Workshop: Herramientas bioinformticas para el estudio de la Biodiversidad Sumilla La bioinformtica permite la utilizacin de anlisis computacionales y bases de datos para

el estudio de genomas de diversos organismos. La unin entre las aplicaciones de la biologa molecular y computacional permite el anlisis de secuencias de ADN para la identificacin molecular, y estimar la diversidad gentica, las relaciones evolutivas y el estado de conservacin de poblaciones naturales. El anlisis de secuencias de ADN puede ser realizado en distintos organismos como virus, bacterias, parsitos, hongos, plantas, insectos, moluscos, peces y humanos; y aplicado a distintas disciplinas como gentica de poblaciones, sistemtica, ecologa, salud, conservacin y manejo de recursos. El taller tiene como objetivo mostrar de manera prctica diversos programas utilizados para la obtencin, manejo, y anlisis de secuencias de ADN. Los participantes deben tener conocimientos bsicos de biologa molecular, sistemtica e informtica, y disponer de una computadora personal. Programacin: 3 das (18 horas) Da 1 1. Introduccin / Obtencin de datos de secuencias nucleotdicas Bioinformtica: Concepto, desarrollo. Marcadores moleculares, utilizacin en identificacin molecular, sistemtica y gentica de poblaciones. Utilizacin de bases de datos y motores de bsqueda. Genbank, Pubmed. 2. Alineamientos Alineamientos locales (BLAST), alineamiento mltiple de Secuencias Programas: ClustalX/ClustalW, Muscle, MAFFT. Da 2 1. Filogenias: Sistemtica molecular, relaciones evolutivas, modelos de sustitucin nucleotdica, hiptesis filogenticas y evaluacin de soporte de clados (bootstrap / Markov Chains). Programas: MEGA, jModeltest, PhyML, MrBayes. 2. Patrones demogrficos: Gentica de poblaciones. Estimacin de la diversidad gentica. Demografa histrica de las poblaciones (expansin sbita, cuellos de botella, coalescencia). Flujo gentico y Diferenciacin poblacional (Fst). Redes de Haplotipos . Programas: DNAsp, Arlequin, Network.

Da 3 1. Anlisis de tiempos de divergencia y ancestros comunes Ejemplos en virus y mamferos. Estimacin de tasas de mutacin y de ancestros comunes ms recientes (MRCA). Interpretacin de resultados. Programas: Preparacin de datos (Beauti), corrida de datos (BEAST). Anlisis de resultados (Tracer) y filogenias (FigTree). 2. DNA Barcoding: Cdigos de barras de ADN, identificacin molecular. Pros y contras. La importancia de formar taxnomos. Iniciativas CBOL. IBOL.

Lugar de realizacin: Auditorio del Museo de Historia Natural. Av. Arenales 1256 Jess Mara. Fechas: 22-24 Agosto, 2012; Horario: 9 -12 y 2-5 pm. Costo: Estudiantes de pregrado: S/. 120 Estudiantes de posgrado y Profesionales: S/. 180

Informacin de contacto Mg. Pedro Romero: quipu.romero@gmail.com Museo de Historia Natural UNMSM.

CV Poseo el grado de Magster en Biologa Molecular por la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, soy Bilogo con mencin en Biologa Celular y Gentica por la misma universidad. Tengo experiencia en proyectos que involucran el estudio de la diversidad gentica, y la aplicacin de la sistemtica molecular y filogenias para estudiar el origen y evolucin de la biodiversidad en especies neotropicales. Experiencia en campo (costa central/Amazonia Occidental), laboratorio (tcnicas de biologa molecular: Extraccin de DNA, PCR, electroforesis, manejo de datos de secuencias, barcoding) y museo (curadura y preservacin de material biolgico, anlisis morfomtrico). He realizado estancias de investigacin en Holanda, Brasil, y Francia, as como presentaciones en congresos y cursos nacionales e internacionales (Mxico, Chile, Brasil) y cursos sobre la aplicacin de la bioinformtica en estudios de biodiversidad (profesor invitado en UNMSM, UNI, UNPRG).