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BRENDA-Enzyme

Database
Ana Sofa Ramrez Pelayo
Salvador Tovar Lpez
Luis Alejandro Farfn
Carlos Antonio Moreno

Qu es?
Braunschweig Enzyme DAtabase
Base de datos :
Informacin: especfica por organismo, propiedades funcionales,
moleculares, nomenclatura, reacciones, especificidad,
estructural, estabilidad aplicacin, ingeniera, ligandos,
referencias y links a otras bases de datos.
Relacional
Extensa:
Al menos 1 000 000 enzimas, de ms de 6900 organismos diferentes,
clasificadas en aproximadamente 5300 nmeros EC.

Extrada y evaluada en literatura primaria (46000 referencias)


Continuamente actualizada (cada 6 meses)

Qu es?
Creada en 1987
German National Research Centre
for Biotechnology in Braunschweig.
Prof. Dietmar Schomburg
Publicada primero como una serie
de libros
En 1996 se mueve al Instituto de
Bioqumica de la Universidad de
Colonia
Transformada en una base de datos de
acceso pblico

En 2007 se regresa a Technische


Universitat Braunschweig
Mejora continua tcnica y de
desarrollo

Cmo se utiliza?
Bsqueda de enzimas por:
Nmeros EC
Nombres o sinnimos
Organismos

Qu ms puedo hacer?
Informacin sobre ligandos y relaciones con enzimas
Calcular o simular las rutas metablicas a partir de datos
obtenidos de BRENDA (cadenas de sustrato/producto, datos
cinticos, metabolismo KEGG)
Enzimas relacionadas con enfermedades

EJERCICIO 1
Enzima UBC13
1. http://www.brenda-enzymes.info/; classic view
2. Enzyme name: UBC13Search

3. Buscar nmero EC

4. Reaccin

5. Buscar localizacin en el ser humano

6. Aplicaciones

EJERCICIO 2
Rennina

Reaccin

pH ptimo

Temperatura ptima

EJERCICIO 3
Lacasa de arroz
http://www.brenda-enzymes.info/index.php

Referencias
Schomburg, I.; Chang, A. y Schomburg, D. (2002, enero 1).
BRENDA, enzyme data and metabolic information. Nucleic
Acids Research, volumen 20, nmero 1, pginas 47-49.
Recuperado el 3 de noviembre del 2014, de
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC99121
Schomburg, D. (2011, marzo). The BRENDA Information
System. Recuperado el 3 de noviembre del 2014, de
https://www.ebi.ac.uk/training/sites/ebi.ac.uk.training/files/mat
erials/2011/110315_Dusseldorf/brenda_roadshow_module_0
_march2011.pdf.