Marcadores moleculares

fenotipo molecular

expresin de un gen

segmento especfico de ADN.

Un marcador molecular

es un carcter o un gen que debido al ligamiento puede usarse para indicar la presencia de otro gen

Estudiar poblaciones de organismos

Seleccionar aquellos que presentan rasgos de inters para el hombre

Seleccionar los individuos aun antes de que expresen el rasgo de inters

Mejorar muchas especies que son la base de la alimentacin del mundo.

SNPs (Polimorfismo de nucletido simple)

Se utilizan como alternativa

Marcadores biallicos

Microsatlites en los estudios de diversidad gentica

Poseen un contenido de informacin bastante bajo

Hay que usar muchos para llegar al nivel de informacin.

Los SNP parecen ser marcadores atractivos para aplicarlos en el futuro a estudios de diversidad gentica

Se pueden usar fcilmente en la evaluacin de la variacin funcional o neutra

SNP

Existen diversas tecnologas para detectar y tipar los marcadores SNP

ya sea secuenciado, polimorfismo conformacional de cadena nica (SSCP)

Se pueden generar mediante varios protocolos experimentales

cromatografa lquida desnaturalizadora de alto rendimiento (DHPLC)

alineando y comparando secuencias mltiples de la misma regin a partir de bases de datos pblicas del genoma y de secuencias expresadas (EST)

Tipo muy reciente de marcador

Disponible gracias a las nuevas tecnologas de secuenciacin

Polimorfismos de un solo nucletido

SNPs
Estn muy cerca del gen que interesa o incluso dentro de l Polimorfismos de un solo nucletido Identificados o empleando una matriz o con una mquina de DHPLC

SNPS consiste en sustituciones

resultando en un polimorfismo diallico de secuencia

una sola base

Son variaciones puntuales a nivel de secuencia

Disponibles por la gran cantidad de secuencias genomicas

SNPs

Se ubican cercanos o en el locus de inters

pueden asociarse precisamente a caracteres como enfermedades

Deteccin de SNPs

Diferencias en las secuencias especficas de segmentos conocidos (locus/loci).

Secuenciacin comparativa de ADN amplificado

Extraccin y purificacin de ADN

Agrobiotecnologa de deteccin

PCR con iniciadores caracterizados

Procedimiento

Aplicacin de alguna de las tcnicas

Secuenciacin del producto de amplificacin

Ventajas

Desventajas