TEMA 15. Introduccin al metabolismo y bioenergtica.

Panormica del metabolismo energtico. Anabolismo y catabolismo. Rutas

centrales del metabolismo. Principios generales sobre regulacin
metablica. Principios de bioenergtica. Energa libre. Procesos
irreversibles. Reacciones acopladas. Papel central del ATP en el
metabolismo energtico. Hidrlisis de ATP. Otros compuestos ricos en
energa. Transferencia de grupos fosfato. Reacciones de oxido-reduccin
biolgica. Coenzimas transportadoras de electrones. Vitaminas.

BIOQUMICA-1 de Medicina
Departamento de Biologa Molecular
M. Dolores Delgado

INTRODUCIN AL METABOLISMO

QUE ES EL METABOLISMO?
El conjunto de todas las transformaciones qumicas que se
producen en una clula u organismo
Cientos de reacciones organizadas en rutas metablicas
QU ES UNA RUTA METABLICA?
Una serie de reacciones catalizadas enzimticamente.
En una ruta, un precursor se convierte en un producto a
travs de una serie de intermediarios: los metabolitos
Las rutas metablicas pueden ser convergentes, divergentes
o cclicas

TEMA 15

Ejemplo de ruta metabolica: GLUCOLISIS

GLUCOSA
Hexoquinasa

GLUCOSA-6-P
Fosfoglucoisomerasa

FRUCTOSA-6-P
Fosfofructoquinasa

FRUCTOSA-1,6-BP
Aldolasa

DHAP

GLICERALDEHIDO-3P

TPI

GAPDH

NADH
1,3-BPG

ATP

PGK

3-PG
PGM

2-PG
Enolasa

PEP
Piruvatoquinasa

ATP
(2) PIRUVATO
TEMA 15

FUNCIONES DEL METABOLISMO

-Obtener energa qumica (ATP) degradando nutrientes ricos en
energa (o a partir de la energa solar)
-Convertir molculas nutrientes en molculas celulares (fabricar
los componentes celulares)
-Polimerizar precursores monomricos a protenas, cidos
nucleicos, polisacridos, etc.
-Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones
celulares especializadas (hormonas, neurotransmisores, etc.)
CARACTERSTICAS DEL METABOLISMO
-Las reacciones bioqumicas son muchas, pero las reacciones
importantes son relativamente pocas
-Las rutas metablicas centrales son pocas y son similares en
todas las formas vivas
-Las molculas importantes del metabolismo no son mas de 100
-Todas las rutas se regulan de forma similar.

TEMA 15

RUTAS
METABLICAS

"Biochemistry" Garrett, R.H.

and Grisham, C.M. Saunders
College Publishing. 2005

TEMA 15

FUENTES DE CARBONO Y ENERGA PARA EL METABOLISMO

Energa solar

Dixido de Carbono
Otros nutrientes

AUTTROFOS
Fotosintticos
(plantas)

Polisacridos
Lpidos
Protenas
Ac. Nucleicos

Dixido de Carbono
Agua

TEMA 15

HETERTROFOS
Quimiosintticos
(animales)
6

PRINCIPALES CARACTERSTICAS DEL

CATABOLISMO Y EL ANABOLISMO
Nutrientes
que contienen
energa

Macromolculas
celulares
Protenas
Polisacridos
Lpidos
Acidos Nucleicos

Glcidos
Grasas
Protenas

CATABOLISMO
Degradativo, oxidativo
Genera energa, produce
ATP.

Catabolismo

Los productos finales e

intermedios son materias
primas del anabolismo

ADP+Pi
NAD+
NADP+

ANABOLISMO
Sinttico, reductivo
Utiliza energa, consume ATP.

ATP
NADH
NADPH

Genera desechos que se

excretan al entorno
LISIS

Los productos finales son

materias primas del catabolismo

Anabolismo

GENESIS

Energa
qumica
Molculas
precursoras

Productos
finales no
energticos

Aminocidos
Monosacridos
cidos grasos
Bases nitrogenadas

CO2, H2O
NH3
TEMA 15

Modificado del Lehninger

Principios de Bioqumica", 4 ed.
Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega.
2006.

