III) La informacin celular

2) cidos nucleicos

2) LOS CIDOS NUCLEICOS

CONCEPTO Qumicamente, los cidos nucleicos son polme ros constituidos por la unin mediante enlaces qumicos de unidades menores llamadas nucletidos. Los cidos nucleicos son compuestos de elevado peso molecular, esto es, son macromolculas.

Fig. 1

Pirimidina.

FUNCIONES GENERALES Los cidos nucleicos, llamados as porque en un principio fueron localizados en el ncleo celular, son las molculas de la herencia y por lo tanto van a participar en los mecanismos mediante los cuales la informacin gentica se almacena, replica y transcribe. sta no va a ser su nica Fig. 2 Purina. funcin. Determinados derivados de estas sustancias: los nucletidos, van a tener otras funciones biolgicas, entre las que pueden destacarse, como ejemplo, la de servir de intermediarios en las transferencias de energa en las clulas (ATP, ADP y otros) o en las transferencias de electrones (NAD+ , NADP+ , FAD, etc.).

LOS NUCLETIDOS: COMPONENTES Los nucletidos estn formados por: una base nitrogenada (BN), un azcar (A) y cido fosfrico (P); unidos en el siguiente orden: PABN
Adenina

LAS BASES NITROGENADAS Son sustancias derivadas de dos compuestos qumi cos: la purina y la pirimidina. Las que derivan de la purina son las bases pricas. En los nucletidos vamos a encontrar, normalmente, dos base pricas: la adenina (A) y la guanina (G). Las que derivan de la pirimidina se llaman pirimid nicas. Tres son las bases pirimid nicas presentes en los cidos nucleicos: la citosina (C), la timina (T) y el uracilo (U).

Guanina
Fig. 3 Bases pricas.

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En ciertos casos, aunque esto pasa muy raramente, pueden encontrarse en los cidos nucleicos otras bases diferentes de estas cinco, por lo general derivados metilados de ellas.

Fig. 4

Citosina.

Fig. 5

Timina.

Fig. 6

Uracilo.

EL AZCAR (GLCIDO) El azcar que interviene en los nucletidos puede ser o la ribosa (R) o la desoxirribosa (dR). Ambas son aldopentosas y las encontraremos en los nucletidos como furanosas. Conviene destacar que la nica diferencia entre ambas est en que en el carbono 2 de la desoxirribosa hay un hidrgeno (-H) en lugar del grupo alcohol (-OH). LOS NUCLESIDOS El azcar y la base nitrogenada se unen entre s como se indica en las figuras formando un nuclesido. El enlace se forma entre el carbono anomrico del azcar y uno de los nitrgenos de la base nitrogenada, en concreto, el indicado en las figuras. En la unin se forma una molcula de agua. Este enlace recibe el nombre de enlace Nglicosdico.
Desoxirribosa

Ribosa

Fig. 7

La ribosa y la desoxirribosa.

ESTRUCTURA DE LOS NUCLETIDOS Los nucletidos son los monmeros que constituyen los cidos nucleicos. Se forman cuando se unen el cido fosfrico y un nuclesido. Es una unin fosfos ter entre un OH del cido fosfrico y el OH situado en el carbono 5 del azcar, con formacin de una molcula de agua. Segn el azcar sea la

Fig. 8

Nuclesido pirimidnico.

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ribosa o la desoxirribosa, tendremos ribonucletidos o desoxirribonucletidos. La timina nunca forma parte de los ribonucletidos y el uracilo no forma parte de los desoxirribonucletidos.

NUCLETIDOS O DERIVADOS DE NUCLETIDOS DE INTERS BIOLGICO. Algunos nucletidos cumplen funciones por s mismos. As, por ejemplo: a) Nucletidos que intervienen en las transferencias de energa : Se trata de molculas que captan o desprenden energa al transformarse unas en otras. As, el ATP desprende energa cuando se hidroliza, transformndose en ADP y fosfato inorgnico (Pi). Por el contrario, el ADP almacena energa cuando reacciona con el fosfato inorgnico y se transforma en ATP y agua. De esta forma se transporta energa (unas 7 kilocaloras por mol de ADP/ATP) de aquellas reacciones en las que se desprende (exergnicas) a aquellas en las que se necesita (endergnicas).

Fig. 9 Nucletido. Las flechas indican los enlaces fosfoster (roja) y N-glicosdico (verde).

