ENZIMOLOGA

Principios generales de la accin enzimtica

Las reacciones qumicas que ocurren en los organismos

vivos presentan casi siempre una energa de activacin tan
elevada, que en condiciones compatibles con la vida
ocurriran a velocidades casi nulas, con lo cual la vida (al
menos en las condiciones actuales) sera prcticamente
imposible.
Como consecuencia, una de las principales adquisiciones
evolutivas de los seres vivos fue la aparicin de protenas
con actividad cataltica (enzimas), que al disminuir la
energa de activacin de las reacciones hacen posible no
slo que stas se produzcan a gran velocidad, sino que se
lleven a cabo en condiciones moderadas de presin,
temperatura, pH, etc., compatibles con la vida.

 Las

enzimas son, generalmente, protenas

globulares con actividad cataltica. La
enorme variedad de reacciones que
comprende la vida son mediadas, casi todas
ellas, por estos catalizadores biolgicos.
La enorme variedad de reacciones
bioqumicas que comprende la vida son
mediadas, casi todas ellas, por una serie de
catalizadores biolgicos notables conocidos
como enzimas.
Las enzimas son producidas nicamente por
organismos vivos.

ENZIMAS

Aunque las enzimas se hallan sometidos a las mismas leyes

naturales que gobiernan el comportamiento de otras
sustancias, se diferencian de los catalizadores qumicos
ordinarios en varios aspectos importantes:

Velocidades de reaccin ms elevadas

Condiciones de reaccin ms suaves: temperaturas por debajo de
50C, a la presin atmosfrica y a valores de pH casi neutros.
Mayor especificidad de reaccin: especificidad muy grande, tanto
respecto a las identidades de sus sustratos (reactantes) como de sus
productos
Capacidad para la regulacin: propiedad fundamental para la
relacin entre la actividad enzimtica y la homeostasis de los
organismo vivos

NOMBRES TRADICIONALES

En los primeros das de la bioqumica, las enzimas

recibieron nombres que slo seguan el gusto de sus
descubridores.
Frecuentemente el nombre dado no daba ninguna
clave hacia la funcin que desempeaba (Vgr.
Tripsina). Con frecuencia se aplicaban diferentes
nombres a la misma enzima, o peor an, el mismo
nombre a enzimas con actividades muy diferentes.
Los enzimas, habitualmente se designaban, y as se
sigue haciendo hoy en muchos casos, aadiendo el
sufijo"-asa al nombre del sustrato de la enzima o a
una frase que describa la accin cataltica de la
enzima. As, "ureasa cataliza la hidrlisis de la urea
y "alcohol deshidrogenasa cataliza la oxidacin de los
alcoholes a sus correspondientes aldehdos.

NOMINACIN DE ENZIMAS
En un esfuerzo para eliminar esta confusin y
proporcionar reglas para designar racionalmente
el nmero rpidamente creciente de enzimas
nuevas, la Intemational Union of
,Biochemistry (IUB) adopt un esquema para la
clasificacin funcional sistemtica y la
nomenclatura de los enzimas.
Los enzimas se clasifican y designan de acuerdo
con la naturaleza de las reacciones qumcas que
catalizan.
Existen seis clases principales de reacciones que
catalizan los enzimas (Ver Tablas), as como
subclases y sub-subclases dentro de las clases.

Enzimas. Clasificacin 1

1. Oxidorreductasas. Son aquellas enzimas que catalizan las

reacciones de oxidorreduccin, o sea, la transferencia de electrones o
sus equivalentes entre un donante y un aceptor. Pueden ser:
Deshidrogenasas: Separan tomos de hidrgeno del sustrato.
Oxidasas: Oxidan el sustrato al aceptar sus electrones.
Otras ms son oxigenasas, reductasas, peroxidasas, e hidroxilasas.

2. Transferasas. Catalizan la transferencia de un grupo qumico entre

un donante y un aceptor; se excluyen aqullas que transfieren
electrones o sus equivalentes, pues pertenecen a la clase anterior, y
aqullas en que el aceptor del grupo es el agua, pues pertenecen a la
clase siguiente. Ejemplos de tales grupos incluyen amino, carboxil,
carbonil, metil, fosforil, y acil (RC=O). Nombres triviales comunes para
este tipo de enzimas incluyen frecuentemente el prefijo trans. Algunos
ejemplos son, transmetilasas, transaminasas y transcarboxilasas.
3. Hidrolasas. Catalizan la ruptura de enlaces qumicos con la
participacin de las molculas del agua. Las hidrolasas incluyen a las
esterasas, fosfatasas, glucosidasas, lipasas y peptidasas.

