PROTEMICA DE EXTREMFILOS

Protemica es el trmino utilizado para los estudios que examinan la global protena de un organismo, tejido o comunidad. Protemica se exitiende ms all del anlisis genmico que solo describen la teora de capacidad de un organismo o comunidad. Por imitacin medio ambiental, la protemica puede ser utiliza para inferir respuestas celulares que son ecolgicamente significativas, para as proporcionar la base para los pases en desarrollo. Los Extremfilos son microorganismos que proliferan los extremos de temperaturas (PH, salinidad, presin, radiacin, etc.) Los extremfilos ofrecen un gran potencial como un natural recurso para el descubrimiento de nuevas enzimas y otros compuestos bioactivos. Aplicacin de tcnicas protemicas de extremfilos Como funcin genmica es adecuado para proporcionar datos cualitativos y cuantitativos para abordar este tipo de preguntas. La principial rea en que la protemica de extremfilos defiere de otros tipos celulares, es la preparacin de los procesos para los anlisis. MS y protemica La principal herramienta analtica para determinar la identidad, abundancia y modificacin de estado de protenas es el MS. La disponibilidad de coincidencia genoma los datos de la secuencia que facilita la identificacin de la protena, un gran nmero de microbios han sido secundados por diversos tipos de extremofilos. La Necesidad de Fraccionar las muestras En adicin de complejidad de la muestra celular, las protenas presentan una amplia gama de concentraciones de hasta siete rdenes de magnitud de mayor y de baja abundancia. Sub-Celulares de Fraccionamiento La Fraccin Secretada.- contiene protenas extracelulares. La Fraccin Insoluble.- que consta de membranas y grandes complejos. La Fraccin Soluble.- que principalmente contiene protenas citoplasmticas.

El anlisis combinado de estas tres fracciones puede enormemente mejorar la cobertura y proporcionar informacin acerca del comportamiento de mentalizacin. Separacin de Protenas Para purificar, reducir la complejidad o visualizar las protenas individuales pueden ser separados con un gel o gel libre.

La Tcnica puede ayudar an ayudar a reducir muestra y complejidad y permite una instantnea y diferencial comparacin de ms de una muestra. Las protenas pueden ser efectivamente separadas por mtodos fuera de lnea. Separacin de Pptido Una forma rpida, sensible, reproducible y automatizados medios de obtener protenas. Los pptidos son normalmente separados de acuerdo a la hidrofobicidad. Protenas de Identificacin de Base y de Novo de Secuenciacin Pptidos y protenas de identificacin es dependiente de la capacidad de igualar experimentalmente lo adquirido intacta masa y la fragmentacin de patrones generados de secuencias de protenas. Abundancia de Protenas Relativas Utilizados mtodos protemico absoluto o relativo de los cambios en protenas, son muy tiles para inferir en respuestas ambientales. Relativa cuantificacin implica la comparacin de dos o ms condiciones (alta o baja temperatura) 2DE de Protemica Cuantitativa La principal ventaja de la 2DE enfoque, es la capacidad de separar y visualizar a miles de protenas, es una sola de poliacrilamida Etiqueta de Protemica Cuantitativa Una etiqueta de libre enfoque son un recipiente desarrollo. Etiqueta de mtodos son implcitamente gel-libre y bien utilizar caractersticas espectrales o escrutinio espectrales similares niveles de biomasa son necesarios para la etiqueta. Estables Istopos etiquetado protemica cuantitativa Los istopos pueden ser introducidas en las protenas o pptidos o in vitro o in vivo In Vitro Etiquetado Requiere la etiqueta para ser covalentemente adjunta que tras la biomasa ha sido recolectada. In Vivo Etiquetado Implica la incorporacin de la etiqueta en protenas durante el crecimiento celular. Metaproteomics Las funciones y las interacciones microbianas, en las comunidades siguen siendo en gran medida desconocidas .Han sido desarrolladas para permitir que los estudios se realicen en las comunidades microbianas y en el medio ambiente.