ESQUEMA GENERAL DEL METABOLISMO

Protenas

Acidos
Nucleicos

Polisacridos

Monosacridos

Lpidos

Glicerol

Nucletidos

Acidos
Grasos

Aminocidos
Glucosa

Piruvato

Urea

ANABOLISMO

CATABOLISMO

AcetilCoA

e-

CO2
O2
H2O

ATP
TEMA 15

REGULACIN DE LAS RUTAS METABLICAS

Sirve para:
Que la velocidad de la va est adaptada a las necesidades de la clula
Que las vas de sntesis y degradacin no est activas a la vez.
Las rutas catablicas y anablicas no son inversas las unas de las
otras. Ambas rutas tienen a menudo localizacin diferente en las
clulas.

Se d a tres niveles:
1. Por los enzimas alostricos, capaces de cambiar la actividad
cataltica en respuesta a moduladores estimuladores o inhibidores.
2. Mediante regulacin hormonal..
3. Por regulacin de la concentracin de un enzima en la clula
(regulacin gentica)

TEMA 15

LAS RUTAS METABLICAS SE DESARROLLAN EN LUGARES

ESPECFICOS DE LAS CLULAS

NCLEO
Replicacin del DNA
Sntesis tRNA y mRNA
NUCLEOLO
sntesis rRNA

RETCULO ENDOPLSMICO
Sntesis de lpidos, transporte intracelular

RIBOSOMAS
Sntesis de protenas

GOLGI
Maduracin de glucoprotenas y otros
componentes de las membranas

MITOCONDRIAS

TEMA 15

Oxidacin del piruvato

Ciclo Krebs
Fosforilacin oxidativa
Oxidacin de cidos grasos
Catabolismo de aminocidos

CITOSOL
Glucolisis, parte de gluconeognesis;
pentosas fosfato; sntesis de cidos grasos, sntesis
de nucletidos
10

SISTEMAS MULTIENZIMTICOS
Complejos multienzimticos Enzimas
fsicamente asociados. A menudo los
intermediarios estn unidos
covalentemente a los complejos. Ej PirDH

Enzimas individuales.
Los intermediarios
fluyen de un enzima a
otro. Ej: glucolisis

Enzimas asociados a grandes

estructuras, membranas o
ribosomas. Ej: cadena electrnica
mitocondrial

"Biochemistry" Garrett,
R.H. and Grisham, C.M.
Saunders College
Publishing. 2005

TEMA 15

11

REACCIONES BIOQUMICAS

Muchas reacciones qumicas requieren condiciones

no compatibles con los organismos vivos:
solventes no acuosos
alta temperatura y presin
presencia de cidos o bases fuertes

Las reacciones bioqumicas tienen lugar bajo

condiciones especiales:
soluciones acuosas
condiciones suaves: presin y temperatura
prcticamente constantes
pH fisiolgico
catalizadas enzimticamente

TEMA 15

12

TIPOS DE REACCIONES BIOQUMICAS

1. Oxidacin-reduccin

2. Formar o romper
enlaces carbono-carbono

3. Reordenamientos internos,
isomerizaciones, eliminaciones

4. Transferencia de grupo
5. Reacciones de radicales libres
TEMA 15

Lehninger Principios de
Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y
Cox, M.M. Omega. 2006.

