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Goyanes
C) La cadena de ARN crece en dirección 5’ – 3’. Esta dirección coincide con la síntesis
de ADN.
La ARN polimerasa es una de las enzimas más grandes que se conoce. Consta de cinco
sub-unidades: dos alfa (α), beta (β), beta prima (β’) y sigma (σ). La enzima completa es
denominada Holoenzima y se divide en dos componentes principales:
• La enzima central, denominada Core, formada por las sub unidades 2α, β y β’
• El Factor Sigma ( el polipéptido σ)
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La ARN polimerasa es lo bastante grande como para tomar contacto con muchas bases
del ADN, así la enzima cubre aproximadamente unas 60 pb (pares de bases), aunque el
segmento de ADN desenrollado, y que sirve como molde, comprende únicamente unos
17 pb.
3’ 5’ ADN molde
-20 0 30
Sentido de la transcripción
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se unen con sus complementarias por medio de dos enlaces del tipo Puente de
Hidrógeno, lo cual implica un menor gasto de energía para la apertura del ADN.
ELONGACIÓN de la cadena:
Después que se han colocado los primeros seis ribonucleótidos, la ARN polimerasa
sufre un cambio en su conformación, perdiendo la sub unidad σ. Se continúa la síntesis
en el estado de Core anteriormente descrito.
El Core se mueve a lo largo del ADN colocando los ribonucleótidos complementarios a
la cadena de ADN molde, abriendo la hélice a medida que se desplaza. Los
ribonucleótidos se unen al extremo 3’ de la cadena de ARN en crecimiento, formándose
un Híbrido ARN-ADN en la región desenrollada, el cual se mantiene estabilizado
mediante enlaces puente de Hidrógeno. El híbrido tiene una longitud aproximada de 12
pb y el nuevo ARN es liberado de estas uniones cuando el ADN recupera su estado de
doble hélice por desplazamiento del Core.
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Un ARNm que codifica para una cadena polipeptídica simple se denomina ARNm
Monocistrónico. En células Procariotas es común hallar ARNm que codifican para
varias cadenas polipeptídicas diferentes, en este caso esta molécula se denomina
ARNm Policistrónico.
Todo ARNm contiene dos tipos de regiones, una codificante y otra no codificante. La
primera, comprende una serie de codones que determinan la serie de aminoácidos de la
proteína. Esta región se extiende desde un codón de inicio (usualmente AUG) hasta un
codón sin sentido.
Raramente el codón de inicio se encuentre en el extremo 5’ del ARNm, ya que a éste lo
preceden centenares de bases que conforman una de las regiones no codificantes. El
sector comprendido entre el extremo 5’ y el codón de inicio se denomina Lider.
Tampoco se traduce la secuencia comprendida entre el codón sin sentido y el extremo
3’ del ARNm y, a esta región, se la denomina extremo Trailer.
Los ARNm Policistrónicos presentan secuencias de longitud variable que separan las
regiones codificantes o Cistrones, estas se denominan regiones espaciadoras,
usualmente de 10 pb. de longitud. Cada Cistrón posee un codón de inicio y uno sin
sentido.
Por lo general las proteínas codificadas por un ARNm Policistrónico, participan en una
misma vía metabólica (ver Operón Lac).
Extremo 5’ Extremo3´
Secuencia espaciadora
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Ya se ha mencionado que, en las células del tipo Eucariota, encontramos tres tipos de
ARN polimerasa las cuales se denominan: ARN polimerasa I, ARN polimerasa II y
ARN polimerasa III. Sus composiciones en sub unidades son complejas y aun no se
conoce en exactitud la función de cada una de estas sub unidades. Lo que sí se conoce
con exactitud, es la localización y el producto de cada una de ellas.
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Los promotores Eucariotas no trabajan solos para asegurar una transcripción eficaz. En
algunos genes o tipos celulares, la actividad de un promotor está aumentada por la
presencia de otra secuencia conocida como Exaltador o Enhacer.
El extremo 5’ contiene dos nucleótidos conectados que siempre están metilados (-CH3).
La reacción de la incorporación del CAP ocurre inmediatamente después de iniciada la
transcripción y siempre precede a cualquier modificación que se le realice al ARN m
precursor. El CAP tendría la función de proteger al ARNm de la degradación, con lo
cual aumenta su vida media.
En el extremo 3’, según se mencionó antes, los ARNm Eucariotas contienen una
secuencia de 20 a 200 nucleótidos que poseen como base nitrogenada a la Adenina. La
secuencia Poly A no está codificada en el ADN, sino que es añadida al ARN después de
finalizada la transcripción. La función de la Cola Poly A es la de aumentar la estabilidad
de los ARN m.
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Figura N° 1 : Estructura del Pre ARN mensajero Eucariota. Observese los Exones 5´y
3´ubicados a ambos lados del Intrón, en el cual se encuentra el punto de ramificación.
