Biologa Molecular y Celular

Lic. Marcelo F. Goyanes

Plegamiento Proteico
A medida que la cadena polipeptdica va siendo sintetizada se produce el plegamiento de la cadena naciente. Si se calculan la cantidad de formas que podra adquirir una protena en el espacio, esta estar determinada por la cantidad de aminocidos que presente. Por ejemplo, una protena que posea n restos, podra plegarse en 8n conformaciones distintas. Este clculo se hace en base a que, desde el punto de vista estereoqumico, son ocho los ngulos de enlace permitidos en la columna vertebral de la cadena polipeptdica. Sin embargo, cada protena adopta una conformacin nica que denominaremos estado nativo, siendo sta la forma de plegamiento ms estable de la molcula. Para evitar un anormal plegamiento, la clula consta de dos procesos fundamentales. Uno de ellos se realiza a nivel molecular, mediante el cual la protena se pliega a travs de una va que solo favorece unos pocos pasos intermedios. El otro consiste en un sistema celular que detecta e impide esta condicin anmala. A esta altura, el lector podra formularse la siguiente pregunta: Dnde radica la informacin para que la protena pueda adquirir su forma nativa? La clave para contestarla se encuentra en la secuencia de aminocidos que componen la cadena polipeptdica. Este descubrimiento fue realizado gracias al estudio del plegamiento y desplegamiento in vitro de las protenas. Debe resultarle sabido que ciertos factores rompen los enlaces no covalentes que estabilizan la conformacin nativa de la protena. El calor, los extremos de pH y ciertos agentes qumicos figuran dentro de estos factores. Al proceso por el cual se altera la conformacin compacta y la actividad de la protena, quedando solo su estructura lineal, se lo denomina desnaturalizacin proteica. La mayora de las protenas desnaturalizadas precipitan cuando se encuentran en solucin, debido a que sus grupos hidrfobos interactan con regiones similares de otras molculas no plegadas, formando as un agregado insoluble. La desnaturalizacin no es un proceso irreversible sino que generalmente es posible renaturalizar la protena mediante la eliminacin de los elementos desnaturalizantes. Para este propsito se realiza la dilisis, en donde vuelven a formarse todos los enlaces disulfuro, los puentes de Hidrgeno y todos aquellos enlaces no polares que estabilizan la conformacin nativa. Dado que

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esta restauracin no requiere cofactores u otras protenas, al menos in vitro, el plegamiento funciona como un proceso de autoensamblaje. Siendo la secuencia de los aminocidos la que determine la informacin necesaria para la adquisicin de la forma nativa. En el camino hacia la adquisicin de esta forma, la protena adquiere configuraciones transitorias. Una de estas formas est representada por el estado de glbulo fundido.

El plegamiento proteico es acompaado por verdaderas chaperonas En vivo la protena debe alcanzar su forma nativa con rapidez y alta eficiencia. El plegamiento realizado en el laboratorio, que lleva algunos minutos, no es suficientemente rpido a nivel celular. Un plegamiento errtico de las protenas correspondera a un gasto innecesario de energa y, como sabemos, muchos de los procesos celulares tienen su base en el ahorro energtico. Estudios realizados en el laboratorio indican que, del total de las protenas encontradas en una clula, slo un 5 % distan de su conformacin nativa. La explicacin a esta notable eficiencia podra radicar en la presencia de ciertas protenas de la familia de las chaperonas. Las chaperonas se caracterizan por tener representantes en todos los

compartimentos celulares, en los cuales se unen a una amplia gama de protenas, formando parte del mecanismo general que determina su plegamiento. Podemos establecer dos tipos distintos de chaperonas: Las chaperonas moleculares y las chaperoninas. Las primeras se encargan de estabilizar a aquellas protenas que no estn plegadas, impidiendo as su degradacin. Las segundas facilitan el plegamiento de las cadenas polipeptdicas. El accionar de las chaperonas demanda un gasto energtico, gasto que es cubierto mediante la degradacin del ATP. Las chaperonas pertenecen a un grupo ms amplio de protenas conocido como protenas de shock trmico, cuyas siglas en ingls son Hsp (HeatShock-Proteins). Y, dentro de estas, se las conoce como las Hsp 60 y 70. Ambos tipos de chaperonas poseen afinidad por las zonas hidrofbicas de las protenas plegadas de forma incompleta. Cuando las chaperonas estn unidas al ATP poseen una forma abierta, en la cual un bolsillo hidrofbico se une a las
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zonas homnimas de las protenas cuya estructura dista de la conformacin nativa. Ante la unin de estas, la chaperona adopta una forma cerrada que libera la protena blanco. Se cree que las chaperonas se uniran a todas las cadenas polipeptdicas en formacin, generando efectos que se asemejaran a masajes proteicos, por los cuales proporcionaran a la protena otra posibilidad de plegarse. Para que usted pueda darse una idea del proceso, imagnese que estruja un trapo con ambas manos, retorcindolo hasta que sea compactado. Las chaperoninas eucariotas, o TciP, son grandes complejos formados por ocho unidades de Hsp60. En las clulas del tipo procariota las chaperoninas poseen catorce sub unidades idnticas que conforman un complejo con forma de barril, conocido bajo las siglas GroEL. El mecanismo por el cual el GroEL interviene en el plegamiento proteico es dependiente del ATP. La protena ingresa al mismo y otra chaperonina, la GroES, cubre los extremos del barril. Debido a que la chaperonina eucariota TciP carece de una chaperonina anloga a la GroES, el ltimo paso del plegamiento proteico difiere en las clulas eucariotas.

