Sin embargo, segn nuestra legislacin procesa penal vigente, la fase de investigacin del delito atraviesa por 2 momentos:

la investigacin preliminar y la instruccin judicial, la primera bajo la direccin del Ministerio Pblico, y la segunda, bajo la direccin del Juez Penal. En la primera no hay problema, pues es el MP quien dirige dicha investigacin preliminar, lo cual es acorde con la Constitucin. En cambio, en la fase de instruccin judicial, quien lo dirige es el Juez Penal, conforme lo dispone el art. 49 del Cdigo de Procedimientos Penales, de lo que se desprende un primer conflicto entre la norma procesal y la Constitucin vigente, pues la potestad de investigar el delito, segn la Carta Fundamental, le est confiada al Ministerio Pblico, y no al Juez Penal.