13

BIOENERGTICA

TEMA 15

14

TRABAJO Y ENERGA BIOLGICOS

Los seres vivos captan ENERGA de diversas fuentes
Utilizan la energa para desarrollar TRABAJO BIOLGICO
Los organismos realizan gran cantidad de transformaciones de energa
Convierten la energa qumica (ATP) de los combustibles en:
Calor, energa mecnica, energa elctrica, otras fuentes de energa qumica

ENERGA

NUTRIENTES DEL ENTORNO.....quimiosintticos

LUZ SOLAR ...................................fotosintticos
Transformaciones qumicas en el interior de
las clulas

TRANSDUCCIONES
DE ENERGA

AUMENTO DE
ENTROPA

TRABAJO BIOLGICO:
Biosntesis (anabolismo)
Trabajo mecnico (contraccin muscular)
Gradientes osmticos (transporte contra
gradiente)
Trabajo elctrico (transmisin del impulso
nervioso) etc.
PRODUCTOS FINALES DEL METABOLISMO
(molculas simples CO2, H2O)
CALOR

TEMA 15

15

PRINCIPIOS BSICOS DE BIOENERGTICA

Bioenergtica: Rama de la bioqumica que estudia la transferencia

y utilizacin de energa en los sistemas biolgicos. Comprende el
estudio cuantitativo de los cambios de energa de las reacciones
bioqumicas.
Aplica los principios bsicos de la termodinmica a los sistemas
biolgicos.
Sistema: se denomina sistema termodinmico a aquella parte del
universo que se est observando. El entorno es el resto del
universo. El sistema y su entorno constituyen el universo.
Las clulas vivas y los organismos son sistemas abiertos que
intercambian materia y energa con el entorno

ENTORNO
TEMA 15

SISTEMA

UNIVERSO
16

Estado de un sistema: forma de comportarse el sistema en un

instante dado.
Cuando se produce una variacin en el estado de un sistema, se
dice que este ha sufrido una transformacin, un proceso en el
que existe un estado inicial y un estado final. El incremento () es
la diferencia entre el valor de una variable en el estado inicial y
en el estado final.
Ej.: Transformacin de un gas
Estado inicial
V1, P1
Cambios:

V =V2-V1

Estado final
V2, P2

P =P2-P1

Funciones de estado: aquellas funciones termodinmicas cuyo

valor depende slo del estado del sistema. Si en un sistema se
produce una transformacin, la variacin de las funciones de
estado depende nicamente del estado inicial y del estado final, y
no del camino por el que se realiza la transformacin.
Volmen V, Presin P, Entalpa H, Energa libre G, etc.
TEMA 15

17

1er PRINCIPIO: conservacin de la energa

La energa ni se crea ni se destruye, solo se transforma de una forma a otra
Ej: los animales convierten la E qumica (ATP) en
- calor (mantenimiento T)
-Trabajo(E mecnica, E elctrica, otras formas de E qumica)
En todas estas conversiones de E, esta no se crea ni se destruye.
H = ENTALPA (contenido calrico del sistema) (J/mol)
H = calor que se libera o se absorbe durante una reaccin
H (-).... EXOTERMICA (libera calor)
H (+) .... ENDOTERMICA (absorbe calor)

2 PRINCIPIO: analiza la direccin de los procesos favorables o espontneos

"en todo proceso el desorden total del universo aumenta
S = entropa (medida cuantitativa del desorden) (J/mol K)
( Ssistema + Sentorno ) > 0 = proceso espontneo
Entropa= la energa de un sistema que no puede utilizarse para realizar
un trabajo til
TEMA 15

18

ENERGA LIBRE O ENERGA DE GIBBS (G)

- La energa libre (G) es la parte de energa de un sistema capaz
de hacer trabajo biolgico.
Las reacciones espontneas van en la direccin de
ms baja energa libre
G (-), EXERGNICA, favorable o espontnea
G (+), ENDERGNICA, no espontnea.
G=0, equilibrio

TEMA 15

Procesos exergnicos

Procesos endergnicos

19

G = H - T S
(relaciona los dos
principios)
G = variacin de la E libre
H = variacin de la entalpa
(cambio calorfico)
T = T absoluta
S= variacin de la entropa
(grado de orden)