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Splicing Alternativo
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Regulación de la Transcripción
Dentro del metabolismo celular, encontraremos enzimas que son necesarias en forma
continua y otras que solo se necesitan en determinadas circunstancias. Las primeras se
sintetizan siempre, mientras que las segundas solo son sintetizadas en determinadas
condiciones. Es decir que, la célula, debe contar con mecanismos que le permitan
regular esta síntesis, ya que sería un gasto de energía innecesario el transcribir y traducir
una proteína que luego no ha de ser utilizada.
Los principales mecanismos de regulación de la expresión génica, recaen en el proceso
de transcripción. Es así como, la célula podrá “elegir” qué genes transcribe y cuáles no,
dependiendo de las necesidades metabólicas reinantes en ese momento.
Cada día se postulan más mecanismos por los cuales la transcripción puede ser
regulada, nosotros nos dedicaremos al estudio del mecanismo clásico de regulación: el
Modelo del Operón.
El Modelo del Operón fue descripto en células Procariotas, por los investigadores
franceses Francois Jacob y Jacques Monod, quienes se hicieron acreedores del Premio
Nobel en el año 1965.
Tal como postularan Jacob y Monod, los grupos de genes que codifican para proteínas
asociadas se encuentran en unidades conocidas como Operones. Un Operón está
constituido por: un Promotor, un Operador y Genes Estructurales. El Promotor, según
vimos en el apartado anterior, es el lugar del ADN en el cual se une la ARN polimerasa
para iniciar la transcripción. El operador es una secuencia de nucleótidos que se
encuentra interpuesto entre el promotor y los genes estructurales. Los Genes
Estructurales son las porciones de ADN que codifican para la síntesis de las proteínas
asociadas metabólicamente.
La transcripción de los Genes Estructurales depende de la actividad de otro gen
denominado Gen Regulador, que generalmente esta ubicado a unos cientos de pares de
bases del sitio promotor. El gen Regulador codifica para una proteína que tiene afinidad
para unirse al operador. Siempre que el represor se encuentre unido a esta proteína, se
verá boqueada la unión de la ARN polimerasa al promotor, inhibiéndose así la
transcripción de los Genes estructurales.
Por el contrario, cuando el operador se encuentre libre, la ARN polimerasa podrá formar
el Complejo Promotor Abierto y la transcripción será un hecho.
Veamos ahora dos modelos específicos en la regulación de la Transcripción: El Modelo
del Operón Lac y el Operón Triptofano.
Operón Lac:
En el estudio de las vías metabólicas de la Bacteria Escherichia coli, se observó que las
enzimas que intervienen en la degradación de la Lactosa no siempre eran sintetizadas.
Esto llevo a postular que la transcripción de las mismas debía estar controlada,
surgiendo así el modelo del Operón Lac.
Es sabido que el principal combustible celular es la Glucosa, pero la célula puede
recurrir, ante el déficit de este monosacárido, a la degradación de otros compuestos para
obtener la energía requerida. Uno de estos compuestos es la Lactosa.
Los genes que intervienen en la producción de las enzimas responsables del catabolismo
de la lactosa se encuentran asociados, respondiendo al modelo del Operón. Contiguo a
estos genes encontraremos entonces el operador y el sitio promotor.
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Operón Triptofano:
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Figura N° 3: Operón Lac. A) cuando la concentración de glucosa en la célula es alta, los genes
estructurales no son transcriptos. El represor se une al operador bloqueando la transcripción. B)
Cuando la concentración de glucosa es baja y la de lactosa alta, esta última actúa bloqueando la
unión del represor al operador. La transcripción se lleva a cabo.
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Figura Nº 4: Operón Try. A- Cuando la concentración de Try es alta este, en función de Co-
Represor, impide la unión de la ARNp al operador reprimiendo su síntesis. B- Cuando la
concentración del mencionado aminoácido baja, el represor queda libre, impidiendo su
unión al operador y generándose la síntesis de las Enzimas necesarias para la producción
de Triptofano.
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Traducción
En el capítulo anterior hemos desarrollado el proceso de transcripción. A partir de una
porción de ADN, que contiene la información necesaria para la síntesis de proteínas, se
sintetiza el ARNm. Para que la síntesis de proteínas llegue a su fin, es necesario traducir
la información que lleva esta molécula.
