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Código genético

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Código genético

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Código genético
El código genético es un conjunto de normas por las que la información codificada en el material genético (secuencias de ADN o ARN) se traduce en proteínas (secuencias de aminoácidos) en las células vivas. El código define la relación entre secuencias de tres nucleótidos, llamadas codones, y aminoácidos. Un codón se corresponde con un aminoácido específico. El ARN se basa en transportar un mensaje del ADN a la molécula correspondiente La secuencia del material genético se compone de cuatro bases nitrogenadas distintas, que tienen una función equivalente a letras en el código genético: adenina (A), timina (T), guanina (G) y citosina (C) en el ADN y adenina (A), uracilo (U), guanina (G) y citosina (C) en el ARN. Debido a esto, el número de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminoácidos (siendo además uno de ellos el codón de inicio, AUG) y los tres restantes son sitios de parada (UAA, llamado ocre; UAG, llamado ámbar; UGA, llamado ópalo). La secuencia de codones determina la secuencia aminoacídica de una proteína en concreto, que tendrá una estructura y una función específicas.
Serie de codones en un segmento de ARN. Cada codón se compone de tres nucleótidos que codifican un aminoácido específico.

Descubrimiento del código genético
Cuando James Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins y Rosalind Franklin crearon el modelo de la estructura del ADN, se comenzó a estudiar en profundidad el proceso de traducción en las proteínas. En 1955, Severo Ochoa y Marianne Grunberg-Manago aislaron la enzima polinucleótido fosforilasa, capaz de sintetizar ARNm sin necesidad de modelo a partir de cualquier tipo de nucleótidos que hubiera en el medio. Así, a partir de un medio en el cual tan sólo hubiera UDP (urdín difosfato) se sintetizaba un ARNm en el cual únicamente se repetía el ácido urídico, el denominado poli-U (....UUUUU....). George Gamow postuló que un código de codones de tres bases debía ser el empleado por las células para codificar la secuencia aminoacídica, ya que tres es el número entero mínimo que con cuatro bases nitrogenadas distintas permiten más de 20 combinaciones (64 para ser exactos).

El código genético.

Los codones constan de tres nucleótidos fue demostrado por primera vez en el experimento de Crick, Brenner y colaboradores. Marshall Nirenberg y Heinrich J. Matthaei en 1961 en los Institutos Nacionales de Salud

Posteriormente. Esta secuencia de ARN se traducirá en una secuencia aminoacídica de tres aminoácidos de longitud. y 6 para un codón. AAA y CCC. Si. Se puede comparar con la informática. Cada gen codificante para proteína se transcribe en una molécula plantilla. Este trabajo se basó en estudios anteriores de Severo Ochoa. donde un codón se asemejaría a una palabra. en un ordenador normal). lo que sería el “trozo” estándar para el manejo de datos (como un aminoácido a una proteína).. en el caso de algunos virus. Holley y Nirenberg recibieron el Premio Nobel en Fisiología o Medicina por su trabajo. la molécula adaptadora que facilita la traducción. se necesitarían al menos 2 bits para representar un nucleótido. se traduce en el ribosoma. UUUAAACCC. Los ARNt tienen anticodones complementarios a los codones del ARNm y se pueden “cargar” covalentemente en su extremo 3' terminal CCA con aminoácidos. en el ARN. Las bases purínicas adenina (A) y guanina (G) son más grandes y tienen dos anillos aromáticos. Robert W. por ejemplo.Código genético descubrieron la primera correspondencia codón-aminoácido. En el proceso de traducción se necesita un ARN de transferencia ó ARNt específico para cada aminoácido con el aminoácido unido a él covalentemente. Holley determinó la estructura del ARN de transferencia. y un nucleótido es similar a un bit. Continuando con el trabajo anterior. guanosina trifosfato como fuente de energía y ciertos factores de traducción. Nirenberg y Philip Leder fueron capaces de determinar la traducción de 54 codones. pasadas a través de un filtro que contiene ribosomas. En 1968. a su vez. que se conoce como ARN mensajero o ARNm. cada uno de los cuales específica un aminoácido. (En la práctica. Además. tenemos una secuencia de ARN. y la lectura del fragmento empieza en la primera U (convenio 5' a 3'). utilizando diversas combinaciones de ARNm.. tradujeron una secuencia ARN de poli-uracilo (UUU. Empleando un sistema libre de células. En el ARN. Har Gobind Khorana completó el código. habría tres codones que serían UUU. Esos genes que codifican proteínas están compuestos por unidades de trinucleótidos llamadas codones. que sería la unidad más pequeña. Los ARNt individuales se cargan con aminoácidos específicos por las enzimas llamadas aminoacil ARNt sintetasas. Las bases pirimidínicas citosina (C) y timina (T) son más pequeñas y sólo tienen un anillo aromático. una desoxirribosa y una de las cuatro posibles bases nitrogenadas. quien recibió el premio Nobel en 1959 por su trabajo en la enzimología de la síntesis de ARN. dos cadenas de ADN están unidas entre sí por puentes de hidrógeno en una asociación conocida como emparejamiento de bases. Esto quiere decir que el número de residuos A y T será el mismo en una doble hélice y lo mismo pasará con el número de residuos de G y C. La alta especificidad de estas enzimas es motivo fundamental del mantenimiento de la fidelidad de la traducción de proteínas. Éste. la timina (T) se sustituye por uracilo (U). y poco después. en una cadena aminoacídica o polipeptídica.. Cada subunidad nucleotídica está formada por un fosfato. Los ARNt se unían a tripletes específicos. Khorana. Hay 4³ = 64 combinaciones diferentes de codones que sean posibles con tripletes de tres nucleótidos: los 64 codones están asignados a aminoácido o a señales de parada en la traducción. . estos puentes siempre se forman entre una adenina de una cadena y una timina de la otra y entre una citosina de una cadena y una guanina de la otra.. De esto se deduce que el codón UUU específica el aminoácido fenilalanina. cada una de los cuales codifica un aminoácido. y la desoxirribosa por una ribosa.) y descubrieron que el polipéptido que habían sintetizado sólo contenía fenilalanina. que tienen alta especificidad tanto por aminoácidos como por ARNt. En la configuración en doble hélice. 2 Transferencia de información El genoma de un organismo se encuentra en el ADN o. La porción de genoma que codifica varias proteínas o un ARN se conoce como gen.

