CONCEPTO Qumicamente, los cidos nucleicos son polmeros consti tui dos por la unin mediante enlaces qumicos de unidades menores llamadas nucletidos. Los cidos nucleicos son compuestos de elevado peso molecular, esto es, son macromolculas. FUNCIONES GENERALES Los cidos nucleicos, llamados as porque en un principio fueron localizados en el ncleo celular, son las molcul!s de l! "e#enci! y por lo tanto van a participar en los mecanismos mediante los cuales la informacin gentica se almacena, replica y transcribe. sta no va a ser su nica funcin. !eterminados derivados de estas sustancias" los nucletidos, van a tener otras funciones biolgicas, entre las que pueden destacarse, como e#emplo, la de servir de intermediarios en las transferencias de energa en las clulas $%&', %!' y otros( o en las transferencias de electrones $)%! * , )%!' * , +%!, etc.(. LOS NUCLE$TIDOS% CO&PONENTES Los nucletidos estn formados por" una '!se nit#o(en!d! $,)(, un !)*c!# $%( y +cido ,os,#ico $'(- unidos en el siguiente orden" PA-N LAS -ASES NITROGENADAS .on sustancias derivadas de dos compues/ tos qumi cos" la .u#in! y la .i#imidin!. Las que derivan de la purina son las '!ses .*#i/ c!s. 0n los nucletidos vamos a encontrar, normalmente, dos base pricas" la !denin! $%( y la (u!nin! $1(. Las que derivan de la pirimidina se llaman .i#imid0 nic!s. &res son las bases pirimid nicas presentes en los cidos nucleicos" la citosin! $2(, la timin! $&( y el u#!cilo $3(. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-1 Fig. 1 Pirimidina. Fig. 2 Purina. Fig. 3 Bases pricas. %denina 1uanina III) La informacin celular 2) cidos nucleicos 0n ciertos casos, aunque esto pasa muy raramente, pueden encontrarse en los cidos nucleicos otras bases diferentes de estas cinco, por lo general derivados metilados de ellas. EL A12CAR 3GL2CIDO) 0l azcar que interviene en los nucletidos puede ser o la #i'os! $R( o la deso4i##i'os! $dR(. %mbas son aldopentosas y las encontraremos en los nucletidos como 6/ furanosas. 2onviene destacar que la nica diferencia entre ambas est en que en el carbono 7 de la deso8irribosa 5ay un 5idrgeno $/9( en lugar del grupo alco5ol $/:9(. LOS NUCLE$SIDOS 0l azcar y la base nitrogenada se unen entre s como se indica en las figuras formando un nuclesido. 0l enlace se forma entre el carbono anomrico del azcar y uno de los nitrgenos de la base nitrogenada, en concreto, el indicado en las figuras. 0n la unin se forma una molcula de agua. 0ste enlace recibe el nombre de enlace N/ (licos0dico. ESTRUCTURA DE LOS NUCLE$TIDOS Los nucletidos son los monmeros que consti tuyen los cidos nucleicos. .e forman cuando se unen el cido fosfrico y un nuclesido. 0s una unin ,os,oste# entre un :9 del cido fosfrico y el :9 situado en el carbono ; del azcar, con formacin de una molcula de agua. .egn el azcar sea la 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-2 Fig. 4 Citosina. Fig. 7 La ribosa y la desoxirribosa. <ibosa !eso8irribosa Fig. 5 Timina. Fig. 6 Uracilo. Fig. 8 Nuclesido pirimidnico. III) La informacin celular 2) cidos nucleicos ribosa o la deso8irribosa, tendremos #i'onucletidos o deso4i##i'onucletidos. La timina nunca forma parte de los ribonucletidos y el uracilo no forma parte de los deso8irribonucletidos. NUCLE$TIDOS O DERI5ADOS DE NUCLE$TIDOS DE INTER6S-IOL$GICO7 %lgunos nucletidos cumplen funciones por s mismos. %s, por e#emplo" a( Nucletidos 8ue inte#9ienen en l!s t#!ns,e#enci!s de ene#(0!" .e trata de molculas que captan o desprenden energa al transformarse unas en otras. %s, el %&' desprende energa cuando se 5idroliza, transformndose en %!' y fosfato inorg/ nico $'i(. 'or el contrario, el %!' almacena energa cuando reacciona con el fosfato inorgnico y se transforma en %&' y agua. !e esta forma se transporta energa $unas = >ilocaloras por mol de %!'?%&'( de aquellas reacciones en las que se desprende $e8ergnicas( a aquellas en las que se necesita $endergnicas(. E:em.los de nucletidos t#!ns.o#t!do#es de ene#(0!