Enzimas. Clasificacin 2
4. Liasas. Catalizan reacciones en las cuales se produce
la adicin o sustraccin de grupos qumicos (e.g., H2O,
CO2, y NH3) a dobles enlaces o para formar dobles
enlaces. Decarboxilasas, hidratasas, dehidratasas,
deaminasas, y sintasas son ejemplos de liasas.
5. Isomerasas. Este es un grupo heterogneo de
enzimas. Las isomerasas catalizan varios tipos de
rearreglos intramoleculares que llevan ese nombre. Las
epimerasas catalizan la inversin de carbonos
asimtricos. Las mutasas la transferencia intramolecular
de grupos funcionales
6. Ligasas. Catalizan la unin covalente de 2 sustratos
mediante la energa de hidrlisis de nuclesidos
trifosfatados, generalmente el ATP. Los nombres de
muchas ligasas incluyen el nombre sintetasa. Varias otras
ligasas reciben el nombre de carboxilasas.

1: oxidoreductasas,
2: transferasas,
3: hidrolasas,
4: liasas,
5: isomerasas,
6: ligasas.

Distribucin de todas las enzimas conocidas por su nmero

de clasificacin en el Sistema EC

NOMBRE RECOMENDADO Y SISTEMTICO

A cada enzima se le asignan dos nombres, y cuando se

quiere llegar a la mxima claridad en la especificidad
de la enzima, se le debe agregar una clasificacin de
cuatro nmeros.
El nombre recomendado, resulta conveniente para el
empleo diario y es, con frecuencia, el nombre trivial de
la enzima empleado previamente.
El nombre sistemtico se emplea cuando debe
hacerse mnima la ambigedad: consiste en el nombre
del (de los) sustrato(s) seguido de una palabra que
acabe en " -asa" y que especifica el tipo de reaccin que
cataliza la enzima, de acuerdo con la clasificacin del
grupo principal. Por ejemplo, la enzima cuyo nombre
recomendado es carboxipeptidasa A tiene el nombre
sistemtico de peptidil-L-amino cido hdrolasa.

EC 3.4.17.1.

En el caso de la enzima mencionada,

carboxipeptidasa A, debera agregarse el nmero
de clasificacin EC 3.4.17.1. (EC significa
Comisin de Enzimas, Enzyme Commission),

El primer nmero (3) ndica la clase principal a la

que pertenece la enzima (Hidrolasas)
El segundo nmero (4) ndica la subclase (acta
sobre el enlace peptdico),
El tercer nmero (17) designa la sub-subclase
metalo-carboxipeptidasas; la carboxipeptidasa A
tiene un ion Zn2+ unido que es esencial para su
actividad cataltica
El cuarto nmero (1) es el nmero de serie de la
enzima asignado arbitrariamente en la sub-subclase.

ENZIMAS NOMENCLATURA - Ejemplo

ATP + D-Glucosa

ADP + D-Glucosa-6-fosfato

IUB - ATP:glucosa fosfotransferasa

E.C. 2.7.1.1
2 - clase - Transferasa
7 - subclase - Fosfotransferasas
1 - sub-subclase - Fosfotransferasa que utiliza un grupo
hidroxilo como receptor
1 - indica que la D-glucose es el receptor del grupo fosfato

Nombre trivial: Hexocinasa

Zimgenos o Proenzimas
Son precursores inactivos de las enzimas.
Un zimgeno es una molcula que necesita ser activada para
convertirse en una enzima activa, por lo que es ms exacto
decir que los zimgenos son precursores de enzimas, que decir
que son enzimas inactivas.
Las enzimas digestivas, algunos factores de la coagulacin y
otras protenas son sintetizadas como zimgenos.
La sntesis de enzimas en forma de zimgenos es uno de los
mecanismos de seguridad con que cuenta el organismo para
su supervivencia. Por ejemplo, la sntesis de enzimas
digestivas en forma inactiva es un mecanismo de seguridad
para las clulas que sintetizan esas enzimas, ya que las
enzimas proteolticas sintetizadas como zimgenos no son
activadas hasta que abandonan la clula y son secretadas al
tracto gastrointestinal.

