
0 (ns) 0.9 1 0.8 0.7 2 cm 0.6 0.5 3 0.4 0.3 4 0.2 0.1 5 0 1 2 cm 3 4 5

Figura 3.16: Reconstrucin utilizando el mtodo de level-sets. o e

3.7.

Conclusin o

Presentamos un algoritmo basado en la forma para la tomograf del a tiempo de vida uorescente. La aproximacin basada en la forma consero va la nitidez de los bordes de los uorforos mejorando as el contraste de o la imgenes. La tcnica level-set empleada aqu nos libera de restricciones a e topolgicas durante el proceso de reconstruccin. o o 96

Cap tulo 4 Conclusiones


En este trabajo hemos desarrollado una novel tcnica para las imgenes e a mdicas por uorescencia. En particular, hemos buscado reconstruir la forma e de una o ms fuentes uorescentes (uorforos) y sus respectivos tiempos de a o vida media . Las tcnicas clsicas de reconstruccin celda por celda (pixele a o pixel) que normalmente se usan en estas aplicaciones no son capaces de resolver las interfaces de los uorforos, es decir, no son capaces de discrimir o adecuadamente dos o ms uorforos cercanos, peor a n, si estos tienen disa o u tintos tiempos de vida media, pues utilizan estrategias de regularizacin que o destruyen las fronteras y, en consecuencia, no pueden reconstruir los perles de parmetros adecuadamente. Esto genera caracterizaciones de las molcua e las o del tejido que no toman en cuenta la informacin a priori de la existencia o de varios tipos de uorforos y por esto no pueden representar de manera o conable las distintas zonas uorescentes. Luego de estudiar los distintos modelos para el comportamiento de la luz en el tejido: ecuacin de transporte radiativo, ecuacin de Fokker-Plank y o o ecuacin de difusin, se selecciono el modelo basado en la ecuacin de dio o o fusin para el desarrollo del algoritmo. Aunque este modelo tiene l o mites, claramente establecidos para su aplicacin, es signicativamente menos coso toso que el modelo basado en la ecuacin de tranporte radiativo y que el o modelo basado en la ecuacin de Fokker-Plank el cual, adems, se restringe o a a casos espec cos. Se ha presentado un nuevo algoritmo de reconstruccin de formas que o est basado en la tcnica de level-sets (conjuntos de nivel) y el esquema a e adjunto para calcular direcciones de descenso para un funcional de coste dado. La forma bsica de este algoritmo supone que los parmetros dentro de zonas a a distintas (uorforos) son constantes. Esta tcnica es similar a tcnicas ya o e e desarrolladas, en campos muy variados como por ejemplo, la caracterizacin o 97

de yacimientos petroleros. Los ejemplos numricos presentados en este trabajo demuestran que las e tcnica desarrollada aqu puede ser una herramienta poderosa, estable y e able para la determinacin de uorforos y sus distintos tiempos de vida o o media. Esto es de fundamental importancia puesto que la marcacin uoo rescente constituye una tcnica mdica y de investigacin fundamental para e e o determinar posibles enfermedades o el comportamiento de una determinada prote na.

98

Cap tulo 5 Apndice I e


Derivacin de la ecuacin de difusin o o o
En este apndice realizaremos una derivacin detallada de la ecuacin de e o o difusin en 2D, a partir de la ecuacin de transporte radiativo. o o

Expansin de la ecuacin de transporte radiativo en o o armnicos esfricos o e


Sea I(r, s, t) =
n=0 m=n p=1 n

In,m (r, t)Yn,m() s

(5.1)

la primera aproximacin, por armnicos esfricos, de la ecuacin de transo o e o porte radiativo (2.1). Desarrollando la serie, la igualdad (5.1) se puede escribir de la siguiente forma I(r, s, t) = I0,0 (r, t)Y0,0 ()+I1,1 (r, t)Y1,1 ()+I1,0 (r, t)Y1,0 ()+I1,1 (r, t)Y1,1 (), s s s s (5.2) donde los trminos In,m son los coecientes de la expansin, el primer sumane o do I0,0 (r, t)Y0,0 () s (5.3) representa la componente isotrpica y el resto de sumandos o I1,1 (r, t)Y1,1 () + I1,0 (r, t)Y1,0 () + I1,1 (r, t)Y1,1 () s s s (5.4)

representan la componente anisotrpica (no-isotrpica) de la radiacin. o o o Para continuar con la deduccin necesitamos la denicin de los armnicos o o o esfricos. Los armnicos esfricos son funciones que representan la variacin e o e o 99

espacial de un conjunto ortogonal1. Se los representan en trminos de fune ciones trigonomtricas y de polinomios de Legendre. e Denicin 5.1. Los armnicos esfricos se denen de la siguiente forma o o e Yn,m() = (1)m s (2n + 1)(n m)! Pn,m(cos())eim , 4(n + m)! (5.5)

donde Pn,m son los polinomios de Legendre Pn,m = (1 x2 )m/2 dm+n 2 (x 1)n . 2n n! dxm+n (5.6)

Propiedades de los armnicos esfricos o e Simetr a


Yn,m() = (1)m Yn,m (). s s

(5.7)

Aqu representa la conjugacin compleja. , o Ortogonalidad Yn,m ()Yn,m ()ds = nn ,mm . s s (5.8)

Sn1

Aqu nn ,mm representa la funcin delta de Krnecker; la cual es 1 , o o si tanto n = n y m = m , y 0 para cualquier otro caso. La integral representa el producto interno. Ademas s = (sin() cos(), sin() sin(), cos()). (5.9)

