ANALISIS DE SECUencias

OBJETIVO

Analizar la secuenciacin de dos virus del

mismo subgrupo, identificando la similitud e
identidad de los nucletidos.

1. Se busca las secuencias a travs de NCBI, al ser

virus; bucamos en la base de datos de Genome, donde
se muestran las secuencias respectivas de del virus.

2. Luego se le da en formato FASTA que muestra la secuenciacin que se

quiere obtener. Al ser dos virus que se quieren analizar, se deb hacer este
proceso dos veces

3. Se obtienen las respectivas secuenciaciones de ambos virus que pertenecen a la misma familia Filoviridae; Sudan ebolavirus, complete genome; Lloviu virus, complete genome
.

Virus Loviu

Sudan ebolavirus

4. Las secuencias son copiadas o enviadas a travs de la

ventana send to que descarga la secuencia por medio
de archivos HTML. Haciendo click en create file

5. Luego de ser copiadas se escoge algn software online

que haga anlisis de alineamientos de secuencias. Se
escogi algunas se las paginas mostradas.

Software online que permiten

hacer anlisis de secuencias

6. Una de las elecciones fue

http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/multalin.html
solo se necesita pegar las secuencias en el espacio que dice
sequence data. Y darle click en start mutAlin

7. Al esperar unos segundo aparasen los resultados con las

secuencias alineadas

Indica los match; donde las

secuencias coinciden

Mismatch, error
que ocurre en la
secuenciacion

Gaps o saltos que

ocurren en la
secuenciacin

8. En emboss needle, no solo te muestra la secuenciacion si

no los resultados de similiaridad, identidad cantidad de bases
nitrogenadas analizadas etc..

En needle permite dar

un resultado de la
identidad, similar dad y
cantidad de GAPS

IDENTIDAD: 52,4%
SIMILARIDAD: 52,4%
GAPS: 3478/20649

Longitud: cantidad de bases analizadas 20640

GAPS

Match

Mismatch

9. Al realizar el ejercicio en emboss water, los resultados

fueron ligeramente diferentes.

Indentidad: 53,4
Similitud: 53,4
Gaps: 15,3
Score: 51759

Longitud: 20309

Conclusiones
Diferentes software, nos permiten realizar
anlisis de secuencias para obtener su
similitud e identidad.
En los software needle y water, se
obtuvieron diferentes porcentajes con
respecto a la similitud y identidad
El analisis de secuencias permite clasificar
las especies, en grupos familias etc..
Virus de las misma familia, obtuvieron una
similitud de 50%