Isoenzimas o Isozimas

Las isoenzimas o isozimas son enzimas que difieren en la

secuencia de aminocidos, pero que catalizan la misma
reaccin qumica.
Estas enzimas suelen mostrar diferentes parmetros cinticos
(i.e. diferentes valores de KM), o propiedades de regulacin
diferentes.
La existencia de las isoenzimas permite el ajuste del
metabolismo para satisfacer las necesidades particulares de un
determinado tejido o etapa del desarrollo.
En bioqumica, las isoenzimas son isoformas (variantes
estructurales estrechamente relacionadas) de las enzimas. En
muchos casos, son codificadas por genes homlogos que han
divergido con el tiempo.
De forma estricta, las aloenzimas representan enzimas de
diferentes alelos de un mismo gene y las isoenzimas
representan enzimas de diferentes genes cuyos productos
catalizan la misma reaccin.

CATLISIS ENZIMTICA

Muchas protenas son enzimas, es decir, se unen a algunas

molculas y catalizan reacciones especficas.
El sufijo asa al final del nombre de una protena la
identifica como una enzima, Vgr. Ribonucleasa, es la
protena enzima que degrada el RNA (cido ribonucleico)
por hidrlisis; Peptidasa, es la protena enzima que rompe,
por hidrlisis, los enlaces peptdicos
La molcula blanco que se une a la superficie de la enzima
en un sitio especfico recibe el nombre de Sustrato de la
enzima.
Las reacciones catalizadas por las enzimas son reacciones
que ocurriran de todas maneras espontneamente pero a
velocidades muy lentas; las enzimas no son sustancias
mgicas - las reacciones que catalizan deben ser
qumicamente posibles.
Las enzimas pueden acelerar las reacciones en que
participan por factores que van de 106 a 1014 veces.

ENZIMAS. ESPECIFICIDAD

La mayor parte de las enzimas funcionan in vivo (en la

clula) catalizando una reaccin particular sobre un
sustrato especfico, esto conforma la especificidad de
sustrato

Sin embargo, las enzimas pueden actuar sobre varios sustratos

estructuralmente relacionados, aunque con diferentes eficiencias.
Tambin es cierto que un misma molcula puede servir como
sustrato a varios tipos de enzimas diferentes.

La especificidad de accin determina que la enzima

cataliza slo una de las posibles transformaciones del
sustrato.
La estreo especificidad de las enzimas es tambin muy
elevada, tanto respecto a la unin de sustratos quirales
como respecto a las reacciones que catalizan. La estreo
especificidad de los enzimas procede de su quiralidad
inherente, pues como ya sabemos las protenas estn
constituidas slo por L-aminocidos.

ESPECIFICIDAD DE SUSTRATO
Las enzimas son especficas en las reacciones que
catalizan, como se dice habitualmente: una enzima-un
sustrato. La mayor parte de las enzimas funcionan in
vivo (en la clula) catalizando una reaccin particular
sobre un sustrato especfico.
La especificidad puede darse en varios grados:

Especificidad absoluta: Se da cuando la enzima slo acta

sobre un sustrato.
Especificidad de grupo: Se da cuando la enzima reconoce un
determinado grupo de molculas.
Especificidad de clase: Es la menos especfica, dado que la
actuacin de la enzima no depende del tipo de molculas,
sino del tipo de enlace.

FACTORES QUE AFECTAN LA ACTIVIDAD

ENZIMTICA

Influencia de la temperatura: Existe una temperatura ptima para la cual

la actividad enzimtica es mxima.
Influencia del pH: Todas las enzimas tienen dos valores lmites de pH entre
las cuales son efectivas. Traspasados estos valores, la enzima se
desnaturaliza y deja de actuar. Entre estos lmites existe un pH ptimo en el
cual la enzima posee una mxima eficacia.
Concentracin del sustrato: En una reaccin enzimtica, al incrementar
la concentracin de sustrato, para una concentracin de enzima constante se
produce un aumento de velocidad de reaccin. Si la concentracin de sustrato
es excesiva, la velocidad de reaccin no aumentar, debido a que se produce
una saturacin de la enzima, cuyas molculas se hallan todas en forma de
complejo enzima-sustrato.
Inhibidores: Son sustancias que disminuyen la actividad de la enzima.
Pueden ser:

Irreversibles: Tienen lugar cuando el inhibidor se fija permanentemente al centro

activo de la enzima alterando su estructura.
Reversibles: Tienen lugar cuando no se inutiliza el centro activo, sino que slo
impide temporalmente su normal funcionamiento.
Competidores: Se debe a la presencia de una sustancia similar al sustrato por lo que
se puede competir en la fijacin al centro activo.
No competidores: Es debida a un inhibidor que se une a la enzima impidiendo la fija
ion del sustrato al centro activo.