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Muerte programada de las Protenas Las clulas son capaces de degradar selectivamente cualquier complejo proteico mal ensamblado mediante un elaborado conjunto de protenas que permite dirigirlas especficamente hacia la maquinaria que realizar la protelisis. Una de las funciones que posee dicha protelisis es, como se mencion en el prrafo anterior, el reconocer y eliminar aquellas protenas que se encuentren daadas o mal plegadas. Sin embargo, esta maquinaria proteoltica actuar tambin confirindole una corta vida media a ciertas protenas normales, cuya concentracin ha de cambiar rpidamente o degradar a otras protenas, como las ciclinas, que deben permanecer en concentraciones estables hasta que sean degradadas espontneamente en un determinado momento del ciclo celular. La mayora de las protenas que son degradadas a nivel citoplasmtico son liberadas a grandes complejos proteicos denominados proteosomas. Cada proteosoma consiste en un cilindro central formado por mltiples proteasas, cuyos centros activos formaran una cmara central. Vale decir que estas estructuras celulares actuaran como verdaderas usinas proteolticas, en las cuales las protenas a degradar seran incorporadas y desensambladas. Cada extremo de este cilindro est obturado por un gran complejo proteico constituido por, al menos, 10 polipptidos distintos. Se cree que los tapones proteicos seran los encargados de seleccionar a las protenas que debern ser destruidas, unindose a ellas e introducindolas en la cmara del cilindro. Las protenas que sean blanco de esta verdadera mquina, sern degradadas hasta pequeos pptidos que se eliminarn hacia el exterior. El ttulo de este presente apartado adelantaba que las protenas a ser degradadas estaban marcadas para morir. Es as como los proteosomas actan sobre aquellas protenas que han sido marcadas mediante la adicin covalente de una pequea protena, la ubiquitina. Este pequeo polipptido est presente en todos los tipos celulares, libre o unida covalentemente a otras protenas. La unin de la ubiquitina a las protenas se realiza mediante enzimas especficas, quienes la aaden a un residuo del aminocido lisina, y
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posteriormente aaden series de ubiquitinas adicionales, formando una cadena multiubiquitina, la cual es reconocida por un receptor proteico especfico del proteosoma. Las protenas mal plegadas, desnaturalizadas, con residuos oxidados o anormales, son reconocidas y degradadas por el complejo dependiente de la ubiquitina. Las enzimas que aaden este pptido reconoceran ciertas seales proteicas que denotan su anormalidad. Uno de los problemas que plantea este tipo de mecanismo, es la discriminacin que debe de realizar la clula entre aquellas protenas que estn mal plegadas, las cuales deben ser ubiquitinadas para su posterior destruccin, de otras que estn siendo sintetizadas a nivel ribosomal. Una de las posibilidades que se plantean es que estas ltimas estn protegidas de la ubiquitinacin mediante el acompaamiento de ciertas chaperonas; la otra posibilidad es que el plegamiento proteico, pos traduccin, sea realizado tan rpido que el complejo de ubiquitinacin no posea el tiempo necesario para actuar.

Ciertas enfermedades podran ser causadas por protenas mal plegadas Las protenas podran adoptar concurrentemente formas distantes a la conformacin nativa, por lo cual se producira la prdida de la funcin biolgica y su posterior marcado para ser degradada. La acumulacin de los fragmentos resultantes de la protelisis contribuye a ciertas enfermedades degenerativas
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caracterizadas por la presencia de placas proteicas insolubles en rganos tales como el hgado y el cerebro. La enfermedad de Alzheimer es un ejemplo de lo antedicho, pues se caracteriza por la presencia de placas y ovillos a nivel cerebral. Los filamentos que componen estas placas son producto de la protelisis de abundantes protenas naturales, como la protena precursora de amiloide, una protena de transmembrana, y Tau, una protena de fijacin de microtbulos. En otros rganos se ha visto que la formacin de placas es el resultado de la protelisis de protenas naturales como la gelsolina, una protena fijadora de la actina, y la albmina srica, protena propia de la sangre. Los fragmentos liberados por protelisis se unen formando hilos muy estables. La degeneracin cerebral, similar a la que se produce por Alzheimer, es causada por priones, una protena infecciosa derivada de la protelisis y el replegamiento de una protena normal del cerebro.

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