UCG. aunque los codones GAA y GAG especifican los dos el ácido glutámico (redundancia). no varían el aminoácido. la tercera posición de los codones de la glicina (GGA. Sólo la tercera posición de algunos codones puede ser cuatro veces degenerada. En biocomputación. se han distinguido 22 códigos genéticos. GAG) es doble degenerada. Así. Se dice que una posición de un codón es dos veces degenerada si sólo dos de las cuatro posibles sustituciones de nucleótidos especifican el mismo aminoácido. así que sólo sustituciones transversionales (purina a pirimidina o pirimidina a purina) en dobles degenerados son antónimas. especificado por AUG. Sin embargo. UUG. el ácido glutámico se específica por GAA y GAG (difieren en la tercera posición). los nucleótidos equivalentes son siempre dos purinas (A/G) o dos pirimidinas (C/U). CUC. el otro es triptófano. es decir. Esta es la tercera posición de un codón de isoleucina: AUU. De una posición de un codón se dice que es cuatro veces degenerada si con cualquier nucleótido en esta posición se específica el mismo aminoácido. segunda o tercera posición). especificado por UGG. Los codones que codifican un aminoácido pueden diferir en alguna de sus tres posiciones. Especificidad y continuidad Ningún codón codifica más de un aminoácido. Sólo dos aminoácidos se especifican por un único codón.[1] que se diferencian del llamado código genético estándar por el significado de uno o más codones. AGU. incluyendo virus y organelos. ninguno específica otro aminoácido (no ambigüedad). Que el código genético sea degenerado es lo que .Código genético 3 Características Universalidad El código genético es compartido por todos los organismos conocidos. de no ser así. UCC. pero AUG codifica metionina. Por ejemplo. de manera que entre ellos no existan comas ni espacios y sin compartir ninguna base nitrogenada. Tampoco presenta solapamiento: los tripletes se hallan dispuesto de manera lineal y continua. conllevaría problemas considerables para la síntesis de proteínas específicas para cada gen. este sitio se trata a menudo como doble degenerado. AUC y AUA. GGG. Sólo hay un sitio triple degenerado en el que cambiando tres de cuatro nucleótidos no hay efecto en el aminoácido. por ejemplo. desde el codón de iniciación hasta el codón de parada. ya que. Por ejemplo. En los lugares dos veces degenerados.3'). lo que conduce a la síntesis de varios polipéptidos diferentes a partir del mismo transcrito. GGU) es cuatro veces degenerada. el codón UUU codifica el aminoácido fenilalanina tanto en bacterias. que también indica el comienzo de la traducción. CUU. uno de ellos es la metionina. porque todas las sustituciones de nucleótidos en este lugar son sinónimos. la tercera posición de los codones del ácido glutámico (GAA. Degeneración El código genético tiene redundancia pero no ambigüedad (ver tablas de codones). Hay tres aminoácidos codificados por 6 codones diferentes: serina. mientras que cambiando los cuatro posibles nucleótidos aparece una sustitución del aminoácido. Por ejemplo. Su lectura se hace en un solo sentido (5' . se específica por UCA. Gracias a la genética molecular. Este hecho indica que el código genético ha tenido un origen único en todos los seres vivos conocidos. arginina. mientras que en el caso de la serina. aunque pueden aparecer pequeñas diferencias. todos codifican isoleucina. AGC (difieren en la primera. El genoma nuclear de los eucariotas sólo suele diferenciarse del código estándar en los codones de iniciación y terminación. CUA y CUG (difieren en la primera o en la tercera posición). como en arqueas y en eucariontes. GGC. leucina. el aminoácido leucina se específica por los codones UUA. por ejemplo. en un mismo ARNm pueden existir varios codones de inicio. La mayor diversidad se presenta en las mitocondrias. UCU. Se dice que una posición de un codón es no degenerada si una mutación en esta posición tiene como resultado la sustitución de un aminoácido. orgánulos de las células eucariotas que se originaron evolutivamente a partir de miembros del dominio Bacteria a través de un proceso de endosimbiosis.

