La Bioinformtica es analizar experimentos biolgicos.

Es utilizar las herramientas

computacionales para experimentos biolgicos.
Programacin: el uso de lenguajes
Por qu hay tantos lenguajes? Porque se especializan a ciertas tareas.
El PERL tiene mucho tiempo en el rea biolgica.
Para realizar una tarea se pueden utilizar todos los lenguajes pero unos son ms factibles
para ciertas tareas que otros.
El usuario es tu persona dentro de la computadora y el acceso est limitado segn los
permisos.
Ejecutar Modificar Guardar
Genoma: Conjunto de toda la informacin gentica de un organismo.
- Procariota: tienen muy pocas partes no codificantes.
- Eucariota: tienen intrones y exones.
o Genoma humano: 3 mil 200 millones pares de bases.
o Genes: 22 a 23 mil en un humano.
Gen:
- Segmento de cidos nucleicos que codifica para algo difusible.
- Produce un mRNA (es una secuencia de RNA que puede ser traducido). Est
compuesto de:
o CDS: Seccin codificante. Es la que va ser leda de 3 en 3 (se llaman codones
y hay 64) y trae un tRNAs equivalente a ese codn integrando un
aminocido. No todos los organismos tienen los mismos tRNAs.
o UTR Unstranslated Region (Seccin no traducible) rodea el CDS en un
mensajero.
Los codones pueden repetirse y traducir al mismo aminocido. Esta
caracterstica hace decir que el cdigo gentico est degenerado.
Plsmido:
- Tiene una regin de replicacin
- Es una secuencia que contiene informacin til para el organismo que lo contiene.
Bases de datos
El NCBI (National Center for Biotechnology Information) es una interfaz para muchas bases
de datos (30 aproximadamente) de informacin biotecnolgica como cidos nucleicos
artculos cientficos.
Entrez: sistema que incluye un lenguaje y la informacin sobre la que trabaja. Acceso a
todas las bases de datos.
PubMed: Base de datos de artculos cientficos relacionados con el rea mdica. Tiene
guardados los artculos para redireccionar a los usuarios hacia ellos.
PubMed Center: base de datos de artculos cientficos gratuitos y completos.
*El archivo de FASTA no est en la base de datos, porque debe generarlo.
GeneBank: tiene entradas en formato GeneBank y est dividido en 3 partes: encabezado,
caractersticas (anotaciones) y origin.
Accession: nmero de identificacin de cada entrada de la base de datos.
(Accession.version)
// doble diagonal indica que ya termin el archivo.
Ontologies: trminos asociados (todo el gen en palabras individuales en las que est
involucrado).