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Conferencia
Conferencia 1
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Razones por las cuales los organismos difieren en morfologa: Filogenia. Edad (ontogenia).
Dimorfismo/polimorfismo
Mutacin / Variacin. Enfermedades / daos.
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Biologa cuantitativa
Siglo XX
Historia de la Estadstica
Siglo XIX
Pruebas de Hiptesis Coef. de correlacin ANOVAs Mtodos de computo intensivo (Pearson, 1895) Bioinformtica Mtodos multivariados (Fisher, 1935) (Hotelling, 1933)
Siglo XX
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Morfometra multivariada
Morfometra geomtrica
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Morfometra tradicional: morfometra concentrada en el manejo estadstico de dimensiones (como las longitudes, anchos y alturas). Los acercamientos al anlisis de las formas eran por la aplicacin de anlisis estadsticos clsicos sobre variables derivadas (ndices).
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A Variable
C Ambas notas 2 1
0,47 0,39 0,11 0,25 0,08 3,23 -2,19 4,7 67,0 26,1 0,99
Ambas notas 1 2
0,23 0,52 0,29 -0,24 0,12 -5,89 5,96 1,94 59,8
Nota 2 2 1
-0,79 0.70 0,03 -0,89 0,72 0,01 0,17 3,9 53,1 39,4 (0 100)
Ambas notas 2 1
0,57 0,11 -0,09 -0,01 0,44 -1,46 2,36 10,43 69,5
Nota 2 2 1
-0,51 1.41 0,39 -2,75 1,11 0,36 0,18 7,2 76,8
Nota 2 2 1
-0,49 1,38 -0,55 -1,02 0.15 0,17 0,04 8,6 68,8 0
2
0,13 1,07 -1,44 0,41 0,02 -1,33 0,74 2,0 87,6 207,1 <0,0001
2
0,72 0,71 -1,2 -0,88 0,10 -7,67 7,99 1,9 93,9
2
0,73 0,41 -0,54 -0,34 -1,28 0,92 0,07 2,1 85,7
Frecuencia Mnima Frecuencia Mxima Frecuencia Central Frecuencia pico Duracin de la nota Tiempo de ascenso Tiempo de descenso Duracin de la llamada Intervalo entre notas Valor propio % de variab. acum. F P % error de clasif.
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y las proporciones?
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Figura: Estudiando la variacin en las formas de los crneos usando el mtodo de coordenadas de D'Arcy Thompson.
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El florecimiento de la BioEstadstica gan terreno en la manera en que se analizaban los datos morfomtricos.
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Morfometra multivariada: morfometra en la cual conjuntos de medidas son analizados usando Anlisis de Componentes Principales, Anlisis de Variables Cannicas y mtodos multidimensionales relacionados.
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Qu es el tamao?
Variables usualmente usadas como indicadoras de tamao: Longitud de un eje. rea. Volumen. Peso. Puntajes en el CP 1.
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Problemas con las asunciones estadsticas : autocorrelaciones, faltas de independencia, multicolinearidad, etc.
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- Longitud de la concha (mm) - Ancho mximo de la concha (mm) - Ancho de la apertura (mm) -
Las tablas con los estadsticos descriptivos de dimensiones de estructuras pueden mostrar similitudes numricas enmascarando profundas diferencias de forma,
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- Longitud de la concha (mm) - Ancho mximo de la concha (mm) - Ancho de la apertura (mm) -
Las tablas con los estadsticos descriptivos de dimensiones de estructuras pueden mostrar similitudes numricas enmascarando profundas diferencias de forma, y viceversa: detectar diferencias en tamaos como si fueran de formas.
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- La homologa de las distancias lineales es difcil de evaluar, porque muchas distancias no estn definidas por puntos homlogos.
Ejemplo: Ancho mximo de la concha
Molusco 1
Molusco 2
Son homlogas?
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Crneo de Lemur
Crneo de roedor
Son homlogas?
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- La homologa de las distancias lineales es difcil de evaluar, porque muchas distancias no estn definidas por puntos homlogos.
- Un mismo conjunto de medidas de distancia pueden obtenerse de formas diferentes debidos que la ubicacin relativa del sitio de medicin no esta incluido en los datos.
Por ej.: el largo y ancho mximo de una elipse y de una gota pueden ser los mismos an cuando son de formas diferentes.
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- La homologa de las distancias lineales es difcil de evaluar, porque muchas distancias no estn definidas por puntos homlogos.
