Captulo 5. INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA....................................................................................

122
5.1. CLASIFICACIN GENERAL DE LOS MICROORGANISMOS.................................................... 122
5.2. METABOLISMO MICROBIANO..................................................................................................... 125
5.3. FUNDAMENTOS DE BIOQUIMICA ............................................................................................... 134
5.3.1. Caractersticas de las enzimas...................................................................................................... 135
5.3.2. Propiedades de las enzimas. ......................................................................................................... 136
5.3.3. Mecanismos de la accin enzimtica............................................................................................ 136
5.3.4. Clases principales de enzimas...................................................................................................... 138
5.4. C O F A C T O R E S.......................................................................................................................... 138
5.5. TRAZAS Y ELEMENTOS MAYORES............................................................................................. 139
5.6. BIOQUIMICA DE LOS CARBOHIDRATOS................................................................................... 139
5.7. BIOQUIMICA DE LAS PROTEINAS............................................................................................... 141
5.8. BIOQUIMICA DE LAS GRASAS Y ACEITES................................................................................ 142
5.9. SULFORREDUCCIN Y SULFATACIN...................................................................................... 144
5.9.1. SULFORREDUCCIN................................................................................................................ 145
5.9.2. SULFATACIN. ......................................................................................................................... 147







Captulo 5. INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA


El campo de la ingeniera ambiental ha desarrollado los procesos de tratamiento de
efluentes con una gran cobertura en procesos biolgicos que utilizan microorganismos para
descomponer las grandes molculas orgnicas que conforman los seres vivos, en molculas
ms pequeas que puedan ser fcilmente retiradas del vertimiento. Estos tratamientos se
basan en las reacciones qumicas que los microorganismos realizan en su metabolismo y
por esta razn se plantea este capitulo que introduce las bases elementales de la
bioqumica, de los microorganismos y de su accin. Tambin los microorganismos actan
en la naturaleza y manejan reacciones que pueden llegar a producir contaminaciones de
aguas y fenmenos de fsicos que cambian los compuestos inorgnicos para producir su
energa estableciendo de paso los ciclos de cada elemento de acuerdo a su interaccin
natural.

5.1. CLASIFICACIN GENERAL DE LOS MICROORGANISMOS

Para entender mejor las reacciones bioqumicas es importante tener en cuenta la accin de
los microorganismos y su metabolismo que hace posible las degradaciones de los
compuestos orgnicos presentes en el agua. La bioqumica esta de la mano de la
microbiologa y su desarrollo es complementario.

CLASIFICACIN GENERAL
(12)
:
Grupo estructura celular caracterizacin miembros representativos
Eucariticos eucaritica multicelular. gran plantas y animales
Diferencia entre clulas
Tejidos.

Unicelular. Sin diferen- algas, hongos, protozoos
ciacin o muy poca de tejidos.

Eubacterias procariticos qumica celular. Parecidos La mayora de las Bacterias
sin membrana nuclear a las eucarioticos.

Arqueobacterias procarioticas qumica celular distinta metanogenicas, halofilos,
122
Termoacidofilos.

Las clulas de los organismos mayores estn recubiertas por membranas celulares
compuestas por protenas y lpidos, protegen a la clula de materiales txicos. El
citoplasma contiene protenas y cidos nucleicos principalmente, las protenas son
sintetizadas en el ribosoma celular, el ncleo de la clula es el centro de control de los
procesos, contiene el ADN.

Los procesos de metabolismo energtico se llevan a cabo en la mitocondria donde
carbohidratos protenas y grasas son metabolizados para obtener dixido de carbono, agua
y energa. El mejor ejemplo de respiracin celular es la oxidacin de la glucosa:

C
6
H
12
O
6
+6O
2
6CO
2
+ 6H
2
O +energa

A diferencia de las clulas de los animales, las clulas vegetales tienen pared celular
compuesta de celulosa que le da la rigidez y la fortaleza a la planta. Las clulas que
manejan la fotosntesis contienen cloroplastos que absorben energa de la luz para
convertirla en energa qumica (alimento), parte de este alimento se almacena como
almidn.

Las clulas vegetales que utilizan la luz del sol como fuente de energa y el dixido de
carbono como una fuente de Carbono, son llamadas autotrofas y siguen bsicamente la
reaccin:
6CO
2
+6H
2
O +luz solar C
6
H
12
O
6
+6O
2

para producir azcares con alto contenido de energa. Estos azcares pueden convertirse en
almidn insoluble en agua, celulosa para la pared celular y otros materiales y sirve como
fuente de energa bsica para el resto de los procesos de la planta.

Las clulas animales pueden depender de materiales orgnicos manufacturados por las
plantas y de sus alimentos. Estas clulas son llamadas heterotrofas, ellas actan como
123
medio en la reaccin qumica entre el oxgeno y el material alimenticio utilizando la
energa de la reaccin para desarrollar sus procesos biolgicos.

Los mayores reactivos biolgicos son protenas, carbohidratos y lpidos y el catalizador de
las reacciones bioqumicas se denomina enzima.

Estructura tpica de microorganismos celulares: a) eucariotico b) procariotico.
(12)

124
5.2. METABOLISMO MICROBIANO
Los microorganismos desarrollan actividades qumicas en forma organizada a travs de las
clulas que comprenden la produccin y utilizacin de energa, proceso que se conoce con
el nombre de metabolismo.

