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TEMA 9: NUCLETIDOS Y CIDOS NUCLEICOS.

1.-INTRODUCCIN.
Entre las biomolculas ms importantes, por su papel en el almacenamiento y transmisin de la informacin gentica, se encuentran los cidos nucleicos. Los cidos nucleicos son macromolculas formadas por la unin de unidades bsicas denominadas nucletidos. Dicha unin se realiza mediante un tipo de enlace conocido como puente fosfodister. Se puede considerar que los nucletidos son los sillares estructurales de los cidos nucleicos, del mismo modo que los aminocidos lo son de las protenas o los monosacridos de los polisacridos. Adems de desempear este importante papel, los nucletidos como tales tienen otras funciones biolgicas de naturaleza energtica o coenzimtica.

2.-CONSTITUYENTES QUMICOS DE LOS NUCLETIDOS.

Cuando se somete a los cidos nucleicos a hidrlisis en condiciones suaves liberan sus unidades monomricas constitutivas: los nucletidos. Los sillares estructurales de otras

2 macromolculas, como los aminocidos o los monosacridos, no son susceptibles de descomponerse a su vez en unidades ms simples; sin embargo los nucletidos s pueden sufrir hidrlisis dando lugar a una mezcla de pentosas, cido fosfrico y bases nitrogenadas. Cada nucletido est compuesto por una pentosa, una molcula de cido fosfrico y una base nitrogenada enlazados de un modo caracterstico. En la Figura 9.1 se muestran estos tres componentes de los nucletidos. Las pentosas que aparecen formando parte de los nucletidos son la -D-ribosa y su derivado, el desoxiazcar 2'--D-desoxirribosa, en el que el grupo hidroxilo unido al carbono 2' fue sustituido por un tomo de hidrgeno. Ambas se encuentran en forma de anillos de furanosa (ver Figura 9.1). Las posiciones del anillo de furanosa se numeran convencionalmente aadiendo el signo (') al nmero de cada tomo de carbono para distinguirlas de las de los anillos de las bases nitrogenadas. El tipo de cido fosfrico que se encuentra en los nucletidos es concretamente el cido ortofosfrico, cuya estructura molecular se muestra en la Figura 9.1. Las bases nitrogenadas (Figura 9.1) son compuestos heterocclicos que, gracias al sistema de dobles enlaces conjugados que poseen en sus anillos, poseen un acusado carcter aromtico, siendo su conformacin espacial planar o casi planar. Sus tomos de nitrgeno poseen pares electrnicos no compartidos que tienen tendencia a captar protones, lo que explica su carcter dbilmente bsico. Los compuestos originarios de los que derivan estas bases nitrogenadas son la purina y la pirimidina. Existen formando parte de los nucletidos dos derivados de la purina (bases pricas), que son la adenina y la guanina, y tres derivados de la pirimidina (bases pirimdicas), que son la citosina, la timina y el uracilo. Todas ellas se obtienen por adicin de diferentes grupos funcionales en distintas posiciones de los anillos de la purina o de la pirimidina (por ejemplo la adenina es la 6-amino-purina, y el uracilo la 2,4dioxipirimidina). Las caractersticas qumicas de estos grupos funcionales les permiten participar en la formacin de puentes de hidrgeno, lo que resulta crucial para la funcin biolgica de los cidos nucleicos.

3.-NUCLESIDOS.
Las pentosas se unen a las bases nitrogenadas dando lugar a unos compuestos denominados nuclesidos. La unin se realiza mediante un enlace N-glucosdico entre el tomo de carbono carbonlico de la pentosa (carbono 1') y uno de los tomos de nitrgeno de la base nitrogenada, el de la posicin 1 si sta es pirimdica o el de la posicin 9 si sta es prica. El enlace Nglucosdico es una variante del tipo ms habitual de enlace glucosdico (Oglucosdico), que se forma cuando un hemiacetal o hemicetal intramolecular reacciona con una amina, en lugar de hacerlo con un alcohol, liberndose una molcula de agua. Los nuclesidos en estado libre slo se encuentran en cantidades mnimas en las

3 clulas, generalmente como productos intermediarios en el metabolismo de los nucletidos. Existen dos tipos de nuclesidos: los ribonuclesidos, que contienen -D-ribosa como componente glucdico, y los desoxirribonuclesidos, que contienen -D-desoxirribosa. En la naturaleza se encuentran ribonuclesidos de adenina, guanina, citosina y uracilo, y desoxirribonuclesidos de adenina, guanina, citosina y timina. En la Figura 9.2 se representan dos nuclesidos de adenina. Los nuclesidos se nombran aadiendo la terminacin -osina al nombre de la base nitrogenada si sta es prica o bien la terminacin -idina si sta es pirimdica (ver Tabla 9.1), y anteponiendo el prefijo desoxi- en el caso de los desoxirribonuclesidos.

