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Manual de Epi Info 3
Manual de Epi Info 3
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Documentacin basada en los ejercicios suministrados con Epi Info, traducidos y adaptados por Pedro Arias Bohigas y Juan Carlos Fernndez Merino
Curso de autoaprendizaje de Epi Info para Windows. Traducido y Adaptado por Pedro Arias y Juan Carlos Fernndez Merino
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ndice Instrucciones generales................................................................................................................................ 5 Instalacin y configuracin general.............................................................................................................. 5 Requisitos del sistema .............................................................................................................................. 5 Desinstalacin de las versiones anteriores.............................................................................................. 5 Aplicaciones del escritorio ........................................................................................................................ 6 Instalacin ................................................................................................................................................. 6 Configuracin del idioma de trabajo......................................................................................................... 6 Ejercicio 1 Crear un cuestionario.................................................................................................................. 7 Paso 1 Crear un nuevo Cuestionario........................................................................................................ 7 Paso 2 Crear campos en el cuestionario.................................................................................................. 8 Grabar datos........................................................................................................................................... 11 Paso 1b Crear un nuevo Cuestionario ................................................................................................... 11 Paso 2b Crear campos en el cuestionario.............................................................................................. 11 Paso 3 Mover variables ........................................................................................................................... 13 Paso 4 Renombrar la pgina actual....................................................................................................... 13 Paso 5 Aadir una nueva pgina al cuestionario.................................................................................. 13 Paso 6 Crear un grupo ............................................................................................................................ 14 Paso 7 Editar una campo y crear una lista de Valores Legales ............................................................ 14 Paso 8 Cambiar el color de fondo .......................................................................................................... 15 Paso 9 Quitar la cuadricula de fondo...................................................................................................... 15 Paso 10 Cambiar el orden de tabulacin ............................................................................................... 15 Paso 11 Alinear campos......................................................................................................................... 16 Paso 12: Crear la tabla datos a la base de datos.................................................................................. 16 Ejercicio 1 Teora. Diseo de bases de datos............................................................................................ 17 Generalidades......................................................................................................................................... 17 Un poco de terminologa ......................................................................................................................... 17 Bases de datos en Epi Info..................................................................................................................... 18 Variables comunes.................................................................................................................................. 20 Ejercicio 2 Grabacin de Datos.................................................................................................................. 23 Paso 1: Aadir datos a la base de datos............................................................................................... 23 Paso 3: Moverse entre los registros....................................................................................................... 24 Paso 4: Buscar registros que cumplen una determinada condicin...................................................... 25 Paso 5: Cambiar la configuracin de Enter............................................................................................ 25 Ejercicio 3 Cdigo Check............................................................................................................................ 26 Paso 1 Calcular la edad (Orden Assign)................................................................................................ 26 Paso 2 Calcular el perodo de incubacin.............................................................................................. 27 Paso 3 Controles de calidad................................................................................................................... 28 Ejercicio 4. Introduccin a las bases de datos Relacionales..................................................................... 31 Paso 1: Abrir una Vista existente y guardarla en otro proyecto ............................................................. 31 Paso 2: Crear un botn relacional .......................................................................................................... 31 Paso 3: Configurar las propiedades de la relacin................................................................................. 32 Paso 5: Mover y cambiar el botn.......................................................................................................... 32 Paso 6: Probando su nuevo sistema de bases relacionales ................................................................. 32 Ejercicio 5 Analysis bsico- introduccin ................................................................................................. 34 Paso 1: Abrir Analysis ............................................................................................................................. 34 Paso 2: Abrir un proyecto existente ........................................................................................................ 34 Paso 3: Obtener un listado ..................................................................................................................... 34 Paso 4: Ordenar el listado...................................................................................................................... 35 Paso 5: Trabajar con una parte de la tabla de datos ............................................................................. 35 Paso 6: Cancelar el orden y la seleccin ............................................................................................... 36 Paso 7: Obtener una Distribucin de Frecuencias................................................................................. 36 Paso 8: Comparar medias (ANOVA)...................................................................................................... 38
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Paso 9: Obtener tablas cruzadas........................................................................................................... 38 Paso 10: Realizar grficas...................................................................................................................... 39 Paso 11: Crear datos Agregados........................................................................................................... 39 Paso 12: Mostrar un mapa desde Analysis ............................................................................................ 39 Paso 13: Cambiar el tipo de mapa a Densidad de puntos..................................................................... 40 Paso 14: Trabajar con Programas. Guardar rdenes en un programa (.PG M) .................................... 40 Paso 15: Abrir un programa que ya existe ............................................................................................. 41 Paso 16: Ejecutar un programa .............................................................................................................. 41 Ejercicio 6 Analysis bsico: Estadsticas avanzadas................................................................................ 43 Paso 1: Muestreos complejos................................................................................................................. 43 Paso 2: Regresin Lineal........................................................................................................................ 43 Paso 3: Regresin Logstica................................................................................................................... 45 Paso 4: Anlisis de Supervivencia de Kaplan -Meier.............................................................................. 46 Ejercicio 7: Leer y escribir archivos con diferentes formatos..................................................................... 48 Paso 1: Abrir Analysis desde el men EpiInfo ....................................................................................... 48 Paso 2: Abrir(importar) y actualizar una hoja de Excel .......................................................................... 48 Paso 3: Abrir(importar) un archivo .DBF ................................................................................................ 49 Paso 4: Escribir los datos del archivo .DBF en una tabla dentro el proyecto .MDB actual................... 49 Paso 5: Abrir una tabla de un archivo HTML.......................................................................................... 49 Paso 6: Escribir la tabla HTML dentro del proyecto .MDB mediante un enlace permanente ............... 50 Paso 7: Abrir un archivo de Epi 6, importndolo.................................................................................... 50 Paso 8: Abrir un archivo de Epi 6, trabajando directamente sobre el archivo .REC............................. 51 Ejercicio 8: Analysis intermedio: Manipulaciones de datos. ...................................................................... 52 Paso 1: Uso de Condiciones: Orden IF ..THEN..................................................................................... 52 Paso 2: Recodificar una variable asignndole el valor a otra ................................................................ 53 Paso 3: Asignar a una variable parte del valor de otra .......................................................................... 53 Paso 4: Guardar los cambios.................................................................................................................. 54 Paso 5: Relacionar dos archivos para calcular tasas ............................................................................ 54 Ejercicio 9 Anlisis Intermedio: Organizacin de salidas ........................................................................... 56 Parte I: Producir SALIDAS...................................................................................................................... 56 Paso 1: Enviar los resultados a un archivo concreto ............................................................................. 56 Paso 2: Crear cabeceras ........................................................................................................................ 56 Paso 3: Insertar texto o Cdigo Html ...................................................................................................... 57 Paso 4: Ejecutar un programa ................................................................................................................ 57 Ejercicio 10. EpiMap................................................................................................................................... 58 Parte I Hacer mapas bsicos.................................................................................................................. 58 Paso 1: Cargar polgonos de un archivo existente................................................................................. 58 Paso 2: Aadir datos a los polgonos..................................................................................................... 58 Paso 3: Cambiar las propiedades del mapa de colores (Clorpletas)................................................... 58 Paso 4: Cambiar las propiedades de la leyenda .................................................................................... 59 Paso 5: Cambiar el tipo de mapa a Densidad de puntos....................................................................... 59 Paso 6: Guardar un mapa como una imagen ........................................................................................ 60 Paso 7: Guardar un mapa como plantilla............................................................................................... 60 Paso 8: Enviar el mapa al portapapeles................................................................................................. 60 Parte II Usar Epi Map Automticamente ................................................................................................ 60 Paso 9: Releer el Mapa........................................................................................................................... 60 Paso 10: Cambiar los datos - Mostrar la actualizacin.......................................................................... 60 Parte III Traba jar con las capas geogrficas (coberturas) ..................................................................... 60 Paso 11: Obtener un archivo .SHP de Internet...................................................................................... 61 Paso 12: Abrir Epimap ............................................................................................................................ 61 Paso 13: Aadir capas a su Mapa.......................................................................................................... 61 Paso 14: Crear una capa nueva con parte de otra capa (Agregar otra capa)....................................... 61 Paso 15: Cambiar el color de la capa ANDALUCIA............................................................................... 62 Paso 16: Cambiar el orden en el que se dibujan las capas................................................................... 62
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Paso 17: Ocultar, mostrar y eliminar capas............................................................................................ 62 Paso 18: Maximizar/Minimizar el mapa.................................................................................................. 62 Paso 19: Mostrar etiquetas..................................................................................................................... 62 Paso 20: Buscar una provincia............................................................................................................... 63 Paso 21: Obtener informacin sobre una Provincia............................................................................... 63 Paso 22: Cambiar el fondo del mapa ..................................................................................................... 63 Paso 23: Borrar todas las capas............................................................................................................. 63 Ejercicio 11 Creacin de Informes. EpiReport........................................................................................... 64 Paso 1: Abrir y guardar plantillas............................................................................................................ 64 Paso 2: Disear una plantilla.................................................................................................................. 65 Paso 3: Aadir salidas de Analysis a la plantilla .................................................................................... 66 Paso 4: Dar formato a las tablas y celdillas............................................................................................ 66 Paso 5: Crear tablas personalizadas...................................................................................................... 67 Paso 6: Agregar datos ............................................................................................................................ 68 Paso 7: Aadir listados........................................................................................................................... 69 Paso 8: Generar el informe ..................................................................................................................... 70 Ejercicio 12. Crear un Men....................................................................................................................... 71 Caractersticas del Ejercicio ....................................................................................................................... 71 Paso 1 Crear una nueva carpeta y copiar los archivos necesarios....................................................... 71 Paso 2 Crear un Nuevo men ................................................................................................................ 71 Paso 3 Probar el men ........................................................................................................................... 72 Paso 4 Aadir Opciones y Apartados a nuestro men.......................................................................... 72 Paso 5 Aadir botones........................................................................................................................... 74 Paso 6 Aadir los bloques de acciones.................................................................................................. 74 Paso 7 Guardar su trabajo...................................................................................................................... 75 Paso 8 Crear un acceso directo ............................................................................................................. 76 Paso 9 Cambiar la imagen de fondo ...................................................................................................... 76 Paso 10 Comprobaciones finales........................................................................................................... 76 Paso 11 Para profu ndizar....................................................................................................................... 76
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Instrucciones generales
Encontrar EpiInfo y todos los archivos necesarios para realizar estos ejercicios en el CD. En Internet, puede obtener copias del programa completo desde las direcciones www.cdc.gov/epiinfo , www.cica.es/epiinfo o desde alguno de los servidores hispanos relacionados en esa pgina. Dependiendo de en qu parte del mundo viva, le interesar llevrselo desde uno o desde otro. En cualquier caso, puesto que ocupa ms de 60 megas, le recomendamos que se los baje en una hora de menor trfico en Internet (cuando tenemos problemas de conexin, nosotros lo bajamos a las 5 de la madrugada o los domingos por la maana).
Instalacin
Ejecute el programa SETUP.EXE y siga las instrucciones. Aunque stas estn en ingls, no tiene muchas opciones y contestando a todas s, por defecto, le har una instalacin completa. Durante la instalacin, se crea una listado llamado INSTALL.LOG en el que se detallan los pasos que se han seguido durante la instalacin. Este archivo lo utilizar el programa UNINSTALL si usted desea desinstalar Epi Info. La desinstalacin quita tambin programas que se han puesto en directorios del SISTEMA o comunes y limpia el registro del sistema. Por tanto, debe usarse la desinstalacin en vez de borrar los archivos directamente del disco duro. UNINSTALL no quitar los archivos de datos que se hayan creado despus de la instalacin, aunque debe asegurarse de no utilizar las bases de datos de ejemplo para incluir sus datos en ellas ni usar esos nombres (SAMPLE.MDB y NUTRI.MDB) para bases de datos propias, ya que estos archivos se quitarn con la desinstalacin o se reescribirn con otra instalacin.
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Principiante 120 Minutos Lea la parte terica que acompaa a este ejercicio
Epi Info organiza las bases de datos en proyectos. Un proyecto de Epi Info es un archivo con
extensin MDB en el que se almacenarn las tablas de datos, programas de anlisis de los mismos y el formato de las pantallas de captura de datos (Vistas). La creacin de un Proyecto nuevo no tiene un proceso independiente, se hace cuando se va a crear una Vista o Cuestionario.