La bioenergtica estudia las formas de producir y consumir energa por parte de las clulas.
Gran cantidad de clulas obtienen energa atravs de una serie de reacciones qumicas que
liberan energa. Otras utilizan la luz como fuente energtica pero, deben convertirla a
energa qumica para poder utilizarla.

Para estudiar los distintos procesos metablicos se debe partir del concepto deenerga libre
G o sea la cantidad de energa liberada o consumida durante el desarrollo de una
reaccin qumica; teniendo en cuenta que la energa til es el cambio en energa libre.

Una reaccin es endergnica cuando requiere energa y G es positiva, y una reaccin es
exergnica cuando libera energa siendo G negativa.

G se relaciona con la constante de equilibrio de la reaccin, as:
G a 25C y 1 atm. = - R T Ln Keq.
Donde R=constante de los gases y T=temperatura absoluta

La energa puede obtenerse de una reaccin qumica en la forma de potencial elctrico. La
energa elctrica es generada cuando la oxidacin ocurre por remocin de electrones; se
produce energa cuando los electrones caen atravs de una diferencia de potencial.
G = - n F E
Siendo n =nmero de electrones transferidos, F=constante de Faraday y
E=diferencia de potencial de oxido-reduccin estndar.

Para la vida es esencial que la energa liberada de una reaccin exergnica sea usada para
efectuar las reacciones endergnicas. Este acoplamiento de reacciones se basa en el
125
principio de un reactante comn. Los reactantes comunes son muy tiles a las clulas y se
denominan compuestos de transferencia de alta energa. Entre los principales estn: el
ATP adenosin trifosfato; el GTP guanosintrifosfato; el UTP uridintrifosfato; el CTP o
citidintrifosfato; el cido fosfoenol pirvico y el acetil fosfato.
Por ejemplo para el ATP
(1)
:


ATP +H
2
O ADP +H
3
PO
4
G =-7,3 Kcal/mol
ADP +H
2
O AMP +H
3
PO
4
G =-7,3 Kcal/mol
AMP +H
2
O ADENOSINA +H
3
PO
4
G =- 2 Kcal/mol

Los procesos metablicos comprenden la oxidacin: o sea la remocin de electrones o de
tomos de hidrogeno, con ayuda de la coenzima A, la cual es reducida y convertida en
NADH; y la Fosforilacin oxidativa o sea cuando los electrones son transferidos del
NADH atravs de una serie de reacciones utilizando coenzimas, hasta el aceptor final de
electrones.

Durante estas transferencias una parte de la energa disponible es transferida al ADP
(adenosin difosfato), y otra parte se pierde como calor, debido a una transferencia
ineficiente.

126
Parte del ATP puede formarse directamente en las transformaciones orgnicas, como en la
transformacin de glucosa en piruvato.

El nitrato puede utilizarse como aceptor final de electrones por organismos facultativos que
viven en condiciones intermedias entre aerobias y anaerobias, llamadas anoxicas, las cuales
se caracterizan por producir finalmente CO
2
, H
2
O y Nitrgeno gaseoso y no producen
metano, dixido de carbono y cido sulfhdrico como en condiciones anaerobias.

La oxidacin es la prdida de electrones y la reduccin la ganancia de los mismos, muchas
reacciones de oxidacin son deshidrogenaciones. La oxidacin incluye la transferencia de
electrones por una sustancia reducida denominada donador de electrones a una sustancia
oxidada llamada aceptor de electrones.

Pueden ser donadores de electrones: los alimentos, el amoniaco NH
3
, el cido sulfhdrico
H
2
S, el Hidrogeno H
2
y el Hierro ionico Fe.

La materia orgnica es utilizada como alimento por las bacterias y los hongos como lo
hacen los animales mayores. Sinembargo algunas bacterias utilizan materia inorgnica
reducida, como fuente de energa.

Se llaman heterotrofas las que necesitan oxidar materia orgnica como fuente de energa y
autotrofas (capaces de mantenerse a s mismas) las que oxidan materia inorgnica que
toman del medio como Nitrgeno, Azufre, Fsforo, dixido de carbono e Hidrgeno.

La energa es transferida del donador de electrones al organismo por una serie de
reacciones enzimticas, para sntesis y mantenimiento.

ADP +fosfato +energa ATP +H
2
O



127









OXIDACIN BIOLGICA



El ADP utiliza la energa liberada en la oxidacin para formar un enlace con fosfato y
formar otro nucletido: ATP que viaja atravs de la clula y entrega esa energa.

Aceptor de e-
Donador de
CO2
ENERGA
Productos finales
CLULAS
128
En la respiracin aerobia el aceptor final de electrones es el oxgeno, en la anaerobia, el
aceptor final puede ser uno de los siguientes compuestos: fumarato, NO
3
-
, SO
4
-2
el CO
3
-2
.
En la fermentacin, el aceptor final de electrones es un compuesto orgnico.

En la transferencia de energa el ATP desempea el papel de unidad de cambio, similar al
de una moneda, y por lo tanto el nmero de molculas de ATP que se forman constituye el
factor crucial de la reaccin productora de energa.

Por medio de los procesos de fermentacin, una molcula de glucosa da lugar a dos de
ATP, y en cambio en el proceso de respiracin se forman 38 molculas de ATP.