TEMA 15

Koolman, Rohm. Bioqumica Texto y

Atlas Panamericana 2003

20

 G Es una funcin de estado:

depende del estado inicial y final, no del camino
seguido o mecanismo

A
Glucosa

B
metabolismo

= - 2840 kJ/mol

combustin

CO2 + H2O

D
G no proporciona informacin sobre la
velocidad de la reaccin, slo si se dar o no
espontneamente
G se expresa en J/mol (o cal/mol)

TEMA 15

21

RELACIN ENTRE G y Keq

A+B
Keq =

C+ D
[C]eq [D]eq
[A]eq [B]eq

G= - RT LnKeq

G= variacin de E libre en
condiciones estandar
(pH=7, 25C, 1atm de presin,
conc. inicial de R y P 1 M)

G y Keq son constantes y caractersticas de

cada reaccin
G es una forma alternativa de expresar la
constante de equilibrio

Keq > 1

G (-)

Keq < 1

G (+)

TEMA 15

Lehninger
Principios de
Bioqumica", 4
ed.. Omega.
2006.

22

RELACIN ENTRE G y G

G= variacin de energa libre en condiciones

estandar. Es una CONSTANTE, tiene un valor fijo
para cada reaccin
G = variacin de energa libre real . Es variable,
depende de las concentraciones de reactivos y
productos y de la temperatura

G = G+ RT Ln

[P]
[R]

TEMA 15

23

LAS G SON ADITIVAS

G1

G2

G3

GTOTAL

Reacciones qumicas
secuenciales

= G1 +G2 +G3

Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas:

la energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las
endergnicas, que no se produciran espontneamente

TEMA 15

24

RESMEN ENERGA LIBRE

- La energa libre (G) es la parte de energa de un sistema capaz de hacer trabajo biolgico.
G = H - T S (relaciona los dos principios)
- Las reacciones espontneas van en la direccin de ms baja energa libre (estado final,
menor energa libre que estado inicial)
Si se conoce G de una reaccin, se podr predecir si es espontnea o no:
G (-), exergnica, favorable o espontnea
G (+), endergnica, no espontnea.
G=0, equilibrio
- G0 es el valor de G para una reaccin a pH7, 25C, 1 atm de presin y [R]i y [P]i = 1M
(condiciones estandar):
G0 = -RT ln Keq
-

G0 es constante y caracterstica de cada reaccin

- En las clulas las condiciones no son las estandar (sobre todo por las distintas
concentraciones de reactivos y productos)
[P]
Greal = G0 + RT ln

[R]

- G0 son aditivas. Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas: la

energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las endergnicas, que no se
produciran espontneamente.
TEMA 15

TEMA 15

25

Lehninger Principios de
Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y
Cox, M.M. Omega. 2006.

26

ATP

TEMA 15

27

ATP: nexo entre procesos biolgicos dadores de energa y procesos

biolgicos consumidores de energa
NUTRIENTES
PRODUCTORES
DE ENERGA

CO2, H2O, NH3

catabolismo
TRABAJO BIOLGICO

ATP

ADP + Pi

Contraccin muscular
Transmisin impulso
nerviosos
Transporte activo

anabolismo
MACROMOLCULAS
COMPLEJAS

Biosntesis

PRECURSORES
SENCILLOS

La hidrlisis del ATP proporciona energa libre para impulsar

reacciones endergnicas, energticamente desfavorables

TEMA 15

28

HIDRLISIS DEL ATP

- Enlaces
fosfoanhidro

adenina

ATP

ribosa
H2O

ATPasa

Hidrlisis con disminucin

de la repulsin de cargas

OH

Pi
(Estabilizacin por
resonancia)

ADP
G 0 = - 30,5 kJ/mol

(Ionizacin)

G real = - 50 a -65 kJ/mol

TEMA 15

29

LA HIDRLISIS DEL ATP PROPORCIONA ENERGIA LIBRE

PARA IMPULSAR REACCIONES ENDERGNICAS

G 0 = - 30,5 kJ/mol
ATP + H2O

ADP + Pi (ortofosfato)