Un proyecto puede contener varias vistas y cada vista muestra informacin sobre una serie de datos. En este ejercicio crear las pantallas (Vistas) de entrada de datos y una tabla donde ms adelante
podr grabar datos. El ejercicio consistir en el diseo de un proyecto donde grabar los datos relacionados con un brote por una toxiinfeccin alimentaria.
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c. De cualquiera de las dos formas obtendr una ventana Crear o Abrir PROYECTO, escriba CursoEpi en el espacio "Nombre de archivo" y haga clic en Abrir (NO es necesario que escriba la extensin MDB ya que el programa la pondr de forma automtica). Acaba de crear un proyecto llamado CursoEpi.mdb. Asegrese de que est trabajando en la carpeta CURSOEPI. Por ahora CursoEpi.Mdb est vaco. d. Epi Info preguntar ahora por el nombre de la nueva vista que desea crear. Escriba Brote1 en la ventana de dilogo Nombre de la Vista y pulse Aceptar. Acaba de crear una vista llamada Brote1 , que est incluida en el proyecto CursoEpi. FJESE en las instrucciones sobre nombre de Vistas que proporciona la ventana: NO deben empezar por un nmero, NO deben contener espacios. Nosotros el aconsejamos adems que no usa la letra , ni letras con acentos, ni otro tipo de letras no usadas habitualmente en ingls (por ejemplo ).
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b. En la ventana de definicin de campo deber traba jar con los espacios: Pregunta o Texto (puede elegir una Fuente para esto) Tipo (y Ancho/ Patrn si es necesario) Nombre del campo (recomendamos nombres de no ms de 8 letras, preferiblemente no acentuadas) c. Para cada campo escriba la Pregunta o texto del cuadro siguiente. Elija el tipo de variables y siga las instrucciones de los comentarios (si hay alguna) Para la mayora de los campos puede elegir el que usted desee, sin embargo para algunos debe usar el que proponemos ya que usaremos ese nombre ms adelante. Para finalizar cada campo pulse Aceptar
Pregunta o Texto Tipo de campo Nombre de Variable o Campo Comentarios
Brote de Toxi Infeccin Alimentaria Identificador Nombre Sexo Edad Caso Horas desde que comi Alimentos consumidos Jamn Cocido Espinacas Rollitos Ensalada de frutas
Label/Title Number Texto Texto Number Yes/no Number Label/Title CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX ID
Elija como Fuente Negrita, Cursiva o Itlica, Tamao 12. Escrbalo centrado en la pantalla. Patrn ##
HORAS
##.## Elija como Fuente Negrita, Cursiva, Tamao 12. Escrbalo centrado en la pantal la.
JAMON
ENSALADA
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Pregunta o Texto
Tipo de campo
Comentarios
Un campo Label/Title es un tipo especial de campo que solo es informativo, no se pueden grabar datos en l. Haga doble clic en cualquier campo de tipo texto si desea cambiar el tamao del mismo. Aparecern unos puntos azules. Pulse y arrastre cualquiera de ellos para cambiar el tamao del campo.
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Grabar datos Con esto ha terminado de disear su primera base de datos con Epi Info. Cierre el programa para crear
Vistas y pulse Aceptar en la ventana que aparecer. Esta ventana sirve para crear la tabla donde se guardarn los datos, ya que hasta ahora lo nico que habamos hecho es disear la pantalla de grabacin. Epi Info le sugerir como nombre de la tabla el mismo nombre que le ha dado a la vista (Brote1). Como resumen le recordamos: Ha creado un proyecto llamado CursoEpi.Mdb en la carpeta C:\CURSOEPI. El proyecto contiene ahora una tabla preparada para almacenar datos llamada brote1 y otra tabla que contiene la informacin sobre el diseo de la pantalla. Esta tabla se llama Viewbrote1. Vaya ahora al ejercicio 2, sgalo y vuelva de nuevo a este punto cuando lo termine.
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Pregunta o Texto Nombre Primer apellido Segundo apellido Telefono Fecha de Nacimiento Edad Sexo Profesin o lugar de trabajo Tipo Via Va N Escalera Piso Puerta Cod. Postal Municipio Provincia Fecha y hora la ingestin Fecha y hora del inicio de sntomas Perodo de Incubacin
Nombre de variable Nombre PrimerApellido SegundoApellido Telefono FECHANACI Edad Sexo Profesion TipoVia Via NumeroVia Escalera Piso Puerta CodPostal Municipio Provincia Ingestion InicioSin INCUBACION
Tipo de Campo TEXT TEXT TEXT NUMBER DATE NUMBER TEXT TEXT TEXT TEXT NUMBER TEXT NUMBER TEXT TEXT TEXT TEXT DATETIME DATETIME NUMBER
Comentarios
5 espacios
Elija formato europeo: DD-MM -YYYY Elija formato europeo: DD-MM -YYYY ###. Marque "Solo lectura"
Un campo Solo lectura es un campo en el que no se pueden grabar datos, solo se puede ver el
contenido del mismo. Para activar la propiedad solo lectura en un campo, cuando este crendolo marque la casilla apropiada. En este ejemplo el campo Edad se establece como Solo lectura porque la edad ser calculada de forma automtica tras grabar la Fecha de Nacimiento utilizando la fecha del ordenador (systemdate) como referencia. (Ms adelante aprender a programar estos clculos)
Un campo Obligatorio o Requerido es un campo que no se puede dejar en blanco (sin datos).
Reflexione sobre las ventajas e inconvenientes de esto.
Otras propiedades posibles son Bsqueda Sonora, y Repetido (Repeat Last), con la que podemos
hacer que se escriba automticamente el mismo valor que se introdujo en este campo en el registro anterior.
Brote de ToxiInfeccin Alimentaria
Identificador ## Enfermo? _ Nombre____ Primer apellido_______ Segundo apellido _____ Telfono ____ Fecha de nacimiento __/__/____ Edad ### Sexo _ Profesin o lugar de trabajo ___ Tipo Via __Va _____________ N __ Escalera __ Piso __Puerta __ Cod. Postal ##### Municipio ___________________ Provincia ___ Fecha y hora de la ingestin Fecha y hora del inicio de sntomas Perodo de Incubacin
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Paso 3 Mover variables A veces desear mover las variables despus de haberlas creado, porque no est satisfecho con el
orden en que aparecen en pantalla. a. Pulse y arrastre la pregunta de la variable Nmero de telfono para ponerla detrs de Provincia. b. Haga lo mismo con las etiquetas Brote de ToxiInfeccin alimentaria y Alimentos consumidos, para colocarlos en la posicin que mas le guste.
Pregunta o texto Sntomas clnicos Nauseas Vomitos Diarrea Calambres abdominales Fiebre Febricula Alimentos consumidos Jamn Cocido Espinacas Rollitos Ensalada de frutas Leche Caf Agua Pastel Helado de Vainilla Helado de Chocolate
Tipo de variable Label/Title CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX Label/Title CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX CHECKBOX
Nombre de Variable
CALABDOM
Elija como Fuente Negrita, Cursiva, Tamao 12. Escrbalo centrado. JAMON ESPINACA ENSALADA CAF
VAINILLA CHOCOLA
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c. Cuando termine con las variables, site el cursor sobre la lnea 2 Page y haga clic con el botn derecho. Escriba Sntomas y Alimentos en la caja. Pulse Aceptar (OK) cuando termine.
Paso 6 Crear un grupo Deseamos agrupar la informacin relativa a los distintos tipos de alimento. Epi Info puede agrupar
variables de forma que su manipulacin para el anlisis sea ms fcil. a. Haga clic en la esquina superior izquierda de un terico cuadrado que rodee todas las variables a agrupar (jamn cocido, espinacas. Rollitos y ensalada de frutas), sin soltar, arrastre el ratn a la esquina inferior derecha, aparecer un cuadrado temporal alrededor de los campos seleccionados. Suelte el ratn. b. En el Men principal, en Insertar elija Grupos. Deber asignar un Nombre a este grupo. Este nombre se mostrar como ttulo del grupo en su parte superior izquierda. Escriba Comida . Puede asignar un color a este grupo usando Establecer Color . c. Para modificar un grupo ya creado haga clic con el botn derecho sobre su nombre. Tambin puede hacer doble clic. d. Aparecer una ventana donde puede cambiarle el nombre, el color, desagruparlo o eliminarlo junto con todas las variables que incluye. e. Cree tambin los grupos, Bebidas y Postre
Paso 7 Editar una campo y crear una lista de Valores Legales Editar un campo significa volver a su pantalla de definicin con objeto de modificar algo. Para editar
las propiedades de un campo, haga clic con el botn derecho sobre la pregunta o texto del campo que desea editar.
Los VALORES LEGALES son la forma ms fcil de personalizar la entrada de datos. Consisten en
una lista de valores posibles como respuesta a una pregunta. Es muy til cuando se est grabando datos en un campo en el que solo se puedan incluir un limitado nmero de opciones.
El control de la calidad de los datos lo hace la propia base de datos y esto permite mejorar la
velocidad de grabacin. Los Valores Legales solo pueden aadirse a campos de tipo texto. a. Para aadir valores legales a la pregunta "Sexo", haga clic con el botn derecho en el texto de esta pregunta. Pulse el botn Valores Legales localizado en la parte derecha de la ventana de edicin de campo. b. Podra usar una tabla de valores legales ya existente o crear una nueva. Haga clic en el botn Crear Nueva .
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c. Aada los valores posibles para Sexo: Femenino, Masculino, No Consta. Si el orden en el que graba esta lista es el orden en el que desea que se muestre en pantalla, marque No ordenar. Si no lo marca la lista se ordenar alfabticamente. d. Haga clic en Aceptar para guardar la lista de valores legales y luego otra vez clic en Aceptar para guardar la nueva configuracin del campo. e. Haga clic sobre la pgina 1 (Datos de identificacin) y edite la pregunta Provincia. Haga clic en el botn Valores Legales . f. Haga clic en Crear Nuevo. g. Escriba los valores posibles para provincia: Albacete, Ciudad Real, Cuenca y Guadalajara y Toledo (use los nombres de las provincias de su Comunidad Autnoma o Regin). No marque No ordenar ya que deseamos que la lista se ordene alfabticamente. h. Haga clic en Aceptar para guardar esta lista y de nuevo en Aceptar para guardar la nueva configuracin del campo.
Paso 10 Cambiar el orden de tabulacin Cuando vaya a grabar datos, Epi Info por defecto, pasar por los campos en el orden en que se
encuentran dispuestos en la pantalla, de izquierda a derecha y de arriba a abajo. Para modificar el orden en que el cursor salta de un campo a otro, deber modificar el orden de tabulacin en cada una de las pginas.
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a. Haga clic en Edicin y luego en Orden de tabulacin. Localice el campo Nmero de telfono en la lista y seleccinelo. Llvelo al final de la lista utilizando los botones de arriba y abajo. Cuando termine pulse Aceptar.
Paso 11 Alinear campos Adems de arrastrar los campos manualmente como hizo antes, MakeView permite alinear campos de
forma automtica. a. En la pgina Datos de identificacin los campos Enfermo? y N de identificacin deberan estar alineados horizontalmente. Para alinear campos debe seleccionarlos como hizo antes para crear un grupo, marcando un cuadrado alrededor de los campos que quiere alinear. Haga clic en la esquina superior izquierda y arrastre el ratn hasta la esquina inferior derecha. Suelte el ratn. b. Una vez que ha seleccionado los campos seleccione Formato Alinear y Horizontal.
Recuerde que el programa slo le preguntar una vez sobre la creacin de la tabla. MakeView ejecutar Enter y usted podr probar el funcionamiento de la nueva base de datos.
RESUMEN: Con esto finaliza el ejercicio 1. Durante el mismo ha aprendido a crear cuestionarios (Vistas) y su tabla de datos en un proyecto de Epi Info (archivo de extensin MDB). Ha creado dos Vistas: brote1 y brote2. La segunda de ellas consta de varias pginas donde ha ido colocando las diferentes preguntas. Ha aprendido a agrupar campos, a cambiar la apariencia de la pantalla, a crear listas de valores legales en algunos campos. Tambin ha aprendido dos formas distintas de crear la tabla de datos asociada a una Vista: al cerrar el programa o al ir a Grabar Datos. Contine ahora con el Ejercicio 3.