GLUCOLISIS
Condiciones aerobias:
GLUCOSA Ferm METABOLITOS INTERMEDIOS resp. O2 CO2 +H2O
Piruvato

Condiciones anaerobias
Glucosa a. pirvico productos de fermentacin

C6H12O6 +2NAD +2ATP + 2Pi 2CH3COCOOH +2NADH + 2ATP
Glucosa fsforos cido pirvico
inorgnicos

Parte del ATP puede formarse directamente en las transformaciones orgnicas, como en la
transformacin de glucosa en piruvato.

El nitrato puede utilizarse como aceptor final de electrones por organismos facultativos que
viven en condiciones intermedias entre aerobias y anaerobias, llamadas anoxicas, las cuales
se caracterizan por producir finalmente CO2, H2O y Nitrgeno gaseoso y no producen
metano, dixido de carbono y cido sulfhdrico como en condiciones anaerobias.

Las reacciones balanceadas para estas oxidaciones y reducciones pueden ser obtenidas por
combinacin de las reacciones medias de la siguiente tabla tomada de Sawyer:
129
# Reaccin media Go (W)
Kcal/e equ.

Reacciones para sntesis celular (Rc)
Amonio como fuente de nitrgeno
1. 1/5 CO
2
+1/20 HCO
3
-
+1/20 NH
4
+
+e =1/20 C
5
H
7
O
2
N +9/20 H
2
O
nitrato como fuente de nitrgeno
2. 1/28 NO
3
- +5/28 CO
2
+29/28 H+ +e =1/28 C
5
H
7
O
2
N +11/28 H
2
O
reacciones para aceptores de electrones (Ra)
Oxigeno
3. O
2
+ H+ +e = 1/2 H
2
O -18.675
nitrato
4. 1/5 NO
3
-
+ 6/5 H
+
+e =1/10 N
2
+3/5 H
2
O -17.128
sulfato
5. 1/8 SO
4
-2
+ 19/18 H
+
+e =1/16 H
2
S +1/16 HS
-
+1/2 H
2
O 5.085
dixido de carbono (fermentacin metanognica)
6. 1/8 CO
2
+ H
+
+e =1/8 CH
4
+1/4 H
2
O 5.763
reacciones para donador de electrones (Rd)
donadores orgnicos(reacciones heterotroficas)
residuos domsticos
7. 9/50 CO
2
+1/50 NH
4
+
+1/50 HCO
3
-
+e =1/50 C
10
H
19
O
3
N +9/25 H
2
O 7.6
protenas (aminocidos, protenas, nitrgeno orgnico)
8. 6/33 CO
2
+H
+
+e =1/66 C
16
H
24
O
5
N
4
+27/66 H
2
O 7.7
carbohidratos (celulosa, almidn, azucares)
9. CO
2
+H
+
+e =CH
2
O +1/4 H
2
O 10.0
lpidos (grasas y aceites)
10. 4/23 CO
2
+ H
+
+e =1/46 C
8
H
16
O +15/46 H
2
O 6.6
acetato
11. 1/8 CO
2
+1/8 HCO
3
-
+H
+
+e =1/8 CH
3
COO
-
+3/8 H
2
O 6.609
etanol
12. 1/6 CO
2
+ H
+
+e =1/12 CH
3
CH
2
OH +1/4 H
2
O 7.592
piruvato
13. 1/5 CO
2
+1/10 HCO
3
-
+ H
+
+e =1/10 CH
3
CoCOO
-
+2/5 H
2
O 8.545
metanol
14. 1/6 CO
2
+ H
+
+e =1/6 CH
3
OH +1/6 H
2
O 8.965
donadores inorgnicos (reacciones autotrofcas)
15. Fe
+3
+ e =Fe
+2
-17.780
16. 1/2 NO
3
-
+H
+
+ e =1/2 NO
2
-
+ 1/2 H
2
O -9.43
130
17. 1/8 NO
3
-
+5/4 H
+
+ e =1/8 NH
4
+
+ 3/8 H
2
O -8.245
18. 1/6 NO
2
-
+4/3 H
+
+ e =1/6 NH
4
+
+1/3 H
2
O -7.852
19. 1/6 SO
4
-2
+4/3 H
+
+ e =16 S +2/3 H
2
O 4.657
20. 1/8 SO
4
-2
+19/16 H
+
+e =1/16 H
2
S +1/16 HS
-
+ 1/2 H
2
O 5.085
21. 1/4 SO
4
-2
+ 5/4 H
+
+ e =1/8 S
2
O
3
-2
+5/8 H
2
O 5.091
22. H
+
+e =1/2 H
2
9.670
23. 1/2 SO
4
-2
+ H
+
+e =1/2 SO
3
-2
+ 1/2 H
2
O 10.595
tanto los reactivos como los productos tienen una actividad unitaria excepto el Hidrogeno =10-7. ( )

por ejemplo se pueden plantear las diferentes reacciones que desarrolla el acetato de etilo
en diferentes condiciones para conocer los niveles de energa intercambiados en cada
proceso, as:
Reacciones para el acetato:
Aerobias:
1/8
CH
3
COO
-
+
1/4
O
2