Observacin. o Para la deduccin de la ecuacin de difusin en 2D, consideraremos que o o o el vector director s es s = (cos(), sin()), (5.10) es decir, = . 2 Proposicin 5.1. La radiacin I(r, s, t), utilizando la aproximacin P1 , se o o o puede escribir de la siguiente manera I(r, s, t) =
1

1 1 (r, t) + J(r, t) s. 2

(5.11)

El conjunto ortogonal considerado es el de las soluciones de la ecuacin de Laplace o cuando esta se expresa en coordenadas esfricas e

100

Demostracin o Dividiremos la demostracin en dos partes. Primero demostraremos el o trmino isotrpico y luego el trmino no isotrpico. e o e o Trmino isotrpico e o Mostraremos que I0,0 (r, t)Y0,0 () = s 1 (r, t). 2 (5.12)

Por la denicin de la intensidad en 3D, ecuacin (2.2), podemos denir o o la intensidad en 2D como: (r, t) =
2

I(r, s, t)d. s

(5.13)

Luego, si sustituimos la ecuacin (5.2) en la ecuacin (5.13), tendremos o o que (r, t) =


2

[I0,0 (r, t)Y0,0 () + I1,1 (r, t)Y1,1 () + I1,0 (r, t)Y1,0 () s s s +I1,1 (r, t)Y1,1 ()] d. s s (5.14)

Antes de continuar, calculemos los armnicos esfricos en 2D. Por la o e denicin de armnicos esfricos, ecuacin (5.5), los armnicos esfricos o o e o o e en 2D son: Y0,0 () = 1 4 Y1,1 () = Y1,0 () Y1,1 () = 0 =
3 i e . 8 3 i e 8

Ahora, utilizando los armnicos esfricos calculados, analicemos cada o e trmino del lado derecho de la ecuacin (5.14). e o 101

El primer trmino es igual a e I0,0 (r, t)Y0,0 ()d =


2

1 I0,0 d 4 0 2 1 = I0,0 d 4 0 1 = 2I0,0 , 4

(5.15)

el segundo trmino es igual a e


2 2

I1,1 (r, t)Y1,1()d =

I1,1 (r, t)
2 0

3 i e d 8 3 i e d 8 (5.16)

= I1,1 (r, t) = 0, el tercer trmino es igual a e


2

I1,0 (r, t)Y1,0 ()d =


2 0

I1,0 (r, t)0d

(5.17)

=0 y el cuarto trmino es igual a e


2 2

I1,1 (r, t)Y1,1 ()d = = 0.

I1,1 (r, t)
0

3 i e 8

(5.18)

Sustituyendo las igualdades (5.15), (5.16), (5.17) y (5.18) en la ecuacin o (5.14), obtenemos que 1 (r, t) = 2I0,0 + 0 + 0 + 0, 4 es decir, (5.19)

1 1 (r, t), (5.20) I0,0 (r, t) = 2 4 pero dado que por la denin de armnicos esfricos sabemos que o o e 1 Y0,0 () = , s 4 102 (5.21)

podemos escribir la ecuacin (5.20) de la siguiente manera o I0,0 (r, t)Y0,0 () = s Trmino no isotrpico e o Mostraremos que
1

1 (r, t). 2

(5.22)

I1,m (r, t)Y1,m () = s


m=1

1 J(r, t) s.

(5.23)

Por la denicin de ujo en 3D, ecuacin (2.3), podemos denir el ujo o o en 2D como J(r, t) =
2

sI(r, s, t)d. s

(5.24)

Antes de continuar expresemos el vector director s en funcin de los o armnicos esfricos, este ser igual a o e a s = (cos(), sin()) = = 2 [Y1,1 () Y1,1()], 3 2 [i(Y1,1 () + Y1,1 ()] 3 (5.25)

2 (Y1,1 () Y1,1 (), i(Y1,1() + Y1,1 ()) . 3

Utilizando la igualdad dada en (5.25), podemos escribir la ecuacin o (5.24) de la siguiente manera J(r, t) = 2 3 [(Y1,1 () Y1,1 ()), i(Y1,1() + Y1,1 ())] I(r, s, t)d. s (5.26)

Analicemos a continuacin cada uno de las componentes de la ecuacin o o vectorial (5.26), para ello denamos la primera componente como Jx (r, t) = 2 3 [(Y1,1() Y1,1 ())] I(r, s, t)d. s 103 (5.27)

Entonces, si sustituimos la ecuacin (5.2) en la ecuacin (5.27), teno o dremos que Jx (r, t) = 2 [(Y1,1() Y1,1 ())] (I0,0 (r, t)Y0,0 () s 3 2 + I1,1 (r, t)Y1,1() + I1,0 (r, t)Y1,0 () +I1,1 (r, t)Y1,1 ()) d s s s s 2 (I0,0 (r, t)[Y1,1 ()Y0,0 () Y1,1 ()Y0,0 ()] 3 2 + I1,1 (r, t)[Y1,1 ()Y1,1() Y1,1 ()Y1,1 ()] + I1,0 (r, t)[Y1,1 ()Y1,0() Y1,1()Y1,0 ()] + I1,1 (r, t)[Y1,1 ()Y1,1() Y1,1()Y1,1 ()]) d 2 3 I0,0 (r, t)
2