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Generalidades
El diseo de la base de datos es uno de los aspectos a los que suele darse una menor importancia en los estudios epidemiolgicos. Es frecuente que el investigador que se enfrenta a la re alizacin de un estudio epidemiolgico contrate o consulte con otros profesionales sobre el tamao de la muestra, la realizacin de determinadas pruebas microbiolgicas, fsico-qumicas, serolgicas, etc., la metodologa de anlisis mas adecuada, la interpretacin de la p e incluso el diseo del cuestionario, la herramienta con la que se proceder a realizar la recogida de datos en papel. Sin embargo cuando los datos estn registrados en papel el investigador se sienta delante de su ordenador y en cinco minutos prepara su base de datos y se dispone a grabarlos y analizarlos. En este momento, cuando empieza a grabar o a veces cuando empieza a analizar, es cuando el investigador empieza a lamentar no haber dedicado un poco mas de atencin a esta fase de s u investigacin, no haber consultado con algn experto y no haber reflexionado sobre algunas cuestiones que en algunas ocasiones obligan a tirar por la borda las horas que uno ha pasado grabando datos. En este captulo se pretenden reflejar algunos aspectos de inters relacionado con el diseo de bases de datos desde un punto de vista terico. Existe una amplia doctrina terica sobre el diseo de bases de datos y posiblemente algunas de las ideas que se van a exponer en este documento no seran aceptadas d entro de la ms pura ortodoxia. Sin embargo consideramos que en el diseo de una base de datos debe conjugarse la ortodoxia doctrinal con el pragmatismo, permitiendo que el sentido comn apoyado por el conocimiento tcnico sea el que establezca los lmites y requisitos que deber tener nuestra base de datos.
Un poco de terminologa
Para adentrarse en el mundo de las bases de datos es necesario conocer algunos trminos sencillos. El uso extendido de los sistemas de gestin de bases de datos ha hecho que muchos usuarios un poco avanzados se hayan familiarizado con este trmino y lo usen con frecuencia sin saber exactamente que es. TABLA. Una tabla es un conjunto de datos organizados y estructurados en filas y columnas. Ejemplos de tablas son las guas de telfonos, los listados censales o de padrones, etc. En una tabla se recogen datos
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de un solo tipo de UNIDADES, ya sean estas personas, libros, animales, pelculas, unidades administrativas, edificios, etc. REGISTROS. Cada fila en una tabla recibe el nombre de registro, una tabla por tanto estar formada por un nmero (desde 0 a N) de registros. Cada registro incluye informacin de una unidad. CAMPOS. Cada columna de la tabla se denomina campo o variable. Los campos recogen el mismo tipo de dato en cada uno de los registros de la tabla, por ejemplo EDAD, SEXO, COLOR, AUTOR, etc. Durante la grabacin de datos, un campo concreto corresponde a una celdilla dentro de la tabla. BASE DE DATOS. Una base de datos es un conjunto de tablas que estn relacionadas entre s por incluir cada una de ellas datos relativos a unidades distintas pero que se refieren a un mismo universo u objeto. Por ejemplo, en un estudio nutricional, podemos tener una tabla con los datos de las personas entrevistadas, otra con los datos de los resultados de cada entrevista realizada a una misma persona, otra con los datos de los valores nutricionales de los distintos alimentos, otra con los valores de conversin de distintas unidades de medida casera a unidades de volumen (1 vaso de agua 250 ml.), etc. En una base de datos puede haber una sola tabla o mltiples. Para complicar las cosas un poco ms debemos hacer notar que en una base de datos, adems de las tablas con datos podemos encontrar otras tablas: Tablas copia de seguridad, tablas de consultas, tablas de programas, etc.
Para usuarios de EpiInfo 6 o dBase: muchos usuarios de la informtica, hemos estado utilizando el nombre de base de datos para denominar a un archivo .REC o dBase. Desde un punto de vista terico las clsicas bases de datos .REC o .DBF seran slo tablas. Para hacer una reconversin de ideas, una base de datos sera un conjunto de archivos .REC organizados dentro de un proyecto comn.
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Tabla de programa: Es una tabla nica. Contiene todos los programas almacenados en este proyecto. Su nombre es PROGRAM y puede no existir si no hay ningn programa de anlisis almacenado. Las vistas son unas tabla s muy especiales para Epi Info, ya que en ellas se definen muchos elementos, desde cual es la estructura y apariencia en pantalla de una tabla de datos, qu controles o especificaciones tienen los campos durante su grabacin, hasta cuales son las relaciones de unas tablas con otras Pginas : En las Vistas de Epi Info la informacin de un registro puede mostrarse organizada en distintas pginas, lo mismo que haramos en un Cuestionario en papel si tuvisemos distinto bloques de preguntas que ocuparan ms de una cara de nuestro soporte. Aspectos prcticos Al disear un cuestionario en papel o en una base de datos para una investigacin en salud pblica es fundamental tener bien claros cual(es) es el objetivo del estudio. Generalmente el diseo debe incluir los siguientes bloques de preguntas: Preguntas, puede ser una o varias, relacionadas con la(s) variable(s) dependiente(s) o resultado . Puede tratarse de una sola pregunta, por ejemplo si el individuo tiene o no tiene una determinada caracterstica (bajo peso al nacer), una enfermedad (cncer de pulmn) o un valor de una medicin (Nivel de colesterol en sangre). Tambin pueden ser varias preguntas, si las variables dependientes son ms de una o si la definicin de "caso" necesita datos de varias caractersticas (por ejemplo sntomas). Otro apartado debe incluir las preguntas relativas a aquellos factores que estamos investigando como posiblemente "relacionados con" o "causas de" la aparicin del resultado. Son por tanto preguntas relacionadas con las variables independientes, explicativas o de exposicin. Como en el caso anterior pueden ser una o varias (hbito tabquico, nivel de ejercicio semanal, etc...) Finalmente, el cuestionario / Base de datos debera incluir preguntas sobre aquellos factores que pueden modificar o confundir la asociacin entre las variables que estamos estudiando como explicativas y el resultado de inters. Se trata de incluir aqu las variables que pueden actuar como factores de confusin o modificadores del efecto. Preguntas tpicas para incluir en este apartado son la edad y el sexo, pero puede haber muchas otras. A veces no es fcil distinguir a priori las preguntas de los dos ltimos bloques, por tanto no es indispensable colocarlas en uno u otro, pero si estar seguro de que se han recogido. Adems, y dependiendo del objetivo del estudio y del uso final del cuestionario / base de datos, puede ser til aadir un apartado especfico con preguntas de identificacin del individuo (nombre, apellidos, direccin, telfonos, etc..). En este caso la edad y el sexo pueden venir aqu, aunque despus se analicen como exposicin o como confusoras. Finalmente es conveniente pensar en un bloque de preguntas de tipo administrativo o de gestin del estudio, por ejemplo si hay que hacer un seguimiento recoger si se hace o no y la fecha, o si hay que administrar algn medicamento si se ha administrado o no, etc...
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Variables comunes
Hay una serie de variables que son comunes a la mayora de las bases de datos, y que conviene tener bien establecido. Por un lado ahorran trabajo, ya que si se definen para una base de datos, la definicin sirve para todas y, por otro lado, asegura la compatibilidad de los datos con el resto de ficheros comnmente utilizados, ahorrndose recodificaciones y sucesos incompatibles, como por ejemplo tener asignados grupos de edades distintos (por ejemplo en un caso de 1 a 4 aos y en otro de 1 a 5, sin que hubiese especial inters en esa diferencia, o por ejemplo sexo 1 y 2 en un caso o M y F en otro)
3. NOMBRE
Se recoger el Nombre y dos apellidos de las personas. A ser posible un campo para cada apellido. Esta ser una variable de tipo alfanumrica.
5. FECHA DE NACIMIENTO
Se recoger la fecha de Nacimiento de la persona. A partir de esta fecha se calcular la Edad. Si se desconoce la fecha de nacimiento y se conoce la edad, se puede imputar la fecha de nacimiento a partir de la fecha de declaracin y la edad. Debindose consignar en ese caso que la fecha est imputada.
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6. EDAD
Se calcular la Edad a partir de la fecha de nacimiento y la fecha de inicio de los sntomas/declaracin. Siempre que sea posible se utilizarn dos variables una con la edad y otra con el tipo de edad representado en la anterior. (Esta ltima ser 1=Aos, 2=Meses, 3=Semanas, 4=Das, 9=No consta). La regla general ser expresar la edad en Aos. Cuando sea menor de 2 aos en meses. Cuando sea menor de un mes en Semanas y cuando sea menor de una semana en Das. Si no puede existir una variable con los metadatos de la edad (tipo de edad), se expresar la edad en aos.
7. SEXO
Se recoger el sexo. La codificacin ser 1 para el gnero Masculino, 2 para el Femenino, 9 para No consta. En los casos en los que el sexo sea verdaderamente desconocido (recin nacidos con sexo indeterminado y no conocido todava) se utilizar el valor 3. Esta ser una variable de tipo alfanumrica. Para facilitar la interpretacin de datos publicados, se podr recodificar el valor en las salidas, expresndose Como Masculino o M para el cdigo 1 y Femeninoo F. Cuando los datos se refieran slo a menores de 15 aos, se podrn utilizar los valores Nio/s o Nia/s.
8. DIRECCIN
Se recoger el tipo de va, nombre de la va, nmero, etc. Es importante que utilice este tipo de estructuracin para las direcciones, ya que se ha comprobado que es la mejor forma de evitar errores de transcripcin, facilitndose el tratamiento informatizado. La descripcin de una calle por el INE es mediante el tipo de va, nombre de la va, nmero, escalera, piso. Cuando existan coordenadas geogrficas o tramero se consignarn como coordenadas X e Y o el valor del tramero si existe
DE LA PERSONA
Sern los oficiales de la Comunidad autnoma para Zonas Bsicas de Salud. Esta ser una variable de tipo alfanumrica
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14.
AGRUPACIONES MS FRECUENTES
A veces es necesario hacer agrupaciones con el propsito de mejorar el anlisis estadstico o de facilitar la presentacin de los datos. Salvo que el anlisis o la presentacin requieran necesariamente otra agrupacin, se utilizarn las siguientes Agrupaciones de edad o General de 5 en 5: 0-4 (o <1, 1-4),5-9,10-14,..............., 80-84 y 85 y ms o General de 10 en 10: 0-4, 5-14,..............., 75-84 y 85 y ms o Mujeres en Edad Frtil: <15,15-19,20-4,......,40-44 y 45 y ms o Edad infantil
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En este ejercicio la grabacin de datos usando Epi Info. Aunque nosotros le proponemos un conjunto de datos de ejem plo, puede grabar tantos registros como desee.
Debe fijarse en los cambios de numeracin de los registros (abajo a la izquierda) conforme va aadiendo nuevas personas a su base de datos. Cuando tenga grabados varios registros pru el funcionamiento de los botones de ebe desplazamiento entre registros movindose a los registros anteriores, posteriores, primero y ltimo. a. Grabe los siguientes datos en la vista Brote1:
1 Page Datos de Identificacin IDpaciente: Edad: 30 Caso Si Jamn Cocido: No Rollitos: No Leche: Si Agua: Si H. de Vainilla: Si 01 Nombre:Juan Prez Bonilla Sexo/Gnero: Masculino Horas desde que comi.:10 Espinacas: Si Ensalada de frutas: No Caf: No Pastel: Si H. de Chocolate: No
1 Page Datos de Identificacin IDpaciente: Edad: 33 Caso No Jamn Cocido: No Rollitos: No 02 Nombre:Maria Pea Grande Sexo/Gnero: Femenino Horas desde que comi.: Espinacas: Si Ensalada de frutas: No
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1 Page Datos de Identificacin IDpaciente: Edad: 34 Caso Si Jamn Cocido: No Rollitos: No Leche: Si Agua: Si H. de Vainilla: Si 03 Nombre:Ana Estrella Luminosa Sexo/Gnero: Femenino Horas desde que comi.:11 Espinacas: No Ensalada de frutas: No Caf: Sio Pastel: Si H. de Chocolate: No
1 Page Datos de Identificacin IDpaciente: Edad: 45 Caso Si Jamn Cocido: Si Rollitos: Si Leche: No Agua: No H. de Vainilla: Si 04 Nombre:Raul Cabello Rubio Sexo/Gnero: Masculino Horas desde que comi.:11 Espinacas: No Ensalada de frutas: No Caf: No Pastel: Si H. de Chocolate: No
1 Page Datos de Identificacin IDpaciente: Edad: 38 Caso No Jamn Cocido: No Rollitos: No Leche: No Agua: No H. de Vainilla: No 01 Nombre:Eloisa Quinto Levanta Sexo/Gnero: Femenino Horas desde que comi.:10 Espinacas: Si Ensalada de frutas: Si Caf: Si Pastel: Si H. de Chocolate: No
El botn << llevar la pantalla de entrada de datos al primer registro, mientras que el
botn < llevar al registro inmediatamente anterior.