SITIO ACTIVO

Se han postulado dos hiptesis para explicar la formacin del

complejo enzima sustrato, las llamadas de la llave y la cerradura,
as como la de acoplamiento inducido

De acuerdo con la hiptesis de la llave y la cerradura, el sitio de unin

del sustrato existe preformado en la estructura de la enzima an en
ausencia del sustrato unido
En el caso de la hiptesis del acoplamiento inducido, la molcula de
sustrato induce un cambio conformacional en el sitio activo de la
enzima de manera de quedar perfectamente acoplados. El cambio de
forma de la enzima facilita la interaccin enzima-sustrato y la
reaccin. La Glucocinasa es un ejemplo interesante de este tipo de
mecanismo.

Los estudios por rayos-X indican que los sitios de unin del
sustrato de la mayor parte de las enzimas se hallan preformados
(llave y cerradura) pero que la mayor parte de ellos exhiben al
menos cierto grado de acoplamiento inducido al unirse al sustrato.
Despus que la reaccin se completa y se libera el producto, el
sitio activo recupera su forma libre y la enzima esta dispuesta
para fijar una nueva molcula de sustrato.

Hiptesis de la llave y la cerradura. El sitio de

unin del sustrato existe preformado en la
estructura de la enzima an en ausencia del
sustrato unido

Hiptesis del acoplamiento inducido. El

sitio activo de la enzima no existe como tal
en ausencia del sustrato (A). La molcula
de sustrato induce un cambio
conformacional en el sitio activo de la
enzima de manera de quedar
perfectamente acoplados (B). El cambio de
forma de la enzima facilita la interaccin
enzima-sustrato y la reaccin (C).
(D) Sustancias de
estructura semejante
no producen el
cambio
conformacional
adecuado

El sitio activo de la enzima digestiva Carboxipeptidasa. (a) La enzima sin sustrato. (b)
La enzima con su substrato (azul oscuro) en posicin. Los tres aminocidos cruciales
(azul-verde) para la actividad de la enzima, han cambiado de posicin para acercarse al
substrato y a la molcula de zinc y acoplarse a ellos para formar el sitio activo.

SACARASA

La hidrlisis se realiza porque la molcula de sacarosa se fija

al sitio activo de la enzima.
La configuracin de la enzima sufre una modificacin de
manera que el puente de oxgeno que forma la unin entre los
dos monosacridos queda expuesto al efecto de las molculas
de agua del solvente.
La exposicin permite que dicha molcula de agua
efectivamente rompa el puente de oxgeno y fije los
componentes del agua en la molcula, un OH se une a uno de
los monosacridos y un H, al tomo de Oxgeno que queda fijo
al otro monosacrido
Esto produce el rompimiento del enlace entre los dos
monosacridos y finalmente lo convierte en dos azcares
separados, la glucosa y la fructosa.
Los productos son liberados y la enzima regresa a su
configuracin inicial, de modo que su sitio activo pueda ser
ocupado po9r una nueva molcula de sacarosa para ser
hidrolizada.

Acoplamiento Inducido en la Reaccin de la Hexocinasa

Una vez que la molcula de Glucosa (en azul) ocupa su lugar en el centro activo de la enzima,
sta sufre una modificacin conformacional, sus extremos se cierran para poner al sustrato en
contacto con todos los grupos enzimticos que participarn en la reaccin

COFACTORES, COENZIMAS, PROSTTICOS

En muchos casos las enzimas pueden catalizar reacciones, slo

cuando se hallan asociadas con molculas pequeas, cofactores,
que actan esencialmente como los " dientes qumicos" de las
enzimas. Los cofactores pueden ser:

Iones metlicos (Fe2+, Cu2+, Mg2+, entre otros), que se necesitan

para la actividad cataltica de numerosas enzimas. Las enzimas
que precisan de iones metlicos se llaman a veces metaloenzimas.
El ion metlico puede actuar como:

Centro cataltico primario.