[Y1,1 ()Y0,0 () Y1,1 ()Y0,0 ()] d

+ I1,1 (r, t)
2

[Y1,1()Y1,1 () Y1,1 ()Y1,1 ()] d

+ I1,0 (r, t)
2

[Y1,1 ()Y1,0() Y1,1 ()Y1,0 ()] d [Y1,1 ()Y1,1() Y1,1 ()Y1,1 ()] d . (5.28)

+ I1,1 (r, t)
2

Ahora, por las propiedades de simetr (5.7) y ortogonalidad (5.8) sabea mos que Y1,1 ()Y0,0()d =
2 2

Y1,1 ()Y0,0()d =
2

Y1,1 ()Y1,1()d = 0, (5.29) Y1,1 ()Y1,1()d = 0,


2

Y1,1 ()Y1,0()d =
2 2

Y1,1 ()Y1,0()d =

(5.30) (5.31) (5.32)

y que

3 Y1,1 ()Y1,1()d = 4 2 3 Y1,1 ()Y1,1 ()d = . 4 2

Sustituyendo las igualdades (5.29), (5.30), (5.31) y (5.32) en (5.28), tendremos que Jx (r, t) = 3 4 2 [I1,1 (r, t) I1,1 (r, t)]. 3 104 (5.33)

Para la segunda componente de la ecuacin vectorial (5.26) denida o como Jy (r, t) = 2 3 i [(Y1,1 () + Y1,1 ())] I(r, s, t)d, s
2

(5.34)

si efectuamos un anlisis similar al realizado para la componente Jx , a obtendremos que Jy = 3 4 2 [I1,1 (r, t) + I1,1 (r, t)]. 3 (5.35)

Entonces, por las igualdades (5.33) y (5.35) podemos escribir la ecuacin o vectorial (5.26) de la siguiente forma J(r, t) = 3 4 2 [I1,1 (r, t)I1,1 (r, t); i(I1,1 (r, t)+I1,1 (r, t))]. (5.36) 3

A continuacin veamos a que es igual el producto escalar o J(r, t) s. (5.37)

Utilizando la denicin para J(r, t) dada por (5.36) y la denicin para o o s dada en (5.25), realizando las operaciones algebraicas correspondi entes, podemos decir que J(r, t) s = [I1,1 (r, t)Y1,1 () + I1,1 (r, t)Y1,1 ]. (5.38)

Finalmente, utilizando el hecho de que Y1,0 () = 0, podemos decir que I1,0 (r, t)Y1,0() = 0, y escribir la igualdad (5.38) de la siguiente manera J(r, t) s = [I1,1 (r, t)Y1,1 () + I1,0 (r, t)Y1,0 () + I1,1 (r, t)Y1,1 ], (5.40) o de forma equivalente
1

(5.39)

I1,m (r, t)Y1,m () = s


m=1

1 J(r, t) s.

(5.41)

105

Proposicin 5.2. Sea o (r, t) + J(r, t) + a (r, t) = S(r, t) ct (5.42)

la ecuacin diferencial escalar obtenida a partir de la ecuacin de transporte o o radiativo. Demostracin o La demostracin se basar en integrar con respecto a , en el intervalo o a [0, 2], la ecuacin de transporte radiativo de la siguiente manera: o 1 I(r, s, t) d = c t +
2

[ I(r, s, t)]d s s
2

[t I(r, s, t)]d
2

p( s )I(r, s, t)d d + s s

[q(r, s, t)]d.
2

(5.43) A continuacin, analizaremos cada uno de los trminos de la ecuacin o e o (5.43): Sea
2

1 I(r, s, t) d c t

(5.44)

el primer trmino de la ecuacin (5.43). Si sustituimos la proposicin e o o 5.1 en (5.43) tendremos que 1 1 1 1 I(r, s, t) d = (r, t) + J(r, t) s d c t c t 2 2 1 1 = (r, t)d + (J(r, t) s)d ct 2 2 2 1 (r, t)2 + 0 = ct 2 (r, t) = . ct (5.45) 1 I(r, s, t) (r, t) d = . c t ct 106

En resumen, (5.46)
2

Observacin. o
2

1 (J(r, t) s)d = 0.

(5.47)

A continuacin su justicacin: o o 1 (J(r, t) s)d =


2 2 0 1

I1,m (r, t)Y1,m ()d


m=1

=
0

[I1,1 (r, t)Y1,1 () + I1,0 (r, t)Y1,0() + I1,1 (r, t)Y1,1 ()]d
2 2

= I1,1 (r, t)
0 2

Y1,1 ()d + 0 + I1,1 (r, t)


0

Y1,1 ()d
2 0

= I1,1 (r, t)
0

3 i e d + 0 I1,1 (r, t) 8

3 i e d 8

= =0 Sea

3 I1,1 (r, t)(sin() i cos())|2 0 8

3 I1,1 (r, t)(sin() + i cos())|2 0 8

[ I(r, s, t)]d s

(5.48)

el segundo trmino de la ecuacin (5.43). e o En la presente deduccin necesitamos tener presente la siguiente ideno tidad vectorial (I) = I s + s I, s (5.49) donde s = 0. Si sustituimos la identidad (5.49) en (5.48) tendremos que s I(r, s, t) = [I(r, s, t)]d s [I(r, s, t)]d, s
2

= es decir,
2

s I(r, s, t) = 107

[I(r, s, t)]d. s
2

(5.50)

Ahora si sustituimos la denicin de ujo en 2D dado por la ecuacin o o (5.24) en la ecuacin (5.50), tendremos que o s I(r, s, t) = J (r, t). (5.51)

