Introduccin a

Gaussian 03

Gaussian 03
Qu es y para qu sirve Gaussian?
Gaussian 03 es producido por Gaussian Inc., es un sistema de programas conectados para ejecutar una
variedad de clculos de estructura electrnica. Capaz de predecir muchas propiedades moleculares y
reacciones qumicas, incluyendo:
Energas y estructuras moleculares.
Energas y estructuras de estado de transicin.
Frecuencias vibracionales.
Espectros infrarrojo y Raman.
Propiedades termodinmicas.
Energas de reaccin y de enlace.
Trayectorias de reaccin.
Orbitales moleculares.
Cargas atmicas.
Apantallamiento en resonancia magntica nuclear y
susceptibilidad magntica.
Afinidades electrnicas y potenciales de ionizacin.
Polarizacin e hiperpolarizacin.
Potenciales electrostticos y densidades electrnicas.

Gaussian 03

Gaussian 03 esta diseado para estudiar sistemas en fase gaseosa y en solucin,

en el estado fundamental y estados excitados; lo que permite explorar reas de
inters qumico como efectos del substituyente, mecanismos de reaccin,
superficies de energa potencial, energas de excitacin, etc.

Gaussian 03
Como genero una entrada?
Primero. Las partes de una entrada para hacer un calculo en Gaussian 03.
Lnea de Ruta (Se indica lo que se quiere calcular)
# Mtodo de clculo/Set de Bases Opciones de clculo
Titulo
Carga Multiplicidad
Especificacin
Geomtrica de la
molcula.

Lnea de Titulo
o Comentario
Carga y
Multiplicidad
Parmetros de la
molcula (coord.
cartesianas o
internas matriz-Z,
mixtas)

Gaussian 03
Como calculo la molcula H2O en Gaussian?
Ejemplo. agua.com para la molcula de H2O.
Para la molecula de agua, el archivo de entrada tiene la extensin .com:
Lnea de Ruta (Se indica lo que se quiere calcular)
#T RHF/6-31G

Lnea de Titulo
o Comentario

OPT

Molecula de agua, mi primer calculo en g03.

0 1
O -0.464
H -0.464
H
0.441

0.177
1.137
-0.143

0.0
0.0
0.0

Ntese que en este clculo la molcula de agua se define en

coordenadas cartesianas.

Carga y
multiplicidad
Parmetros de la
molcula (coor.
cartesianas o
matriz-Z)

Gaussian 03
Ms formatos para la geometra molecular.
Molcula de H2O2
# RHF/6-31G

OPT

Molecula de peroxido de hidrogeno.

0 1
H1
O2 1
O3 2
H4 3
R1
R2
R3
A1
A2
D1

=
=
=
=
=
=

R1
R2 1 A1
R3 2 A2
Variables:
1.5
1.1
1.5
109.5
109.5
180.0

1
1 D1

Ntese que en este clculo la molcula de H2O2 se define con

una matriz-Z.

3
4

Leyendo
Una Salida de Gaussian 03
(.log/.out)

Gaussian 03
1. Lo primero que encontraremos es una nota de registro, esto indica que el programa ha
sido ejecutado
Entering Gaussian System, Link 0=g98
Input=agua.com
Output=agua.log
Initial command:
/usr/g98/l1.exe /linus/tmp/Gau-1100784.inp -scrdir=/linus/tmp/
Entering Link 1 = /usr/g98/l1.exe PID=
1100783.
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998 Gaussian, Inc.
All Rights Reserved.
This is part of the Gaussian(R) 98 program. It is based on
the Gaussian 94(TM) system (copyright 1995 Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992 Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990 Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988 Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986 Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
This software contains proprietary and confidential
information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.
This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.
The following legend is applicable only to US Government
contracts under DFARS:

Gaussian 03
2. La versin de Gaussian que se ha utilizado, en este caso tenemos Gaussian 03 x86Win32-G03RevB.03 y al final, la fecha de ejecucin del trabajo 25-Mar-2006 .