Por el contrario, el botn > llevar al registro inmediatamente siguiente y el botn >> al
ltimo registro.
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a. Estando en la pantalla de grabacin de datos pulse el botn Buscar. b. Elija el campo Primer Apellido de la lista que aparece a la izquierda. Recuerde que este campo aparecer con el nombre que usted eligiera al crear el campo. c. Escriba un apellido y pulse Aceptar. Aparecer el resultado de su bsqueda. d. Pulse Limpiar para empezar una nueva bsqueda. e. Elija el campo Edad f. Escriba una edad y pulse aceptar g. Modifique las condiciones de bsqueda en el campo edad escribiendo un rango de edades, por ejemplo 20 to 35. Pulse Aceptar. Compruebe que los registros que se muestran cumplen la condicin. h. Pulse Limpiar para realizar una nueva bsqueda. i. Elija los campos Edad y Caso. Indique en edad 22 aos y en Caso el valor con que ha grabado los positivos, por ejemplo Si (si no lo recuerda puede escribir 1 que es el valor universal para positivos)
RESUMEN: Con esto termina el ejercicio 2. En este ejercicio ha aprendido a abrir un proyecto de Epi Info (CURSOEPI.MDB) y seleccionar una tabla (Brote1) en la que grabar datos. El programa usa la definicin de pantalla de datos que usted realiz en el ejercicio anterior (ViewBrote1). Ha practicado como ir grabando datos, como moverse entre registros y como buscar registros que cumplen una condicin. Finalmente ha aprendido a configurar la pantalla de entrada de datos para adaptarla a sus preferencias. Regrese ahora al Ejercicio 1 para completarlo .
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Intermedio 1 Hora Haber realizado el Primer Ejercicio Necesita aprender el concepto de funciones y variables internas (especialmente YEARS y SYSTEMDATE) revisando la Ayuda de Epi Info. Leer la parte terica asociada a este ejercicio
En el men de Epi Info pulse el botn Vistas , vaya a Archivo Abrir y seleccione el proyecto
CursoEpi.mdb y la vista Brote2.
El cdigo check se usa para calcular valores en algunos campos, adems de para mostrar mensajes de
aviso a la persona que est grabando los datos sobre cualquier problema que se presente durante la entrada de los mismos (inconsistencias, etc.) El cdigo Check puede ser muy simple o muy complicado.
En nuestro ejemplo lo usaremos para calcular la edad actual de la persona, el perodo de incubacin y
establecer algunos controles de calidad. Al hacer clic en el botn azul etiquetado Check se activa el editor de cdigo check.
Todo el cdigo check debe asociarse a una variable existente en la vista. La lista de variables est
disponible en la caja de desplazamiento llamada Indique el campo donde ocurrir. Las variables estn organizadas en pginas. Recuerde que no ver la pregunta o texto sino el nombre corto de la variable.
Las variables de solo lectura no ejecutarn ningn cdigo check, as que deber seleccionar una
variable que no tenga esta propiedad para ejecutar el cdigo que asigne un valor a las mismas (normalmente una variable que est relacionada con ella). Para cada paso le indicaremos que es lo que vamos a hacer, como hacerlo y como se ve el cdigo de programacin. Los COMENTARIOS no deben escribirse, se usan solo para explicar que es lo que queremos hacer.
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Para esto Epi Info dispone de funciones especiales (consulte el manual para ver la funcin YEARS). b. En el campo FECHANACI incluya el siguiente cdigo: ASSIGN EDAD=YEARS (FECHAN ACI, SYSTEMDATE) *COMENTARIO: Calcula la edad en aos entre la fecha de *nacimiento y la fecha de hoy obtenida del ordenador. El clculo se *realiza despus de escribir la fecha de nacimiento en su campo. COMO? 1. Primero seleccione la variable donde se ejecutar el cdigo check En nuestro ejemplo, seleccione FECHANACI usando la lista desplegable, Indique el campo donde ocurrir. Deje marcado Despus. Esto significa que el clculo de la edad se har despus de que el cursor salga de ese campo. 2. Haga Clic en la Pestaa Variables y luego en el botn Asignar . 3. Rellene esta ventana usando los siguientes elementos: I. En el espacio Asignar valor a variable, elija Edad. Es decir el nuevo valor se grabar en la variable EDAD. II. El espacio Expresin contendr la frmula usada para calcular la edad. Puede usar la funcin Years para realizar esto.
Las funciones modifican el valor de una o ms variables usando valores de otras. La mayora de
funciones necesitan argumentos o parmetros, palabras que deben escribirse entre parntesis, junto a la funcin, separados por comas cuando son varios, sin dejar espacios.
III. La funcin Years usa dos parmetros: el primero ser la fecha de nacimiento (FECHANACI) (eljalo de la lista de Variables disponibles) y el segundo ser la fecha actual que se expresar como SYSTEMDATE. Escriba la siguiente expresin (asegrese de poner los parntesis): Years(FECHANACI,Systemdate) NOTA: SYSTEMDATE es una variable interna que contiene el valor de la fecha de hoy. 4. Haga clic en Aceptar cuando termine y luego en Guardar en el editor de cdigo en la parte inferior. Finalmente haga clic en Aceptar en la parte superior de la pantalla para salir de Check.
Paso 2 Calcular el perodo de incubacin El mtodo estndar para calcular el perodo de incubacin es restar las horas que hay entre la fecha de En el campo INICIOSINI incluya el siguiente cdigo:
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ASSIGN INCUBACION=HOURS (INGESTION, INICIOSIN) *COMENTARIO: Calcula el Periodo de Incubacin en nmero de *horas entre la fecha y hora de comida y la fecha y hora de inicio de *sntomas. El clculo se realiza despus de escribir la fecha de inicio *de sntomas en su campo CMO? a. Primero, seleccione la variable donde se ejecutar el cdigo check (deje la opcin "despus" marcada). En nuestro ejemplo, seleccione Iniciosin de la lista, Indique el campo donde ocurrir . b. Haga clic en la pestaa Variables y despus en el botn Asignar . c. Rellene la ventana usando los siguientes elementos: En el espacio Asignar valor a variable, elija incubacin. Es decir el nuevo valor se grabar en la variable INCUBACION. El espacio Expresin contendr la formula usada para calcular esta fecha. La expresin final ser:
HOURS(INGESTION,INICIOSIN)
Haga clic en Aceptar cuando termine y luego en Guardar , de nuevo en el editor de cdigo en la
parte inferior. Finalmente haga clic en Aceptar en la parte superior de la pantalla para salir de Check.
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*COMENTARIO: Se evala el nmero de Horas del perodo de incubacin. Si es *mayor de 72 horas, muestra un mensaje, se borra el valor de la fecha de inicio de *sntomas y del periodo de incubacin calculado. El cursor se va al campo de fecha de ingestin. CMO?: 1.- Pulse el botn Chek 2.- En el espacio Indique el campo donde ocurrir seleccione el campo INICIOSIN (fjese que tendr un asterisco al lado, esto es por que ya tiene algo de cdigo escrito, el cdigo correspondiente al calculo del Periodo de incubacin del paso anterior) 3.- Pulse la pestaa Registros 4.- Pulse el botn Si...Entonces. Aparecer una nueva ventana 5.- En el espacio "Condicin Si" escriba: INCUBACION>72. Si lo desea puede seleccionar los nombres de las variables de la lista de variables disponibles. 6.- Para establecer lo que ocurrir si el perodo de incubacin es mayor de 72 pulse el botn Entonces. Aparecern de nuevo las pestaas (aunque puede que est en ingls). 7.- Pulse la pestaa User Interaction (interaccin con el usuario) y despus el botn Dialog (Dilogo) 8.- Aparecer una ventana. En el espacio Ttulo escriba: Error en el perodo de incubacin. En el espacio Pregunta o Texto escriba: El perodo de incubacin no puede ser mayor a 72 horas. Pulse el botn Aceptar. Volver a la ventana de la condicin Si. Fjese que en el espacio debajo del botn Entonces, all aparecer escrito el cdigo check usado hasta el momento en esta parte del ejercicio. 9.- Pulse de nuevo el botn Entonces 10.- Elija ahora la pestaa Fields (Campos) y pulse el botn Clear(borrar) . Seleccione los campos INCUBACIN e INICIOSIN de la lista y pulse el botn Aceptar. 11.- Pulse de nuevo Entonces 12.- Vuelva a seleccionar la pestaa Fields (campos), pero ahora pulse el botn Goto (ir a). Seleccione el campo INGESTION y pulse Aceptar 13.- Ahora debe ver en la ventana de Entonces todo el cdigo que se ejecutar si se cumple la Condicin Si. El espacio "De lo contrario" debe estar en blanco. 14.- Pulse el botn Aceptar 15.- El cdigo deseado incluyendo las palabras IF .. THEN...END, debe aparecer escrito en la ventana del editor de programas (en la parte inferior de su pantalla). NOTA: Su ventana de Cdigo Chek debera incluir ahora lo siguiente: ASSIGN INCUBACION=HOURS (INGESTION, INICIOSIN) IF INCUBACION>72 THEN DIALOG "El perodo de incubacin no puede ser mayor de 72 horas!" TITLETEXT="Error en el perodo de incubacin" CLEAR INCUBACION INICIOSIN GOTO INGESTION END La primera parte del cdigo (la lnea ASSIGN) calcula el periodo de incubacin y lo escribe enel campo INCUBACION. La segunda parte, desde el IF hasta el final, comprueba el nmero de horas del periodo de incubacin y realiza diversas cosas si este es mayor de 75.
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16. Pulse el botn Guardar en esa ventana. RESUMEN: Con esto finaliza el ejercicio 3. En este ejercicio usted ha aprendido a valorar la importancia del cdigo Check para facilitar el trabajo de grabacin de datos y mejorar la calidad de los mismos . Ha aprendido el concepto de funciones y a saber cuando ocurren las acciones del cdigo Check. Ha realizado un pequeo programa que permite calcular la edad de una persona y el tiempo transcurrido entre dos fechas. Tambin ha aprendido a programar acciones condicionadas a los resultados de clculos o datos grabados por el usuario. Finalmente sabe como hablar con el usuario para decirle si las cosas van bien o no y como darle nuevas instrucciones. Contine ahora con el siguiente ejercicio.
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Intermedio 60 minutos
SITUACIN: Ya ha creado una vista y utilizado rdenes de control (Check). En este ejercicio copiar una vista previamente creada y la modificar. Esta vista, Vigilancia, que est en el archivo EJEMPLOS.MDB con ejemplos de Epi Info, tiene un prototipo de cuestionario de grabacin de declaraciones individualizadas. Este cuestionario tiene unas pginas comunes y unos cuestionarios adicionales especficos de la enfermedad. Lo que va a hacer es copiar esta vista en su proyecto CURSOEPI y luego revisarlo. Para familiarizarse con la vista, brala primero con GRABAR DATOS e intente grabar un caso, utilizando sus campos (grabar datos->abrir->c:\CursoEpi\EJEMPLOS ViewVigilancia) Como ve, hay varias pginas. En la primera hay unos botones inactivos, que se activan en funcin de la enfermedad que est grabando.
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cumplirse es que en el campo ENFERMEDAD est escrito el valor "HEP. A o "HEP. B" o "HEP. C") y que volver a la pantalla principal una vez introducido el registro. Una vez revisado esto, va a crear un botn para llamar a un cuestionario de Fiebre tifoidea. a. Cree una nueva variable en la parte inferior derecha de la pantalla de la pgina uno. b. Escriba " Fiebre tifoidea ", en la pregunta o texto del campo. Seleccione el tipo de variable "Relate" y pulse Aceptar. El mismo efecto se obtendra pulsando el botn "Vista Relacionada" .