Sea [t I(r, s, t)]d


2

(5.52)

el tercer trmino de la ecuacin (5.43). Por la denicin de intensidad e o o en 2D dada por la ecuacin (5.13), podemos decir que o [t I(r, s, t)]d = t
2 2

[I(r, s, t)]d

(5.53)

= t (r, t). Sea s


2 2

p( s )I(r, s, t)d d s s

(5.54)

el cuarto trmino de la ecuacin (5.43). Si sustituimos la proposicin e o o 5.1 en (5.54), tendremos que s
2 2

p( s )I(r, s, t)d d = s s s

p( s ) s

1 (r, t) 2

1 + J(r, t) s d d s s s s = p( s )(r, t)d d + s s s p( s )(J(r, t) s)d d s s s 2 2 2 2 2 s s = (r, t) p( s )d d + s s s p( s )(J(r, t) s)d d. s s s 2 2 2 2 2 En resumen, s


2 2

p( s )I(r, s, t)d d = s s s

s (r, t) 2 s + 2

p( s )d d s s s

p( s )(J(r, t) s)d d. s s s (5.55)

108

Por otra parte, utilizando la denicin de la funcin de fase, ecuacin o o o (1.4), la cual nos dice que p( s )ds = 1, s

podemos decir que que el primer trmino del lado derecho de la ecuacin e o (5.55) es s (r, t) 2 p( s )d d = s s s s (r, t) 1d s 2 2 s = (r, t)2 2 = s (r, t),

(5.56)

y que el segundo trmino es e s p( s )(J(r, t) s)d d = s s s s p( s )|J(r, t)||| cos()d d s s


2 2

s s = |J(r, t)||| s s = |J(r, t)||| s = 0. = |J(r, t)||| s

p( s ) cos()d d s p( s ))d cos()d s

2 2 0

(1) cos()d (5.57)

Finalmente, si reemplazamos los resultados obtenidos en (5.56) y (5.57) en (5.55), tendremos que s
2 2

p( s )I(r, s, t)d d = s (r, t). s s s

(5.58)

Sea [q(r, s, t)]d.


2

(5.59)

el quinto trmino de la ecuacin (5.43). Consideraremos que la fuente e o 109

q es isotrpica, es decir, es independiente de la direccin s, por lo tanto o o [q(r, s, t)]d =


2

q(r, t) d 2 2 q(r, t) 2 = d 2 0 q(r, t) = 2 2 = q(r, t). (5.60)

En resumen, [q(r, s, t)]d = q(r, t).


2

Para nalizar, si reemplazamos las ecuaciones (5.46), (5.51), (5.53), (5.58) y (5.60) en la ecuacin (5.43) obtenemos que o (r, t) = J (r, t) t (r, t) + s (r, t) + q(r, t), ct o (r, t) + J(r, t) + a (r, t) = q(r, t). ct (5.61) (5.62)

Proposicin 5.3. Sea o J (r, t) 1 + (a + s )J(r, t) + (r, t) = 0, (5.63) ct 2 la ecuacon diferencial vectorial obtenida a partir de la ecuacin de transporte o radiativo. Demostracin o La demostracin se basar en multiplicar por s e integrar con respecto a o a , en el intervalo [0, 2], la ecuacin de transporte radiativo, de la siguiente o manera: s
2

1 I(r, s, t) d = c t +

s[ I(r, s, t)]d s s s
2

s[t I(r, s, t)]d


2

p( s )I(r, s, t)d d + s s

s[q(r, s, t)]d.
2

(5.64) 110

A continuacin, analizaremos cada uno de los trminos de la ecuacin o e o (5.64): Sea 1 I(r, s, t) d c t

s
2

(5.65)

el primer trmino de la ecuacin (5.64). Por la denicin de ujo en 2D e o o dado por la ecuacin (5.24), podemos decir que o s
2

1 1 I(r, s, t) d = c t c t

sI(r, s, t)d
0

1 J (r, t) = . c t Sea
2

(5.66)

s[ I(r, s, t)]d s

(5.67)

el segundo trmino de la ecuacin (5.64). Si sustituimos la proposicin e o o 5.1 en (5.67), tendremos que

s[ I(r, s, t)]d = s

1 1 (r, t) + J(r, t) s d 2 2 1 1 = s [ (r, t)] d + s s s (J (r, t) s) d 2 2 2 1 1 = ((r, t)) + (0) 2 1 = (r, t). 2 s s

En resumen, 1 s[ I(r, s, t)]d = (r, t). s 2 2 Sea s[t I(r, s, t)]d


2

(5.68)

(5.69)

111

el tercer trmino de la ecuacin (5.64). Por la denicin de ujo en 2D e o o dado por la ecuacin (5.24) podemos decir que o s[t I(r, s, t)]d = t
2 2

[I(r, s, t)]d s

(5.70)

= t J(r, t). Sea s s


2 2

p( s )I(r, s, t)d d s s

(5.71)

el cuarto trmino de la ecuacin (5.64). Si sustituimos la proposicin e o o 5.1 en (5.71), tendremos que s
2

s
2

p( s )I(r, s, t)d d = s s s s p( s ) s

s
2 2

p( s ) s

1 (r, t) d d s 2

1 J(r, t) s d d s 2 2 s s = (r, t) s p( s )d d + s s 2 2 2 2 s s (r, t) s(1)d + g J(r, t) = 2 2 2 + s = 0 + s g J(r, t) = s g J(r, t). En resumen, s


2

sp( s )d (J(r, t) s)d s s

s
2

p( s )I(r, s, t)d d = s g J(r, t). s s

(5.72)