Ejemplos de nucletidos transportadores de energa: AMP (adenosina-5'-monofosfato) A-R-P ADP (adenosina-5'-difosfato) A-R-P-P ATP (adenosina-5'-trifosfato) A-R-P-P-P GDP (guanosidina-5'-difosfato) G-R-P-P GTP (guanosidina-5'-trifosfato) G-R-P-P-P

b) Nucletidos que intervienen en los procesos de xido-reduccin. Estas molculas captan electrones de molculas a las que oxidan y los ceden a otras molculas a las que a su vez reducen. As, el NAD + puede captar 2e - transformndose en su forma reducida, el NADH, y ste puede ceder dos electrones a otras sustancias, reducindolas y volviendo a transformarse en su forma oxidada, el NAD + . As, se transportan electrones de aquellas reacciones en las que se desprende a aquellas en las que se necesitan. Ejemplos de nucletidos transportadores de electrones: - NAD+ / NADH (Nicotinamida-adenina-dinucletido) oxidado y reducido, respectivamente. - NADP+ /NADPH (Nicotinamida-adenina-dinucletido-fosfato), oxidado y reducido. - FAD/FADH2 (Flavina-adenina-dinucletido), oxidado y reducido.

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c) Nucletidos reguladores de procesos metablicos. Algunos nucletidos cumplen funciones especiales como reguladores de procesos metablicos, por ejemplo el AMPc (adenosina-3',5'- monofosfato) o AMP ccli co, en el que dos OH del fosfato esterifican los OH en posiciones 3 y 5 de la ribosa formando un ciclo. Este compuesto qumico acta en las clulas como intermediario de muchas hormonas.

LOS POLINUCLETIDOS Dos nucletidos van a poder unirse entre s mediante un enlace sterfosfato (fosfoster). Este enlace se forma entre un OH del cido fosfrico de un nucletido y el OH (hidroxilo) del carbono nmero 3 del azcar del otro nucletido con formacin de una molcula de agua. La unin de otros nucletidos dar lugar a un polinucletido. Es de destacar que en toda cadena de polinucletidos el nucletido de uno de los extremos tendr libre el OH del azcar en posicin 3, ste ser el extremo 3' de la cadena. El cido fosfrico del nucletido que se encuentre en el extremo opuesto tambin estar libre, ste ser el extremo 5'. Esto marca un sentido en la cadena de polinucletidos. Toda cadena podr considerarse bien en sentido 3' 5' o en sentido 5' 3' y as habr que indicarlo.

3
Fig. 10 Dinucletido.

dR P

A dR P G dR P C dR P 3 T dR P G dR A

ADN Y ARN: QUMICO

DIFERENCIAS

NIVEL

- El ADN (cido desoxirribonucleico) sus nucletidos tienen desoxirribosa como azcar y no tiene uracilo. - El ARN (cido ribonucleico) tiene ribosa y no tiene timina. EL ADN (DNA) Concepto: Qumicamente son polinucletidos constituidos por d-AMP, d-GMP, d-CMP y dTMP. Los nucletidos del ADN no tienen ni uracilo, ni ribosa, como ya se ha dicho. Caractersticas: Los ADN celulares tienen una elevada masa molecular, muchos millones de daltons. As, por ejemplo: el genoma humano est formado por 3x10 9

Fig. 11 tdica.

Ejemplo de cadena polinucleo-

Fig. 12

Modelo de la estructura del ADN.

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pares de nucletidos. Esto hace que sean molculas de una gran longitud; por ejemplo: 1,7 m en el caso del virus de la poliomielitis y 2,36 m si sumamos todo el ADN de todos los cromosomas de una clula humana. El ADN fue aislado por primera vez en 1869, pero hasta 1950 no se empez a conocer su estructura. Se encuentra en el ncleo de las clulas eucariotas asociado a prote nas (histonas y otras) formando la cromatina, sustancia que constitu ye los cromosomas y a partir de la cual se transcribe la informacin gentica. Tambin hay ADN en ciertos orgnulos celulares (por ejemplo: plastos y mitocondrias). ESTRUCTURA DEL ADN Se pueden distinguir 3 niveles estructurales: -Estructura primaria: La secuencia de los nucletidos. -Estructura secundaria: La doble hlice. -Estructura terciaria: Collar de perlas, estructura cristalina, ADN superenrollado. En las clulas eucariotas, a partir de la estructura 3 0, se dan otros niveles de empaquetamiento de orden superior. ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN. Es la secuencia de nucletidos de una cadena o hebra. Es decir, la estructura primaria del ADN viene determinada por el orden de los nucletidos en la hebra o cadena de la molcula. Para indicar la secuencia de una cadena de ADN es suficiente con los nombres de las bases o su inicial (A, T, C, G) en su orden correcto y los extremos 5' y 3' de la cadena nucleotdica. As, por ejemplo: 5'ACGTTTAACGACAAGGACAAGTATTAA3' La posibilidad de combinar cuatro nucletidos diferentes y la gran longitud que Fig. 15 Modelo de la estructura pueden tener las cadenas polinucleotdicas, secundaria del ADN. hacen que pueda haber un elevado nmero de polinucletidos posibles, lo que determina que el ADN pueda contener el mensaje biolgico o informacin gentica y explica la diversidad del mensaje gentico de todos los seres vivos.

