ENZIMAS

El diagrama de cintas de la enzima TIM, rodeado por el modelo de relleno de espacio de la

protena. La TIM es una enzima extremadamente eficiente envuelta en el proceso que convierte
azcar a energa en el cuerpo.
Las enzimas son protenas que catalizan reacciones qumicas. En estas reacciones, las
molculas en el comienzo del proceso son llamadas sustratos, y las enzimas las convierten en
diferentes molculas, llamadas productos. Casi todos los procesos en las clulas necesitan enzimas,
para que ocurran en tasas significativas.
Debido a que las enzimas son extremadamente selectivas con sus sustratos, el set de enzimas
hechas en una clula, determina el camino metablico que ocurre en cada clula.
Como todos los catalizadores, las enzimas funcionan disminuyendo la energa de activacin
(G

) para una reaccin, as se acelera dramticamente la tasa de la reaccin. La gran mayora de

las reacciones de las enzimas son millones de veces ms rpidas que las reacciones no catalizadas.
Al igual que ocurre con los catalizadores, las enzimas no son consumidas por las reacciones
que ellas catalizan, ni alteran su equilibrio qumico. Sin embargo, las enzimas difieren de otros
catalizadores por ser ms especficas. Las enzimas son conocidas por catalizar alrededor de 4.000
reacciones bioqumicas. No todos los catalizadores bioqumicos son protenas, pues algunas
molculas de ARN llamadas ribosomas, tambin catalizan reacciones.
La actividad de las enzimas puede ser afectada por otras molculas. Las inhibidoras son
molculas que disminuyen la actividad de las enzimas; mientras que las activadoras son molculas
que incrementan la actividad. Muchas drogas o pociones son enzimas inhibidoras. La actividad es
afectada la temperatura, el pH, y la concentracin del sustrato.
Algunas enzimas son usadas comercialmente, por ejemplo, en la sntesis de antibiticos.
Adems, algunos productos para hogares usan enzimas para acelerar las reacciones bioqumicas.

NDICE:

1.- Etimologa e historia
2.- Estructuras y mecanismos
3.- Aplicaciones industriales
4.- Cintica de las reacciones qumicas
5.- Velocidad de reaccin y equilibrio
5.1 Efecto de la temperatura sobre la velocidad de reaccin: Energa de activacin
6.- Catalizadores
7.- Enzimas: catalizadores biolgicos
8.- Nomenclatura y clasificacin
8.1 Clasificacin Internacional de las Enzimas
9.- Cofactores
9.1 Activadores Metlicos
10.- Cintica enzimtica
10.1 Principios generales
10.2 Cintica de las reacciones enzimticas
10.3 Centro activo de una enzima
10.4 Factores que influyen en la velocidad de las reacciones enzimticas
11.- Inhibicin Enzimtica
11.1 Inhibidores reversibles
11.2 Inhibidores irreversibles
11.3 Descubrimiento y diseo de inhibidores
11.4 Aplicaciones de los inhibidores
12.- Isoenzimas