1/8
CO
2
+
1/8
HCO
3

-
+
1/8
H
2
O
G =-25,28 Kcal/mol
anoxicas:
1/8
CH
3
COO
-
+
1/5
NO
3
-
+
1/5
H
+

1/8
CO
2
+
1/8
HCCO
3
-
+
1/10
N
2
+
9/40
H
2
O
G =- 23,74 Kcal/mol.
Anaerobias:
1/8
CH
3
COO
-
+
1/8
H
2
O
1/8
CH
4
+
1/8
HCO
3
-
G =- 0,85 Kcal/mol
1/8
CH
3
COO
-
+
1/8
SO
4
-2
+
3/16
H
+

1/8
CO
2
+
1/8
HCO
3
-
+
1/16
H
2
S+
1/16
HS
-
+
1/8
H
2
O
G =-1,52 Kcal/mol.

La energa libre estndar encontrada en cada reaccin para el acetato indica que se obtiene
mas energa en los procesos de crecimiento biolgico aerobio y anxico que en las
reacciones anaerobias.

En el diseo de sistemas biolgicos para tratamiento de aguas residuales el ingeniero
necesita conocer todas las transformaciones que tienen lugar, por ejemplo qu parte del
donador de electrones podra convertirse en energa y as, determinar la cantidad de
oxgeno, nitratos o sulfatos que se necesiten o tambin la cantidad de metano que se
131
producir. Para adicionar el nitrgeno y el fsforo se requiere conocer la cantidad de
material celular o sea que se necesita realizar un balance de materia del sistema.

Las reacciones qumicas balanceadas para toda la conversin biolgica pueden ayudar en la
realizacin de este balance y se puede considerar que la transformacin total incluye una
parte para sntesis celular, otra para el donador de electrones y otra para el aceptor de
electrones, se puede calcular a partir de las reacciones pertinentes y la relacin siguiente:

R =Fs Rc + fe Re - Rd fe +Fs =1

Donde el subndice s se refiere a la sntesis de material celular
El subndice indica la energa en los cambios para el aceptor de electrones
Y el subndice d para el donador de electrones.

Rc representa las reacciones medias para sntesis de clulas bacteriales y podra ser la
primera o segunda reaccin de la tabla anterior.

Los valores de Fs(max) pueden utilizarse a partir de la siguiente tabla presentada por
Sawyer
(1 )
:
Donador de electrones aceptor de electrones Fs(max)
Reacciones heterotroficas:
Carbohidratos O2 0.72
NO3- 0.6
SO4-2 0.3
CO2 0.28
Protenas O2 0.64
CO2 0.08
Acidos grasos O2 0.59
SO4-2 0.06
CO2 0.05
Metanol NO3- 0.36
CO2 0.15
Reacciones autotroficas:
S O2 0.21
S2O3-2 O2 0.21
NO3- 0.20
NH4+ O2 0.10
H2 O2 0.24
CO2 0.04
Fe+2 O2 0.07

132
Como ejemplo de la utilizacin de las reacciones medias en los balances podemos
encontrar la ecuacin balanceada para la fermentacin de glucosa a etanol, asumiendo que
el amonio esta presente como nutrientes y que fs es igual a 0.15:
Fe =0.85 para Rc tomamos la reaccin 1; Para Rd la reaccin 9 y para Re la reaccin
12
Fs Rc : 0.15 R1
0.03 CO
2
+0.0075 HCO
3
-
+0.0075 NH
4
+
+0.15 H
+
+0.15 e =0.0075 C
5
H
7
O
2
N +0.675 H
2
O
feRe : 0.85R9
0.142 CO
2
+0.85 H
+
+0.85 e =0.0708 CH
3
CH
2
OH +0.2125 H
2
O
-Rd (+inverso de R12)
0.25 CH
2
O +0.25 H
2
=0.25 CO
2
+H
+
+e
________________________________________________________________________________
reaccin final:
0.25 CH
2
O +0.0075HCO
3
-
+0.0075 NH
4
+
=0.0708 CH
3
CH
2
OH +0.0075 C
5
H
7
O
2
N
+0.078 CO
2
+0.03 H
2
O

Con base en esta reaccin se pueden realizar los balances de materia y calcular los
requerimientos de nutrientes que deben adicionarse al reactor para que las bacterias puedan
desarrollar estas transformaciones.








133
5.3. FUNDAMENTOS DE BIOQUIMICA
La bioqumica trata de los cambios realizados en los organismos vivos. Las molculas
orgnicas que contienen carbono forman los componentes esenciales de todo organismo
vivo. Los tomos de carbono establecen uniones fuertes con Hidrogeno, Oxigeno,
Nitrgeno y otros tomos de Carbono. Estos tomos constituyen el 99% de la masa de los
organismos vivos.

La composicin de los microorganismos presenta cuatro clases principales de compuestos:
carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos.

CARBOHIDRATOS: Cn(H2O)n. Azucares simples. Son polihidroxialdehidos o
polihidroxicetonas. Los monosacaridos forman enlaces glucosdicos para formar
polisacaridos y se unen con otros elementos como el fsforo con enlaces esterfosfatados.

LIPIDOS: Insolubles en agua y solubles en compuestos no polares como cloroformo.
Componen las membranas bioqumicas formando barreras semipermeables.
Lpidos complejos: cidos grasos ligados a un alcohol (triglicrido).
Lpidos simples: esteroides.
Los fosfolpidos se ubican en las membranas biolgicas.