Fig. 13

J. Watson y F. Crick.

Fig. 14 Puentes de hidrgeno (.....) entre bases complementarias en el ADN.

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ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN. Datos preliminares: A) A finales de los aos 40 Erwin CHARGAFF y sus colaboradores estudiaron los componentes del ADN y emitieron los siguientes resultados: La concentracin de bases vara de una especie a otra. El porcentaje de A, G, C y T es el mismo en los individuos de la misma especie y no por esto el mensaje es el mismo.

Fig. 16

Doble hlice del ADN.

Tejidos diferentes de la misma especie tienen la misma composicin en bases. La composicin en bases del ADN de una misma especie no vara con la edad del organismo ni con su estado nutricional ni con las variaciones ambientales. Las densidades y viscosidades corresponden a la existencia de enlaces de hidrgeno entre los grupos NH y los grupos CO. La concentracin de Adenina es igual a la de Timina, y la de Citosina a la de Guanina. Las dos primeras establecen dos puentes de hidrgeno entre ellas, y las ltimas tres puentes. La cantidad de purinas es igual a la cantidad de pirimidinas. B) Por medio del mtodo analtico de difraccin de rayos X, FRANKLIN y WILKINS observaron una estructura fibrilar de 20 (Amstrongs) de dimetro con repeticiones cada 3,4 y una mayor cada 34 . C) WATSON y CRICK postularon en 1953 un modelo tridimensional para la estructura del ADN que estaba de acuerdo con todos los datos disponibles anteriores: el modelo de doble hlice. Este modelo, adems de explicar cmo era el ADN, sugera los mecanismos que explicaban su funcin biolgica y la forma como se replicaba.

Segn el modelo de la doble hlice de WATSON y CRICK: 1 1) El ADN estara constituido por dos cadenas o hebras de polinucletidos enrolladas helicoidalmente en sentido dextrgiro sobre un mismo eje formando una doble hlice. 2 1) Ambas cadenas seran antiparalelas, una ira en sentido 3' 5' y la otra en sentido inverso, 5' 3'. 3 1) Los grupos fosfato estaran hacia el

Fig. 17

Doble hlice del ADN.

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exterior y de este modo sus cargas negativas interaccionaran con los cationes presentes en el nucleoplasma dando ms estabilidad a la molcula. 4 1) Las bases nitrogenadas estaran hacia el interior de la hlice con sus planos paralelos entre s y las bases de cada una de las hlices estaran apareadas con las de la otra asocindose mediante puentes de hidrgeno. 5 1) El apareamiento se realizara nicamente entre la adenina y la timina, por una parte, Fig. 18 Replicacin del ADN. y la guanina Y la citosina, por la otra1 . Por lo tanto, la estructura primaria de una cadena estara determinada por la de la otra, ambas cadenas seran complementarias.
A T C G A T C G G G C T A G C T A G C C C
T A G

primer

La complementariedad de las cadenas sugiere el mecanismo por el cual el ADN se copia -se replica- para ser trasferido a las clulas hijas. Ambas cadenas o hebras se pueden separar parcialmente y servir de molde para la sntesis de una nueva cadena complementaria (sntesis semiconservativa). PROPIEDADES DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: DESNATURALIZACIN Si una disolucin de ADN se calienta suficientemente ambas cadenas se separan, pues se rompen los enlaces de hidrgeno que unen las bases, y el ADN se desnaturaliza. La temperatura de desnaturalizacin depende de la proporcin de bases. A mayor proporcin de C-G, mayor temperatura de desnaturalizacin, pues la citosina y la guanina establecen tres puentes de hidrgeno, mientras que la adenina y la timina slo dos y, por lo tanto, a mayor proporcin de C-G, ms puentes de hidrgeno unirn ambas cadenas. La desnaturalizacin se produce tambin variando el pH o a concentraciones salinas elevadas. Si se restablecen las condiciones, el ADN se renaturaliza y ambas cadenas se unen de nuevo.

% del par C-G en la muestra

primer

Fig. 19 Temperatura de desnaturalizacin del ADN en funcin del tanto por ciento de citosina-guanina.

ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN EN LAS CLULAS EUCARIOTAS. Las grandes mol culas de ADN de las clulas eucariotas estn muy empaquetadas ocupando as menos espacio en el ncleo celular y adems como mecanismo para preservar su transcripcin. Como hemos visto, en las clulas eucariotas el ADN se encuentra en el ncleo
1

El par A-G no puede formarse por ser ambas bases demasiado grandes, y el par C-T por estar a demasiada distancia.

