UNIVERSIDAD NACIONAL

AUTNOMA DE MXICO
FACULTAD DE ESTUDIOS
SUPERIORES CUAUTITLN
BIOINFORMTICA
Primers
CERN ALBARRN JORGE ALBERTO

Profesoras:
M. en C. Maritere Domnguez Rojas
pBQD Larisa Andrea Gonzlez Salcedo
BQD ngeles Lpez Cabrera

Fecha: Septiembre 23, 2015

PRIMER BLAST

Primer Pair
1 Forward
1 Reverse
2F
2R
3F
3R
4F
4R
5F
5R
6F
6R
7F
7R
8F
8R
9F
9R
10 F
10 R

Length
20
20
20
20
20
20
20
20
20
20
20
18
20
19
19
20
20
18
18
20

Tm
60.66
60.03
59.97
60.66
59.33
59.96
59.90
60.96
60.18
61.95
59.83
60.13
59.75
61.15
61.15
59.46
59.68
60.75
58.93
60.76

GC%
55
60
60.00
55.00
50.00
55.00
55.00
60.00
55.00
60.00
55.00
61.11
55.00
63.16
63.16
60.00
55.00
66.67
61.11
65.00

Self Complem
3.00
4.00
5.00
3.00
3.00
4.00
4.00
2.00
7.00
4.00
4.00
4.00
5.00
4.00
4.00
4.00
4.00
3.00
4.00
4.00

Se utiliza el par de Primers No. 3 que da un producto de 210 pb

Self 3 Comple
2.00
2.00
1.00
0.00
2.00
3.00
1.00
2.00
3.00
0.00
2.00
0.00
2.00
2.00
2.00
1.00
0.00
2.00
2.00
0.00

PRIMER 3

Primer Pair
1 Forward
Reverse
2 Forward
Reverse
3 Forward
Reverse
4 Forward
Reverse
5 Forward
Reverse

Length
20
20
20
20
20
20
20
20
20
20

Tm
60.04
60.18
60.11
59.90
60.11
59.90
59.89
60.18
60.01
59.70

GC%
60.00
55.00
55.00
55.00
55.00
55.00
60.00
55.00
55.00
55.00

Self Complem
4.00
4.00
7.00
6.00
6.00
6.00
4.00
4.00
4.00
4.00

Self 3 Comple
2.00
2.00
3.00
2.00
3.00
2.00
1.00
2.00
2.00
2.00

Se utiliza el par de Primers No. 4 ya que tiene una temperatura de fusin

cercana con una diferencia de 0.29C una autocomplementariedad total de
4.00 que comparando con las dems es de las bajas, y se eligi principalmente
por tu ligeramente menor complementariedad con 3