Recuerde que le pedirn que cree la tabla slo una vez. MakeView ejecuta Enter y ya puede probar su nueva base de datos relacional e introducir sus datos nuevos.
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Observe cmo al principio, el botn Fiebre tifoidea no estar activo. Slo se pondr activo cuando el campo de Enfermedad sea igual a FIEBRE TIFOIDEA.
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Principiante 60 minutos
Conocimientos de estadstica son aconsejables para una mejor comprensin de los resultados del programa.
Necesidades
Fjese la pantalla Analysis est dividida en tres ventanas: a. La ventana de la izquierda, dispuesta en vertical contiene todas las rdenes que podr utilizar. Cada vez que se selecciona una orden se mostrar una ventana de dilogo para que rellene los componentes de la orden (variables, etc.) b. Despus de seleccionar y ejecutar una orden, esta queda escrita en la ventana inferior (Editor de rdenes). c. Finalmente en la ventana superior (Resultados) se mostrar el resultado de la orden recien ejecutada y de las anteriores de la misma sesin de trabajo.
Paso 3: Obtener un listado Pulse en la orden Listar para realizar un listado de registros. Epi Info puede mostrar el listado
de dos formas: una es como un documento HTML y la otra es como una cuadrcula (formato hoja de clculo). Este ltimo formato es la opcin por defecto. Pruebe ambos formatos.
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El asterisco (*) representa todas las variables que existen en la tabla de datos. Si desea listar slo algunas variables, sustituya el asterisco por el nombre de la variable que desea listar. Vaya aadiendo una a una las variables que quiera listar. Si marca "Todo menos", obtendr un listado de todas las variables excepto las seleccionadas. a. Para nuestro ejercicio deje todo lo que aparece en la ventana listar tal y como est y simplemente pulse Aceptar. Obtendr un listado de la tabla de datos con la que vamos a trabajar en este ejercicio. b. Desplcese para ver lo que contiene con las barras de desplazamiento en la parte inferior y en la derecha de la ventana de resultados. La tabla que hemos abierto contiene datos de un sistema de vigilancia de casos de enfermedades infecciosas. Ver que en la tabla existen los campos CODIGO, CENTRO (cdigo del centro notificador), FECHADECLA, SEMANA (Semana epidemiolgica), AO, ENFERMEDAD, CODENFERMEDAD (cdigo de la enfermedad en una codificacin propia del sistema de vigilancia), CASOS (nmero de casos de enfermedad declarados), SEXO (codificado 1=Hombre y 6=Mujer), FECHANAC (Fecha de nacimiento del caso), EDAD, TEDAD, MUNICIPIO, CODMUN, FECHAINIC (Fecha de inicio de sntomas), MECTRANS (mecanismo de transmisin) y PROVINCIA. Adems existen dos campos llamados UniqueKey y RecStatus que son propios de EpiInfo y que podr ver en todas las tablas de este programa.
C:\CURSOEPI\Ejemplos.MDB:viewEDO SEXO= "1" MUNICIPIO (Excluye registros Nmero de Registros: 644 Fecha: 05/11/2001 3:48:19 PM borrados)
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b. Haga ahora un Nuevo listado y compare los resultados con el anterior. Fjese que en el campo Sexo solo debera aparecer el valor 1.
La asuncin para poder utilizar tanto el estimador puntual como el intervalo es que la muestra es una muestra aleatoria simple no segada procedente de la poblacin diana. Si la muestra no es aleatoria estos resultados no pueden utilizarse para extrapolar a la poblacin. Si la muestra es aleatoria, pero no simple (por ejemplo es estratificado o por conglomerado) debe utilizarse la orden adecuada para muestras complejas.
a. Para obtener una distribucin de frecuencias debe seleccionar la orden Frecuencias. Elija PROVINCIA de la lista de campos que aparece en Frecuencias de:
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b. El resultado debe ser parecido a este: Siguiente procedimiento Adelante PROVINCIA Frecuencia Porcentaje Porcentaje acumulado 103 12,0% 12,0% ALMERIA CADIZ CORDOBA GRANADA HUELVA JAEN MALAGA SEVILLA Total 73 54 177 41 25 203 185 861 8,5% 6,3% 20,6% 4,8% 2,9% 23,6% 21,5% 100,0% 20,4% 26,7% 47,3% 52,0% 54,9% 78,5% 100,0% 100,0%
Int. Conf. 95 % ALMERIA 9,9% 14,4% CADIZ 6,7% 10,6% CORDOBA 4,8% 8,2% GRANADA 17,9% 23,4% HUELVA 3,5% 6,5% JAEN 1,9% 4,3% MALAGA 20,8% 26,6% SEVILLA 18,8% 24,4%
c. Observe que Epiinfo le muestra todos los valores que contiene la variable PROVINCIA y al lado de cada uno de ellos, muestra la frecuencia absoluta (el nmero de registros con ese valor), la frecuencia relativa (porcentaje respecto al total) y la frecuencia acumulada (en cada valor se suma su porcentaje a los de los valores anteriores. La ltima en la tabla de porcentajes muestra el 100%. Fjese que este Total puede no coincidir con el total de registros en la tabla de datos si existen registros con valores ausentes (missing) . Adems de esta tabla EpiInfo presenta los intervalos de confianza para cada porcentaje. La distribucin de frecuencias es la orden ms adecuada para hacer un anlisis univariante cuando la variable es dicotmica o categrica.
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Paso 8: Obtener estadsticas resumen de una variable cuantitativa y comparar medias (ANOVA)
a. Cualquier variable cuantitativa puede ser descrita a travs de diversas medidas de centralizacin y dispersin. Epi Info permite realizar esto usando la orden MEDIAS. Pulse Medias y elija EDAD en Medias de. Pulse Aceptar. El resultado, tras una distribucin de frecuencias de la variable edad, ser parecido a:
Observaciones Total Media Varianza Desviacin tpica 861 48246,0000 56,0348 17166,0058 131,0191 Mnimo 25% Mediana 75% Mximo Moda 1,0000 24,0000 38,0000 52,0000 999,0000 30,0000 b. La comparacin de medias se hace utilizando la orden Medias. Seleccione la variable EDAD en la lista de campos de Medias de y la variable SEXO en Tabulado por . Pulse Aceptar .
Aqu es importante hacer un parntesis para hablar sobre los distintos tipos de variables. Comprender esta clasificacin es fundamental para utilizara adecuadamente los test estadsticos. En resumen, podemos clasificar las variables en los siguientes grupos: 1- Variable cualitativas NOMINALES: son variables cuyos valores no tienen una relacin de orden entre ellos, por ejemplo Sexo o Raza. Estas variables pueden estar codificadas con nmeros sin que los valores tengan un significado numrico. Para ellas el mejor anlisis se har con una orden FERCUENCIAS. 2- Variables cualitativas ORDINALES, cuyos valores presentan una relacin de orden entre ellos. Por ejemplo, si definimos la variable FUMADOR como NO FUMADOR, POCO FUMADOR y MUY FUMADOR. Esta variable tambin podra estar codificada con nmeros (1,2 y 3). En este caso, adems de una distribucin de frecuencia pueden tener sentido la moda, los cuartiles o comparar los valores en dos grupos usando KrusKal-Wallis. 3- Variables CUANTITATIVAS, cuyor valore s se recogen enuna escala mtrica ya sea discreta o continua) por ejemplo el PESO o el Nmero de hijos. Estas variables deben analizarse preferentemente utilizando la orden MEDIAS .
El resultado, despus de la tabla cruzada de ambas variables y las estadsticas resumen de la variable EDAD en cada grupo de SEXO, presenta los resultados del Anlisis de la Varianza, Pruebas de homogeneidad de Varianzas y Test no paramtricos. Consulte libros de estadstica para saber mas sobre estos temas.
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La base de datos que contiene el nmero de casos por provincia slo un registro por
entidad geogrfica. El nico anlisis disponible para los datos agregados es el total de casos (suma).
b. Seleccione Suma en el listado que aparece en Funcin agregada o marque la casilla 1
pantalla.
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La variable de datos es un campo numrico que contiene los valores que le gustara
mostrar en el mapa.
d. Seleccione Count como la Variable de datos .
Seleccione Nombre y aparecer el nombre de las provincias (en este ejemplo). No necesita marcar nada en este caso, le sirven slo como informacin de su contenido.
g. Pulse Aceptar para visualizar el mapa. Se muestra un mapa de Andaluca con los casos de
Paso 13: Cambiar el tipo de mapa a Densidad de puntos Epi Map puede mostrar los datos como mapa de densidad de puntos.
a. Para transformar el mapa de colores (clorpletas) a un mapa de puntos, pulse en ArchivoGestor de Capas, y pulse en Propiedades.
b. Pulse en la pestaa Densidad de puntos (Dot Density). Cambie el tamao del punto a 5.
Si quiere, puede cambiar los colores. Cuando lo haya hecho, pulse en Aplicar y luego Aceptar.
Cada punto est situado aleatoriamente en el polgono. Si quisiera situar los puntos
en un lugar especfico, debe usar la caracerstica Aadir Puntos. (Ms abajo)
c. Cierre Epi Map y vuelva a Analysis.
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a. En la ventana de rdenes, situada en la parte inferior derecha de la pantalla, localice el botn Guardar y haga clic en l. Este botn guardar todas las rdenes que estn escritas en esta ventana en una tabla especial llamada Programs dentro del proyecto que usted elija. Un programa guardado se puede ejecutar o editar de nuevo en cualquier momento. b. Asegrese que el proyecto seleccionado es Cursoepi.Mdb . Si no lo es bsquelo y seleccinelo. c. En el espacio Programa de la ventana que aparecer, escriba Informe Basico, luego escriba su nombre en el espacio Autor. Antes de guardarlo definitivamente, escriba una breve descripcin en el espacio comentarios. Pulse Aceptar.
Usando la opcin Guardar como archivo de Texto, los programas pueden gu ardarse en un formato texto similar a los archivos .PGM de Epi Info para MS-DOS. d. Salga de Analizar Datos y vuelva a entrar. Con esta maniobra lo que ocurre es que el programa es eliminado de la memoria. Tambin puede pulsar el botn Nuevo. En este ltimo caso seguir viendo en el navegador los resultados previos.
En algn caso, puede desear utilizar solo una de las rdenes guardadas en un programa. Localice esta orden en el editor, pulse en la primera lnea de la orden y despus en Ejecutar esta orden .
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RESUMEN: En este ejercicio se ha familiarizado con el aspecto del programa Analysis de Epi Info. Ha aprendido a abrir una tabla de datos en un proyecto de Epi Info usando la orden Abrir/Importar. Ha podido visualizar los datos que la tabla contiene realizando un listado y ha aprendido a realizar una Distribucin de Frecuencias, a obtener estadsticos resumen de una variable numrica, a cruzar dos variables para obtener medidas de asociacin e impacto y a comparar los valores medios de una variable numrica entre dos o mas grupos. En el aspecto grfico, ha aprendido a utilizar el mdulo de grficos y mapas que acompaa a Epi Info. Finalmente ha guardado todas las rdenes en un programa y ha aprendido a abrir y ejecutar un programa ya existente.
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MEDIAS del programa ANALYSIS de Epi Info, realizan clculos que asumen que los datos proceden del universo muestral o de un muestreo aleatorio simple (o sistemtico no sesgado). Sin embargo, en muchos estudios y encuestas, se utiliza una estrategia de muestreo ms compleja. Estas pueden incluir procesos como la estratificacin, el muestreo por conglomerados y el uso de fracciones de muestreo diferentes. Ejemplos de encuestas que incluyen alguna de estas caractersticas son las encuestas de cobertura vacunal del Programa Expandido de Inmunizacin de OMS (Lemeshow and Robinson, 1985) y el sistema de Vigilancia de los CDC sobre Factores de riesgo asociados al Comportamiento (Marks et al., 1985). CSAMPLE calcula proporciones y medias con sus errores estndar y lmites de confianza en aquellos estudios en los que los datos no proceden de muestreos aleatorios simples. Si se realizan tablas de dos dimensiones, se calculan las odds ratio, riesgos relativos y diferencias de riesgos. Los datos procedentes de diseos de muestreos complejos deben ser analizados con mtodos que tengan en cuenta el efecto del diseo. En el pasado, no existan programas fciles de usar para analizar este tipo de datos. CSAMPLE proporciona estas herramientas y con ellas y un correcto entendimiento de esta metodologa de muestreo , se puede establecer las bases de un sistema de encuestas completo. Para poder usar las estadsticas complejas, en la base de datos debe existir una variable que identifique las unidades primarias de muestreo (PSU) o clusters. Pueden incluirse en la base de datos otras variables, como el peso muestral y los estratos, pero no son obligatorios. Los pesos pueden calcularse durante la fase del diseo y se usan durante la fase de anlisis.
