Biosíntesis de nucleótidos

• Son precursores del RNA y el DNA

• Son esenciales como acarreadores de energía
• Son componentes de cofactores (NAD, FAD,
adoMet, Coenzima A y de intermediarios
biosintéticos activados (UDP-glucosa, CDP-
diacilglicerol, etc.
•Son componentes de mensajeros secundarios como el
AMPc, el GMPc, etc.

• Existen dos tipos de vías biosintéticas que dan

lugar a los nucleótidos:
• de novo: ribosa-5-fosfato, aminoácidos, CO2 y NH3
• de recuperación o reciclaje: reciclan las bases y los
nucleósidos libres provenientes de la degradación de
los ácidos nucléicos.
ÁCIDOS NUCLÉICOS y DERIVADOS de NUCLEÓTIDOS

DNA RNA, metabolitos activados, coenzimas DNA

dTTP dCTP CTP UTP GTP ATP dGTP dATP

NUCLEÓTIDOS

dTMP

dUDP dCDP CDP UDP GDP ADP dGP dADP

dUMP dCMP UMP GMP AMP

dUTP

Inosinato (IMP)
PRECURSORES

Carbamoil PRPP
fosfato

Aminoácidos Azúcares de 5 carbonos

 Pirimidinas Purinas

Asp participa en 2 pasos

diferentes durante la síntesis
de novo.

Gln es la fuente más importante

de grupos amino, participa en 5
pasos diferentes durante la
síntesis de novo.

EL PRPP es un precursor importante en

la síntesis tanto de purinas como de
pirimidinas. En este caso, a diferencia
de la síntesis de aminoácidos (Trp y
His),la estructura de la ribosa se
retiene como parte del nucleótido.
 La síntesis de novo de los nucleótidos de purina

Glutamina-PRPP
Amido transferasa

FGAM ciclasa o
AIR sintetasa Estos pasos son
catalizados por
un polipéptido
multi-funcional

GAR
transformilasa
 La sintesis de novo de los nucleotidos de purina:
construcción del anillo de purina a partir del inosinato (IMP)

N-CAIR mutasa

AICAR transformilasa

numbers

SAICAR sintetasa
IMP sintasa

Estos pasos son

catalizados por
un polipéptido
multi-funcional
La síntesis de novo de los nucleótidos de purina:
el IMP es el primer intermediario que posee un
anillo completo de purinas
Notar que para la
síntesis de AMP se
utiliza GTP como
donador de energía y
no ATP, como ocurre
en el caso de la
síntesis de GMP este
es un arreglo recíproco
que tiende a balancear
la síntesis de los dos
ribonucleótidos
 ÁCIDOS NUCLÉICOS y DERIVADOS de NUCLEÓTIDOS

DNA RNA, metabolitos activados, coenzimas DNA

dTTP dCTP CTP UTP GTP ATP dGTP dATP

NUCLEÓTIDOS

dTMP

dUDP dCDP CDP UDP GDP ADP dGDP dADP

dUMP dCMP UMP GMP AMP

dUTP

Inosinato (IMP)
PRECURSORES

Carbamoil PRPP
fosfato

Aminoácidos Azúcares de 5 carbonos

 La biosíntesis de nucleótidos
está regulada por inhibición por
retroalimentación
Cuando cualquiera de los dos productos finales, AMP
o GMP se acumulan en exceso los siguientes pasos de
su síntesis se inhiben parcialmente.

• La glutamina-PRPP amidotransferasa se
inhibe por los productos finales (IMP, GMP y
AMP).
• Estos mismos nucleótidos también inhiben la
síntesis de PRPP (Ribosa-fosfato-
pirofosfoquinasa).
• Un exceso de GMP inhibe la formación de
xantilato (XMP, sin afectar la síntesis de
AMP.
• Un excesos de AMP inhibe la formación de
adenil-succinato sin afectar la síntesis de
GMP.
 Carbamoil P
sintetasa
En eucariotes la 3 primeras enzimas de esta ruta
son parte de una sola proteína tri-funcional,
llamada CAD (acrónimo con la primera letra del
nombre de c/u). Está formada por 3 polipéptidos
idénticos, cada uno con sitios activos para las 3
reacciones.