4.-NUCLETIDOS.

Los nucletidos resultan de la unin mediante enlace ster de la pentosa de un nuclesido con una molcula de cido fosfrico. Esta unin, en la que se libera una molcula de agua, puede producirse en cualquiera de los grupos hidroxilo libres de la pentosa, pero como regla general tiene lugar en el que ocupa la posicin 5'; es decir, los nucletidos son los 5' fosfatos de los correspondientes nuclesidos. La posesin de un grupo fosfato, que a pH 7 se encuentra ionizado, confiere a los nucletidos un carcter marcadamente cido. En la Figura 9.3 se muestra la estructura de un nucletido de manera que se puedan distinguir sus tres constituyentes qumicos. Adems de los nucletidos monofosfato que acabamos de describir, que son los sillares estructurales de los cidos nucleicos, existen en la naturaleza nucletidos di~ y trifosfato, que resultan de la unin mediante enlace anhidro de 1 2 molculas de cido fosfrico adicionales a la que se encuentra unida al carbono 5' de la pentosa (Figura 9.4). Al igual que los nuclesidos, los nucletidos pueden clasificarse en ribonucletidos y desoxirribonucletidos segn contengan ribosa o desoxirribosa respectivamente. Existen diversas maneras de nombrar los nucletidos; la de uso ms amplio y menor ambigedad es la que se muestra en la parte derecha de la Tabla 9.1. En ella cada nucletido se identifica mediante

4 tres letras maysculas, la primera de ellas es la inicial de la base nitrogenada, la segunda indica si el nucletido es Mono~, Di~, o Trifosfato, y la tercera es la inicial del grupo fosfato (en ingls, phosphate); en el caso de los desoxirribonucletidos se antepone una "d" minscula a estas tres siglas. Otra forma de nombrarlos consiste en anteponer la palabra cido y aadir la terminacin -lico al nombre de la base nitrogenada correspondiente; as, por ejemplo, el AMP se puede denominar tambin como cido adenlico, o, dado que a pH 7 se encuentra normalmente disociado, como adenilato; este sistema de nomenclatura resulta un tanto ambiguo ya que no especifica el nmero de grupos fosfato. Tambin es habitual nombrar a los nucletidos como fosfatos de los correspondientes nuclesidos; por ejemplo, el ATP es el trifosfato de adenosina o adenosn-trifosfato. La Tabla 9.1 contiene un resumen de la nomenclatura ms comn de los nucletidos y de sus constituyentes qumicos.
NUCLETIDOS PENTOSA BASE NITROGENADA NUCLESIDOS MONO~ RIBONUCLESIDOS ADENINA GUANINA CITOSINA URACILO ADENOSINA GUANOSINA CITIDINA URIDINA DI~ TRI~ RIBONUCLETIDOS AMP GMP CMP UMP ADP GDP CDP UDP ATP GTP CTP UTP

RIBOSA

DESOXIRRIBONUCLESIDOS DESOXIADENOSINA DESOXIGUANOSINA DESOXICITIDINA DESOXITIMIDINA

DESOXIRRIBONUCLETIDOS dAMP dGMP dCMP dTMP dADP dGDP dCDP dTDP dATP dGTP dCTP dTTP

DESOXIRRIBOSA

ADENINA GUANINA CITOSINA TIMINA

Tabla 9.1

5.-FUNCIONES DE LOS NUCLETIDOS.

Adems de ser los sillares estructurales de los cidos nucleicos, los nucletidos desempean en las clulas otras funciones no menos importantes. Los enlaces anhidro que unen los grupos fosfato adicionales de los nucletidos di~ y trifosfato son enlaces ricos en energa:

5 necesitan un aporte energtico importante para formarse y liberan esta energa cuando se hidrolizan (Figura 9.5). Esto les permite actuar como transportadores de energa. En concreto, el trifosfato de adenosina (ATP) acta universalmente en todas las clulas transportando energa, en forma de energa de enlace de su grupo fosfato terminal, desde los procesos metablicos que la liberan hasta aquellos que la requieren. En algunas reacciones del metabolismo, otros nucletidos trifosfato como el GTP, CTP y UTP, pueden sustituir al ATP en este papel.