Grupo puente para reunir el sustrato y la enzima, formando un complejo de
coordinacin
Agente estabilizante de la conformacin de la protena enzimtica en su
forma catalticamente activa.

Coenzimas, molculas orgnicas de tamao pequeo, tales como

el NAD+, que slo se hallan asociados transitoriamente con la
molcula de una enzima determinada de modo que, en efecto,
funcionan como cosustratos.
Grupos prostticos, los cuales se hallan asociados de modo
permanente con la enzima, frecuentemente mediante enlace
covalente. Tal es el caso del FMN en la enzima NADH
deshidrogenasa o del FAD en la succinato deshidrogenasa.

APOENZIMA - HOLOENZIMA
Las coenzimas cambian qumicamente en las
reacciones enzimticas en las que participan. As, para
completar el ciclo cataltico la coenzima debe ser
devuelta a su estado original.
Cuando se trata de coenzimas unidas de modo
transitorio, tales como NAD+, la reaccin de
regeneracin es usualmente catalizada por una enzima
diferente.
La protena que, cuando se encuentra aislada y
separada de su cofactor, es inactiva enzimticamente,
se designa como apoenzima
El complejo enzima-cofactor, activo catalticamente, se
llama holoenzima; es decir:
Apoenzima (inactiva) + cofactor Holoenzima (activa)

PRINCIPALES COENZIMAS
FAD (flavn-adenn dinucletido): transferencia de electrones y protones.
FMN (Flavn mononucletido): transferencia de electrones y protones.
NAD+(nicotn-adenn dinucletido): transferencia de electrones y protones.
NADP+ (nicotn-adenn dinucletido fosfato): transferencia de electrones y
protones.
Coenzima A: transferencia de grupos acetilo (por ejemplo, en la descarboxilacin
del cido pirvico) y de grupos acilo en general.
Coenzima Q: transferencia de electrones en la cadena respiratoria.
Coenzima B12: transferencia de grupos metilo o hidrgenos entre molculas.
TPP (Pirofosfato de tiamina): transferencia de grupos aldehdo; forma parte,
entre otros, del complejo piruvato deshidrogenasa.
Vitamina C
PLP (fosfato de piridoxal): transferencia de grupos amino.
PMP (fosfato de piridoxamina): transferencia de grupos amino.
FH4 (cido tetrahidroflico): transferencia de grupos formilo, metenilo y
metileno.
Biocitina: transferencia de dixido de carbono.
cido lipoico: transferencia de hidrgenos, grupos acilo y metilamina.

FACTORES GENERALES

Con muy pocas excepciones (ribozimas) todas las

enzimas son protenas y por lo tanto son afectadas por
todos los factores que afectan la estructura proteica.
Esto significa que las enzimas sern susceptibles a
cambios en las condiciones de la reaccin tales como el
pH y la temperatura.
La velocidad de las reacciones catalizadas por
enzimas es afectada fundamentalmente por:
La concentracin de la enzima;
La concentracin del sustrato.

Puesto que las enzimas son catalizadores, entonces:

son necesarias en concentraciones relativamente pequeas;

Son recuperadas sin ningn cambio al final de la reaccin.

ARRHENIUS Y MS

La asombrosa velocidad de las reacciones catalizadas por

enzimas, se debe principalmente a dos factores descritos por
Arrhenius.

En primer lugar, las enzimas disminuyen considerablemente la

energa de activacin, necesaria para que las molculas reaccionen.
En segundo lugar las enzimas poseen un sitio cataltico o sitio
activo, donde el sustrato y los cofactores y coenzimas necesarios,
como molculas reaccionante, se encuentran con la estreo
especificidad adecuada para que interaccionen correctamente, a
diferencia de lo que ocurre en la reaccin no catalizada, en que las
molculas chocan al azar en cualquier posicin.

Tal vez pueda mencionarse un tercer factor, las enzimas se

hallan, dentro de la clula, restringidas en compartimentos
funcionales especficos, ncleo, membrana, mitocondria, etc.
donde deben realizar su accin, y/o formando grandes
complejos enzimticos donde los sustratos y productos pasan
de un componente del complejo a otro, facilitando su
interaccin.

COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO

Todas las reacciones enzimticas se realizan al menos en 2

etapas, una primera en la cual se forma de manera
reversible la unin fsica entre la enzima (E) y el sustrato
(S), que da origen al complejo enzima-sustrato (ES).
Una vez formado el complejo enzima-sustrato ste puede
realizar la transformacin del sustrato, dando origen al
producto (P) y a la enzima libre que est en condiciones de
volver a iniciar el proceso.
E + S ES E + P
A la etapa nmero 1 le llamamos etapa de unin, y a la
nmero 2, de transformacin. Esta es una representacin
simplificada. pues es posible suponer la existencia de otros
complejos intermedios sobre todo cuando en la reaccin
intervienen cofactores o ms de un sustrato.
El punto crucial de este mecanismo bsico es la existencia
del complejo enzima-sustrato, que fue propuesta por
primera vez por Henry en1905. A partir de ese momento se
ha reunido suficiente evidencia para demostrar su
presencia.

RECONOCIMIENTO Y CATLISIS

Las enzimas presentan dentro de su estructura proteica

2 regiones o sitios importantes para la realizacin de su
actividad cataltica,
Sitio de reconocimiento, reconoce y liga al sustrato
Sitio cataltico, una vez unido el sustrato, cataliza la
reaccin

Estos 2 sitios estn adyacentes uno al otro en la forma

activa de la enzima y, en ocasiones, el sitio cataltico es
parte del sitio de reconocimiento,
Estas 2 regiones en conjunto reciben el nombre de
centro activo de la enzima

CENTRO ACTIVO

El centro activo representa una porcin pequea del volumen

total de la enzima: muchos de los residuos de aminocidos de la
enzima no entran en contacto con el sustrato.
El centro activo est situado superficialmente en la enzima;
permite el acceso de las molculas del sustrato con relativa
facilidad.
El centro activo de una enzima tiene un conjunto de grupos
qumicos ordenados espacialmente de forma precisa, esto hace
que el sustrato quede unido al centro activo de forma tan ntima
que casi ninguna otra molcula puede unirse de la misma
manera.
Los aminocidos de las 2 regiones del centro activo generalmente
no estn adyacentes unos a otros en la cadena polipeptdica lineal;
el acercamiento se produce como consecuencia del plegamiento de
la cadena proteica al adquirir su estructura terciaria.
El centro activo es una entidad tri-dimensional estreo especfica.
Los grupos que intervienen en la formacin del centro activo
realizan diferentes funciones
El centro activo es una estructura dinmica

ENERGA DE ACTIVACIN

Una reaccin qumica se produce cuando las molculas reaccionantes poseen

una cantidad mnima de energa llamada energa de activacin (Ea), o como es
ms frecuente en bioqumica, energa libre de activacin (G).
No todas las colisiones entre los reactivos resultan en una reaccin qumica
porque solo una fraccin de molculas tienen suficiente energa o chocan en la
orientacin correcta para reaccionar.
En sistemas de molculas reaccionantes, segn se eleva la temperatura la
movilidad de las molculas aumenta y por lo tanto se aumenta la posibilidad
de choques efectivos.
Otra manera de aumentar la frecuencia de colisiones efectivas para producir la
formacin de productos es la de aumentar la concentracin de los reactivos.
En los sistemas vivos ninguna de estas dos posibilidades es factible, el uso de
temperaturas elevadas afectara las delicadas estructuras celulares y la
concentracin de sustratos requiere ser usualmente muy baja.
Por estas razones los organismos vivos han resuelto el problema mediante el
uso de biocatalizadores, las enzimas.