Estas observaciones sugieren que la

presencia de grandes complejos multi-
enzimáticos puede ser la regla para esta
vía biosintética

La síntesis de nucleótidos de
pirimidinas utiliza como
precursores al aspartato, al
PRPP, y al carbamoil
fosfato:
ó NH4
Síntesis de CTP y UTP a partir de
orotidilato
ÁCIDOS NUCLÉICOS y DERIVADOS de NUCLEÓTIDOS

DNA RNA, metabolitos activados, coenzimas DNA

dTTP dCTP CTP UTP GTP ATP dGTP dATP

NUCLEÓTIDOS

dTMP

dUDP dCDP CDP UDP GDP ADP dGP dADP

dUMP dCMP UMP GMP AMP

dUTP

Inosinato (IMP)
PRECURSORES

Carbamoil PRPP
fosfato

Aminoácidos Azúcares de 5 carbonos

 Gln
Los intermediarios de la síntesis
de carbamoil fosfato se mueven
en canal a través de la
estructura proteíca de la
carbamoil fosfato sintetasa
bacteriana
Esta enzima bacteriana es capaz de proporcionar
carbamoil fosfato tanto para la síntesis de arginina
como de pirimidinas, a diferencia de lo que ocurre en
animales, en donde se requiere una enzima diferente
para cada proceso biosintético.Esta enzima tiene 3
sitios activos separados que se encuentran a lo largo de
un canal de 100 Å de longitud.

Este es un ejemplo vívido de la canalización de

intermediarios inestables para su transferencia a los
diferentes sitios activos de esta enzima.
ADP

ATP
O ADP O O NH4
Pi O ATP
ADP
-
O-C-OH O-P-O-C-OH NH2-C-OH O O
bicarbonato O carbamato H2N-C-O-P-O
Anhidruro del acido O ADP
carbonico fosforico
Carbamoil fosfato
 Regulación alostérica de la transcarbamoilasa de aspartato
(ATCasa) por CTP y ATP
La ATCasa bacteriana es una molécula que consiste de 6 subunidades catalíticas y 6 subunidades regulatorias.
Las catalíticas se unen al sustrato, en tanto que las regulatorias al inhibidor alostérico CTP. Esta enzima existe
en 2 conformaciones, una activa y una inactiva. Cuando el CTP no se une a las subunidades regulatorias, la
enzima está en su conformación activa, en tanto que cuando el CTP se llega a acumular, éste se une a estas
subunidades provocando su cambio conformacional, el cual es transmitido a las subunidades catalíticas que
consecuentemente adquieren a una conformación inactiva.
Los nucleósidos monofosfato (NMPs) se convierten
a nucleósidos bi-fosfato (NDPs)

ATP + AMP 2 ADP

Adenilato quinasa

ATP + NMP ADP + NDP

Nucleósido monofosfato quinasa

(generalmente específica para una base pero no para el azúcar, ribosa o desoxi-ribosa)

NTPD + NDPA NDPD + NTPA

Nucleósido difosfato quinasa

(esta enzima no es específica para la base ni para el azúcar)
ÁCIDOS NUCLÉICOS y DERIVADOS de NUCLEÓTIDOS

DNA RNA, metabolitos activados, coenzimas DNA

dTTP dCTP CTP UTP GTP ATP dGTP dATP

NUCLEÓTIDOS

dTMP

dUDP dCDP CDP UDP GDP ADP dGP dADP

dUMP dCMP UMP GMP AMP

dUTP

Inosinato (IMP)
PRECURSORES

Carbamoil PRPP
fosfato

Aminoácidos Azúcares de 5 carbonos

Reducción de los ribonucleótidos a deoxi-ribonucleótidos por la
ribonucleótido reductasa
 La ribonucleótido reductasa

Su mecanismo de reacción evoca uno de los mejores

ejemplo de la participación de radicales libres en una
transformación bioquímica.
Esta enzima está conformada por 2 subunidades, R1
y R2. La R1 contiene 2 clases de sitios regulatorios.
Los 2 sitios activos e la enzima se forman en la
interfase entre la R1 y R2. La R2 contiene un co-
factor binuclear de Fe3+ que ayuda a generar y
estabilizar los radicales tirosilo.

Los radicales tirosilo generan otro radical que

actúa en el sitio activo durante la catálisis.
Regulación alostérica de la ribonucleótido reductasa por
los deoxi-nucleósidos trifosfato
FIN