ya que los individuos heterocigotos presentan cierta resistencia ante el parásito malárico Plasmodium (ventaja heterocigótica o heterosis). GAA o GAG se convierte en GUA o GUG. En la hemoglobina mutante un glutamato hidrofílico (Glu) se sustituye por una valina hidrofóbica (Val). La degeneración aparece porque el código genético designa 20 aminoácidos y la señal parada. porque el código genético es el mismo para todos los individuos. Frases como «Se analizó el código genético de los restos y coincidió con el de la desaparecida». y los pares de bases formados se llaman “pares de bases wobble” (tambaleantes). la equivalencia de purinas o de pirimidinas en los lugares dobles degenerados añade una tolerancia a los fallos complementaria. los dos veces degenerados pueden tolerar una de las tres posibles mutaciones puntuales en la tercera posición. entonces sólo podrían codificarse 16 aminoácidos (4²=16). indicando que debe haber degeneración. un gen de hemoglobina mutado provoca la enfermedad de células falciformes. o de ADN. Debido a que hay cuatro bases. de genotipo. los codones cuatro veces degenerados pueden tolerar cualquier mutación puntual en la tercera posición. aunque el codón de uso sesgado restringe esto en la práctica en muchos organismos. NAN codifica un tamaño promedio de residuos hidrofílicos. Por ejemplo. 4 Usos incorrectos del término La expresión "código genético" es frecuentemente utilizada en los medios de comunicación como sinónimo de genoma. por ejemplo. La enfermedad de las células falciformes no está causada generalmente por una mutación de novo. Agrupamiento de codones por residuos aminoacídicos. las mutaciones puntuales pueden causar la aparición de proteínas disfuncionales. aunque es posible que lo comparta con otros si se ha originado por algún mecanismo de multiplicación asexual. Incluso así. Debido a que las mutaciones de transición (purina a purina o pirimidina a pirimidina) son más probables que las de transversión (purina a pirimidina o viceversa). volumen molar e hidropatía Una consecuencia práctica de la redundancia es que algunos errores del código genético sólo causen una mutación silenciosa o un error que no afectará a la proteína porque la hidrofilidad o hidrofobidad se mantiene por una sustitución equivalente de aminoácidos. los codones en triplete se necesitan para producir al menos 21 códigos diferentes. cada organismo tiene un genotipo propio. NCN codifica residuos aminoacídicos que son pequeños en cuanto a tamaño y moderados en cuanto a hidropatía. por ejemplo. en teoría. Sin embargo.[2][3] Estas tendencias pueden ser resultado de una relación de las aminoacil ARNt sintetasas con los codones heredada un ancestro común de los seres vivos conocidos.Código genético determina la posibilidad de mutaciones sinónimas. Y dado que al menos se necesitan 21 códigos. o «se creará una base de datos con el código genético de todos los ciudadanos» son científicamente incorrectas. . 4³ da 64 codones posibles. La sustitución de glutamato por valina reduce la solubilidad de β-globina que provoca que la hemoglobina forme polímeros lineales unidos por interacciones hidrofóbicas entre los grupos de valina y causando la deformación falciforme de los eritrocitos. un codón de NUN (N =cualquier nucleótido) tiende a codificar un aminoácido hidrofóbico. Esta propiedad del código genético lo hacen más tolerante a los fallos en mutaciones puntuales. Más bien se selecciona en regiones de malaria (de forma parecida a la talasemia). aludir al «código genético de una determinada persona». UNN codifica residuos que no son hidrofílicos. Por ejemplo. si hubiera dos bases por codón. Las bases modificadas incluyen inosina y los pares de bases que no son del tipo Watson-Crick U-G. La relación entre el ARNm y el ARNt a nivel de la tercera base se puede producir por bases modificadas en la primera base del anticodón del ARNt. Por ejemplo. es decir. Es insensato.