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Vista actual:: C:\EPI_INFO\Sample.Mdb:viewEstriolAndBirthweight Nmero de Registros: 31 Registros Borrados: Excluidos Fecha:1/15/00 11:17:14 AM
gl Suma de cuadrados Media de cuadrados Estadstico -F 1 248.421 248.421 16.811 29 428.547 14.777 30 676.968 Coeficiente Error Est. F-test 21.536 2.636 66.7390 0.606 0.148 16.8108 Valor p 0.000000 0.000321
Coeficiente de Correlacin: El coeficiente de correlacin de Pearson, o r. En este ejemplo toma el valor de 0.61, lo que indica una correlacin positiva relativamente fuerte entre estriol y peso al nacer. Cuando solo hay una variable independiente, r= raiz cuadrada de r2. r^2 A veces representado como r2 o R2 , es decir, R cuadrado. El valor de R2 se obtiene de: Regression Sum of Squares / Total Sums of Squares (en el ejemplo anterior, 248.421/676.968 = 0.367). R 2 puede ser interpretado como la proporcin de variacin de y (en este ejemplo, peso al nacer) que puede ser explicado por x (en el ejemplo, estriol). As, en este ejemplo, el 37% de la variacin del peso al nacer puede ser explicado por el nivel de estriol de la madre. Si R2 = 1, entonces toda la variabilidad es explicada, lo que significara que todos los puntos caen sobre la recta de regresin. Si R2 = 0, nada de la variabilidad es explicada por x.
Estadstico F El valor de F se calcula como Regression Mean Square / Residual Mean Square (en el ejemplo, 248.421/14.777 = 16.81). Se calcula para determinar si la pendiente de la regresin es estadsticamente diferente de 0. Media El valor medio de ESTRIOL; podra haberse calculado usando MEANS ESTRIOL. Coeficiente La pendiente de la lnea, a veces denominada coeficiente de regresin. En el ejemplo, el valor 0.606 puede interpretarse como: por cada unidad de incremento en el nivel de estriol (1 mg/24 hr), hay un incremento de 0.61 unidades en el peso al nacer (g/100). Tambin se incluye el valor del error estndar de la pendiente, 0.148.
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Y-Intercept Es el punto donde la recta corta el eje y . En el ejemplo, la recta cortar el eje y (el peso al nacer) en el punto 21.5. La frmula general de la recta de regresin lineal simple es: y = a + bx donde y es la variable dependiente, a es el punto de corte, b es la pendiente y x es la variable independiente. En el ejemplo anterior la recta de regresin es: BW = a + b (estriol) BW = 21.54 + 0.61 (estriol) A partir de la formula, se puede calcular el valor del peso al nacer para cualquier valor de estriol. Por ejemplo, usando el nivel medio de estriol: 17.226, BW = 21.54 + 0.61(17.226) = 32.05
Paso 3: Regresin Logstica La regresin logstica se usa frecuentemente en epidemiologa, porque la curvas, en la
que est basada, representa mejor los extremos que la regresin lineal.
En Epi Info, puede usarse tanto la orden TABLAS como la regresin logstica cuando la variable resultado es dicotmica (por ejemplo, enfermedad/no enfermedad). El uso de TABLAS es adecuado cuando solo hay un factor de riesgo. La Regresin Logstica se necesita cuando el nmero de variables explicatorias (factores de riesgo) es mayor que uno. Esta metodologa se denomina tambin regresin logstica multivariada. La Regresin Logstica muestra la relacin entre una variable resultado con dos valores y una variable explicatoria que puede ser categrica o continua. Epi Info usa un programa independiente llamado MVAWIN para realizar este anlisis.
Por ejemplo, podemos usar los datos de Oswego para determinar que alimento puede haber sido la causa de la enfermedad. En el ejercicio de Oswego, la variable dependiente (resultado), enfermo (ILL),es dicotmica es decir, solo puede tomar dos valores No (0) o Si (1). Las variables independientes usadas en el modelo pueden ser categricas (Consumo de ensalada de patatas?: Si o No) o continua (Edad). En el ejemplo que sigue, ILL es la variable resultado y AGE, COFEE, MILK y VANILLA son las variables independientes.
MVAWIN - Multivariate Analysis for Windows Thu May 10 16:58:44 2001
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Epi Info v3 Windows Ejercicio 6 Analysis bsico. Estadsticas avanzadas VANILLA CONSTANT SINGLE 3.1357 - 1.9931 0.7173 0.7834 4.3714 -2.5442
________________________________________________________________________________ Term ---AGE COFFEE MILK VANILLA Odds Ratio ---------1.010 0.795 0.469 23.004 Lower ----0.979 0.201 0.040 5.639 Upper ----1.042 3.144 5.508 93.843
-2*Maximized Log-Likelihood :
D.F. ---4 4
________________________________________________________________________________ Criteria and Model Building Characteristics ------------------------------------------Analysis (Likelihood)........ Tolerance ................... Convergence ................. Iterations .................. Confidence Level ............ Observations in Analysis .... Warnings .................... Unconditional 0.0000010000 0.0000100000 15 95% 75 None
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la metodologa de Kaplan -Meier (KM) es estimar la probabilidad de sobrevivir de un determinado grupo en un intervalo de tiempo (probabilidad condicionada).
Para que sirve KM? Cada vez que se hace un estudio de supervivencia (por ejemplo: un estudio de seguimiento, un ensayo clnico o el estudio de la ocurrencia de un evento en el tiempo, la metodologa de KM podra usarse para estimar la probabilidad de sobrevivir a un determinado periodo de tiempo. Sobrevivir significa que el evento de inters no ha ocurrido. El evento puede ser la muerte, una complicacin del tratamiento o cualquier otro evento negativo definido. KM proporciona adems una estimacin de la probabilidad de estar libre del evento en un tiempo t. Inversamente, 1 menos la probabilidad de estar libre del evento al tiempo t es la probabilidad de sufrir el evento al tiempo t.
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Ejercicio 7: Leer y escribir archivos con diferentes formatos Caractersticas del Ejercicio
Objetivos Nivel Duracin Necesidades Requisitos Al finalizar el ejercicio, el alumno debera ser capaz de Entender cmo leer y escribir formatos de archivos de datos distintos a los de Epi Info Intermedio 45 minutos Archivos de Excel, Html, Dbase, Texto y EpiInfo 6 Haber realizado los ejercicios 5 y 6 Haber ledo el captulo de Anlisis bsico del libro introduccin a Epi Info
Con frecuencia ser necesario analizar datos que han sido generados en bases de datos o programas distintos a Epi Info. En este ejercicio aprender a abrir ficheros en otros formatos. Epi Info dispone de herramientas que permiten leer casi cualquier formato de archivo. Si finalmente el formato que usted tiene no puede ser ledo por Epi Info deber solicitar a alguien que lo exporte a un formato mas estndar (texto fijo, por ejemplo)
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Paso 4: Escribir los datos del archivo .DBF en una tabla dentro el proyecto .MDB actual
La orden Escribir(Exportar) tiene varias opciones. a. Pulse Escribir. Seleccione CursoEpi en el espacio Nombre y escriba indi9702 en el espacio Tables . Haga clic en la opcin Reemplazar y luego en Aceptar.
Seleccionar Todas significa que todas las variables se escribirn en la tabla. Seleccionar Anexar (la opcin por defecto) dentro de Modo de salida, significa que los datos se aadirn a la tabla existente (si existe). Seleccionar Reemplazar significa q ue los datos reemplazarn la tabla de datos, si existiese, en la base de datos.
b. Vuelva a Leer (read) el proyecto CursoEpi. Haga clic en el opcin Todos y seleccione la tabla indi970 . c. Pulse la orden Listar para ver los datos de esta tabla.
Recuerde que la pgina Html no est dentro del proyecto actual. Aparecer una caja de dilogo preguntando si se desea crear un enlace permanente a la pgina o si desea una consulta simple. Por defecto, el nombre del enlace ser TMP_LNK_x donde x es cualquier nmero. Si no desea un enlace permanente, haga clic en Aceptar y el enlace se eliminar la prxima vez que se cambia el proyecto o se cierre el programa.
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Database
View Table
Related View
TMPLNK_1
Spreadsheet
Data Table
Grid Table
TMPLNK_2
Code Table
Programs
TMPLNK_3
Text
Paso 6: Escribir la tabla HTML dentro del proyecto .MDB mediante un enlace permanente
a. Cuando escriba la tabla, como en el ejercicio anterior y le pregunte por el nombre de un enlace, escriba ICD9_LINK, es decir un nombre distinto de TMP_LINK_x. Este enlace (ICD9_LINK) se guardar en el proyecto como si se tratase de una tabla. b. Abra el proyecto Cursoepi. Pulse Todos y seleccione ICD9_LINK . c. Pulse la orden Listar para ver los datos.
c. Salga de An alysis. d. Desde el men principal de Epi Info, pulse Vistas para ver la nueva vista de la tabla Address en el proyecto CursoEpi. Salga de MakeView cuando haya terminado.
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Fjese en la diferencia que hay al abrir archivos de Epi6 seleccionando Epi6 o Epi6 Direct Read. Al abrir un archivo Epi6, Epi Info importa fsicamente los registros del archivo .REC creando automticamente una tabla en el proyecto. Tambin se crea de forma automtica la vista correspondiente. Sin embargo, al abrir un archivo Epi6 Direct Read no se importa sino que se utiliza el archivo de forma externa, de la misma forma que ocurre con otros fo rmatos, como dbf u hoja de clculo.
RESUMEN: En este ejercicio ha aprendido a abrir archivos con formatos distintos del estndar de Epi Info, lo cual le permitir analizar datos sea cual sea el programa que los ha generado.
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En muchas ocasiones los datos de la base de datos necesitan ser preparados previamente antes del anlisis. Por ejemplo, puede necesitar sustituir un valor por otro en todos los registros, o puede querer obtener un valor a partir de los datos disponibles en otras variables (calcular el ndice de Masa Corporal). En los distintos pasos utilizar la orden ASIGNAR (ASSIGN). Esta orden se utiliza para asignar valores a una variable, tanto si es de la propia base de datos como si es una variable definida (temporal). Tambin utilizar la orden DEFINIR (DEFINE) una variable.
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Para comprobarlo, haga una distribucin de frecuencias de EDAD. Ver que ahora hay 0 y ya no hay 999
RECODE EDAD TO GRUPOEDAD 0 - 4 = "1. 0 -4" 5 - 14 = "2. 5-14" 15 - 64 = "3. 15-64" 65 - 115= "4. 65 y +" ELSE = (.) END
Ponga el cursor en la primera lnea (RECODE.....) y pulse Ejecutar esta orden Para comprobar el resultado, haga un listado de estas variables o tambin una distribucin de frecuencias. Se ha optado por ponerle el n 1, 2, etc, para que el resultado aparezca ordenado. Si no lo hubiramos hecho as, se habra puesto el valor 5-14 detrs del valor 45-54
DEFINE CODPROV
ASSIGN CODPROV=SUBSTRING(CODMUN,1,2)
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Vea un listado para comprobar los cambios. Ahora realice una distribucin de frecuencias de la variable GRUPEDAD, de la variable SEXO, una tabla cruzada de GRUPEDAD y SEXO y calcule la media de EDAD segn ENFERMEDAD.
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c. Ahora defina una variable llamada TASA y asgnele el valor casos por 100.000 dividido por poblacin. El resultado ser: ASSIGN tasa=COUNT*100000/COUNT1 Haga un listado para ver el resultado Ha visto cuantos decimales tiene la tasa? Para cambiarle el formato, con dos decimales, usaremos la funcin FORMAT ASSIGN Tasa=format(tasa,#.##) Le recomendamos guardar las rdenes en un archivo de rdenes o programa, de la misma forma que hizo en el paso 14 del ejercicio 5. En este caso llame al programa Tasas RESUMEN: Este ejercicio ha repasado los conceptos relacionados con la manipulacin de datos previa al anlisis de los mismos. Ha aprendido crear variables que no existen en la tabla original, a asignar valores a una variable, a guardar las modificaciones de los datos en nuevas tablas, a relacionar dos tabla con datos complementarios a travs de una variable comn y a realizar clculos basndose en datos que existen en otras variables (incluso procedentes de dos tabla distintas).