Energa Libre de Activacin

Los catalizadores realizan su actividad

disminuyendo le energa de activacin que se
requiere para cualquier reaccin qumica.
Es decir, los catalizadores proveen una va de
reaccin que requiere menos energa
Un estado de transicin ocurre en la cspide de
ambas vas de reaccin, pero la energa
requerida es mucho menor en la va catalizada.
La energa libre de activacin, DG, se define
como la cantidad de energa que se requiere
para convertir una mol de sustratos (reactivos o
reactantes) desde el nivel basal (el nivel de baja
energa de una molcula) al estado de
transicin.
No existe diferencia en la energa libre de la
reaccin completa G (energa libre de los
reactivos minus energa libre de los productos)
entre las reacciones sin catalizadores y las
reacciones con catalizadores

No existe diferencia en la energa libre de la reaccin

completa (energa libre de los reactivos minus
energa libre de los productos) entre las reacciones
sin catalizadores y las reacciones con catalizadores
Energa libre de
activacin (sin
catalizador)

Energa libre de
activacin (con
catalizador)

Energa Libre de
Activacin
Los catalizadores realizan su
actividad disminuyendo la energa
de activacin que se requiere para
cualquier reaccin qumica.
Es decir, los catalizadores proveen
una va de reaccin que requiere
menos energa
Un estado de transicin ocurre en
la cspide de ambas vas de
reaccin, pero la energa requerida
es mucho menor en la va
catalizada.
La energa libre de activacin, DG,
se define como la cantidad de
energa que se requiere para
convertir una mol de sustratos
(reactivos o reactantes) desde el
nivel basal (el nivel de baja energa
de una molcula) al estado de
transicin.

Mecanismo Cataltico
A pesar de una intensa dedicacin al estudio de la catlisis

enzimtica, solo se ha podido obtener informacin detallada

acerca de los mecanismos de accin de unas pocas enzimas.
A pesar de ello, se ha demostrado que las enzimas utilizan los
mismos mecanismos catalticos que los catalizadores no
enzimticos.
Las enzimas proporcionan efectos catalticos significativamente
mejores porque en su sitio activo poseen una estructura que est
especficamente orientada a promover el efecto cataltico.
Varios factores contribuyen a la catlisis enzimtica. Los ms
importantes son:
A.
B.
C.
D.
E.

Efectos de proximidad y deformacin molecular,

Efectos electrostticos,
Catlisis cido-base,
Catlisis covalente.
Estabilizacin del estado de transicin

Mecanismos
Muchas reacciones qumicas pueden ser aceleradas

utilizando grupos catalticos apropiadamente

colocados.
Las enzimas, a causa de su composicin de
aminocidos y su estructura tridimensional, son
extremadamente capaces de tener colocados los
grupos funcionales apropiados, en el sitio apropiado
y en el tiempo justo.
La catlisis suele implicar la existencia de
interacciones covalentes transitorias entre el
sustrato y la enzima o transferencias de grupos
desde o a la enzima, con el fin de adoptar una ruta
de reaccin nueva y de menor energa.

Estabilizacin de los
Estados de Transicin
El estado de transicin de una
reaccin es un intermediario que
posee una configuracin molecular
muy inestable con enlaces que se
encuentran en el momento de
formarse o de romperse.
Estos estados de transicin
frecuentemente comprenden
grandes separaciones de los
residuos cargados.
Las enzimas pueden proveer el
arreglo ptimo para dichos grupos
qumicos y producir la adecuada
estabilidad de tales estados de
transicin.

Las enzimas generalmente se fijan con mayor fuerza a los

estados de transicin que a los sustratos.
sto orienta la reaccin hacia la formacin de los productos.

Energa de Fijacin
Una parte significativa de la energa utilizada para el incremento

de la velocidad de las reacciones enzimticas procede de

interacciones dbiles (enlaces de hidrgeno, interacciones
hidrofbicas e interacciones inicas) entre enzima y sustrato.
El sitio activo de la enzima tiene una estructura tal que hace que
algunas de estas interacciones dbiles tengan lugar de modo
preferente en el estado de transicin de la reaccin, con lo que lo
estabilizan.
Una de las razones del gran tamao de los enzimas es la
necesidad de que existan mltiples interacciones. La energa de
fijacin, Gb, puede utilizarse para disminuir la entropa del
sustrato o para producir en la enzima un cambio conformacional
(acoplamiento inducido).
La energa de fijacin es tambin la responsable de la exquisita
especificidad de las enzimas por sus sustratos.

Mecanismos
Entre los mecanismos catalticos adicionales
empleados por los enzimas se cuentan:

la catlisis cido-base general,

la catlisis covalente y
la catlisis por iones metlicos.

La catlisis suele implicar la existencia de

interacciones covalentes transitorias entre el
sustrato y el enzima o transferencias de grupos
desde o a la enzima, con el fin de adoptar una
ruta de reaccin nueva y que requiera menor
energa.