La secuencia de bases del ARNm debe cobrar significado indicando qué aminoácidos y
en qué orden deben formar parte de la cadena polipeptídica a sintetizar. Pensemos lo
siguiente: Las proteínas sintetizadas por las células están formadas por 20 aminoácidos
distintos. Si la cadena de ARNm tomase sentido codificando cada base nitrogenada a un
aminoácido distinto, podría portar información suficiente para sintetizar 4 aminoácidos
(41 = 4). La Adenina, el Uracilo, la Citosina y la Guanina codificarían cada una para un
aminoácido distinto. Por consiguiente, nos quedarían fuera de nuestra codificación 16
aminoácidos. Por el contrario, si el código cobrase sentido de a dos bases nitrogenadas,
podríamos codificar 16 aminoácidos distintos (42 = 16), quedándonos fuera del código
cuatro aminoácidos. Por último, si el código genético cobrase sentido cada tres bases
nitrogenadas, nos daría un total de 64 combinaciones distintas (43 = 64), con lo cual nos
alcanza para codificar los 20 aminoácidos que son utilizados para sintetizar las distintas
cadenas polipeptídicas. Cada triplete del ARNm, denominado Codón, cobrará sentido al
codificar qué aminoácido deberá acoplarse para sintetizar la proteína en cuestión.
De esto se desprende que, no solamente nos alcanza para codificar esa cantidad de
aminoácidos, sino que también nos sobra. Cuando los científicos comenzaron a conocer
el código genético se dieron cuenta que un aminoácido podía ser codificado por más de
un triplete de bases del ARNm, por esta razón, diremos que el Código Genético es
Degenerado.
Otra de las características típicas del Código Genético, es que éste es Universal, puesto
que es idéntico para todos los Organismos. Recientemente, se ha descubierto que hay
ciertas excepciones a esta regla puesto que se ha demostrado que en las mitocondrias
eucariotas no se sigue dicho Código al pie de la letra y habría ciertos aminoácidos que
serían codificados por codones distintos a los ya conocidos.
2° Base
1° Base U C A G 3° Base
Fenilalanina Serina Tirosina Cisteína U
U Fenilalanina
Leucina
Leucina
Serina
Serina
Serina
Tirosina
STOP
STOP
Cisteína
STOP
Triptofano
C
A
G
Leucina Prolina Histidina Arginina U
C Leucina
Leucina
Leucina
Prolina
Prolina
Prolina
Histidina
Glutamina
Glutamina
Arginina
Arginina
Arginina
C
A
G
Isoleucina Treonina Asparagina Serina U
A Isoleucina
Isoleucina
Metionina
Treonina
Treonina
Treonina
Asparagina
Lisina
Lisina
Serina
Arginina
Arginina
C
A
G
Valina Alanina A. Aspártico Glicina U
G Valina
Valina
Valina
Alanina
Alanina
Alanina
A. Aspártico
A.Glutámico
A.Glutámico
Glicina
Glicina
Glicina
C
A
G
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Traducción:
La síntesis de proteínas requiere, además del ARNm, otras dos clases de ARN: el ARN
ribosómico (ARNr) y el ARN de Transferencia (ARNt). Estos tipos de ARN difieren
estructural y funcionalmente con el ARNm. El ARNr es el ARN de mayor abundancia
en la célula, los ribosomas están formados por dos sub unidades, la mayor y la menor.
Están constituidos por 2/3 de ARN y 1/3 de proteínas.
La sub unidad menor de los ribosomas posee un sitio para la unión con el ARNm,
mientras que la sub unidad mayor posee dos sitios por los cuales se une con el ARNt.
Los ARNt son moléculas pequeñas, de entre 75 y 85 nucleótidos de largo, con una
conformación especial; esta recuerda a la forma que adopta en el espacio una hoja de
trébol. En su constitución posee dos sitios de fundamental importancia, uno de ellos es
el denominado Anticodón, formado por tres bases nitrogenadas que se unirán en forma
complementaria a los codones del ARNm. El otro sitio relevante de la molécula es
contrapuesto al mencionado y es el lugar de unión al aminoácido. Funcionalmente, los
ARNt juegan el rol de ser el diccionario por medio del cual se traduce el lenguaje del
ARNm al lenguaje de los aminoácidos.
En el extremo 3´ del ARNt se acopla el aminoácido, siempre en este extremo
encontraremos el triplete de bases CCA. Los demás nucleótidos varían dependiendo el
tipo de ARNt que se trate. La unión de los aminoácidos a su respectivo ARNt está
catalizada por un grupo de proteínas denominada aminoacil-ARNt-sintetasas. Se
conoce hoy, un grupo de aproximadamente 20 de estas enzimas, uno para cada
aminoácido. Cada una de estas enzimas posee un sitio para la unión con el aminoácido y
otro para su unión al ARNt.