% / A&P $adenosina/;@/monofosfato( A/R/P / ADP $adenosina/;@/difosfato( A/R/P/P / ATP $adenosina/;@/trifosfato( A/R/P/P/P / GDP $guanosidina/;@/difosfato( G/R/P/P / GTP $guanosidina/;@/trifosfato( G/R/P/P/P b( Nucletidos 8ue inte#9ienen en los .#ocesos de 4ido/#educcin7 0stas molculas captan electrones de molculas a las que o8idan y los ceden a otras molculas a las que a su vez reducen. %s, el )%! * puede captar 7e / transformndose en su forma reducida, el )%!9, y ste puede ceder dos electrones a otras sustancias, reducindolas y volviendo a transformarse en su forma o8idada, el )%! * . %s, se transportan electrones de aquellas reacciones en las que se desprende a aquellas en las que se necesitan. E:em.los de nucletidos t#!ns.o#t!do#es de elect#ones% / NAD * ?NAD; $)icotinamida/adenina/dinucletido( o8idado y reducido, respecti / vamente. / NADP < =NADP; $)icotinamida/adenina/dinucletido/fosfato(, o8idado y reducido. / FAD=FAD;2 $+lavina/adenina/dinucleti do(, o8idado y reducido. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-3 Fig. 9 Nucletido. Las flechas indican los enlaces fosfoster (roja) y N-glicosdico (verde). III) La informacin celular 2) cidos nucleicos c( Nucletidos #e(ul!do#es de .#ocesos met!'licos7 %lgunos nucletidos cumplen funciones especiales como reguladores de procesos metablicos, por e#emplo el A&Pc $adenosina/A@,;@/ monofosfato( o %B' ccli co, en el que dos :9 del fosfato esterifican los :9 en posiciones A y ; de la ribosa formando un ciclo. 0ste compuesto qumico acta en las clulas como intermediario de muc5as 5ormonas. LOS POLINUCLE$TIDOS !os nucletidos van a poder unirse entre s mediante un enlace ste#,os,!to $fosfoster(. 0ste enlace se forma entre un :9 del cido fosfrico de un nucletido y el :9 $5idro8ilo( del carbono nmero A del azcar del otro nucletido con formacin de una molcula de agua. La unin de otros nucletidos dar lugar a un .olinucletido. 0s de destacar que en toda cadena de polinucletidos el nucletido de uno de los e8tremos tendr libre el :9 del azcar en posicin A, ste ser el e8tremo A@ de la cadena. 0l cido fosfri co del nucletido que se encuentre en el e8tremo opuesto tambin estar libre, ste ser el e8tremo ;@. 0sto marca un sentido en la cadena de polinu/ cletidos. &oda cadena podr considerarse bien en sentido A@ ;@ o en sentido ;@ A@ y as 5abr que indicarlo. ADN > ARN% DIFERENCIAS A NI5EL ?U@&ICO / 0l ADN $cido deso8irribonucleico( sus nucletidos tienen deso8irribosa como azcar y no tiene uracilo. / 0l ARN $cido ribonucleico( tiene ribosa y no tiene timina. EL ADN 3DNA) Conce.to% Qumicamente son polinucletidos consti tuidos por d/%B', d/1B', d/2B' y d/ &B'. Los nucletidos del %!) no tienen ni uracilo, ni ribosa, como ya se 5a dic5o. C!#!cte#0stic!s" Los %!) celulares tienen una elevada masa molecular, muc5os millones de daltons. %s, por e#emplo" el genoma 5umano est formado por A8CD E 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-4 Fig. 10 Dinucletido. AB CB Fig. 11 Ejemplo de cadena polinucleo- tdica. P dR A P dR G P dR C P dR T P dR G P dR A AB CB Fig. 12 Modelo de la estructura del ADN. III) La informacin celular 2) cidos nucleicos pares de nucleti dos. 0sto 5ace que sean molculas de una gran longitud- por e#emplo" C,= m en el caso del virus de la poliomie/ litis y 7,AF m si sumamos todo el %!) de todos los cromosomas de una clula 5umana. 0l %!) fue aislado por primera vez en CGFE, pero 5asta CE;D no se empez a conocer su estructura. .e encuentra en el ncleo de las clulas eucariotas asociado a prote nas $5istonas y otras( formando la c#om!tin!, sustancia que constituye los cromosomas y a partir de la cual se transcribe la informacin gentica. &ambin 5ay %!) en ciertos orgnulos celulares $por e#emplo" plastos y mitocondrias(. ESTRUCTURA DEL ADN .e pueden distinguir A niveles estructurales" /0structura primaria" La secuencia de los nucleti dos. /0structura secundaria" La doble 5lice. /0structura terciaria" 2ollar de perlas, estructura cristalina, %!) superenrollado. 0n las clulas eucariotas, a partir de la estructura A0, se dan otros niveles de empaquetamiento de orden superior.
