En primer lugar, dicho proyecto conllevar a la inundacin de ms de 600km2
provocando la prdida e incluso la fragmentacin de hbitats terrestres. Como ya hemos mencionado antes, la prdida de hbitats provocar la extincin de numerosas especies tanto de animales como de plantas. Este hecho llama ms la atencin, en este caso, debido a que el lugar en el que se encuentra la presa es considerado uno de los famosos puntos calientes de biodiversidad. Otro punto a tener en cuenta, se sabe que en los aos 50 la cubierta forestal media de toda la regin se encontraba entre el 30 y el 50%, a da de hoy se estima que dicha cubierta tan slo se encuentra en torno a un 10%. Este hecho ha provocado que la erosin afecte a un 60% de la regin del embalse. Por otro lado, al construir la presa se bloquear el ro, hecho que provocar una modificacin de su rgimen natural, cambiando la descarga de agua y los patrones de sedimentacin. Los sedimentos pasarn a acumularse en el embalse, en lugar de en la desembocadura, provocando que el contenido de limos aguas abajo sea menor que el natural. Este hecho repercute en el curso del ro y sus inmediaciones, provocando cambios en la estructuracin del mismo: disminuciones de superficie de las llanuras de inundacin, llegndose incluso a la prdida de las mismas, modificaciones de deltas y estuarios, playas, marismas, etc. A su vez, al bloquear los sedimentos y nutrientes tambin se dar un gran cambio en las propiedades bioqumicas del agua sobre todo en el curso inferior del ro, modificando la productividad biolgica, las redes trficas fluviales y adyacentes al ro. Otro de los problemas es la posible intrusin de agua salada en la desembocadura del ro debido al continuo cambio del caudal y a la menor cantidad de sedimentos en la desembocadura. Otro de los grandes problemas es que, al crear el embalse y reducir la velocidad del agua, la capacidad de autodepuracin del ro es mucho menor, hecho bastante significativo ya que, en el ro Yangts, el caudal de las aguas residuales es muy elevado (mayor de 1000 Hm3) lo que implica que es de vital importancia una rpida actuacin para reducir la contaminacin en los cauces alto y medio del ro, hecho que afecta a ocho provincias que ocupan un total de 633.000 Km2. Como problema de significativa importancia es la falta de capacidad de la infraestructura para controlar inundaciones, que qued evidenciada tras la riada de 2010, en la que incluso se lleg a pensar en la posibilidad de que el dique cediera provocando una catstrofe an mayor. Contrariamente a este suceso es la sequa posterior que dej a casi 400.000 personas sin agua potable adems de la imposibilidad para navegar en su zona baja.