Observacin o

sp( s )d (J(r, t) s)d = s g J(r, t). s s

(5.73)

A continuacin su justicacin. Para ello consideremos la siguiente o o identidad vectorial s = s ( s ) + s ( s ). s s 112 (5.74)

Entonces s
2 2

sp( s )d (J(r, t) s)d = s s

s ( s )p( s )d (J(r, t) s)d s s s

s + s ( s )p( s )d (J(r, t) s)d s s s 2 2 s = s ( s )p( s )d (J(r, t) s)d s s s 2 2 s s sp( s )d s (J(r, t) s)d s s + 2 2 s = s g(J(r, t) s)d + 0 s 2 s = g s (J(r, t) s)d s 2 s = g J(r, t) = s g J(r, t). Sea s[q(r, s, t)]d
2

(5.75)

el quinto trmino de la ecuacin (5.64). Consideraremos que la fuente e o q es isotrpica, es decir, es independiente de la direccin s, por lo tanto o o sq(r, s, t)d =
2

q(r, t) d 2 2 q(r, t) 2 = sd 2 0 q(r, t) = 0 2 = 0. s

(5.76)

En resumen, q(r, s, t)d = 0.


2

(5.77)

Para nalizar, si reemplazamos las ecuaciones (5.66), (5.68), (5.70), (5.72) y (5.77) en la ecuacin (5.64) obtenemos que o 1 J (r, t) 1 = (r, t) (s + a )J(r, t) + s g J(r, t), c t 2 113 (5.78)

o 1 J (r, t) 1 + (r, t) + t J(r, t) = 0 c t 2 (5.79)

Proposicin 5.4. La ecuacin de difusin en 2D es o o o 1 (r, t) (D(r, t)) + a (r, t) = q(r, t), c t donde D= 2(s 1 . + a ) (5.80)

(5.81)

Demostracin o Para la demostracin supondremos que el cambio del ujo J(r, t) para una o distancia equivalente al coeciente libre medio reducido lt es muy peque o, n es decir, 1 J (r, t) lt 1, (5.82) c t |J(r, t)| donde el primer parntesis describe el tiempo que tardan los fotones en a e travesar lt y el segundo parntesis describe la fraccin de cambio del ujo e o por unidad de tiempo. Est hiptesis implica que a o 1 J (r, t) t |J(r, t)|. c t Si ahora consideramos la proposicin 5.3, la cual estable que o 1 J (r, t) 1 + (r, t) + t J(r, t) = 0, c t 2 bajo la hiptesis establecida, ecuacin (5.83), podemos despreciar el trmino o o e temporal y obtener la siguiente expresin o 1 (r, t) + t J(r, t) = 0. 2 Despejando el ujo, tendremos que J (r, t) = 1 (r, t). 2t (5.85) (5.84) (5.83)

114

o J (r, t) = D(r, t), donde D= 1 1 = . + ) 2t 2(s a (5.86) (5.87)

La ecuacin (5.88) se conoce como la ley de Fick. o Finalmente si sustituimos (5.88) en la proposicin 5.2, es decir en o 1 (r, t) + J (r, t) + a (r, t) = q(r, t), c t tendremos que 1 (r, t) (D(r, t)) + a (r, t) = q(r, t). c t (5.88)

115

Cap tulo 6 Apndice II e


Mtodo numrico para la ecuacin de difusin e e o o
En este apndice desarrollaremos el mtodo n mero para resolver la ecuacin e e u o de difusin en el plano x y. o Para empezar, consideremos la siguiente notacin: I = I(x, y, t), D = o D(x, y), a = a (x, y) y S = S(x, y, t). Luego, consideremos la siguiente ecuacin de difusin o o I (DI) + aI = S t donde (DI) = D I + DI D I D I 2I 2I + + D 2 + D 2. = x x y y x y (6.2) (6.1)

Ahora, si sustituimos (6.2) en la ecuacin diferencial (6.1), tendremos que o I t D I D I 2I 2I + +D 2 +D 2 x x y y x y + a I = S. (6.3)

Esta es la ecuacin de difusin en el plano x y con coecientes variables o o que resolveremos numricamente utilizando el esquema de Crank-Nicholson. e

Discretizacin de la Ecuacin o o
Discretizaremos la ecuacin (6.3) utilizando diferencias nitas centradas o de segundo orden para los operadores diferenciables. 116

Discretizacin espacial o D Di+1,j Di1,j = x 2dx I Ii+1,j Ii1,j = x 2dx D Di,j+1 Di,j1 = y 2dy I Ii,j+1 Ii,j1 = y 2dy (6.4)

(6.5)

Ii+1,j 2Ii,j + Ii1,j 2I = 2 x dx2

2I Ii,j+1 2Ii,j + Ii,j1 = . 2 y dy 2

(6.6)

Utilizando la relaciones establecidas en (6.4), (6.5) y (6.6), respectivamente, desarrollaremos el trmino en x. e D I 2I +D 2 = x x x Di+1,j Di1,j Ii+1,j Ii1,j Ii+1,j 2Ii,j + Ii1,j + Di,j 2dx 2dx dx2 1 [(Di+1,j Di1,j )(Ii+1,j Ii1,j ) + 4Di,j (Ii+1,j 2Ii,j + Ii1,j )] = 4dx2 1 [(Di+1,j Di1,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j )Ii1,j ] = 4dx2 1 [4Di,j Ii+1,j 8Di,j Ii,j + 4Di,j Ii1,j ] + 4dx2 1 = [(Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j ] 4dx2 1 [8Di,j Ii,j ] 4dx2 (6.7)