Proximidad y Deformacin Molecular

Este modelo de catlisis comprende la distorsin, empuje, atraccin o

torcimiento de un enlace que debe ser roto o producido durante la
reaccin.
Las partes del sustrato que no sern involucradas directamente en la
reaccin qumica interaccionan con residuos enzimticos
estratgicamente colocados de manera de mantener el sustrato en la
posicin distorsionada adecuada para facilitar la reaccin.
La distorsin y esfuerzo a que est sometido el enlace facilitan la
produccin del estado de transicin.

Catlisis Electrosttica

Veamos por ejemplo una reaccin simple, la adicin de agua a un grupo

carbonilo.
En esta reaccin podemos pensar en dos factores: el grupo carbonilo es
reactivo sobre el agua porque el grupo carbonilo se haya parcialmente
polarizado los electrones del grupo C=O no se reparten igualmente
entre el carbono y el oxgeno. El tomo de oxgeno, por ser ms
electronegativo retiene los electrones ms tiempo y ms cerca que el
carbono.
Segn el agua acta sobre el oxgeno del grupo carbonilo, los electrones
del enlace que se est rompiendo (C=O) se separan y van al oxgeno
dndole una carga negativa formal.
Si durante la reaccin (en el sitio activo de la enzima) existe un grupo
funcional positivamente cargado cercano al oxgeno del grupo
carbonilo, la polarizacin agregada a este grupo lo hace ms reactivo
ayudndolo ha adquirir la carga negativa segn procede la reaccin
qumica
Este mecanismo es llamado Catlisis Electrosttica.

Veamos por ejemplo una reaccin simple, la adicin de agua a un grupo carbonilo.
En esta reaccin podemos pensar en dos factores: el grupo carbonilo es reactivo sobre el agua
porque el grupo carbonilo se haya parcialmente polarizado los electrones del grupo C=O no
se reparten igualmente entre el carbono y el oxgeno. El tomo de oxgeno, por ser ms
electronegativo retiene los electrones ms tiempo y ms cerca que el carbono.
Segn el agua acta sobre el oxgeno del grupo carbonilo, los electrones del enlace que se
est rompiendo (C=O) se separan y van al oxgeno dndole una carga negativa formal.
Si durante la reaccin (en el sitio activo de la enzima) existe un rea funcional positivamente
cargada cercana al oxgeno del grupo carbonilo, la polarizacin agregada a este grupo lo hace
ms reactivo ayudndolo ha adquirir la carga negativa segn procede la reaccin qumica
Este mecanismo es llamado Catlisis Electrosttica.

Catlisis cido-Base

En la misma reaccin, veamos ahora, que podemos hacer con el

agua.
Debido a que posee mayor carga negativa (una densidad electrnica
mayor), OH es ms reactivo que HOH.
Si en el sitio activo de la enzima radica un residuo bsico colocado de
manera apropiada para que por lo menos pueda remover
parcialmente uno de los protones de la molcula de agua
reaccionante, podemos aumentar la reactividad del agua y acelerar
de este modo la reaccin.
Este mecanismo se conoce como Catlisis cido-Base y es
frecuentemente utilizado en las reacciones enzimticas para facilitar
la transferencia de protones durante las reacciones qumicas.

Catlisis Covalente
Otra alternativa es la formacin inestable de un
enlace covalente entre la enzima y el sustrato.
La enzima utiliza uno de sus grupos funcionales
para reaccionar covalentemente con el sustrato.
Esta participacin directa de la enzima en la
formacin de un enlace covalente se denomina
as, Catlisis Covalente.
Este enlace covalente enzima-sustrato, debe
formarse rpidamente, y los intermediarios
deben ser razonablemente reactivos para que
este tipo de catlisis pueda ser utilizado para
acelerar adecuadamente la reaccin.

Catlisis Covalente
Muchas enzimas estabilizan un
intermediario necesario de la
reaccin formando con l un
enlace covalente inestable.
Esto sucede con mucha
frecuencia entre las
transferasas, las cuales utilizan
un mecanismo de tipo "pingpong".
Este mecanismo es muy
frecuentemente utilizado por las
hidrolasas, tales como las
glucosidasas, las proteasas y las
lipasas.
Todas estas son usualmente
transferasas que utilizan al agua
como un aceptor.