1- ETIMOLOGA E HISTORIA



Edward Buchner


Desde finales del siglo XVIII y principios del siglo XIX, la digestin de la carne por las
secreciones del estmago, y la conversin del almidn a azcar por los extractos de plantas y la
saliva, ya eran conocidos. Sin embargo, el mecanismo por el cual esto ocurra no haba sido
identificado.
En el siglo XIX, cuando se estaba estudiando la fermentacin del azcar en alcohol en
levaduras, Louis Pasteur lleg a la conclusin que esta fermentacin era catalizada por una fuerza
vital contenida en las clulas de la levadura, llamadas fermentos, que se pens solo funcionaban con
organismos vivos. Escribi que "la fermentacin del alcohol es un acto relacionado con la vida y la
organizacin de las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las clulas".
En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne (18371900) acu el trmino enzima, que viene del
griego "en levadura", para describir este proceso. La palabra enzima fue usada despus para
referirse a sustancias inertes como el pepsin. Por otro lado, la palabra "fermento" sola referirse a la
actividad qumica producida por organismos vivientes.
En 1897 Edward Buchner comenz a estudiar la habilidad de los extractos de levadura para
fermentar azcar debido a la ausencia de clulas vivientes de levadura. En una serie de
experimentos en la Universidad Humboldt de Berln, encontr que el azcar era fermentada
inclusive cuando no haba elementos vivos en las clulas de las levaduras en la mezcla. Nombr la
enzima que caus la fermentacin de la sucrosa, zimasa. En 1907 recibi el Premio Nobel de
Qumica "por sus investigaciones bioqumicas y el haber descubierto la fermentacin libre de
clulas". Siguiendo el ejemplo de Buchner, las enzimas son usualmente nombradas de acuerdo a la
reaccin que producen. Tpicamente el sufijo "-asa" es agregado al nombre del sustrato (Por
ejemplo, la lactasa es la enzima que separa lactosa) o el tipo de reaccin (Por ejemplo, el DNA
polimerasa) forma polmeros de ADN.
Habiendo mostrado que las enzimas pueden funcionar afuera de una clula viva, el prximo
paso era determinar su naturaleza bioqumica.
En muchos de los trabajos iniciales se not que la actividad enzimtica estaba asociada con
protenas, pero algunos cientficos (como el Premio Nobel Richard Willsttter) argumentaban que
las protenas eran simplemente el transporte para las verdaderas enzimas y que las protenas per se
no eran capaces de realizar catlisis.
Sin embargo, en 1926, James B. Summer demostr que la enzima ureasa era una protena
pura y la cristaliz; Summer hizo lo mismo con la enzima caralase en 1937. La conclusin de que
las protenas puras podan ser enzimas fue definitivamente probada por John Howard Northrop y
Wendell Meredith Stanley, quienes trabajaron en las enzimas digestivas pepsin (1930), trypsin y
chymotrypsin. Estos tres cientficos recibieron el Premio Nobel de Qumica en 1946.
El descubrimiento de que las enzimas podan ser cristalizadas eventualmente permita que sus
estructuras fuesen resueltas por una cristalografa de rayos X. Esto fue hecho primero por la
lisozima, una enzima encontrada en las lgrimas, la saliva y los huevos blancos que digieren la capa
de algunas bacterias; la estructura fue resuelta por un grupo liderado por David Chilton Phillips y
publicada en 1965. Esta estructura de alta resolucin de lisozimas marc el comienzo del campo de
la biologa estructural y el esfuerzo por entender como las enzimas trabajan a un nivel anatmico de
detalles.






2- ESTRUCTURAS Y MECANISMOS


Diagrama de cintas mostrando una anhidrasa carbnica de tipo II. La esfera gris es el
cofactor zinc en el sitio activo.
Las actividades de las enzimas estn determinadas por su estructura tridimensional.
Casi todas las enzimas son mucho ms grandes que los sustratos donde actan, y solo una
pequea porcin de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminocidos) est directamente envuelta en la
catalizacin. La regin que contiene estos residuos catalizados, llevan consigo el sustrato, y
entonces realiza una reaccin conocida como el sitio activo.

3- APLICACIONES INDUSTRIALES
Las enzimas son utilizadas en la industria qumica y en otras aplicaciones industriales en
donde se requiere el uso de catalistas muy especializados. Sin embargo, las enzimas en general
estn limitadas en el nmero de reacciones que han evolucionado a catlisis y tambin por su falta
de estabilidad en solventes orgnicos y a altas temperaturas. Consecuentemente, la ingeniera de las
protenas es un rea de investigacin activa que involucra intentos de crear nuevas enzimas con
novedosas propiedades, ya sea por diseo racional o por evolucin in vitro.

4- CINTICA DE LAS REACCIONES QUMICAS
Una reaccin qumica tiene dos caractersticas de importancia: la posicin de equilibrio
(estabilidad de la concentracin de productos y reactivos) y la velocidad de reaccin (las reacciones
tienen por objeto determinar el mecanismo y la velocidad con que interaccionan las molculas bajo
determinadas condiciones).
La velocidad de una reaccin qumica puede medirse como la velocidad de formacin de uno
o ms de su productos o bien la velocidad de utilizacin de sus reactivos. Intuitivamente podemos
suponer que al aumentar la concentracin de los reactivos la probabilidad de interaccin de los
mismos aumenta conjuntamente con la velocidad que procede tal reaccin. Ambas variables
(velocidad de reaccin y concentracin de los reactivos) son directamente proporcionales, as que
matemticamente debe existir un valor constante, de esta manera podemos escribir:
v
r
= k. [reactivos]
n
.
(velocidad de reaccin) = (constante). (concentracin de reactivos)
n
El valor del exponente n es el orden de la reaccin. As si n = 1, estamos en presencia de una
reaccin de primer orden donde la velocidad es proporcional a la reaccin de un solo reactivo. v
r
=
k. [A]
Anlogamente, cuando n = 2, la velocidad es proporcional al producto de las concentraciones
de dos reactivos o al cuadrado de la concentracin de uno solo. Este tipo de reacciones reciben el
nombre de segundo orden. v
r
= k. [A] [B] = k [A]
2
La importancia de determinar el orden de una reaccin qumica radica en que a partir de ese
parmetro puede obtenerse informacin sobre el mecanismo molecular en que opera.