ESTRUCTURA PRI&ARIA DEL ADN7 0s la secuencia de nucletidos de una cadena o 5ebra. 0s decir, la estructura primaria del %!) viene determinada por el orden de los nucletidos en la 5ebra o cadena de la molcula. 'ara indicar la secuencia de una cadena de %!) es suficiente con los nombres de las bases o su inicial $%, &, 2, 1( en su orden correcto y los e8tremos ;@ y A@ de la cadena nucleotdica. %s, por e#emplo" ADACGTTTAACGACAAGGACAAGTATTAACD La posibilidad de combinar cuatro nucle/ tidos diferentes y la gran longitud que pueden tener las cadenas polinucleotdicas, 5acen que pueda 5aber un elevado nmero de polinucletidos posibles, lo que determina que el %!) pueda contener el mensa#e biolgico o informacin gentica y e8plica la diversidad del mensa#e gentico de todos los seres vivos. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-5 Fig. 13 J. Watson y F. Crick. Fig. 15 Modelo de la estructura secundaria del ADN. Fig. 14 Puentes de hidrgeno (.....) entre bases complementarias en el ADN. 2 1 & % III) La informacin celular 2) cidos nucleicos ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN7 !atos preliminares" %( % finales de los aHos ID 0rJin 29%<1%++ y sus colaboradores estudiaron los componentes del %!) y emitieron los siguientes resultados" La concentracin de bases vara de una especie a otra. 0l porcenta#e de %, 1, 2 y & es el mismo en los individuos de la misma especie y no por esto el mensa#e es el mismo. &e#idos diferentes de la misma especie tienen la misma composicin en bases. La composicin en bases del %!) de una misma especie no vara con la edad del organismo ni con su estado nutricional ni con las variaciones ambientales. Las densidades y viscosidades corresponden a la e8istencia de enlaces de 5idrgeno entre los grupos )9 y los grupos 2:. La concentracin de %denina es igual a la de &imina, y la de 2itosina a la de 1uanina. Las dos primeras establecen dos puentes de 5idrgeno entre ellas, y las ltimas tres puentes. La canti dad de purinas es igual a la cantidad de pirimidinas. ,( 'or medio del mtodo analtico de difraccin de rayos K, +<%)LLM) y NMLLM). observaron una estructura fibrilar de 7D O $%mstrongs( de dimetro con repeticiones cada A,I O y una mayor cada AI O. 2( N%&.:) y 2<M2L postularon en CE;A un modelo tridimensional para la estructura del %!) que estaba de acuerdo con todos los datos disponibles anteriores" el modelo de do'le "lice. 0ste modelo, adems de e8plicar cmo era el %!), sugera los mecanismos que e8plicaban su funcin biolgica y la forma como se replicaba. .egn el modelo de la doble 5lice de N%&.:) y 2<M2L" C1( 0l %!) estara consti tuido por dos cadenas o 5ebras de polinucletidos enro/ lladas 5elicoidalmente en sentido de8trgiro sobre un mismo e#e formando una do'le "lice. 71( %mbas cadenas seran !nti.!#!lel!s, una ira en sentido A@ ;@ y la otra en sentido inverso, ;@ A@. A1( Los grupos fosfato estaran 5acia el 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-6 Fig. 16 Doble hlice del ADN. Fig. 17 Doble hlice del ADN. III) La informacin celular 2) cidos nucleicos e8terior y de este modo sus cargas negativas interaccionaran con los cationes presentes en el nucleoplasma dando ms estabilidad a la molcula. I1( Las bases nitrogenadas estaran 5acia el interior de la 5lice con sus planos paralelos entre s y las bases de cada una de las 5li/ ces estaran apareadas con las de la otra asocindose mediante puentes de 5idrgeno. ;1( 0l apareamiento se realizara nicamente entre la adenina y la timi na, por una parte, y la guanina P la citosina, por la otra C . 