ATP + H2O

AMP + PPi (pirofosfato)

PPi
2 Pi

G real = - 50 a -65 kJ/mol

G 0 = - 45,6 kJ/mol
G 0 = - 19 kJ/mol

G 0 = - 64,6 kJ/mol

LOS NUCLESIDOS TRIFOSFATO SON ENERGTICAMENTE EQUIVALENTES

Los otros nuclesidos trifosfato: GTP, UTP y CTP y los deoxinuclesidos

trifosfato: dATP, dGTP, dTTP, dCTP son energticamente equivalentes al ATP
Se producen transfosforilaciones entre nucletidos:
ATP + NDP
TEMA 15

Nuclesido
difosfato quinasa

ADP + NTP
30

OTROS COMPUESTOS DE ALTA ENERGA

G0=- 61,9 kJ/mol

PIRUVATO + Pi

FOSFOENOL PIRUVATO
1,3-BISFOSFOGLICERATO

3-FOSFOGLICERATO + Pi

G0=- 43 kJ/mol

CREATINA + Pi

FOSFOCREATINA

ACETATO + CoA-SH

ACETIL-CoA

G0=- 49,3 kJ/mol

G0=- 32,2 kJ/mol

tiosteres
SUCCINATO + CoA-SH

SUCCINIL-CoA

G0 de hidrlisis (kJ/mol)

REACCIONES DE TRANSFERENCIA
DE FOSFORILO
-Compuestos de alta energa = altos potenciales de
transferencia de fosforilo (tendencia a ceder el P )
- ATP = valor intermedio

-Compuestos de alta energa.....transfieren su

grupo fosfato al ADP para formar ATP
-- ATP.......transfiere su grupo fosfato a compuestos
de baja energa y los activa

G0=- 36 kJ/mol

Ej:

PEP + ADP
Glucosa + ATP

PK

HK

ATP + Pir
Glucosa-6-P +ADP

TEMA 15

31

PROCESOS CELULARES DONDE SE FORMA O SE CONSUME ATP

El ATP est contnuamente consumindose y regenerndose

Formacin de ATP:

ATP

- Fosforilacin a nivel de sustrato (1):

transferencia de grupo fosfato desde un
compuesto de alta energa al ATP

Intermedios -P

ATP

- Fosforilacin oxidativa (2): transferencia de

electrones al O2 acoplado a la biosntesis
de ATP en la membrana mitocondrial

Fosfocreatina

ATP

Consumo de ATP:

ATP

-Primeras etapas glucolisis

ATP

-Reacciones de Biosntesis (4)

-Transporte activo (5)
ATP

UTP
UDP-glucosa

-Contraccin muscular (6)

-muchos otros procesos

Modificado de: Basic Medical Biochemistry. A

Clinical Approach. Marks, D.B, Marks, A.D and
Smith, C.M. Williams and Wilkins.1996.
TEMA 15

32

Reacciones Redox biolgicas

TEMA 15

33

CONCEPTOS GENERALES DE REACCIONES REDOX

Reacciones de transferencia electrnica, son reacciones de oxidacin reduccin:

-prdida de e- por una especie qumica reducida (que se oxida)
-ganancia de e- por una especie qumica oxidada (que se reduce)

3 etapas del catabolismo:

1. La fuente de e- son compuestos reducidos (ej: glucosa, ac.grasos)
2. Reacciones de oxidacin: los e- pasan de distintos intermediarios
metablicos a transportadores electrnicos con liberacin de energa
3. Transporte de e- al O2 (aceptor final) acoplado a sntesis de ATP
(fosforilacin oxidativa)