Anlogo para el trmino en y a e D I 2I 1 +D 2 = [(Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1] y y y 4dy 2 1 [8Di,j Ii,j ] . 4dy 2 (6.8) En resumen, por las ecuaciones (6.7) y (6.8) el operador diferencial de la 117

ecuacin (6.3) es o (DI) = D I D I 2I 2I + +D 2 +D 2 x x y y x y 1 = [(Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j ] 4dx2 1 + [(Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1] 4dy 2 1 1 8 + Di,j Ii,j . 4dx2 4dy 2 (6.9)

Esquema de Crank-Nicholson El esquema se basa en la construccin de una aproximacin numrica al o o e valor de la solucin en (x, y, t+k/2) que es un punto situado entre dos las de o la malla. Para construir el esquema, empezaremos por aproximar la ecuacin o (6.3) en dos las distintas. Aproximacin para la la k o
k+1 k Ii,j Ii,j k k (DI k ) + ai,j Ii,j = Si,j . dt Aproximacin para la la k + 1 o

(6.10)

k+1 k Ii,j Ii,j k+1 k+1 (6.11) (DI k+1) + ai,j Ii,j = Si,j . dt El valor de la solucin estar entre estas dos las. La forma ms sencilla o a a de establecer un punto entre las las k y k + 1 es su punto medio. Entonces, el promedio entre las las k y k + 1 es k+1 k Ii,j Ii,j 1 1 1 1 1 k k k+1 k+1 (DI k )+ ai,j Ii,j (DI k+1)+ ai,j Ii,j = Si,j + Si,j dt 2 2 2 2 2 (6.12) donde 1 k k (DI k ) = (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j 4dx2 1 k k + (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1 4dy 2 1 1 k 8 + Di,j Ii,j 2 4dx 4dy 2 (6.13)

118

y (DI k+1) = 1 k+1 k+1 (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j 2 4dx 1 k+1 k+1 + (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1 2 4dy 1 1 k+1 8 + Di,j Ii,j . 2 2 4dx 4dy (6.14)

Por otra parte, si multiplicamos la ecuacin (6.12) por dt y denimos los o trminos e dt dt dt p= , q= y r= , 8dx2 8dy 2 2 la ecuacin (6.12) se puede escribir as o
k+1 k k k+1 k k+1 Ii,j Ii,j (p[k]+q[k]+p[k+1]+q[k+1])+rai,j Ii,j +rai,j Ii,j = r(Si,j +Si,j ). (6.15) Finalmente, separando los trminos (k + 1) y (k) se obtiene la siguiente e ecuacin en diferencias o k+1 k+1 k k k k+1 Ii,j (p[k+1]+q[k+1])+rai,j Ii,j = Ii,j +p[k]+q[k]rai,j Ii,j +r(Si,j +Si,j ) (6.16) con

p[k + 1] =

dt k+1 k+1 (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j 8dx2 k+1 8Di,j Ii,j , (6.17) dt k+1 k+1 (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1 8dy 2 k+1 8Di,j Ii,j , (6.18)

q[k + 1] =

p[k] =

dt k k (Di+1,j Di1,j + 4Di,j )Ii+1,j (Di+1,j Di1,j 4Di,j )Ii1,j 8dx2 k 8Di,j Ii,j , (6.19) 119

y q[k] = dt k k (Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j )Ii,j+1 (Di,j+1 Di,j1 4Di,j )Ii,j1 8dy 2 k 8Di,j Ii,j . (6.20)

Agrupando trminos, el lado izquierdo de la ecuacin (6.16) es e o


k+1 k+1 k+1 Ii,j (p[k + 1] + q[k + 1]) + rai,j Ii,j = [1 + 8Di,j (p + q) + rai,j ] Ii,j ain k+1 p[Di+1,j Di1,j + 4Di,j ] Ii+1,j ai+1 in k+1 +p[Di+1,j Di1,j 4Di,j ] Ii1,j ai1 in k+1 q[Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j ] Ii,j+1 aj+1 in k+1 +q[Di,j+1 Di,j1 4Di,j ] Ii,j1 aj1 in

(6.21) y el lado derecho es


k k k k+1 k Ii,j + p[k] + q[k] rai,j Ii,j + r(Si,j + Si,j ) = [1 8Di,j (p + q) rai,j ] Ii,j bin k +p[Di+1,j Di1,j + 4Di,j ] Ii+1,j bi+1 in k p[Di+1,j Di1,j 4Di,j ] Ii1,j bi1 in k +q[Di,j+1 Di,j1 + 4Di,j ] Ii,j+1 bj+1 in k q[Di,j+1 Di,j1 4Di,j ] Ii,j1 bj1 in k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . cin

(6.22) 120

La discretizacin de la ecuacin (6.3) nos genera al siguiente sistema o o [Ain ]I k+1 = [Bin ]I k + [Cin ] donde 0 aj1 0 in . [Ain ] = . . . . . . . . . . . 0 0 aj1 in 0 bj1 0 in . [Bi ] = . . . . . . . . . . . 0 0 bj1 in y 0 ai1 ain ai+1 0 in in . . . .. .. .. . . . . . . . . . i1 i+1 0 0 ain ain ain 0 bi1 bin bi+1 0 in in . . . .. .. .. . . . . . . . . . i1 i+1 0 0 bin bin bin cin . [Ci ] = . . . cin 0 aj+1 0 in . .. .. . . . . 0 0 .. . j+1 ain 0 . , . . 0 (6.23)