5- VELOCIDAD DE REACCIN Y EQUILIBRIO
En un estado de equilibrio qumico las velocidades de reacciones directa e inversa son
exactamente iguales. Considerando una reaccin de primer orden:
k
1
[A] = k
1
[B]
Este principio nos permite llegar fcilmente a una reaccin entre las constantes de velocidad y
de equilibrio:
Efecto de la temperatura sobre la velocidad de reaccin: Energa de activacin
La clave llev al descubrimiento del criterio ms importante para las reacciones qumicas, las
velocidades de reaccin son generalmente sensibles a la temperatura. En el caso de las reacciones
biomoleculares, un aumento de 10 C incrementa su velocidad entre 1,5 y 5 veces. Para explicar
este hecho se postul que al acrecentar la temperatura aumenta la fraccin de molculas capaces de
tener una energa suficiente para alcanzar un "estado activado" que luego se transforme en producto
de la reaccin por formacin o ruptura de enlaces qumicos.
Se admite que las nicas molculas que reaccionan son aquellas que al chocar llevan consigo
una energa mayor que un cierto valor mnimo. A este valor de energa necesaria se lo denomina
energa de activacin y es un factor de suma importancia para determinar la magnitud de la
velocidad de reaccin.



6- CATALIZADORES
Para que una reaccin qumica tenga lugar se debe superar el valor de la energa de
activacin. Una vez vencida esa barrera el sistema evoluciona de forma tal que llegar al estado
final de la reaccin. La velocidad de reaccin podra incrementarse de dos maneras: aumentando la
concentracin del "complejo activado" o eventualmente disminuyendo la energa de activacin.
Este ltimo mecanismo es el que se pone de manifiesto cuando se emplea determinadas sustancias
llamadas catalizadores. Estas sustancias aceleran las reacciones qumicas disminuyendo la energa
libre de activacin, se combinan con los reactivos para producir un estrato de transicin de menor
energa que el estado de transicin de la reaccin no catalizada. Cuando los productos de la reaccin
se forman, se regenera el catalizador al estado libre.

7- ENZIMAS: CATALIZADORES BIOLGICOS
Las reacciones qumicas en sistemas biolgicos raramente ocurren en ausencia de un
catalizador. Estos catalizadores se denominan enzimas y son en su totalidad molculas de naturaleza
proteica (aunque ha habido estudios acerca de enzimas de naturaleza glucosdica).
Es razonable pensar en la necesidad que tienen los seres vivos de poseer estos catalizadores,
ya que las funciones vitales de cualquier clula seran imposibles de mantener si las reacciones que
ocurren en ella fueran extremadamente lentas.
Adems de incrementar la velocidad las enzimas exhiben una elevada especificidad y en
algunos casos pueden ser reguladas por diferentes metabolitos, aumentando y otras veces
disminuyendo, de acuerdo a las necesidades del momento, su actividad.
Todas estas propiedades pueden ser cumplidas por molculas altamente complejas, que al ser
molculas orgnicas (macromolculas) comparten caractersticas con las protenas no enzimticas y
difieren de los catalizadores inorgnicos:
a) Son termolbiles y su actividad depende en ciertos casos del pH del medio.
b) El reconocimiento de la enzima con el reactivo a procesar (denominado sustrato) es
altamente especfico.
c) Tienen gran eficiencia, es decir, transforman un gran nmero de molculas de sustrato por
unidad de tiempo.
d) Estn sujetas a una gran variedad de controles celulares, genticos y alostricos.
Como todos los catalizadores las enzimas aceleran notablemente la velocidad de una reaccin
qumica y cumplen con las siguientes caractersticas:
1) Son efectivas en pequeas cantidades
2) No sufren modificaciones qumicas irreversibles durante la catlisis. Es decir que luego de
la reaccin enzimtica, las molculas de enzimas que reaccionaron son indistinguibles de las que no
lo han hecho, (la estructura de la molcula se mantiene, al principio y final de la reaccin,
exactamente igual).
3) No afectan la posicin de equilibrio de la reaccin que catalizan. El estado inicial y final de
la reaccin es el mismo, solo que se llega al equilibrio mucho ms rpidamente.