TEMA 15

34

ESQUEMA GENERAL DEL METABOLISMO

Protenas

Acidos
Nucleicos

Polisacridos

Lpidos

1
Monosacridos

Glicerol

Nucletidos

Acidos
Grasos

Aminocidos
Glucosa

Piruvato

Urea

ANABOLISMO

CATABOLISMO

AcetilCoA

e-

CO2
O2
H2O

ATP
TEMA 15

35

REACCIONES REDOX BIOLGICAS

Oxidacin = prdida de eReduccin = ganancia de e- Oxidacin y reduccin se producen simultneamente: el e- que
pierde la molcula oxidada se capta por otra que se reduce.
- En los sistemas biolgicos frecuentemente la transferencia de un e- se
produce unida a la transferencia de un protn (tomo de H) H+ + eOxidacin = prdida de tomos de H (deshidrogenacin)
Reduccin = ganancia de tomos de H
- Los e- tambien se pueden transferir en forma de in hidruro (:H-),
que incluye 2 e- + H+

Un e- transferido en cualquiera de esas formas se

denomina equivalente de reduccin

TEMA 15

36

ESTADOS DE OXIDACIN DEL CARBONO

N de epertenecientes
aC

Ms reducido

Ms oxidado
Modificado del Lehninger Principios de
Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox,
M.M. Omega. 2006.
TEMA 15

37

COENZIMAS TRANSPORTADORAS DE ELECTRONES

1. Cofactores principales: hidrosolubles, intervienen en muchas reacciones
Redox del metabolismo

NAD+ y NADP+. Cofactores mviles, se trasladan de un enzima a otro

FAD y FMN: grupo prosttico de las flavoprotenas, a las que estn
fuertemente unidas.
2. Otros cofactores: algunos solubles, otros protenas de membrana
quinonas liposolubles, protenas ferrosulfuradas, citocromos
Equivalentes de reducin (e-)
del catabolismo

TEMA 15

NAD+

NADH

FAD

FADH2

Sntesis de ATP

NADP+

NADPH

Reacciones anablicas
38

NAD+ y NADP+
nicotinamida

+ H+
NADH
reducido

NAD+
oxidado

NAD+ + 2H+ + 2 e-

NADH + H+

Ej.

NAD+ + R C R
OH

NADH + H+ + R C R
O

Ms de 200 enzimas utilizan NAD o NADP como coenzimas.

Se denominan oxidoreductasas o deshidrogenasas.
TEMA 15

39

FAD y FMN

FAD y FMN

Grupo prosttico de flavoprotenas

FAD + 2H+ + 2 e-

H H
FAD + R C C R
H H

TEMA 15

FADH2

H
FADH2 + R C C R
H

40

VITAMINAS Y COENZIMAS

VITAMINA

COENZIMA

B1, Tiamina

TPP

Piruvato deshidrogenasa
-ceto-glutarato DH
-cetocido DH

Aldehido

B2, Riboflavina

FAD,FMN

Deshidrogenasas
(flavoprotenas)

electrones

B3, Niacina

NAD, NADP

Deshidrogenasas

electrones

B5, Pantotenato CoA

Pir-DH, -KG-DH,
acil-CoA sintetasas...

acilos

B6, Piridoxina

Piridoxal fosfato

Aminotransferasas
(Glucgeno fosforilasa)

amino

B8, Biotina

Biotina

Carboxilasas

CO2

B9, Folato

Tetrahidrofolato

metab. aminocidos

B12, cobalamina CoenzimaB12

ENZIMA

Grupo transportado

grupos
monocarbonados

oxidacin propionato

hidrgenos

TEMA 15

41

A los mdicos les gusta prescribir vitaminas,

y millones de personas las toman, pero se
necesita una buena cultura bioqumica para
entender porqu se necesitan y cmo las
utiliza el organismo.
Fritz Lipman (1899-1986), Descubridor del CoA
The Nobel Prize in
Physiology or Medicine 1953
"for his discovery of the
citric acid cycle"

"for his discovery of coenzyme A and its

importance for intermediary
metabolism"

http://nobelprize.org/

Hans Adolf Krebs

TEMA 15

Fritz Albert Lipmann

42

TEMA 15

FIN de la
BIOENERGTICA

43