*********************************************
Gaussian 03: x86-Win32-G03RevB.03 4-May-2003
25-Mar-2006
*********************************************

Gaussian 03
3. Se indica la seccin de ruta, el ttulo y la especificacin molecular proveniente de la
entrada, indica la lectura, en este caso, del archivo H2O.com

-----------------# rhf/6-311g opt

-----------------------------------Molecula de agua, mi primer calculo en g03.
------------------Symbolic Z-matrix:
Charge = 0 Multiplicity = 1
O
0.
0.
0.
H
0.
0.
0.96
H
0.91239
0.
-0.29857

Gaussian 03
4. La orientacin estndar, indica la geometra molecular en el sistema de coordenadas
interno al programa. Le acompaan las constantes rotacionales, tipo de tomos (istopos),
cuenta el nmero de funciones base y gaussianas primitivas segn el tipo de base , y calcula
la energa de repulsin internuclear (en Hartrees) y las simetras-orbital iniciales.
Standard orientation:
--------------------------------------------------------------------Center
Atomic
Atomic
Coordinates (Angstroms)
Number
Number
Type
X
Y
Z
--------------------------------------------------------------------1
8
0
0.000000
0.000000
-0.112692
2
1
0
0.000000
-0.777247
0.450768
3
1
0
0.000000
0.777247
0.450768
--------------------------------------------------------------------Rotational constants (GHZ):
889.2439552
415.0345501
282.9663783
Isotopes: O-16,H-1,H-1
Standard basis: 6-311G(d,p) (5D, 7F)
There are
14 symmetry adapted basis functions of A1 symmetry.
There are
2 symmetry adapted basis functions of A2 symmetry.
There are
5 symmetry adapted basis functions of B1 symmetry.
There are
9 symmetry adapted basis functions of B2 symmetry.
Crude estimate of integral set expansion from redundant integrals=1.136.
Integral buffers will be
131072 words long.
Raffenetti 1 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
30 basis functions
48 primitive gaussians
5 alpha electrons
5 beta electrons
nuclear repulsion energy
9.1600384432 Hartrees.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=
30 RedAO= T NBF=
14
2
5
9
NBsUse=
30 1.00D-04 NBFU=
14
2
5
9
Projected INDO Guess.
Initial guess orbital symmetries:
Occupied (A1) (A1) (B2) (A1) (B1)
Virtual
(A1) (B2) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1)
(A1) (A1) (A2) (A2) (B1) (B1) (B1) (B1) (B2) (B2)
(B2) (B2) (B2) (B2) (B2)

Gaussian 03
5. Energa electrnica autoconsistenete en unidades atmicas, nmero de ciclos para
alcanzarla, criterio de convergencia que suele ser del orden de 1E-08, relacin de virial,
evaluacin del operador S2 (S es el operador de espn.

SCF Done:

E(RHF) = -76.0459596187
Convg =
0.1295D-08
S**2
=
0.0000

A.U. after
11 cycles
-V/T = 2.0000

Gaussian 03
6. Anlisis de poblacin de densidad autoconsistente: obtiene los autovalores de los orbitales
moleculares ocupados y virtuales, a partir de estas energas autoconsistentes, hace una
reparticin de la carga neta de la molcula entre sus tomos.
**********************************************************************
Population analysis using the SCF density.
**********************************************************************
Orbital Symmetries:
Occupied (A1) (A1) (B2) (A1) (B1)
Virtual
(A1) (B2) (B2) (A1) (A1) (B1) (B2) (A1) (A2) (A1)
(B1) (B2) (B2) (A1) (A1) (B2) (B1) (A2) (A1) (A1)
(B2) (B1) (A1) (B2) (A1)
The electronic state is 1-A1.
Alpha occ. eigenvalues -- -20.54327 -1.33706 -0.71156 -0.56399 -0.49815
Alpha virt. eigenvalues -0.15072
0.21621
0.57289
0.60082
0.99970
Alpha virt. eigenvalues -1.00454
1.10719
1.31191
1.50298
1.54544
Alpha virt. eigenvalues -1.73580
1.89339
2.26500
2.36726
2.61524
Alpha virt. eigenvalues -2.76357
3.47520
3.56220
3.70142
4.03907
Alpha virt. eigenvalues -4.24090
5.32759
5.72092
6.21452 51.55211
Condensed to atoms (all electrons):
1
2
3
1 O
7.860126
0.326140
0.326140
2 H
0.326140
0.447932 -0.030274
3 H
0.326140 -0.030274
0.447932
Total atomic charges:
1
1 O
-0.512405
2 H
0.256203
3 H
0.256203
Sum of Mulliken charges=
0.00000
Atomic charges with hydrogens summed into heavy atoms:
1
1 O
0.000000
2 H
0.000000
3 H
0.000000
Sum of Mulliken charges=
0.00000