0 bj+1 0 in . .. .. .. . . . . . j+1 0 0 bin

0 . , . . 0

Condiciones de contorno Las condiciones de contorno a considerar, de manera general, se pueden escribir as : I + DI n = , (6.24) donde , y son constantes. Para nuestro problema, de manera particular, tendremos las siguientes condiciones de contorno I = xa , x I = xb x

xa I + xa D

xb I + xb D

x [a, b] (6.25)

yc I + yc D

I = yc , y

yd I + yd D

I = yd y

y [c, d]. (6.26)

Discretizacin de la condicin de contorno o o A continuacin, desarrollaremos la discretizacin de las condiciones de o o contorno. 121

Desarrollo del trmino en x, tendremos que e Ii+1,j Ii1,j = 2dx 2dxIi,j + D [Ii+1,j Ii1,j ] = 2dx 2dx 2dx Ii+1,j Ii1,j = Ii,j , D D Ii,j + D es decir, Ii+1,j Ii1,j = 2dx 2dx Ii,j . D D (6.28)

(6.27)

Despejando la ecuacin (6.28), obtendremos que o Ii+1,j = Ii1,j + e Ii1,j = Ii+1,j Anlogo para el trmino en y a e Ii,j+1 = Ii,j1 + e Ii,j1 = Ii,j+1 2dy 2dy Ii,j D D 2dy 2dy + Ii,j . D D (6.31) 2dx 2dx Ii,j D D 2dx 2dx + Ii,j . D D (6.29)

(6.30)

(6.32)

Determinacin de las ecuaciones en diferencias para las condiciones o de contorno Para determinar las ecuaciones en diferencias de la condiciones de contorno, consideraremos que el trmino difusivo D es constante en la frontera, e con lo cual la ecuacin de difusin ser o o a I D2 I + a I = S. t (6.33)

La discretizacin de la condiciones de contorno, considerando el siguiente o esquema [Af ]I k+1 = [Bf ]I k + [Cf ], (6.34) 122

es [Af ]I k+1 = 1 + D dt dt dt Ddt k+1 Ddt k+1 k+1 + D 2 + a Ii,j I I 2 2 i+1,j dx dy 2 2dx 2dx2 i1,j Ddt k+1 Ddt k+1 I I , 2 i,j+1 2dy 2dy 2 i,j1 (6.35)

[Bf ]I k = 1 D

dt dt Ddt k Ddt k dt k D 2 a Ii,j + I + I 2 2 i+1,j dx dy 2 2dx 2dx2 i1,j (6.36) Ddt k Ddt k + I + I 2dy 2 i,j+1 2dy 2 i,j1 dt k k+1 (S + Si,j ). 2 i,j

y [Cf ] = (6.37)

Ecuaciones en diferencias para los contornos Contorno (frontera) Inferior Para j = 1 / i = 1. Sustituimos Ii1,j e Ii,j1 en (6.35) y en (6.36). Ddt Ddt a dt a dt c dt k+1 Ddt k+1 + 2 + I 2 Ii+1,j 2 dx dy 2 a dx c dy i,j dx
af ai+1 f

[Af ]I k+1 = 1 +

Ddt k+1 I dy 2 i,j+1 (6.38)

aj+1 f

[Bf ]I k = [1

Ddt Ddt a dt a dt c dt k+1 Ddt k+1 + + ]I + I 2 2 dx dy 2 a dx c dy i,j dx2 i+1,j


bf bi+1 f

Ddt k+1 I dy 2 i,j+1


bj+1 f

(6.39) 123

y [Cf ] = 2a dt 2c dt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . a dx c dy


cf

(6.40)

Para j = 1 / i = 2, . . . , nx 1. Sustituimos Ii,j1 en (6.35) y en (6.36).

[Af ]I k+1 = 1 +

Ddt Ddt a dt c dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 I I + 2 + Ii,j 2 2 i+1,j dx dy 2 c dy 2dx 2dx2 i1,j
af ai+1 f ai1 f

Ddt k+1 I , dy 2 i,j+1 (6.41)

aj+1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt Ddt a dt c dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 2 + I + I I + dx2 dy 2 c dy i,j 2dx2 i+1,j 2dx2 i1,j
bf bi+1 f bi1 f

Ddt k+1 I dy 2 i,j+1 (6.42)

bj+1 f

y [Cf ] = 2c dt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . c dy


cf

(6.43)

Para j = 1 / i = nx. Sustituimos Ii+1,j e Ii,j1 en (6.35) y en (6.36). 124

[Af ]I k+1 = 1 +

c dt k+1 Ddt k+1 Ddt Ddt a dt b dt I 2 Ii1,j + 2 + + 2 dx dy 2 b dx c dy i,j dx


af ai1 f

Ddt k+1 I , dy 2 i,j+1 (6.44)

aj+1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt Ddt a dt b dt c dt k+1 Ddt k+1 + I + 2 Ii1,j 2 2 dx dy 2 b dx c dy i,j dx


bf bi1 f

Ddt k+1 I dy 2 i,j+1 (6.45)

bj+1 f

y [Cf ] = 2b dt 2c dt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . b dx c dy


f

(6.46)

Frontera superior Para j = ny / i = 1. Sustituimos Ii1,j e Ii,j+1 en (6.35) y en (6.36).