8- NOMENCLATURA Y CLASIFICACIN
Una forma general de denominar a las enzimas es aadir el sufijo "asa" al nombre del
sustrato. As, la ureasa es la enzima que cataliza la hidrlisis de la urea formando amonaco y
dixido de carbono.

Sin embargo con el descubrimiento de nuevas enzimas esta nomenclatura resulta a veces
confusa. Actualmente se ha adoptado ciertas recomendaciones de la Internacional Enzime
Comission, que pretende sistematizar la nomenclatura y clasificacin de las diferentes enzimas
conocidas. Este sistema divide a las enzimas en seis clases que a su vez pueden tener diferentes
subclases.
Clasificacin Internacional de las Enzimas
xido Reductasas (reacciones de oxido-
reduccin)
Actan sobre ": CH OH "
Actan sobre ": C = O "
Actan sobre ": C = CH "
Actan sobre ": CH NH
2
"
Actan sobre ": CH NH "
Hidrolasas (reacciones de hidrlisis)
Esteres
Enlaces glucosdico
Enlaces pepsdicos
Otros enlaces C N
Anhdridos de cido
Transferasas (transferencia de grupos funcionales)
Grupos de un tomo de C
Grupos aldehdos o cetnicos
Grupos acilos
Grupos glucosilos
Grupos fosfatos
Grupos que contienen azufre
Liasas (Adicin a los dobles enlaces)
: C = C :
: C = O
: C = N
Isomerasas (reaccin de isomerizacin)

Racemasas
Ligasas (Formacin de enlaces con escisin de
ATP)
: C O
: C N
: C S
: C C
Los nombres propuestos en este sistema son los que se emplean cuando es necesaria una
identificacin exacta de las enzimas, (por ejemplo en revistas cientficas). Sin embargo,
cotidianamente pueden emplearse los nombres triviales por ser mucho ms conocidos.

9- COFACTORES
Algunas enzimas dependen para su actividad cataltica adems de la estructura proteica, de
otras molculas de naturaleza no proteica. Estas estructuras reciben el nombre de cofactores. Esto s
son resistentes al calor mientras que las protenas generalmente no lo son. El complejo enzima
cofactor recibe el nombre de holoenzima. A la fraccin proteica aislada del cofactor que es inactiva
se la denomina apoenzima. Los cofactores pueden ser simplemente iones metlicos o en algunos
casos molculas orgnicas complejas. Estas ltimas el nombre de coenzimas.
Holoenzima = Apoenzima + Coenzima
Activadores Metlicos
Elemento Enzima Activada
Zn
++
Deshidrogenasas, anhidrasa carbnica, ARN y ADN
polimerasas.
Mg
++
Fosfohidrolasas, fosfotransferasas, fosfatasas.
Mn
++
Arginasas, peptidasas, quinasas.
Mo Nitratoreductasa, nitrogenasa.
Fe
2+
, Fe
3+
Citocromos, catalasas, ferredoxina, peroxidasas,
nitritoreductasa.
Cu
2+
Citocromo oxidasa, tirosinasa, cido ascrbico oxidasa,
plastocianina
Ca
2+
1,3 glucansintetasa, calmodulina.
K
+
Piruvato fosfoquinasa, ATPasa.
Co Vitamina B
12
hallada en microorganismos y animales, pero no
en plantas. Importante en la fijacin simbitica de nitrgeno.
Ni Ureasa.
En ciertos casos las coenzimas estn estrechamente unidas a la molcula de la enzima y
reciben el nombre del grupo prosttico. Un ejemplo clsico lo constituye el grupo hemo del
citocromo C, unido covalentemente a la protena. Entre los cofactores que requieren las enzimas
para su funcionamiento estn las coenzimas: NADPH + H (nicotinamida adenina dinucletido
fosfato reducido), NAD (nicotinamida adenina dinucletido), FAD (flavina adenina dinucletido),
piridoxal, biotina, tiamina, cido tetra hidroflico, cobalamina.