Dividiremos el proceso de traducción en cuatro etapas:
1. Activación de los aminoácidos
2. Iniciación
3. Elongación
4. Terminación
Para que el aminoácido sea unido al correspondiente ARNt se necesitan dos reacciones
químicas que demandarán energía. La primera reacción es la que aporta la energía
necesaria para que la unión se produzca. Se escinde la molécula de ATP, se liberan dos
grupos fosfatos y se forma un complejo entre el AMP y el aminoácido en cuestión. Este
complejo Aminoácido- AMP – Enzima, se mantiene intacto hasta que se encuentra con
la molécula de ARNt correspondiente. En la segunda reacción, la molécula de AMP se
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2-Iniciación:
Una vez que los aminoácidos son unidos a su correspondiente ARNt, están listos para
comenzar la síntesis de proteínas. La primera etapa, la iniciación, comienza cuando la
sub unidad menor del ribosoma se une al ARNm, por su extremo 5´. Cada ARNm
posee, en forma previa al primer codón, una secuencia de bases complementaria a una
secuencia de consenso de la sub unidad menor del ARNr.
Una vez sucedido este, el primer aminoacil-ARNt se une, por medio de su Anticodón, al
primer codón del ARNm. Se ha observado que, habitualmente, el primer codón del
ARNm es el AUG. Si recurrimos al código genético veremos que, en consecuencia, el
primer aminoácido incorporado a la cadena peptídica en formación es la Metionina. Sin
embargo la Metionina, una vez finalizada la síntesis proteica, puede ser removida.
La combinación entre el ARNm, la sub unidad ribosómica menor y el aminoacil-ARNt
es conocida como el Complejo de Iniciación de la traducción. Para que se vea
posibilitada la formación del Complejo de Iniciación, es necesaria la participación de
ciertas proteínas denominadas Factores de Iniciación. En Procariotas se conocen tres
de estos factores, mientras que en Eucariotas el número conocido hasta el momento
asciende a once.
A continuación, la sub unidad mayor del ribosoma se une al complejo de iniciación.
Hemos mencionado que esta sub unidad contiene dos sitios por los cuales se unirá con
los distintos ARNt. Uno de ellos es conocido como Sitio P (peptídico) y el otro se
denomina Sitio A (aminoacil). Es de suma relevancia destacar que la unión entre el
primer ARNt y la sub unidad mayor, se propicia por medio del Sitio P.
En consecuencia, una vez que la sub unidad mayor se encuentre acoplada al complejo
de inicio, el sitio P se encontrará ocupado por el primer ARNt, mientras que el Sitio A
se encontrará vacío. La energía necesaria para este paso, la suministra la hidrólisis de
una molécula de GTP.
3- Elongación:
Al iniciarse esta etapa en el Sitio A, de la sub unidad mayor del ribosoma, se encuentra
el segundo codón del ARNm. Un aminoacil – ARNt que posea su Anticodón
complementario al segundo codón del ARNm, ingresará al sitio A del ribosoma. Una
vez que ambos sitios de la sub unidad mayor del ribosoma se encuentran cubiertos, la
enzima de ésta sub unidad, la Peptidil Transferasa, realizará el primer enlace peptídico
entre los aminoácidos portados por ambos ARNt. En dicho enlace interviene el grupo
amino (NH2) del segundo aminoácido con el grupo carboxilo (COOH) del aminoácido
anterior.
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Así cada vez que ingresa un ARNt cargado al Sitio A y se produce la unión entre el
grupo COOH del aminoácido de la cadena en crecimiento y el grupo NH2 del
Aminoácido del Sitio A, se cumple la fase de elongación.
El primer ARNt, que estaba ocupando el Sitio P, rompe la unión que lo mantenía
adherido al primer aminoácido y es liberado al medio. El ribosoma se desplaza un
codón hacia el extremo 3´ del ARNm. En consecuencia, el segundo ARNt incorporado
en el Sitio A, se traslada al Sitio P, llevando consigo los dos aminoácidos incorporados
hasta el momento. De esta manera, en el Sitio A queda el tercer codón a ser traducido,
ingresando al mismo un tercer aminoacil - ARNt que posee un Anticodón
complementario al mencionado triplete de bases del ARNm.
Nuevamente, la enzima ribosómica realiza la unión peptídica entre el segundo y tercer
aminoácido incorporado. El segundo ARNt es liberado al medio, quedando el tercer
ARNt con los tres aminoácidos unidos a él. De la misma manera que fue realizado en la
etapa anterior, el ribosoma se desplaza un codón hacia el extremo 3´ del ARNm,
quedando ahora el tercer ARNt en la posición P de la sub unidad mayor. El ribosoma
seguirá corriéndose hacia el extremo 3´ del ARNm y los aminoácidos serán
incorporados de igual forma a lo largo de toda esta etapa.
Una de las formas por las cuales se logra que la traducción se lleve a cabo a una
velocidad mayor, es mediante el accionar de varios ribosomas a lo largo del ARNm. La
estructura que forma esta multitud de ribosomas, traduciendo un mismo ARNt, es
conocida como polisoma o polirribosimas.
4- Terminación:
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