PROTEINAS: Grandes macromolculas que van de 6.000 a varios millones de peso
molecular.
Estn compuestas de aminocidos unidos por enlaces peptidicos (grupo carboxilico de un
aminocido unido a un grupo amino de otro aminocido).
Su funcin ms importante es la de servir de enzimas.

ACIDOS NUCLEICOS: Grandes macromolculas compuestas de nucleotidos.

Las reacciones bioqumicas entre estas molculas son esenciales para el metabolismo, el
desarrollo y la reproduccin microbiana.
134

Las reacciones pueden ser extracelulares o intracelulares. Las hidroliticas son generalmente
extracelulares. Ellas reducen los compuestos orgnicos complejos hasta un tamao que
permita atravesar la pared celular (membranas).

Las reacciones de oxidacin ocurren dentro de la clula y producen energa de acuerdo a la
energa libre de la reaccion particular.

Las reacciones bioqumicas ocurren entre 0 y 60 C de temperatura y se denominan as:
Psicrofilicas de 0 a 10 C
Mesofilicas de 10 a 40 C
Termofilicas cuando ocurren a una temperatura mayor de 40 C.

La clula debe ser capaz de tomar los nutrientes externos a ella, degradarlos para obtener
energa y obtener los precursores necesarios para la sntesis de nuevo material celular.

Estos cambios pueden lograrse por la actividad de las enzimas que son sustancias que se
hallan presentes en muy pequeas cantidades al interior de la clula. Son catalizadores
sensibles a la temperatura, de naturaleza orgnica, elaboradas por las clulas vivas y
capaces de una accin interna o externa a ellas.

5.3.1. Caractersticas de las enzimas
1. Aceleran la reaccin.
2. No afectan el equilibrio de la reaccin reversible.
3. Son especificas para determinada reaccin.
4. Son compuestos orgnicos producidos por los organismos vivos.
5. Pueden actuar al interior de la clula intracelulares-endoenzimas o al exterior
extracelulares-exoenzimas.
6. Estn determinadas por las condiciones ambientales de la clula y por su constitucin
gentica.
135
5.3.2. Propiedades de las enzimas.
Son protenas o protenas combinadas con otros grupos.
1. Son desnaturalizadas por el calor.
2. Se precipitan en etanol o en altas concentraciones de sales inorgnicas.
3. No son dializables.

5.3.3. Mecanismos de la accin enzimtica.

ENZIMA E + SUSTRATO S ENZIMA-SUSTRATO ES PRODUCTO P+ENZIMA E

Este proceso se repite hasta consumir todas las molculas de sustrato. La principal funcin
de una enzima es disminuir la energa de activacin.
Energa de activacin: cantidad de energa requerida para llevar una sustancia al estado
reactivo.

La enzima se combina con el sustrato para producir un estado de transicin que requiere
una energa de activacin menor para que la reaccin se efecte.

Nivel de energa

Estado de transicin











Progreso de la reaccin.



Estado de transicin
Estado inicial
reactantes
Estado final
productos
Sin
Enzi.
Con E
136
La actividad enzimtica esta afectada por:

1. La concentracin de la enzima.
2. Concentracin del sustrato
3. pH
4. La temperatura.



Formacin de productos Velocidad de reaccin

Con 2X vel. mxima




Con X 1/2Vmax.



Sin enzima

T i e m p o concentracin de sustrato


Actividad de la enzima Actividad de la enzima











2 4 6 8 10 12 14 10 20 30 40 50 60
pH temperatura


Cada enzima tiene un rango de pH donde trabaja bien. La mayora trabaja a pH neutro. La
rata de reaccin se duplica al incrementar 10C la temperatura. La temp. Influye en el
tiempo de retencin, en las necesidades de oxigeno y en la solubilidad del O
2
.
137
5.3.4. Clases principales de enzimas

1. OXIDOREDUCTASAS Reacciones de transferencia de electrones o tomos de
hidrogeno.

2. TRANSFERASAS Transfieren grupos funcionales.
3. HIDROLASAS Reacciones hidroliticas (+agua para romper enlaces)
4. LIASAS Formacin de dobles enlaces y remocin de grupos
qumicos por reacciones no hidroliticas.
5. ISOMERAZAS Reacciones de isomerizacin.
6. LIGASAS Formacin de enlaces con el consumo de ATP.


5.4. C O F A C T O R E S
Algunas enzimas requieren un agente para actuar que no tiene estructura protenica y que es
llamado cofactor. Los cofactores pueden ser iones metlicos o complejos orgnicos
llamados coenzimas. Algunas veces se necesitan ambos factores para la actuacin de las
enzimas.

Los cofactores metlicos ms comunes son: Zn, Mg, Mn, Fe, Ca, P, Na. Son estables con
la temperatura.

Se conocen doce coenzimas, entre ellas estn:
NAD transfiere tomos de hidrogeno o electrones y participa en la oxidacin de materia
orgnica.
NADP tiene tres tomos de fsforo en vez de dos que tiene el NAD.
COENZIMA A trabaja en la sntesis y metabolismo de los cidos grasos.
Una parte integral de una coenzima es una vitamina.