'or lo tanto, la estructura primaria de una cadena estara determinada por la de la otra, ambas cadenas seran com.lement!/ #i!s. La complementariedad de las cadenas sugiere el mecanismo por el cual el %!) se copia /se replica/ para ser trasferido a las clulas 5i#as. %mbas cadenas o 5ebras se pueden separar parcialmente y servir de molde para la sntesis de una nueva cadena complementaria $s0ntesis semiconse#9!ti9!(. PROPIEDADES DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN% DESNATURALI1ACI$N .i una disolucin de %!) se calienta suficientemente ambas cadenas se separan, pues se rompen los enlaces de 5idrgeno que unen las bases, y el %!) se desn!tu#!li)!. La temperatura de desnaturalizacin depende de la proporcin de bases. % mayor proporcin de 2/1, mayor temperatura de desnaturalizacin, pues la citosina y la guanina establecen tres puentes de 5idrgeno, mientras que la adenina y la timina slo dos y, por lo tanto, a mayor proporcin de 2/1, ms puentes de 5idrgeno unirn ambas cadenas. La desnaturalizacin se produce tambin variando el p9 o a concentraciones salinas elevadas. .i se restablecen las condiciones, el %!) se renaturaliza y ambas cadenas se unen de nuevo. ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN EN LAS C6LULAS EUCARIOTAS7 Las grandes molculas de %!) de las clulas eucariotas estn muy empaquetadas o/ cupando as menos espacio en el ncleo celular y adems como mecanismo para preservar su transcripcin. 2omo 5emos visto, en las clulas eucariotas el %!) se encuentra en el ncleo 1 El par A-G no puede formarse por ser ambas bases demasiado grandes, y el par C-T por estar a demasiada distancia. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-7 Fig. 19 Temperatura de desnaturalizacin del ADN en funcin del tanto por ciento de citosina-guanina. Temperatura en C %
d e l
p a r
C - G
e n
l a
m u e s t r a Fig. 18 Replicacin del ADN. A T C G A T C G G G C T A G C T A G C C C A T C G A T C G G T A G C T A G C C T A G C T
A T C G A C A U C G A T C G G G primer T A G C T A G C C C primer III) La informacin celular 2) cidos nucleicos asociado a ciertas protenas" nucleo/ .#ote0n!s, formando la c#om!tin!. 0n la cro/ matina, la doble 5lice de %!) se enrolla alrededor de unas molculas proteicas glo/ bulares, las "iston!s, formando los nucleoso/ m!s. 2ada nucleosoma contiene G 5istonas y la doble 5lice de %!) da dos vueltas a su alrededor $7DD pares de bases(. 0l con/ #unto, si no est ms empaquetado an, forma una estructura arrosariada llamada coll!# de .e#l!s. %5ora bien, los nucleoso/ mas pueden empaquetarse formando fibras de un grosor de AD nm $,i'#! de CE nm(. .egn el modelo del solenoide las fibras se forman al enrollarse seis nucleosomas por vuelta alrededor de un e#e formado por las 5istonas 9C. NI5ELES SUPERIORES DE E&PA?UETA&IENTO Los siguientes niveles de empaquetamiento no estn an aclarados del todo pero, parece ser, que cada fibra se volvera a enrollar formando un 'ucle $cada bucle tendra ;D millones de pares de bases(, seis bucles se empaquetaran asocindose a un Q es8ueleto nucle!#Q producindose un #osetn, AD rosetones formaran una es.i#!l y 7D espirales formaran una c#om+tid!. &odo ello producira un gran acortamiento de las largas cadenas de %!). 