El fenmeno se inicia en el Ocano Pacfico tropical, cerca de Australia e
Indonesia, alterndose con ello la presin atmosfrica en zonas muy distantes entre s, hay cambios en la direccin y en la velocidad de los vientos, as como el desplazamiento de las zonas de lluvia a la regin tropical. En condiciones normales, tambin llamadas condiciones No-Nio, los vientos Alisios (que soplan de este a oeste) apilan una gran cantidad de agua y calor en la parte occidental de este ocano. El nivel superficial del mar es, en consecuencia, aproximadamente medio metro ms alto en Indonesia que frente a las costas del Per y Ecuador. Adems, la diferencia en la temperatura superficial del mar es de alrededor de 8C entre ambas zonas del Pacfico.
Consecuencias para el sureste asitico Lluvias escasas. Enfriamiento del ocano. Baja formacin de nubes. Periodos muy secos. Alta presin atmosfrica. Consecuencias del fenmeno del nio para Amrica del Sur Lluvias intensas. Calentamiento de la Corriente de Humboldt o Corriente del Per. Prdidas pesqueras. Intensa formacin de nubes. Periodos muy hmedos. Baja presin atmosfrica. En nuestro pas el fenmeno de El Nio, ocasiona importantes cambios en el clima, provocando calentamiento del mar, condiciones de sequa en el centro de Mxico, lluvias intensas en secciones del pas e inviernos generalmente hmedos.