Por otra parte, algunos nucletidos o sus derivados pueden actuar como coenzimas (sustancias orgnicas no proteicas que resultan imprescindibles para la accin de muchos enzimas). Tal es el caso del NAD, NADP, FAD o FMN, nucletidos complejos en los que aparecen bases nitrogenadas diferentes a las tpicas de los cidos nucleicos, que actan como transportadores de electrones en reacciones metablicas de oxidacin-reduccin. Otros nucletidos como el cAMP, un fosfato cclico de adenosina en el que el grupo fosfato est unido mediante enlace ster al hidroxilo de la posicin 3' y al de la posicin 5', actan como mediadores en determinados procesos hormonales, transmitiendo al citoplasma celular seales qumicas procedentes del exterior.

6.-CIDOS NUCLEICOS.
Los cidos nucleicos son polmeros de nucletidos. En ellos la unin entre las sucesivas unidades nucleotdicas se realiza mediante enlaces tipo ster-fosfato que resultan de la reaccin entre el cido fosfrico unido al carbono 5' de la pentosa de un nucletido y el hidroxilo del

6 carbono 3' de la pentosa de otro nucletido. Este tipo de unin, en la que un grupo fosfato queda unido por dos enlaces ster a dos nucletidos sucesivos, se conoce tambin como puente fosfodister (Figura 9.6). Cuando dos nucletidos se unen mediante un puente fosfodister el dinucletido que resulta conserva un grupo 5' fosfato libre en un extremo que puede reaccionar con el grupo hidroxilo 3' de otro nucletido, y un grupo hidroxilo 3' libre que puede reaccionar con el grupo 5' fosfato de otro nucletido. Esta circunstancia permite que mediante puentes fosfodister se puedan enlazar un nmero elevado de nucletidos para formar largas cadenas lineales que siempre tendrn en un extremo un grupo 5' fosfato libre y en el otro un grupo hidroxilo 3' libre. De manera anloga a lo establecido para otros tipos de biomolculas, el compuesto formado por una cadena de hasta 10 nucletidos se denomina oligonucletido, mientras que si el nmero de unidades nucleotdicas es superior a 10 se dice que es un polinucletido. En la mayor parte de los casos, las cadenas polinucleotdicas de los cido nucleicos contienen varios miles de estas unidades monomricas unidas por puentes fosfodister.. Del mismo modo que se defini la estructura primaria de las protenas como su secuencia de aminocidos, se puede definir la estructura primaria de los cidos nucleicos como su secuencia de nucletidos. La analoga entre cidos nucleicos y protenas todava se puede llevar ms all: al igual que las cadenas polipeptdicas poseen un esqueleto montono a partir del cual se proyectan lateralmente los grupos R de los distintos aminocidos, los cidos nucleicos poseen un esqueleto de las mismas caractersticas, formado por una sucesin alterna de pentosas y grupos fosfato, a partir del cual se proyectan lateralmente las distintas bases nitrogenadas. Existen dos tipos principales de cidos nucleicos: el cido ribonucleico (RNA), que es un polmero de ribonucletidos, y el cido desoxirribonucleico (DNA), que es un polmero de desoxirribonucletidos. Las diferencias en cuanto a composicin entre estos dos tipos de cido nucleico vienen dadas por las que existen entre sus nucletidos constituyentes y residen en el tipo de pentosa y bases nitrogenadas caractersticas de uno y otro (Tabla 9.2).

7 Los dos tipos de cidos nucleicos estn presentes simultneamente en todas las clulas vivas. En los virus, parsitos intracelulares obligados, aparecen de manera excluyente DNA o RNA. Los cidos nucleicos son molculas portadoras de informacin. La secuencia ordenada de sus nucletidos junto con las estructuras caractersticas de las cadenas polinucleotdicas proporcionan las bases fsico-qumicas para que estas macromolculas puedan almacenar y transmitir la informacin gentica en el proceso de reproduccin de los seres vivos, lo que constituye su funcin biolgica primordial. Tanto la estructura como la funcin de los cidos nucleicos se comprendern mejor cuando se hayan adquirido nuevos conocimientos acerca de la biologa de la clula y de los mecanismos de la herencia biolgica, por lo que su estudio se pospondr para otra parte del programa de esta asignatura. RNA PENTOSA BASES PRICAS BASES PIRIMDICAS
Tabla 9.2

DNA DESOXIRRIBOSA ADENINA GUANINA CITOSINA TIMINA

RIBOSA ADENINA GUANINA CITOSINA URACILO