0n los espermatozoides el %!) se encuen/ tra an muc5o ms empaquetado, se dice que tiene Q est#uctu#! c#ist!lin!Q. Los %!) de las bacterias, virus, mitocon/ drias y plastos no presentan estructuras tan comple#as y no estn asociados a 5istonas, aunque s estn asociados a otras protenas. TIPOS DE ADN .egn su estructura se distinguen los siguientes tipos de %!)" / Bonocatenarios o de una cadena- por e#emplo los de algunos virus. / ,icatenarios, con dos 5ebras o cadenas $algunos virus, las bacterias y los eucariotas(. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-8 Fig. 20 Fibra nucleosmica en collar de perlas. nucleosom! ADN es.!ci!do# ;iston! ;F Fig. 21 Nucleosoma. ADN ;iston! ;F N*cleo de "iston!s del nucleosom! Fig. 22 Empaquetamiento de los nucleosomas formando una fibra de 30nm, segn el modelo del solenoide. Fig. 23 Cromosomas de una clula en divisin. Cada cromosoma tiene dos cromtidas. En los cromosomas el ADN est fuertemente empaquetado y asociado a protenas. III) La informacin celular 2) cidos nucleicos % su vez, y en ambos casos, el %!) puede ser" / Lineal, como por e#emplo el del ncleo de las clulas eucariotas y el de algunos virus. / 2ircular, como el de las mitocondrias, cloroplastos, bacterias y algunos virus. EL ARN 3RNA)7 DIFERENCIAS CON EL ADN 0l %<), cido ribonucleico, es un polirribonucleti do que, a diferencia del %!), no contiene ni deso8irribosa ni timina, pero s ribosa y uracilo. 0l %<) no forma dobles cadenas, salvo en ciertos virus $por e#. los reovirus(. Lo que no quita que su estruc/ tura espacial pueda ser en ciertos casos muy comple#a. CLASES DE ARN 'or su estructura y su funcin se distinguen tres clases de %<)" / 0l %<)m $%<) mensa#ero( es un polirri/ bonucleti do constituido por una nica cadena sin ninguna estructura de orden superior. .u masa molecular suele ser elevada. 0ste %<) se sinteti za en el ncleo celular y pasa al citoplasma transportando la informacin para la sntesis de prote nas. La duracin de los %<)m en el citoplasma celular es de escasos minutos siendo degra/ dados rpidamente por enzimas espec ficas. / 0l %<)t $%<) de transferencia( transporta los aminocidos para la sntesis de protenas. 0st formado por una sola cadena, aunque en ciertas zonas se encuen/ tra replegada y asociada internamente mediante puentes de 5idrgeno entre bases complementarias. .u peso molecular es del orden de 7;.DDD da. 0st formado por entre =D y ED nucletidos y consti tuye el C; R del total del %<) de la clula. .e sintetiza en el ncleo y sale 5acia el citoplasma para realizar su funcin. 0n el %<)t podemos distinguir un brazo aceptor de aminocidos abierto y un bucle anticodon.
0l %<)r $%<) ribosomal( es el %<) de los ribosomas, cuya funcin es poco conocida. Los %<) vricos. %lgunos virus tienen como material gentico %<) bicatenario. 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-9 Fig. 24 ARN t . La lnea es la cadena de polinucletidos y los rectngulos las bases o los pares de bases. 1) brazo aceptor de ami- nocidos; 2) bucle anticodon. III) La informacin celular 2) cidos nucleicos ESTRUCTURAS TERCIARIA > SUPERIOR DEL ADN 3SUPERENROLLA&IENTO) 4. L. .nc5ez 1uilln Pgina III-2-10 !os cromtidas 78CD vueltas de espiral C vuelta de espiral $AD rosetones( C rosetn $F bucles( C bucle +ibra de AD nm 2ollar de perlas $nucleosoma( %!)