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b. Pulse en la orden Encabezados. En la casilla Lnea de ttulo, elija 1 (Ttulo de ventana. Pulse en el espacio Ttulo y escriba: Distribucin de casos de Brucelosis. Cambie el color a Verde, y pulse Aceptar. c. Pulse en la orden Encabezados. En la casilla Lnea de ttulo, elija 2 (Ttulo del Archivo. Pulse en el espacio Ttulo y escriba : Resumen de resultados bsicos. Cambie el color a Aqua, cambie el estilo a Negrita, cambia el tamao a 7, y pulse Aceptar. d. Pulse en la orden Encabezados. En la casilla Lnea de ttulo, elija 3 Ttulo de la Fuente de Datos. Pulse en el espacio Ttulo y escriba: Publica do por (Su Nombre). Cambie el color a Aqua, el estilo a Cursiva, el tamao a 4 , y pulse n Aceptar. e. Pulse en la orden Encabezados. En la casilla Lnea de ttulo, elija 4 Ttulo del procedimiento. Pulse en el espacio Ttulo y escriba: Anlisis Bsico. Cambie el color a Blue, el tamao a 3 , y pulse Aceptar. f. Pulse en la orden Encabezados. En la casilla Lnea de ttulo, elija 5Ttulo de Variable. Pulse en el espacio Ttulo y escriba: Factores de . Cambie el color a Olive, el estilo a Subrayado, el tamao a 3, y pulse Aceptar.
RESUMEN: En este ejercicio ha aprendido a indicar a Epi Info como obtener un fichero de resultados que exija el menor esfuerzo de edicin posible antes de publicarlo (en papel o en Internet). Aprendi a definir el fichero donde se guardarn los resultados y a definir algunas cuestiones relacionadas con el aspecto de los resultados.
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Bajar un archivo shp de la pgina de Epi Info o del CD Haber seguido el captulo EpiMap del libro introduccin a EpiInfo
A estas alturas hemos aprendido dos maneras diferentes de mostrar informacin sobre un mapa. La primera forma, (ejercicio 5 Paso 12), enva la informacin directamente de Analysis a Epi Map. La segunda forma, en este ejercicio, usando Epi Map interactivamente y recuperar la informacin de la base de datos sin usar Analysis.
Los datos de los mapas de colores se pueden mostrar de dos formas, una automticamente
y la otra personalizable
b. EpiMap permite mostrar los datos en Percentiles. Para activar esto, marque la casilla Cuantiles localizada debajo del botn Restablecer la leyenda.
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c. A la izquierda de la graduacin de colores hay una caja desplegable llamada Nmero de clases. Cambie el valor a 8 y h aga clic en el botn Restablecer la Leyenda. Haga clic en Aplicar para hacer los cambios efectivos. Luego pulse Aceptar.
g. haga clic en el botn Restablecer la Leyenda . Pulse en Aceptar para realizar los cambios
en el mapa.
Paso 4: Cambiar las propiedades de la leyenda La leyenda se puede modificar desde el Gestor de capas usando el botn
Configuracin .
a. Pulse en Gestor de capas y luego en Configuracin.
Paso 5: Cambiar el tipo de mapa a Densidad de puntos Epi Map puede mostrar los datos como mapa de densidad de puntos.
a. Para transformar el mapa de colores (clorpletas) a un mapa de puntos, pulse en Gestor de Capas, y pulse en Propiedades.
c. Pulse en la pestaa Densidad de puntos (Dot Density). Cambie el tamao del punto a 5.
Si quiere, puede cambiar los colores. Cuando lo haya hecho, pulse en Aplicar y luego Aceptar.
Cada punto est situado aleatoriamente en el polgono. Si quisiera situar los puntos
en un lugar especfico, debe usar la caracerstica Aadir Puntos. (Ms abajo)
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Paso 6: Guardar un mapa como una imagen Puede guardar un mapa como archivo de imagen, tanto en formato BMP como
GIF. a. Cierre el Gestor de Capas (si est abierto) y desde el men principal haga clic en Archivo y elija Guardar como Bitmap. Asigne un nombre a su mapa y haga clic en Guardar. Repita el proceso para guardar el mapa en formato BMP. b. Abra el Explorador de Windows Explorer y haga doble -clic en cualquiera de los archivos BMP o GIF para verlos.
Paso 7: Guardar un mapa como plantilla Es posible guardar el mapa de las provincias como una plantilla.
La ventaja de este tipo de archivos es que, a diferencia de los otros formatos, Epi Map actualizar los datos cada vez que el mapa sea abierto.
a. Para guardar su mapa como una plantilla, cierre el gestor de capas (si est abierto) y haga clic en Archiv o y luego elija Guardar el Mapa . El nombre del archivo ser MAPAPROV. Haga clic en Guardar.
Paso 8: Enviar el mapa al portapapeles Es posible copiar el mapa al portapapeles y luego pegarlo en cualquier otra
aplicacin (por ejemplo PowerPoint, Microsoft Word, Corel o Harvard Graphics). a. Cierre el Gestor de Capas(si est abierto) y haga clic en Editar . Elija Copiar bitmap al portapapeles Seleccione la aplicacin destino y pegue la imagen. .
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b. Haga clic en el enlace Download Free Shapefiles for Epi Map y luego en Europa. c . Busque el enlace correspondiente a Spain y haga clic en l. Aparecer una ventana titulada Download . Asegrese de que est marcada la opcin Guardar en disco. Pulse Aceptar (Ok). Luego guarde el archivo (sp.exe) en la carpeta c:\cursoepi. La primera cobertura corresponde a Espaa por CCAA. Repita la operacin bajndose tambin el archivo de Espaa que est un poco ms abajo, bajo Second level administrative region. El archivo es ESP.EXE y corresponde a Espaa por CCAA. d. Usando el Explorador de Windows o Mi Pc abra la carpeta C:\cursoepi y haga doble-clic en el archivo ESP.EXE. Aparecer un mensaje informndole de que se van a extraer los archivos. Pulse Aceptar. Compruebe que el directorio de destino es c:\cursoepi y luego haga clic en Unzip. Haga clic en Ok cuando la extraccin de los cinc o archivos termine. Para finalizar pulse Cerrar. e. Repita el proceso con SP.EXE f. Cierre el navegador y salga del Explorador de Windows.
Los archivos ESP y SP han sido elaborados en EUA, y son tiles si no se dispone de otras capas. Para estos ejercicios hemo s suministrado unos archivos fuente suministrados por ESRI Espaa. Los archivos Esp_prov y Esp_ccaa, que contienen Espaa por provincias y CCAA. En estas capas se ha optado por escribir los nombres de provincias y CCAA sin acentos. Circunstancia que debe tener en cuenta cuando prepare mapas con sus propios datos.
Paso 14: Crear una capa nueva con parte de otra capa (Agregar otra capa) Dado que los ejercicios estn realizados con datos de Andaluca, slo se
necesitan stas provincias. a. En la ventana del Gestor de Capas, haga clic en el botn Agregar parte de una capa . Seleccione el archivo esp_prov.shp, que se encuentra en la carpeta c:\cursoepi. Haga clic en Abrir y obtendr una nueva ventana conteniendo todas las provincias.
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b. Haga clic en Almeria, Cadiz, Cordoba, Granada, Huelva, Jaen, Malaga y Sevilla Tenga en cuenta que debe mantener pulsada la tecla (Ctrl) para realizar una seleccin mltiple. Cuando termine pulse Aceptar. c. Epi Info crear ahora una nueva capa conteniendo slo las provincias seleccionadas. Use ANDALUCIA como nombre del archivo. Finalmente haga clic en Guardar.
Paso 17: Ocultar, mostrar y eliminar capas Para ocultar una capa, haga clic en la caja de verificacin junto al nombre de la
capa para desmarcarla. Los polgonos de la capa no se mostrarn en pantalla aunque estn disponibles en memoria. a. En el Gestor de capas, haga clic en la capa ESP_CCAA para seleccionarla (o resaltarla). Luego haga clic en el botn Quitar la capa . b. Cerrar Gestor de Capas
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a. Marque la casilla Map Tips (Ver rotulo activo)en el lado inferior derecho del mapa. Aparecen dos cajas de seleccin. La primera permite seleccionar la capa a utilizar y la segunda la variable a mostrar como etiqueta. Seleccione ANDALUCIA como capa y Nombre como campo. b. Ponga el cursor sobre una de las provincias representadas en la capa ANDALUCIA . Aparecer una etiqueta con el nombre de la provincia cuando pase el ratn por encima de cada una. Seleccione otro campo y se mostrarn los valores del campo seleccionado.
Caso 2: Mostrar etiquetas impresas c. Para mostrar los nombres de las provincias, haga clic en el botn del Gestor de Capas y seleccione Propiedades. d. Haga clic en Sencillo y cambia el color del mapa a blanco usando el espacio Relleno, haga clic en Aplicar. Inmediatamente, haga clic en la pestaa Std Label y asegrese de que en el espacio llamado Campo aparece Nombre . Haga clic en Aplicar y luego en Aceptar. Cierre el Gestor de Capas.
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El modulo Epi Report se puede utilizar para disear y generar varios tipos de informes. En los informes generados se pueden incluir datos de diferentes fuentes. Los elementos que se pueden incluir en los informes son salidas de Analysis (Archivos XML, listados de registros, celdas, grupos y datos agregados. Tambin se puede analizar datos mediante tablas flotantes (tablas dinmicas o pivotables).
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La mitad izquierda de la pantalla muestra los posibles elementos de un informe en una estructura de rbol:
Pulse el signo ms que hay en cada item para ver los elementos que contiene: 1. Insertar objeto muestra todos los elementos que se pueden insertan en el documento HTML (Tabla, Imagen, Enlace, Etiqueta) 2. Herramientas de dibujo muestra el elemento lnea . 3. Insertar Variables muestra Variables Permanentes definidas con Epi Info y las Variables del Sistema, como fecha actual, hora y directorio. 4. Leer datos muestra las siguiente opciones:
Salidas de Analysis permite ver la informacin contenida en las archivos XML producidos por Analysis y que se pueden aadir a la plantilla. Valores de campos permite seleccionar valores agregados de las variables que seleccione y quiera incorporar en la plantilla. Listados crea un listado de registros de las tablas de la base de datos. Tablas flotantes permite la creacin de tablas flotantes basada en los campos de la tabla de datos.
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d. Luego pngalo en negrita y cambia el tamao de letra a 18 pt. Pulse en cualquier lugar de las lneas de la etiqueta (cuando el cursor se convierta en una cruceta ) para seleccionar el elemento y luego arrstrelo hacia el centro superior de la pantalla. e. Aada otra etiqueta y escriba el texto Informe bsico . Cambie el tamao de letra a 14 pt. Cambie la fuente de color y pngalo en Negrita. Ponga esta etiqueta debajo de la primera etiqueta. f. Seleccione el elemento Lnea de Herramientas de dibujo, y luego arrstrelo hasta ponerlo debajo de las etiquetas. Pulse sobre la lnea y mueva el ratn sobre la cajita blanca ms alejada para ampliar el tamao de la lnea. g. Pulse el botn derecho del ratn en cualquier rea en blanco de la plantilla y escoja el ltimo item, Propiedades del cuerpo. En el dilogo Propiedades seleccione el color de fondo del cuerpo de la plantilla. Cierre la ventana cuando termine.
e. Pulse y arrastre la salida Sexo hacia la plantilla. Con esto conseguir insertar una replica de la distribucin de frecuencia de sexo en la plantilla.
Si el archivo XML se actualiza con un programa (PGM) de Analysis, cuando se genere el informe los valores tambin se actualizar.
a. Pulse en cualquiera de las lneas de una tabla para seleccionarla (cuando el cursor se convierte en una cruz ) , y luego seleccione Propiedades con el botn derecho del ratn.
