Controversias: La Universidad Nacional Mayor de San Marcos de Per es reconocida como la universidad ms antigua de Amrica, al ser la universidad que

ms tiempo ha funcionado ininterrumpidamente desde su fundacin. As tambin es reconocida por ser la primera universidad fundada "oficialmente" con autorizacin real, Real Cdula y Real Provisin. Sin embargo, existe cierta discusin sobre su calificacin como la primera institucin de educacin superior de Amrica. Los reconocimientos a la Universidad de San Marcos son dos:

El ser la primera universidad creada "oficialmente", Real Cdula, y por mandato de la Corona espaola, Real Provisin, el 12 de mayo de 1551. Es as la primera universidad de Amrica que fue oficial y solemnemente constituida, es decir, con todas las formalidades reales y cannicas exigidas en la poca. Ser la nica de las universidades fundadas durante el siglo XVI que ha operado sin interrupciones hasta el da de hoy. Esto ltimo resulta de relevancia, debido a que muchas universidades americanas fueron cerradas durante las guerras de independencia hispanoamericanas o, con posterioridad, debido a conflictos internos.

La Universidad Santo Toms de Aquino tiene una prioridad entre las universidades de Amrica basndose en la bula In Apostolatus Culmine de Paulo III del 28 de octubre de 1538, pero no cont con el pase regio del rey Carlos I de Espaa, es decir, aprobacin real, razn por la cual se estima que, jurdicamente, no tuvo efecto. La Universidad Autnoma de Santo Domingo fue fundada, como tal, el 16 de noviembre de 1914 con el objetivo de concretizar la reapertura de la Universidad Santo Toms de Aquino, fundada por bula papal el 28 de octubre de 1538 (y oficialmente por Real Cdula el 23 de febrero de 1558), y clausurada en el siglo XIX.4 5 6 San Marcos recurre, adems, al Archivo General de Indias, que contiene documentos del perodo colonial espaol entre el siglo XVI hasta el siglo XVIII, donde no existen documentos oficiales anteriores a 1551 que reconozcan a una universidad o institucin de educacin superior anterior a la Universidad de San Marcos. Por otro lado, la Universidad Nacional Mayor de San Marcos es la nica universidad de entre las dos que ha tenido un funcionamiento ininterrumpido desde su fundacin, razn por la cual no entra en el debate de los historiadores el asunto de su continuidad.