- Un mismo conjunto de medidas de distancia pueden obtenerse de formas diferentes debidos que la ubicacin relativa del sitio de medicin no esta incluido en los datos. - No es posible una representacin grfica de formas a partir de dimensiones lineales ya que las relaciones geomtricas (espaciales) entre variables no son preservadas.
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Forma
Tabla
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Concepto de forma
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Concepto de forma
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Naturaleza
Formas sujetas a variaciones arbitrarias
Por ejemplo: Fsica: Un cristal puede ser cbico pero nunca es perfecto ya que se crea bajo diferentes condiciones de turbulencia o gravedad. Biologa: Factores conducen a la variabilidad morfolgica: genticos, ecolgicos, prenatales, etc.
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Que es la FORMA?
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Espaol
Ingls
Shape Igual geometra
Forma
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Traslacin
Rotacin
Reescalado isotrpico
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Pose:
Nuevo sistema de coordenadas de referencia al cual todas las formas se alinean.
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Rotacin Traslacin
Reescalado
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A a
c
b b B c C B
ABC = ABC si
a = a b = b c = c
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Pre-shape
Traslado
Reescalo
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Forma: toda la informacin geomtrica que permanece cuando los efectos de la ubicacin, escala y rotacin son eliminadas de un objeto.
La forma es invariante a transformaciones de similitud euclideanas (Euclidean similarity transformations).
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Partes de las diferencias entre objetos que pueden ser eliminadas por transformaciones Variaciones afines (Affine shape variation): que no afectan el paralelismo de todos los conjuntos de lneas paralelas dentro de esta.
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Rotaciones Traslaciones
Escalados
Igual forma
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Igual forma? Variaciones afines (non-affine shape variations): Variaciones no no afines de la forma
(Non-affine shape diferencias Es la parte de las variation) en forma que no pueden ser explicadan por las transformaciones afines.
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Variaciones no afines
(Non-affine shape variation)
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Revolucin en la morfometra
Cambio de paradigma
Morfometra geomtrica
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Morfometra geomtrica
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Nuevo vocabulario
distancias Procrustes
Espacio tangente Anlisis de curvaturas Formas consenso
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Hiptesis I
Hiptesis II
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Estudios de Asimetras
El nivel de simetra en el fenotipo puede reflejar elementos sobre el estrs inherente (gentico) y extrnseco (ambiental) durante el desarrollo. Puede ser in indicador sensible de calidad gentica y ambiental.
Puede dar pistas importantes, incluso sobre procesos y eventos genticos como las hibridizaciones.
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Mtricas
(medidas continuas, lineales)
Desventajas: estadsticamente puede ser problemtico su anlisis, sobre todo cuando la variacin es pequea.
Desventajas: los grados de asimetra suelen ser muy pequeos y localizados, por tanto es dificil su medicin, y las deformaciones por el muestreo pueden ser un problema
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Antisimetra
Asimetra direccional
Asimetra fluctuante
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Asimetra direccional:
es cuando la mayora de los individuos son asimtricos pero la diferencia siempre es hacia el mismo lado. En este caso los valores de frecuencia izquierda y derecha tienen una sola moda y una distribucin normal con media diferente de cero.
Por ejemplo: las mitades del cerebro humano son asimtricas y la mayora de las personas tienen el izquierdo ms grande.
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Asimetra fluctuante:
Cuando los organismos son simtricos y la distribucin de frecuencias Derecha Izquierda es normal y con media cero. El grado de asimetra en la poblacin es indicada por la desviacin estndar, o sea la magnitud de las diferencias de la morfologa ideal.
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Estudios ecomorfolgicos:
Desplazamiento de caracteres
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Estudios ecomorfolgicos:
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Microbiologa
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Estudios filogenticos
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Mtodos de contornos
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Transformacin uniforme Transformacin de similitud euclideanas Traslacin Rotacin Reescalados isotrpicos Registro D'Arcy Thompson Variaciones afines Variacin no afnes de la forma Asimetra direccional Asimetra fluctuante Antisimetra
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Polihronakis, M. 2006. Morphometric Analysis of Intraspecific Shape Variation in Male and Female Genitalia of Phyllophaga hirticula (Coleoptera: Scarabaeidae: Melolonthinae) Ann. Entomol. Soc. Am. 99(1): 144 -150
Pandolfi J. M. y C. D. Burke.1988. Shape analysis of two sympatric coral species: Implications for taxonomy and evolution. Lethaia 22: 183-193 Iwata, H. 2002. The Evaluation of Genotype Environment Interactions of Citrus Leaf Morphology Using Image Analysis and Elliptic Fourier Descriptors. Breeding Science 52 : 243-251