CCA. el primer AUG en un ARNm es la región que codifica el sitio donde la traducción de proteínas se inicia. La tabla 2 muestra qué codones especifican cada uno de los 20 aminoácidos que intervienen en la traducción. Está codificado por el codón UAG (que normalmente es de parada) cuando están presentes en la secuencia los elementos PYLIS (Secuencia de inserción de la pirrolisina). CAC AUU. La tabla 1 muestra qué aminoácido específica cada uno de los 64 codones. AAG CGU. ACG Trp (W) UGG Tyr (Y) UAU. He aquí algunas diferencias con el estándar: . y UGU y UGC representan cisteína (en la denominación estándar por 3 letras. CUC. GUC. tioredoxina reductasas. se conocen 22 códigos genéticos. el codón AAU es el aminoácido asparagina. UAC Val (V) GUU. UGA. CUA. AGG Met (M) AUG AAU. UUC Pro (P) Sec (U) Ser (S) CCU. GUA. AUC. UCG. CUG Parada UAG. CUU. Estas tablas se llaman tablas de avance y retroceso respectivamente. ACA. UAA Phe (F) UUU. CCG UGA UCU. La siguiente tabla inversa indica qué codones codifican cada uno de los aminoácidos. CGC. GAC UGU. CGG. GCG Lys (K) AAA. La selenocisteína (Sec/U)[4] es un aminoácido presente en multitud de enzimas (glutatión peroxidasas. Nótese que el codón AUG codifica la metionina pero además sirve de sitio de iniciación.Código genético 5 Tabla del código genético estándar El código genético estándar se refleja en las siguientes tablas. Ala (A) Arg (R) Asn (N) Asp (D) Cys (C) Gln (Q) Glu (E) Gly (G) His (H) Ile (I) Leu (L) GCU. AAC GAU. GGG CAU. Son la selenocisteína y la pirrolisina. El otro aminoácido. CGA. CAG GAA. UGC CAA. Excepciones a la universalidad Como se mencionó con anterioridad. ACC. formiato deshidrogenasas. AGU.[5][6] es un aminoácido presente en enzimas metabólicas de arqueas metanógenas. AUA UUA. tetraiodotironina 5' deiodinasas. Está codificado por el codón UGA (que normalmente es de parada) cuando están presentes en la secuencia los elementos SECIS (Secuencia de inserción de la seleniocisteína). UCC. CCC. glicina reductasas y algunas hidrogenasas). AGC Thr (T) ACU. GCA. GGA. Por ejemplo. AGA. UCA. la pirrolisina (Pyl/O). GGC. GCC. GUG Comienzo AUG Aminoácidos 21 y 22 Exiten otros dos aminoácidos codificados por el código genético en algunas circunstancias y en algunos organismos. UUG. respectivamente). Asn y Cys. GAG GGU.

protozoos y Coelenterate Mycoplasma y Spiroplasma (núcleo) Mitocondrias de equinodermos y platelmintos UGA Trp Q Q W M T T T T W AAA Asn AGA Ser AGG Ser UGA Trp N S S W C S G G M W N S S Y Euplotidae (núcleo) Endomycetales (núcleo) Mitocondrias de Ascidiacea UGA Cys CUG Ser AGA Gly AGG Gly AUA Met UGA Trp Mitocondrias de platelmintos (alternativo) AAA Asn AGA Ser AGG Ser UAA Tyr UGA W Blepharisma (núcleo) Mitocondrias de Chlorophyceae UAG Gln TAG Leu Q L . Dasycladaceae y Hexamita (núcleo) UAA Gln UAG Gln Mitocondrias de mohos.Código genético 6 Mitocondrias de vertebrados AGA Ter AGG Ter AUA Met UGA Trp * * M W S S AnGyBeL Mitocondrias de invertebrados AGA Ser AGG Ser AUA Met UGA Trp M W AGG Ausente en Drosophila Mitocondrias de levaduras AUA Met CUU Thr CUC Thr CUA Thr CUG Thr UGA Trp CGA Ausente CGC Ausente Ciliados.