138
5.5. TRAZAS Y ELEMENTOS MAYORES
Las bacterias son los organismos vivos ms simples, su tejido celular tiene una formula
emprica aproximada a C5H7NO2 donde el nitrgeno es cerca del 12 %. Se conocen por su
capacidad de sintetizar protenas a partir de materia orgnica. Requieren nitrgeno para su
reproduccin y fsforo y azufre para la formacin de algunas protenas conjugadas, por esto
el nitrgeno el fsforo y el azufre se consideran nutrientes mayores.

Para el metabolismo de las bacterias se necesitan trazas de otros elementos como: calcio,
cobalto, cobre, hierro, magnesio, manganeso, potasio, selenio y zinc.
Las bacterias que fijan nitrgeno requieren Molibdeno.

Las aguas residuales domesticas (ARD) proveen todos los elementos que necesitan las
bacterias para su estabilizacin, lo que no ocurre con las aguas residuales industriales, a las
que se debe agregar nitrgeno y fsforo para realizar tratamientos biolgicos que reduzcan
la materia orgnica polutante.


5.6. BIOQUIMICA DE LOS CARBOHIDRATOS
Los carbohidratos sirven como fuente de energa en animales mayores y en los
microorganismos pueden ser utilizados, adems, para sintetizar grasas y protenas.

Se usan para construir el tejido celular y pueden almacenarse como polisacaridos dentro o
fuera de la clula. El mecanismo es el mismo que en las plantas y los animales mayores.

La primera etapa es la hidrlisis, la cual se puede resumir en el siguiente cuadro:



139




Su degradacin puede progresar hasta llegar a la etapa de los Disacaridos antes de salir de
la clula. En la pared, el azcar simple puede usarse para sntesis o produccin de energa.

La va por la cual las bacterias metabolizan el azcar en energa depende de si las
condiciones son aerobias o anaerobias. En cada caso, la conversin inicial es a cido
pirvico, as:

=O
C
6
H
12
O
6
bacterias 2CH
3
C-COOH +4H
enzimas cido pirvico



Condiciones aerobias:


cido pirvico +4H + 6O
2
bacterias 6CO
2
+ 6H
2
O

Enzimas
O x i d a c i n


140
En condiciones anaerobias, esta oxidacin es posible y las bacterias descargan diferentes
productos en la solucin, de acuerdo a las bacterias y a las condiciones en que se realizan
las reacciones.

Pueden ocurrir los siguientes casos:
-OH
2CH
3
C-COOH

cido pirvico + 4H CH
3
CH
2
COOH +CH
3
COOH + HCOOH

2CH
3
CH
2
OH +2CO
2


Que la oxidacin produzca cidos, alcoholes o cetonas con la intervencin de enzimas y
bacterias en cada caso.

Los cidos disminuyen el pH y pueden llegar a terminar la actividad biolgica en
condiciones aerobias.


5.7. BIOQUIMICA DE LAS PROTEINAS
Son esenciales en las dietas de animales mayores, se usan en la construccin del tejido
celular. Si se consumen en mayor cantidad se usan para producir energa o convertirse a
carbohidratos y grasas.

Las bacterias saprofiticas (spapros =muerte; phytos =planta) requieren menos protenas,
las sintetizan del nitrgeno orgnico y de materia orgnica no proteica, como carbohidratos,
grasas y alcoholes. Caracterstica importante en el tratamiento de residuos lquidos de las
industrias de alimentos, que son bajos en protenas.

La primera etapa en la utilizacin biolgica de las protenas es la hidrlisis, que se
desarrolla en etapas, as:

protenas peptonas polipeptidos +dipeptidos - aminocidos
141

se producen - aminocidos antes de atravesar la pared de la clula.


Deaminacin:

En condiciones aerobias:

NH
2
R- C - COOH + O
2
bac +enzimas R - COOH +CO
2
+ NH
3
(cidos saturados)
H

O:

NH
2
OH
R - C - COOH +H
2
O bac +enzimas R - C - COOH +NH
3
(cidos hidroxilicos)
H H

En condiciones anaerobias:

NH
2
R - C - COOH + H
2
bac +enzimas R - CH
2
COOOH + NH
3
(cidos saturados)
H

O:
NH
2
R - CH
2
- C - COOH bac +enzimas R - CH =CH - COOH + NH
3
(. Insaturados)
H




5.8. BIOQUIMICA DE LAS GRASAS Y ACEITES

La degradacin o asimilacin de la materia grasa es afectada por su insolubilidad, en los
animales mayores la bilis secretada por el hgado las emulsiona, pero esto no lo pueden
realizar las bacterias. Las grasas al tener menor densidad que el agua flotan y complican los
tratamientos con lodos activados.

La degradacin de las grasas se inicia con la hidrlisis produciendo glicerol y cidos
grasos; luego viene la oxidacin, que se realiza por -oxidacin, teora de Knoop, en etapas
activadas por la coenzima A.
b. y e. OH b y e
R - C - C - COOH -2H + H
2
O R - C - C - COOH -2H
142


=O
R - C - C - COOH + H2O R - COOH + CH
3
COOH


La ruptura de las molculas se da en la etapa final con la formacin de una molcula de
cido actico y un nuevo cido con dos carbonos menos que sigue la -oxidacin hasta
cido actico.