[Af ]I k+1 = 1 +

Ddt Ddt a dt a dt d dt k+1 Ddt k+1 + 2 + + I 2 Ii+1,j 2 dx dy 2 a dx d dy i,j dx


af ai+1 f

Ddt k+1 I , dy 2 i,j1 (6.47) 125

aj1 f

[Bf ]I k = 1

d dt k+1 Ddt k+1 Ddt Ddt a dt a dt + I + 2 Ii+1,j 2 2 dx dy 2 a dx d dy i,j dx


bf bi+1 f

Ddt k+1 I dy 2 i,j1 (6.48)

bj1 f

y [Cf ] = 2a dt 2ddt k k+1 + + r(Si,j + Si,j ) . a dx d dy


cf

(6.49)

Para j = ny / i = 2, . . . , nx1. Sustituimos Ii,j+1 en (6.35) y en (6.36). [Af ]I k+1 = 1 + Ddt Ddt a dt d dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 + 2 + + I I I dx2 dy 2 d dy i,j 2dx2 i+1,j 2dx2 i1,j
af ai+1 f ai1 f

Ddt k+1 I , dy 2 i,j1 (6.50)

aj1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt Ddt a dt d dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 2 I + I I + dx2 dy 2 d dy i,j 2dx2 i+1,j 2dx2 i1,j
bf bi+1 f bi1 f

Ddt k+1 I dy 2 i,j1 (6.51)

bj1 f

y [Cf ] = 2d dt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . d dy


cf

(6.52)

126

Para j = ny / i = nx. Sustituimos Ii+1,j e Ii,j+1 en (6.35) y en (6.36). Ddt Ddt a dt b dt d dt k+1 Ddt k+1 I 2 Ii1,j + 2 + + + 2 dx dy 2 b dx d dy i,j dx
af ai1 f

[Af ]I k+1 = 1 +

Ddt k+1 I , dy 2 i,j1 (6.53) d dt k+1 Ddt k+1 Ddt Ddt a dt b dt I + 2 Ii1,j 2 2 dx dy 2 b dx d dy i,j dx
bf bi1 f

aj1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt k+1 I dy 2 i,j1


bj1 f

(6.54) y [Cf ] = 2b dt 2d dt k k+1 + + r(Si,j + Si,j ) . b dx d dy


cf

(6.55)

Frontera izquierda Para j = 2, . . . , ny 1 / i = 1. Sustituimos Ii1,j en (6.35) y en (6.36). [Af ]I k+1 = 1 + Ddt Ddt a dt a dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 + 2 + I 2 Ii+1,j I dx2 dy 2 a dx i,j dx 2dy 2 i,j+1
af ai+1 f aj+1 f

Ddt k+1 I , 2dy 2 i,j1 (6.56) 127

aj1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt Ddt a dt a dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 2 + I + 2 Ii+1,j + I dx2 dy 2 a dx i,j dx 2dy 2 i,j+1
bf bi+1 f bj+1 f

Ddt k+1 I 2dy 2 i,j1 (6.57)

bj1 f

y [Cf ] = 2a dt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . a dx


cf

(6.58)

Frontera derecha Para j = 2, . . . , ny 1 / i = nx. Sustituimos Ii+1,j en (6.35) y en (6.36). [Af ]I k+1 = 1 + Ddt Ddt a dt b dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 + 2 + + I 2 Ii1,j I dx2 dy 2 b dx i,j dx 2dy 2 i,j+1
af ai1 f aj+1 f

Ddt k+1 I , 2dy 2 i,j1 (6.59)

aj1 f

[Bf ]I k = 1

Ddt Ddt a dt b dt k+1 Ddt k+1 Ddt k+1 2 I + 2 Ii1,j + I dx2 dy 2 b dx i,j dx 2dy 2 i,j+1
bf bi1 f bj+1 f

Ddt k+1 I 2dy 2 i,j1 (6.60) 128

bj1 f

y [Cf ] = 2bdt k k+1 + r(Si,j + Si,j ) . b dx


cf

(6.61)

Ahora que ya sabemos el valor de los coecientes para las condiciones de contorno, podemos denir la matriz [Af ] de la siguiente manera: [Af i ] [Af ] = [Af s ] , donde

(6.62)

[Af i ] = y

af ai+1 0 0 aj+1 0 0 0 0 0 f f j+1 i1 i+1 af af af 0 0 af 0 0 0 0 . . . . . .. .. .. .. .. .. .. . . . . . . . . . . . . . . . . . j+1 i1 i+1 0 0 af 0 0 0 af af af j+1 i1 0 0 af af 0 0 0 af 0 j+1 j1 i+1 af af 0 0 af 0 af 0 0 0

0 0 .. .. . . 0 0 0

0 0 . . .

, 0 0 0

[Af s ] =

0 0 0 aj1 0 0 ai1 af aj+1 0 0 0 f f f j1 i+1 0 0 0 0 af 0 0 0 af af 0 0 j1 j+1 i1 0 0 0 0 0 af 0 0 af af af 0 . .. .. .. . . . . . .. .. .. .. .. .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . j1 i1 i+1 0 0 0 0 0 0 af 0 0 af af af 0 0 0 aj1 0 0 ai1 af 0 0 0 0 f f

La matriz [Bf ] es igual a la matriz [Af ] salvo los coecientes. La matriz [Cf ] tiene la siguiente forma 129

Para nalizar, el esquema de Crank-Nicholson tendra la siguiente estructura AI k+1 = BI k + C donde [Af i ] A = [Ain ] , [Af s ] [Bf i ] B = [Bin ] [Bf s ] [Cf i ] y C = [Cin ] [Cf s ] (6.64) (6.63)

cf i . . . cf i cf i [Cf ] = . cf s cf s . . . cf s

130

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