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b. En la nueva caja de dilogos, seleccione el color de fondo de la tabla. Seleccione tambin el color de los bordes El color del borde no aparecer hasta que se apliquen las modificaciones. c. Pulse en la caja de bordes y pulse en el botn de tres puntos Seleccione los botones de exterior e interior de los bordes. Pulse Aceptar. Cierre la caja de dilogo de las propiedades cuando termine.
Se pueden especificar ciertos elementos de las celdillas, el tipo numrico, moneda, fecha corta/larga, personalizacin, etc. d. Pulse el botn derecho sobre la celdilla con el ttulo Percent y elija Format Column . Seleccione Custom Format (la ltima opcin). Con esta opcin seleccionada, escriba en el lado derecho de la ventana, en ###% y luego pulse Aceptar. e. Cree el mismo formato personalizado para la siguiente columna, Cum Percent.
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c. Resalte el texto de la primera lnea y marque Negrita, el color y tamao de letra que prefiera. d. Pulse dentro de la primera celdilla de la segunda fila y escriba, Enfermedad En la siguiente celdilla a la derecha escriba Edad Media, en la siguiente escriba Edad mnima . e. En la ltima columna de esa fila, escriba Edad mxima . Resalte la fila completa y adale un color y tamao de letra a los ttulos.
f.
En el apartado Salidas de Analysis, Informe caso de enfermedad, MEANS EDAD ENFERMEDAD, pulse el botn derecho sobre el elemento Descriptive. Se abrir una ventana donde se muestran las estadsticas descriptivas para la edad. Para traer cada elemento individual, pulse en su celdilla de forma que cambie el color de fondo de la celdilla a amarillo.
g. Pulse Aceptar y se aadirn todas las celdas seleccionadas en la tabla. (Observe el nuevo signo ms). h. El listado contiene ahora los elementos individuales de la tabla Descriptive. i. Podr ir aadiendo a la tabla los valores que desee pulsando y arrastrando cada valor individual a la nueva Tabla de la plantilla.
Como en todas las salidas de Analysis los valores se actualizarn con los ltimos valores del archivo XML cuando se genere el informe j. Para los valores numricos Mnimo y Mxima pulse el botn derecho en cada uno de ellos y elija Format. Seleccione para cada uno de los cuatro valores Custom Format y escriba 0.## k. Seleccione la Tabla pulsando en cualquiera de la lneas grises (hasta que aparezca la cruz.... ) y con el botn derecho elija Propiedades. Cambie los colores de fondo y bordes segn le parezca.
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b. Seleccione el archivo Ejemplos.MDB en la nueva ventana y pulse Abrir. c. Le aparece una nueva ventana de seleccin para seleccionar tablas, pulse en la tabla Edo y pulse en el smbolo de flecha simple > para mover la tabla al lado derecho de la pantalla, y luego pulse en Aceptar. d. Pulse en el signo ms que aparece junto al item Valores de Campos. Ahora est visible el directorio del archivo .MDB. Pulse el signo ms del archivo .MDB. Pulse el signo ms de las tablas. Pulse el signo ms de Edo y observe cmo ahora se ven los campos de la tabla, como nuevos elementos. e. Inserte una nueva etiqueta y ponga el texto La edad media de los pacientes es f. Pulse en el signo ms del campo Edad . Pulse y arrastre el elemento Average junto al texto que acaba de escribir.
f.
Pulse en el botn Aadir criterio. Vea cmo se aade esta consulta en la ventana.
g. Seleccione ahora la pestaa Grou p. Seleccione el campo Ao de la columna Campos seleccionados, mquelo y pulse > para pasarlo a la siguiente columna. h. Como Nombre de la consulta escriba Listado Granada y pulse Aceptar. Pulse en el signo ms que est ahora en grupo de listados y ver ahora el archivo .MDB.
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i.
Pulse en el signo ms que est en la base de datos (.MDB) y aparece el nombre de la consulta. Pulse sobre l y arrstrelo hacia el sitio que desee en la plantilla.
Se pueden seleccionar diversas opciones de formato como color, tamao , etc. Las opciones de formato se aplican cuando se genera el informe.. Para editar o borrar un listado, pulse el botn derecho sobre el nombre de la consulta y elija la opcin.
b. Este informe se puede guardar ahora como un archivo HTML. En el men Archivo seleccione Guardar comoLlmelo Informe personalizado.
La opcin to Make Template Build... del men Archivo permite guardar los resultados como un archivo HTML con todas las imgenes referenciadas en una sola carpeta.. c. Pulse en el botn Vista Previa de la barra de tareas en la parte alta de la pantalla. La vista previa muestra el informe tal como se imprimir. d. Pulse el botn Cerrar de la barra de tareas. Esto har volver a la pantalla anterior. e. Pulse ahora el botn Atrs f. para volver a la plantilla
Pulse el botn Guardar de la barra de herramientas, elija Salir en el men Archivo y luego abandonar el mdulo Epi Report.
RESUMEN: En este ejercicio se ha creado un archivo de tipo REPORT (RPT) con Epi Info. En este archivo, una plantilla donde se definen los contenidos de nuestro informe, se han incluido diversos elementos: Imgenes, textos (etiquetas), datos procedentes de un archivo de resultados de Epi Info (XML), datos directamente de la tabla de datos ya sea en forma de listados, ya en forma de resumen. Una vez definida la plantilla se puede generar el informe que podr, o bien imprimirse directamente o bien guardarse como un archivo HTM.
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Intermedio 60 minutos
Ninguna Haber ledo el captulo El sistema de Men de EpiInfo del libro Introduccin a Epi Info
Editar una Vista para modificar la base de datos Grabar datos Obtener estadsticas resumen Generar un Mapa Acceder a una pgina de Internet
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documento, es decir como un texto sencillo. Asegrese tambin de que el procesador de texto no aade ninguna extensin adicional. d. Cambie el tamao de la ventana del editor de texto de forma que ocupe aproximadamente la mitad de la pantalla (por ejemplo la mitad izquierda). Para hacer esto, si su editor est maximizado pulse el botn "restaurar" (el botn central de los tres de la esquina superior derecha), despus deber pasar el cursor sobre el borde de la ventana hasta que adquiera una forma de doble flecha, pulse y arrastre el borde a la posicin deseada. Para desplazar la ventana completa pulse y arrastre sobre la barra del ttulo de la ventana (habitualmente de color azul).
b. Pulse de nuevo el icono Guardar. Fjese que en la ven tana de su men habr aparecido el texto Programa Curso. Acaba de crear su primera opcin del men (aunque por ahora no hace nada). c. El aspecto del texto en el editor de texto debe ser: MENU CURSOEPI BEGIN POPUP "&Programa Curso"
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BEGIN END END d. POPUP es una palabra reservada. Sirve para indicar un men desplegable.
e. Ahora aadiremos otra opcin a nuestro men. Entre las dos palabras END del fina del texto escriba: POPUP "&Herramientas" BEGIN END Pulse el icono Guardar. En el men debe ver dos opciones una al lado de la otra: Programas Curso y Herramientas. f. Fjese en las letras que aparecen subrayadas. Para hacer esto se ha utilizado el signo &. La letra que aparece subrayada define un atajo para activar la opcin del men correspondiente usando el teclado en lugar del ratn. g. El aspecto del texto en el editor de textos debera ser: MENU CURSOEPI BEGIN POPUP "&Programa Curso" BEGIN END POPUP "&Herramientas" BEGIN END END
h. Hemos utilizado los sangrados para facilitar la interpretacin de las parejas BEGIN-END. La primera pareja, la que est ms a la izquierda define el inicio y el fin del men. Como ve todos los elementos del men se escriben en medio de estas dos palabras (despus del primer BEGIN y antes del ltimo END). Aunque no son necesarios, el uso de tabuladores o sangrados es de mucha utilidad a la hora de organizar un men. Debajo del primer POPUP, aparece otra pareja BEGIN-END, definen el principio y el fin del men desplegable llamado Programas Curso. Por ahora no hay nada escrito en este men desplegable. i. Aadiremos ahora varios apartados al primer men desplegable. Entre el BEGIN y el END del POPUP Programa Curso escriba el siguiente texto: MENUITEM Editar Vista, Editarvista
MENUITEM Grabar datos, Grabar
Pulse el icono Guardar. Lleve el cursor a la opcin Programa Curso del men CURSOEPI y pulse sobre ella, ver que se despliegan dos apartados: Editar Vista y Grabar datos.
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j.
Por el momento estas dos opciones no hacen absolutamente nada, pero fjese en las dos palabras que aparecen detrs de las comas. Editarvista y Grabar se denominan etiquetas. Posteriormente crearemos un bloque de rdenes llamado Editarvista en el que escribiremos lo que deseamos que haga el men cuando se seleccione el apartado Editar Vista. Tambin crearemos un bloque de rdenes llamado Grabar.
k. Aadiremos ahora varios apartados al segundo men desplegable. Entre el BEGIN y el END del POPUP Herramientas escriba el siguiente texto:
MENUITEM Estadsticas, Estadis MENUITEM Mapa, HacerMapa
MENUITEM Pgina Curso, IraWEB Pulse el icono Guardar. Lleve el cursor a la opcin Programa Curso del men CURSOEPI y pulse sobre ella, ver que se despliegan dos apartados: Editar Vista y Grabar datos.
Paso 5 Aadir botones Los botones son una forma fcil de acceder a las tareas ms frecuentes. Pueden tener o no un
equivalente en las opciones del men. a. Por debajo del ltimo END escriba las siguientes lneas: ***** Comienza la seccin de botones
BUTTON Editar Vista, Editarvista, 5,46,"Editar el cuestionario" BUTTON "Grabar datos, Grabar, 5, 56, "Abrir la tabla de pacientes" BUTTON "Estadsticas, Estadis, 5, 68, "Ejecuta un programa" BUTTON "Mapa, HacerMapa, 95, 57, "Muestra un mapa de casos" BUTTON "Pgina Curso, IraWEB,95, 68, "Conecta con la pgina oficial" BUTTON "Salir", Seacabo, 95, 46, "Cierra el men"
b. Pulse el botn Guardar y observe que en la ventana del men aparecern seis botones. Cada lnea de las anteriores define uno de ellos. El primer texto entre comillas es el que usted ve dentro del botn. El texto detrs de la primera coma es una etiqueta, fjese que los nombres de las etiquetas coinciden con los que asigno en los diferentes apartados del men. Las dos cifras indican la posicin relativa (fila y columna) delbotn. Finalmente, el segundo texto entre comillas es un mensaje que aparecer cuando usted ponga el ratn, sin hacer clic sobre el botn. La primera de las lneas comienza con un asterisco, esto permite incluir aclaraciones y comentarios en el men. Le recomendamos que utilice este tipo de comentarios para recordar en el futuro por que hizo las cosas.
Paso 6 Aadir los bloques de acciones. Para que su men sea realmente til, es necesario especificar que tareas realizar cada opcin del
men o cada botn. Para ello es necesario aadir un bloque de rdenes o acciones para cada una de las tareas distintas que queramos realizar. Cada bloque de rdenes se compone de los siguientes elementos: El nombre del bloque: ETIQUETA
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La palabra BEGIN (comienzo del bloque) y la palabra END (fin del bloque) y entre ambas las distintas ordenes que deseamos que se realicen. a. Por debajo de la ltima lnea de botones aada las siguientes lneas:
******Comienza la seccin de Bloques de rdenes Grabar Begin Execute Enter.exe c:\Cursoepi\Cursoepi.mdb:brote2 End Estadis Begin Execute Analysis.exe c:\ Cursoepi \Cursoepi.mdb: Informe Basico End HacerMapa Begin Execute Epimap.exe c:\ Cursoepi\mapaprov.map End IraWEB Begin Execute File:///C|/EPI_INFO/Report.htm End Seacabo Begin Exit End EditarVista Begin DIALOG "Por favor, consulte con el programador antes de realizar cualquier cambio en esta Vista!" TITLETEXT="ADVERTENCIA" Execute Makeview.exe c:\Cursoepi\cursoepi.mdb:brote2 End
b. Como puede ver en el ltimo bloque las rdenes que se realizan en una misma tarea pueden ser varias. En este caso la orden DIALOG sirve para mostrar un mensaje, mientras que la orden EXECUTE sirve para abrir el programa MakeView y presentar en pantalla la vista prenatal del proyecto CURSOEPI.MDB (que debe estar en la carpeta C:\CURSOEPI)
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