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Temperatura en C

A T

A T

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asociado a ciertas protenas: nucleoprotenas, formando la cromatina. En la cromatina, la doble hlice de ADN se enrolla alrededor de unas mol culas proteicas globulares, las histonas, formando los nucleosomas. Cada nucleosoma contiene 8 histonas y la doble hlice de ADN da dos vueltas a su alrededor (200 pares de bases). El conjunto, si no est ms empaquetado an, forma una estructura arrosariada llamada collar de perlas. Ahora bien, los nucleosomas pueden empaquetarse formando fibras de un grosor de 30 nm (fibra de 30 nm). Segn el modelo del solenoide las fibras se forman al enrollarse seis nucleosomas por vuelta alrededor de un eje formado por las histonas H1. NIVELES SUPERIORES DE EMPAQUETAMIENTO Los siguientes niveles de empaquetamiento no estn an aclarados del todo pero, parece ser, que cada fibra se volvera a enrollar formando un bucle (cada bucle tendra 50 millones de pares de bases), seis bucles se empaquetaran asocindose a un " esqueleto nuclear" producindose un rosetn, 30 rosetones formaran una espiral y 20 espirales formaran una cromtida. Todo ello producira un gran acortamiento de las largas cadenas de ADN. En los espermatozoides el ADN se encuentra an mucho ms empaquetado, se dice que tiene " estructura cristalina". Los ADN de las bacterias, virus, mitocondrias y plastos no presentan estructuras tan complejas y no estn asociados a histonas, aunque s estn asociados a otras protenas. TIPOS DE ADN Segn su estructura se siguientes tipos de ADN: distinguen los

nucleosoma

ADN espaciador

Histona H1

Fig. 20 perlas.

Fibra nucleosmica en collar de

Histona H1

ADN

Ncleo de histonas del nucleosoma

Fig. 21

Nucleosoma.

Fig. 22 Empaquetamiento de los nucleosomas formando una fibra de 30nm, segn el modelo del solenoide.

- Monocatenarios o de una cadena; por ejemplo los de algunos virus. - Bicatenarios, con dos hebras o cadenas (algunos virus, las bacterias y los eucariotas).

Fig. 23 Cromosomas de una clula en divisin. Cada cromosoma tiene dos cromtidas. En los cromosomas el ADN est fuertemente empaquetado y asociado a protenas.

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A su vez, y en ambos casos, el ADN puede ser: - Lineal, como por ejemplo el del ncleo de las clulas eucariotas y el de algunos virus. - Circular, como el de las mitocondrias, cloroplastos, bacterias y algunos virus. EL ARN (RNA). DIFERENCIAS CON EL ADN El ARN, cido ribonucleico, es un polirribonucletido que, a diferencia del ADN, no contiene ni desoxirribosa ni timina, pero s ribosa y uracilo. El ARN no forma dobles cadenas, salvo en ciertos virus (por ej. los reovirus). Lo que no quita que su estructura espacial pueda ser en ciertos casos muy compleja. CLASES DE ARN Por su estructura y su funcin se distinguen tres clases de ARN: - El ARNm (ARN mensajero) es un polirribonucletido constituido por una nica cadena sin ninguna estructura de orden superior. Su masa molecular suele ser elevada. Este ARN se sinteti za en el ncleo celular y pasa al citoplasma transportando la informacin para la sntesis de prote nas. La duracin de los ARNm en el citoplasma celular es de escasos minutos siendo degradados rpidamente por enzimas espec ficas. - El ARNt (ARN de transferencia) transporta los aminocidos para la sntesis de protenas. Est formado por una sola cadena, aunque en ciertas zonas se encuentra replegada y asociada internamente mediante puentes de hidrgeno entre bases Fig. 24 ARNt. La lnea es la cadena de complementarias. Su peso molecular es del polinucletidos y los rectngulos las bases o orden de 25.000 da. Est formado por entre los pares de bases. 1) brazo aceptor de ami70 y 90 nucletidos y constituye el 15 % nocidos; 2) bucle anticodon. del total del ARN de la clula. Se sintetiza en el ncleo y sale hacia el citoplasma para realizar su funcin. En el ARNt podemos distinguir un brazo aceptor de aminocidos abierto y un bucle anticodon.

El ARNr (ARN ribosomal) es el ARN de los ribosomas, cuya funcin es poco conocida. Los ARN vricos. Algunos virus tienen como material gentico ARN bicatenario.

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ESTRUCTURAS TERCIARIA Y SUPERIOR DEL ADN (SUPERENROLLAMIENTO)

Dos cromtidas 2x10 vueltas de espiral

1 vuelta de espiral (30 rosetones)

1 rosetn (6 bucles)

1 bucle

Fibra de 30 nm

Collar de perlas (nucleosoma)

ADN

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