doi: 10. Turner..1046/j. chem.. Schimmel. nih.1073/pnas. In Reaction Centers of Photosynthetic Bacteria. puede ser un desarrollo posterior y que. gov/ Taxonomy/ Utils/ wprintgc.J. R. algunos de los cuales se incorporaron más tarde a la maquinaria de codificación genética. uk/ iubmb/ newsletter/ 1999/ item3. html)» (reprint. los aminoácidos que comparten la misma vía biosintética tienden a tener la primera base igual en sus codones[9] y aminoácidos con propiedades físicas similares tienden a tener similares a codones.95.-E. Germany) 209-218 Genetic Algorithms and Recursive Ensemble Mutagenesis in Protein Engineering http:/ / www. .x (http:/ / dx.A. Se ha planteado la hipótesis de que el código genético estándar actual surgiera por expansión biosintética de un código simple anterior. en un principio. The direct genetic encoding of pyrrolysine.Código genético 7 Mitocondrias de trematodos TGA Trp ATA Met AGA Ser AGG Ser AAA Asn Mitocondrias de Scenedesmus obliquus TCA Ter TAG Leu W M S S N * L El origen del código genético A pesar de las variaciones que existen. Proceedings of the National Academy of Sciences 95 (19):  pp. Esto ha llevado a pensar que el código genético primitivo podría haber constado de codones de dos nucleótidos. las proteínas se sintetizaran directamente sobre la secuencia de ARN. The 22nd Amino Acid. Curr Opin Microbiol 8 (6): 706–712. Atkins and Ray Gesteland (2002). org. x).[7] El código genético no es una asignación aleatoria de los codones a aminoácidos. cgi)».R.. [6] Krzycki J (2005). « Genetic code origins: tRNAs older than their synthetases? (http:/ / www. doi: 10. aunque circunstanciales. nlm. with permission).news99.) (Springer-Verlag. lo que resulta bastante coherente con la hipótesis del balanceo del ARNt durante su acoplamiento (la tercera base no establece puentes de hidrógeno de Watson y Crick). La vida primordial pudo adicionar nuevos aminoácidos (por ejemplo. nih.. [5] John F. Esto sugiere que el código genético se estableció muy temprano en la historia de la vida y que tiene un origen común en las formas de vida actuales. doi. Science 296 (5572): 1409–1410. org/ 10. pnas. Steer. ncbi.. 607–609. (1998). [7] De Pouplana. 19. 1999. 1046/ j. Otro factor interesante a tener en cuenta es que la selección natural ha favorecido la degeneración del código para minimizar los efectos de las mutaciones y es debido a la interacción de dos átomos distintos en la reacción[14] . Se tienen pruebas. . 11295). ac. news99. de que formas de vida primitivas empleaban un menor número de aminoácidos diferentes. 1432-1327. actuando éste como ribozima y catalizando la formación de enlaces peptídicos (tal como ocurre con el ARNr 23S del ribosoma). PMID 9736730 (http:/ / www. P. gov/ pubmed/ 9736730). org/ 10. org/ cgi/ content/ full/ 95/ 19/ 11295)». qmul.[12] Esto sugiere que el complejo mecanismo actual de traducción del ARNm que implica la acción ARNt y enzimas asociadas. ncbi. 1990.. subproductos del metabolismo). .[13] aunque no se sabe con exactitud que aminoácidos y en que orden entraron en el código genético.[10][11] Experimentos recientes demuestran que algunos aminoácidos tienen afinidad química selectiva por sus codones. L. Michel-Beyerle. Análisis filogenético sugiere que las moléculas ARNt evolucionaron antes que el actual conjunto de aminoacil-ARNt sintetasas. au/ ci/ vol01/ fullen01/ html/ IUPAC-IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN) and Nomenclature Committee of IUBMB (NC-IUBMB) (1999).[8] Por ejemplo. 1073/ pnas. 95. M. Yang et al. 11295.1999. complexity. « Newsletter 1999 (http:/ / www. nlm.1432-1327. B. Referencias [1] [2] [3] [4] « The Genetic Codes (http:/ / www.11295 (http:/ / dx..19. (Ed. European Journal of Biochemistry 264 (2):  pp. doi. los códigos genéticos utilizados por todas las formas conocidas de vida son muy similares.

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