Cargas atmicas

HOMO

LUMO

Gaussian 03
7. Las componentes cartesianas del momento dipolar en la orientacin estndar, y momentos de orden superior y
energa Ncleo-Ncleo, Electrn-Ncleo y Energa cintica.

Dipole moment (Debye):

X=
0.0000
Y=
0.0000
Z=
-2.1386 Tot=
2.1386
Quadrupole moment (Debye-Ang):
XX=
-7.1365
YY=
-4.1324
ZZ=
-6.0163
XY=
0.0000
XZ=
0.0000
YZ=
0.0000
Octapole moment (Debye-Ang**2):
XXX=
0.0000 YYY=
0.0000 ZZZ=
-1.3288 XYY=
0.0000
XXY=
0.0000 XXZ=
-0.3572 XZZ=
0.0000 YZZ=
0.0000
YYZ=
-1.3040 XYZ=
0.0000
Hexadecapole moment (Debye-Ang**3):
XXXX=
-5.1455 YYYY=
-5.4489 ZZZZ=
-6.0335 XXXY=
0.0000
XXXZ=
0.0000 YYYX=
0.0000 YYYZ=
0.0000 ZZZX=
0.0000
ZZZY=
0.0000 XXYY=
-2.0508 XXZZ=
-1.9148 YYZZ=
-1.5921
XXYZ=
0.0000 YYXZ=
0.0000 ZZXY=
0.0000
N-N= 9.350351570908D+00 E-N=-1.995548388502D+02 KE= 7.612251957749D+01

8. Resumen del archivo de entrada y los resultados obtenidos en la ejecucin del programa.
Test job not archived.
1|1|UNPC-UNK|SP|RHF|6-31G|H2O1|PCUSER|25-Mar-2006|0||#T RHF/6-31G TEST
||H2O SP RHF/6-31G||0,1|O|H,1,0.957|H,1,0.957,2,104.5||Version=x86-Win
32-G03RevB.03|State=1-A1|HF=-75.9839919|RMSD=5.845e-005|Dipole=0.81829
7,0.,0.6335932|PG=C02V [C2(O1),SGV(H2)]||@

Gaussian 03
9. Gaussian 03 tiene una coleccin interna de citas y pensamientos, que irn saliendo
aleatoriamente en cada ejecucin del programa. Adems entrega informacin de la fuente
de la maquina y tiempo de CPU que toma al trabajo completarse y en la ltima lnea ,
indica que el trabajo ha sido ejecutado exitosamente, de no aparecer, el programa enva un
mensaje indicando el error.

IF AT FIRST YOU DON'T SUCCEED, TRY, TRY AGAIN.

THEN GIVE UP;
THERE'S NO USE BEING A DAMN FOOL ABOUT IT.
-- W. C. FIELDS
0 minutes 2.0 seconds.
11 Int=
0 D2E=

Job cpu time: 0 days 0 hours

File lengths (MBytes): RWF=
0 Chk=
Scr=
1
Normal termination of Gaussian 03 at Sat Mar 25 20:20:37 2006.