Se remueven cuatro hidrgenos por cada molcula de cido actico producido, los cuales
se oxidan para formar agua en condiciones aerobias as:

4H + O
2
2 H
2
O

en condiciones anaerobias, esto no es posible, se sigue otro procedimiento general.




























143
5.9. SULFORREDUCCIN Y SULFATACIN
El azufre existe en gran variedad de estados como producto de la oxidacin de los
compuestos orgnicos e inorgnicos y las reacciones de oxidorreduccin mediadas por
microorganismos, las que cambian los estados de oxidacin del azufre presente en varios
compuestos y establecen el ciclo del azufre.


Lazo inorgnico lazo orgnico


oxidaciones sulfatasas
quimiolitotro- Asimilacin del sulfato esterificacin
ficas Sulfato esteres sulfato
oxidacin
sulfito desasimilacin
reductora
tiosulfato del sulfato . Sulfonicos asimilacin del sulfato
oxidacin
azufre elemental
oxidacin asimilacin sulfdica
sulfdica por
fotosntesis cido sulfhdrico desulfuracin tioles




Algunos microorganismos son capaces de remover azufre de los compuestos orgnicos:
Bajo condiciones de aerobiosis la remocin del azufre o desulfuracin de los compuestos
orgnicos origina formacin de sulfatos. Sulfatacin.
Bajo condiciones de anaerobiosis se produce normalmente cido sulfhdrico a partir de la
mineralizacin de los compuestos orgnicos sulfurados. Sulfo reduccin.

SO
4
-2
SO
3
2
S
2
O
3
2
S
0
H
2
S
PAPS
R-OSO
3
H
R-SO
3
H
R-SH
144
5.9.1. SULFORREDUCCIN
Se puede formar cido sulfhdrico por medio de las bacterias reductoras de sulfatos que lo
utilizan como aceptor final de electrones durante la respiracin anaerobia.
Las bacterias del genero sulfobivrio son ejemplo de este proceso que puede encontrarse en
los sedimentos marinos ricos en sulfatos y se muestra tambin en los procesos de corrosin.

El anin sulfato es muy estable qumicamente y su reduccin no tiene lugar
espontneamente en la naturaleza sino bajo condiciones ambientales normales. La
reduccin de sulfato a sulfuro se efecta mediante diversos estados de oxidacin
intermedios de los cuales el sulfito ha sido identificado con toda seguridad.

El paso inicial en la reduccin del sulfato implica la activacin del anin sulfato con ATP
dando lugar a la formacin del Adenosil fosfosulfato (APS) y esta activacin es la reaccin
biolgica fundamental para la sulforreduccin. Una vez activado se efecta fcilmente la
reduccin a sulfito mediante el NAD reducido. El sulfito por s mismo es mucho mas
fcilmente reducido que el sulfato, llevndose a cabo esta reaccin qumicamente o por
diversas bacterias. Otros estados de oxidacin intermedia del azufre, el tiosulfato y el
tetrationato, pueden ser intermediarios en la reduccin desasimiladora del sulfato, aunque
se ignoran los detalles.

Otro caso de sulforreduccin lo presentan las bacterias del gnero cromatium cuando se
colocan en la oscuridad, el azufre elemental almacenado dentro de sus clulas les puede
servir como un aceptor de electrones siendo reducido a sulfuro. Los electrones provienen de
un producto de almacenamiento, el glucgeno. Las bacterias almacenan tanto su aceptor de
electrones, azufre elemental, como su donador de electrones, el glucgeno, en forma de
polmeros intracelulares.

Una reaccin efectuada por muchas bacterias reductoras es la reduccin del sulfato con el
lactato como donador de electrones, donde dos moles de carbono orgnico son necesarias
para reducir un mol de sulfato a sulfuro.

145
Esta situacin es impactante en sedimentos marinos donde la cantidad de reduccin del
sulfato puede ser aumentada notablemente por la adicin de materia orgnica, dando lugar a
un aspecto importante en contaminacin marina porque todos los desechos de aguas negras,
lodos de drenaje y basura que llegan al ocano aumentan la materia orgnica en los
sedimentos generando una excesiva formacin de cido sulfhdrico que es potencialmente
txico para muchos microorganismos.

Un factor importante en la determinacin del destino y la incidencia del HS- ambiental, es
la disponibilidad de hierro y metales pesados en el medio, ya que la mayora de los metales
forman sulfuros altamente insolubles, de forma espontnea. El hierro es comn en todos los
sedimentos y por tanto la reduccin del sulfato casi siempre dar lugar a la formacin del
sulfuro de hierro, de color negro caracterstico de las aguas donde se han efectuado
procedimientos anaerobios. Si estn presentes metales pesados, por ejemplo cobre o
mercurio, tambin son precipitados como sulfuros y slo cuando se han agotado estas
fuentes se iniciara la formacin de H2S libre.

Como consecuencia de la reduccin bacteriana del sulfato se han formado cierta cantidad
de depsitos de minerales econmicamente importantes. Los depsitos de sulfuro mineral
biognicos se encuentran caractersticamente en capas delgadas estratiformes en asociacin
con otras rocas sedimentarias por ejemplo pizarra. Deben diferenciarse los depsitos de
sulfuro mineral de origen volcnico de los de origen hidrotermal que no son estratificados y
que estn asociados con la actividad volcnica en el rea inmediata. Depsitos de mineral
de sulfuro estratiforme fsicamente biognicos son aquellos del monte Isa en Australia y del
norte de Rodhesia en Africa.

