Las enzimas de restriccin cortan dejando extremos cohesivos o romos.

Los
extremos cohesivos son generados cuando la enzima corta las dos hebras
asimtricamente, dejando los extremos de cada hebra de simple cadena
complementarios entre s. Por otro lado, los extremos romos son generados
cuando la enzima corta las dos hebras por el mismo lugar, generando dos
extremos doble cadena.

Este tipo de endonucleasas puede dejar dos tipos de extremos. En el primer

caso, el corte genera nuclotidos de simple cadena llamados extremos
cohesivos. Estos extremos se pueden unir por medio de otra enzima, la ADN
ligasa. En el segundo caso, se generan extremos doble cadena (extremos
romos). Estos extremos tambin pueden ser unidos con la ayuda de una
enzima ligasa pero, como no los extremos no son complementarios, la unin
ser ms inespecfica.
ELECTROFORESIS DE ADN
La electroforesis en gel es uno de los mtodos ms utilizados en los
laboratorios para separar cidos nucleicos o protenas, de acuerdo con su
tamao. Esto se logra por la diferencia de desplazamiento de las molculas a lo
largo de un gel sometido a un campo elctrico. La carga elctrica sirve como
fuerza impulsora que atrae las molculas cargadas negativamente hacia el otro
extremo del gel que posee carga positiva. Existen distintos tipos de gel;
comnmente se utiliza agarosa o poliacrilamida.
La velocidad de desplazamiento de las molculas es inversamente proporcional
a su tamao. En los cidos nucleicos la carga est dada por los nucletidos, por
lo que el tiempo que tardar la molcula en atravesar el gel ser directamente
proporcional al nmero de nucletidos que tenga, es decir a su tamao. De
esta manera, para un tiempo determinado, las molculas ms grandes
quedarn ms retrasadas en el gel que las molculas ms pequeas.