Tambin presentan reduccin de azufre la echericha coli por reduccin asimilatoria del
sulfato hasta azufre elemental y la proteus que reduce el azufre orgnico a sulfuro en
procesos de putrefaccin y desulfuracin.
Todas las bacterias sulforreductoras son anaerobias obligadas.


146
5.9.2. SULFATACIN.
La sulfatacin o la oxidacin hasta sulfatos de especies reducidas de azufre como el H2S,
S, Tiosulfato, se realiza de acuerdo con la cantidad de Oxgeno y su relacin con el azufre,
de la concentracin de sulfuros y la presencia de metales como catalizadores pudiendo
detenerse en compuestos intermedios.

Este proceso es importante en la generacin de ATP de los microorganismos autotroficos,
una parte de los cuales, los quimiautotroficos o quimiolitotroficos, usan la energa derivada
de la oxidacin de compuestos inorgnicos como el azufre para suministrar la energa
necesaria en la sntesis del ATP.

Se han cultivado solo cuatro gneros consistentemente thiobacilus, thiomicrospira,
thermothrix y sulfolobus asociados los dos ltimos a manantiales hidrotermales y
reservorios geotrmicos.

Pueden distinguirse dos amplias clases ecolgicas de bacterias oxidantes de azufre, las que
viven en pH neutro y las que viven en pH cido. Muchas de las formas que viven en pH
cido tienen la capacidad de crecer en forma litotrofica empleando hierro ferroso como
donador de electrones.

Thiobacilus. Este gnero contienen los bacilos gramnegativos con flagelo polar, que son
capaces de derivar su energa de la oxidacin del azufre elemental, sulfuros y tiosulfato.

La oxidacin de sulfuro y azufre requiere primero l reaccin de stas sustancias con los
grupos sulfhidrilos de la clula como glutacin con la formacin de un complejo sulfuro-
sulfhidrilo. El azufre luego se oxida a sulfito por la enzima sulfuro-oxidasa.

Existen dos formas en las que se pueden oxidar el sulfuro para producir enlaces de fosfato
de alta energa. En la primera se oxida a sulfato por un sulfito oxidasa ligada al citocromo,
con la formacin de ATP mediante la fosforilacin por transporte de electrones. Este ciclo
se presenta universalmente en los tiobacilos. En la segunda el sulfito reacciona con AMP,
147
dos electrones se eliminan y se forma el adenosin fosfosulfato APS. Los electrones
eliminados se transfieren al oxgeno por medio del sistema citocromo, originando enlaces
fosfato de alta energa mediante la fosforilacin a nivel de sustrato, el APS reacciona con
fsforo y se convierte en ADP y sulfato.

El tiosulfato (S2O3
-2
) que puede verse como un sulfuro o un sulfito se desdobla en sulfuro
y sulfito. El sulfito se oxida a sulfato con la produccin de ATP y el otro tomo de azufre se
convierte en azufre elemental insoluble.
Otro gnero de organismos oxidantes de azufre es el sulfolobus. Los miembros de ste
gnero no son solo acidoflicos, sino tambin termoflicos. Crecen sobre el nivel de pH de 1
a 5 (ptimo de 2 a 3), y a un lmite de temperatura de 60 a 85C (ptimo de 70 a 80C).

Sulfolobus tiene una forma generalmente esfrica y produce distintos lbulos. Las clulas
se adhieren con fuerza a los cristales de azufre donde pueden visualizarse con microscopa
empleando tinciones fluorescentes. La membrana de los sulfolobulos no es de dos etapas de
fosfolpidos, sino una capa que consiste en una cadena de hidrocarbones larga, realmente
un isoprenoide, conectado a ambos extremos por enlace de ester, a residuos de glicerol.

El gnero thiomicrospira consta de dos especies, ambas son littrofos obligados, una de
ellas puede crecer en forma anaerbica con el nitrato como aceptor de electrones.

Los Thermotrix son bacterias pequeas en forma de espiral, filamentosas que habitan en
manantiales azufrosos calientes, con pH neutro o ligeramente cido. Los cultivos de
thermotrix crecen en forma aerbica y anaerbica, con nitrato como aceptor de electrones, a
temperaturas entre 55 y 85C.

Aunque el cido sulfhdrico es txico para muchos microorganismos, las bacterias
fotosintticas sulfricas lo utilizan como donador de electrones para generar coenzimas
reducidas durante su metabolismo. Algunas depositan azufre elemental y otras sulfatos
como producto de la oxidacin.

148
El drenaje en las minas es consecuencia del metabolismo de bacterias oxidantes del azufre
y del hierro. El carbn en los depsitos geolgicos, muchas veces se encuentra asociado
con piritas y cuando las actividades mineras de extraccin exponen el mineral con pirita al
oxgeno atmosfrico la combinacin de la autooxidacin con azufre microbiano y con la
oxidacin del hierro produce grandes cantidades de cido sulfrico como parte de la
recuperacin de las acciones minerales. El cido que drena de las minas destruye la vida
acutica y hace que el agua ya no sea adecuada como fuente para beber o para uso
recreativo.
149